2021年12月，南京農(nóng)業(yè)大學(xué)動物醫(yī)學(xué)學(xué)院楊倩教授及生命科學(xué)學(xué)院林建副教授，于Cell＆Bioscience(IF:7.133) 在線發(fā)表了IBDV ***雞法氏囊的單細胞測序的***研究成果。研究工作內(nèi)容的主要承擔(dān)者為Abid Ullah Shah博士。歐易...

細胞是生命活動的基本功能單位。不同類型細胞之間的相互作用網(wǎng)絡(luò)構(gòu)成了生命的基礎(chǔ)。研究對象的這一“基本屬性”決定了單細胞高通量技術(shù)是目前我們解析各種生命現(xiàn)象、揭示各種生物學(xué)機制的**強有力的技術(shù)手段。隨著單細胞測序技術(shù)的發(fā)展，原核細胞的scRNA-seq技術(shù)也...

細胞是生命活動的基本功能單位。不同類型細胞之間的相互作用網(wǎng)絡(luò)構(gòu)成了生命的基礎(chǔ)。研究對象的這一“基本屬性”決定了單細胞高通量技術(shù)是目前我們解析各種生命現(xiàn)象、揭示各種生物學(xué)機制的**強有力的技術(shù)手段。隨著單細胞測序技術(shù)的發(fā)展，原核細胞的scRNA-seq技術(shù)也...

歐易單細胞測序繼續(xù)發(fā)力！近日，歐易生物合作客戶復(fù)旦大學(xué)附屬中山醫(yī)院王群教授團隊在EBioMedicine（IF8.143）期刊發(fā)表的關(guān)于食管鱗狀細胞*（ESCC）分子圖譜的相關(guān)成果，對食管鱗狀細胞*的異質(zhì)性和**微環(huán)境進行深入的分析并提出了食管鱗狀細胞**...

酵母文庫實驗：本研究發(fā)現(xiàn)了一個硝酸鹽響應(yīng)的 BTB/TAZ 蛋白 MdBT2，它參與調(diào)節(jié)硝酸鹽介導(dǎo)的蘋果植株生長。利用酵母雙雜交、蛋白質(zhì) pull-down、BiFC 實驗證實，MdBT2 可以與一個 DELLA 蛋白 MdRGL3a 互作，這種互作是 MdR...

LC-MS靶向代謝組+16S微生物多樣性檢測研究。題目：糞便微生物可以區(qū)分酒精性肝炎引起的酒精攝入量，但不能區(qū)分疾病的嚴(yán)重程度期刊：HepatologyIF=17.425研究思路：*樣本類型：人糞便*檢測平臺：LC-MS靶向代謝組、16S微生物多樣性檢測為了表...

LC-MS和GC-MS兩大平臺是現(xiàn)今代謝組學(xué)研究**常用的兩大技術(shù)平臺，各自有其特點和優(yōu)勢，在物質(zhì)檢測的范圍和種類上，都有一定的偏向性。往往一種方法、一個技術(shù)平臺很難獲取樣品當(dāng)中***的代謝物信息，為了解決這個問題，LC-MS+GC-MS這種組合式雙平臺解決方...

LC-MS靶向代謝組學(xué)研究本篇文章通過LC-MS靶向代謝組學(xué)和16S rRNA基因序列分析，探究谷物在加工傳統(tǒng)飲料ogi過程中******的減少和細菌群落的動態(tài)變化。同時，從糧食安全方面考慮，谷物的污染水平低、較安全，又優(yōu)于玉米，可以代替受******污染的玉...

LC-MS非靶向代謝技術(shù)發(fā)現(xiàn)了糞便移植（FMT）對血液代謝的影響。標(biāo)題：藻酸鹽寡糖化小鼠的微生物群成功減輕了小腸粘膜炎期刊：MicrobiomeIF=14.650研究思路：*樣本類型：小鼠小腸、腸道內(nèi)容物、血漿*檢測平臺：LC-MS非靶向代謝組、轉(zhuǎn)錄組、16S...

代謝組學(xué)研究：浙江省農(nóng)科院農(nóng)產(chǎn)品質(zhì)量營養(yǎng)所風(fēng)險評估研究團隊聯(lián)合浙江工業(yè)大學(xué)在農(nóng)藥聯(lián)合暴露效應(yīng)機制研究中取得新進展，作者：楊桂玲，王彥華，李健，王豆，鮑志偉，王強（通訊作者），靳遠詳（共同通訊作者），在Journal of Hazardous Materials...

非靶向和靶向代謝組學(xué)研究方法，2021年7月，廣州多家研究機構(gòu)科研人員在EuropeanRespiratoryJournal期刊發(fā)表了題為“Metabolomicanalysesrevealsnewstage-specificfeaturesoftheCOVI...

通過蛋白質(zhì)組學(xué)+轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究方法，發(fā)現(xiàn)大黃素引發(fā)外泌體通過抑制代謝通路來減少肺泡巨噬細胞的活化和改善肺部炎癥的特征，探究了外泌體在參與炎癥相關(guān)***損傷中的重要作用，為大黃素可以通過減少胰腺外泌體介導(dǎo)的肺泡巨噬細胞活化來減輕嚴(yán)重急性胰腺炎相關(guān)的急性肺損傷提供依...

iTRAQ標(biāo)記定量蛋白組學(xué)技術(shù)研究方法：2021年7月，海南大學(xué)園藝園林學(xué)院吳友根教授課題組等在《Horticulture Research》期刊發(fā)表了題為“Integrative iTRAQ-based proteomic and transcriptomi...

空間代謝組學(xué)：中文標(biāo)題：MYC*基因與固醇調(diào)節(jié)元件結(jié)合蛋白協(xié)同調(diào)節(jié)**生長所必需的脂肪生成研究對象：小鼠發(fā)表期刊：CellMetabolism影響因子：27.287合作單位：斯坦福大學(xué)運用生物技術(shù)：空間代謝組學(xué)、CHIP、RNA-seq、NMR和IHC等MYC...

TMTpro-16plex等標(biāo)記試劑已經(jīng)發(fā)布一年，廣受科研工作者喜愛。但是，對于6組3重復(fù)、3組6重復(fù)的實驗設(shè)計，16plex卻難以滿足。TMTpro? 18-plex標(biāo)記蛋白組會是更好的選擇方式。其中基于質(zhì)譜儀平臺的蛋白組學(xué)近年來備受青睞，穩(wěn)定同位素標(biāo)記策略...

通過酵母雙雜交文庫進行了互作蛋白的篩選，結(jié)果顯示TaTIFY9可以與TaSRL1相互作用（下圖A），并通過Bi-FC、熒光互補實驗得以證實（圖B-C）。TaTIFY9屬于茉莉酸信號途徑關(guān)鍵因子JAZ家族的成員之一。RT-PCR顯示TaTIFY9也主要表達于小麥...

3篇經(jīng)典的蛋白組學(xué)和代謝組學(xué)在水產(chǎn)動物中的研究。水產(chǎn)動物的研究不僅是保障我國海水養(yǎng)殖業(yè)的健康可持續(xù)發(fā)展，同時可為良種創(chuàng)制、海洋環(huán)境研究、生態(tài)研究等提供重要理論基礎(chǔ)和技術(shù)支撐~因此在水產(chǎn)生物研究方面蛋白組學(xué)、代謝組學(xué)在其中起到什么作用呢？期望這3篇經(jīng)典文章能給您...

基于原位測序的空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)。基于原位測序（ISS）的方法通過測序產(chǎn)生空間轉(zhuǎn)錄組信息，這種方法只依靠連接酶連接兩段DNA—一段已知序列的引物和一個探針與模板匹配，不匹配的探針就會被洗掉。2013年開發(fā)的ISS中，每個探針使用一個查詢堿基來測序基因條形碼。FIS...

以上結(jié)果表明，AFADESI-MSI方法可以直接檢測極性代謝產(chǎn)物，并具有高特異性，能呈現(xiàn)其在大腦微區(qū)分布的圖像。3.在大鼠腦中繪制微區(qū)代謝網(wǎng)絡(luò)圖要了解大腦的結(jié)構(gòu)區(qū)域發(fā)生的復(fù)雜代謝過程，不僅應(yīng)準(zhǔn)確表征代謝物，還要研究其相關(guān)性。從大鼠腦微區(qū)中提取代謝譜進行代謝網(wǎng)絡(luò)...

空間代謝組學(xué)研究：一區(qū) | IF:14.553多發(fā)性硬化癥的相關(guān)空間代謝組學(xué)研究。本文為倫敦帝國理工學(xué)院Zoltan Takats教授課題組在ACS central science期刊發(fā)表的題為“Correlated Heterospectral Lipido...

文章中酵母文庫實驗由歐易生物完成。2021 年 3 月，揚州大學(xué)陳忱教授為通訊作者，在 The Plant Journal 雜志（IF: 6.141）在線發(fā)表了題為“The rice LEC1-like transcription factor OsNF-YB...

通過空間代謝組學(xué)測量了四種轉(zhuǎn)基因小鼠模型（肺*（LC）、RCC、HCC和T-ALL）中甘油磷脂（GPs）的含量，發(fā)現(xiàn)在不同的**中，MYC誘導(dǎo)改變了磷酸酰甘油（PGs）的豐度（圖 4A），能夠增加了大多數(shù)PG物質(zhì)。MYC失活后，PG豐度恢復(fù)到基礎(chǔ)水平（圖 4B...

酵母文庫：2021年11月，山東農(nóng)業(yè)大學(xué)園藝科學(xué)與工程學(xué)院張振魯團隊在MolecularPlantPathology（IF：5.663）發(fā)表了題為“Nitrate-inducibleMdBT2actsasarestrictionfactortolimitapp...

（2）基因檢出率低當(dāng)前主流的單細胞平臺對基因的捕獲效率較低，常見的臨床標(biāo)本，可檢測到的基因中位值在1-5k不等，占總基因數(shù)的10-20%。低豐度的基因往往捕獲不到。 （3）測序數(shù)據(jù)的高背景單細胞測序數(shù)據(jù)的背景噪聲大。單個細胞RNA含量很少，擴增和捕獲...

歐易單細胞測序繼續(xù)發(fā)力！近日，歐易生物合作客戶廣州中醫(yī)藥大學(xué)一附屬醫(yī)院魯路團隊在Cardiovascular Research（IF 10.787）期刊發(fā)表的關(guān)于主動脈縮窄模型小鼠心臟巨噬細胞異質(zhì)性及CD72陽性促炎巨噬細胞功能研究的相關(guān)成果，這項研究作者旨在...

inferCNV 是一款 R 包，用來探索**單細胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)中體細胞大規(guī)模染色體拷貝數(shù)變異，例如整個染色體或大片段染色體的擴增（gain）或缺失（loss）。通過與一組參考的“正?！奔毎容^，探索**基因組不同位置的基因表達強度來實現(xiàn)。通過熱圖顯示每條染色...

（2）基因檢出率低當(dāng)前主流的單細胞平臺對基因的捕獲效率較低，常見的臨床標(biāo)本，可檢測到的基因中位值在1-5k不等，占總基因數(shù)的10-20%。低豐度的基因往往捕獲不到。 （3）測序數(shù)據(jù)的高背景單細胞測序數(shù)據(jù)的背景噪聲大。單個細胞RNA含量很少，擴增和捕獲...

歐易單細胞測序繼續(xù)發(fā)力！近日，歐易生物合作客戶復(fù)旦大學(xué)附屬中山醫(yī)院王群教授團隊在EBioMedicine（IF8.143）期刊發(fā)表的關(guān)于食管鱗狀細胞*（ESCC）分子圖譜的相關(guān)成果，對食管鱗狀細胞*的異質(zhì)性和**微環(huán)境進行深入的分析并提出了食管鱗狀細胞**...

過去 5 年里，單細胞測序技術(shù)的快速發(fā)展極大地加速了生物醫(yī)學(xué)領(lǐng)域的相關(guān)研究，讓科研人員以更廣的維度來研究生命的本質(zhì)。隨著 2013 年單細胞測序技術(shù)被 Nature Methods 雜志評選為年度技術(shù)；2019 年單細胞多組學(xué)技術(shù)再次被 Nature Meth...

腸道的自主調(diào)節(jié)需要腸神經(jīng)系統(tǒng)（ENS）中不同功能的神經(jīng)元聯(lián)合作用。然而，腸神經(jīng)元類型的多樣性以及它們在發(fā)育過程中是如何出現(xiàn)的仍然未知。本研究作者通過單細胞轉(zhuǎn)錄組測序詳細描繪了小鼠小腸肌間神經(jīng)叢內(nèi) 12 種腸神經(jīng)元亞型，為小腸肌間神經(jīng)叢的神經(jīng)元亞型提供了分子標(biāo)記...