LC-MS非靶向代謝技術發(fā)現了糞便移植(FMT)對血液代謝的影響。標題:藻酸鹽寡糖化小鼠的微生物群成功減輕了小腸粘膜炎期刊:MicrobiomeIF=14.650研究思路:*樣本類型:小鼠小腸、腸道內容物、血漿*檢測平臺:LC-MS非靶向代謝組、轉錄組、16S微生物多樣性檢測等本研究發(fā)現藻酸鹽寡糖(AOS)可以減輕***藥物白消安誘導的小腸細胞膜的損傷,特別是細胞連接和微絨毛;并有利于腸道菌群變化進而改善小腸功能,提高腸道的免疫功能。LC-MS非靶向代謝技術發(fā)現了糞便移植(FMT)對血液代謝的影響,并分析了血液代謝物與腸道菌群之間的相關性,發(fā)現不同劑量的糞便移植對血液代謝組均產生了***影響,其中大部分是在小腸功能中起著重要作用的脂質代謝物,表明FMT可以在血液中恢復被白消安擾亂的代謝物。相關性分析表明,“有益菌”乳酸桿菌有助于血液代謝產物的恢復,“有害菌群”則不能協(xié)助血液代謝物的回收,揭示了FMT可改善小腸功能和腸道菌群,恢復血液代謝的原因。代謝組學、空間代謝組學多組學聯合分析服務。浙江細胞代謝組學要多少細胞
本研究通過LC-MS和GC-MS雙平臺代謝組學研究方法,對92例樣品5個時間點的尿液樣品進行分析,分別找到了33種和155種與PM和生物氣溶膠相關的差異標志物,結果揭示了年輕健康人在五個不同時間點的尿液代謝譜的動態(tài)變化,采用KEGG通路富集分析和時間序列分析確定了與短期共同暴露于空氣中PM和生物氣溶膠相關的幾種潛在代謝物生物標志物,發(fā)現短期高濃度暴露于PM可能會導致代謝改變并降低應激***水平,這可能是與下丘腦-垂體-腎上腺和交感-腎上腺-髓質軸的***有關;而生物氣溶膠劑則通過***系統(tǒng)對病理性成癮有重要作用。其中尿液中的16-脫氫孕酮可能是PM暴露的潛在生物標志物;4-羥基苯乙醇可能是生物氣溶膠的潛在生物標志物,可用于分別預測或診斷PM或生物氣溶膠相關疾病。上海代謝組學脂類代謝組學專區(qū) 系統(tǒng)生物學驅動的功能代謝組學方法,具有高靈敏、高分辨和高通量。
LC-MS+GC-MS雙平臺代謝組學研究案例,中文標題:使用無偏差代謝組學方法鑒定短期暴露于顆粒物和微生物氣溶膠中的青年人尿液生物標志物研究對象:年輕健康志愿者發(fā)表期刊:EnvironmentalPollution影響因子:8.071發(fā)表時間:2022年4月17日合作單位:中國醫(yī)學科學院醫(yī)藥生物技術研究所衛(wèi)計委***生物工程重點實驗室、中國中醫(yī)科學院廣安門醫(yī)院運用生物技術:LC-MS代謝組學、GC-MS代謝組學(由鹿明生物提供技術支持)。本研究旨在使用LC-MS+GC-MS雙平臺代謝組學研究方法探索 92 名年輕健康個體的尿液代謝組學特征,并確定與短期共暴露相關的潛在生物標志物。
尿液代謝組學研究案例,空氣中PM和生物氣溶膠共同暴露的尿液代謝組學特征采用LC-MS+GC-MS雙平臺代謝組學方法對尿液樣品進行分析,其中GC-MS檢測102種代謝物,LC-MS檢測到1271種。作者通過使用亞組來分析差異代謝物是否具有性別或季節(jié)性,結果表明性別和季節(jié)對本研究的結果沒有明顯的混雜影響。差異分析表明,Pu1和Po1之間的差異代謝物數量大于Po1和C之間的差異,LC-MS分析比GC-MS分析檢測到更多的差異代謝物,體現出不同平臺的檢測特點。為了確定尿液中與空氣污染PM暴露相關的代謝生物標志物,使用綜合分析獲得候選差異代謝物,其中C-Po1和Po1-Pu1比較中的重疊差異代謝物作為短期PM暴露相關標志物,確定了33種與短期暴露于空氣污染相關的差異代謝物,包括8種脂質、6種核酸、7種氨基酸及其衍生物、3種葡萄糖和9種其他代謝物。KEGG通路分析表明,***富集到5種代謝通路,與免疫、炎癥、人類的環(huán)境壓力、缺血和缺氧有關。聚焦于代謝產物研究,采用高精尖的分析儀器,對細胞內的代謝物進行定性和定量分析。
非靶向代謝組學研究:對于代謝物分析,作者對非靶代謝組學測定,共檢測到4,346種代謝物。根據所有檢測到的代謝物的投影中變量重要性(VIP)>1和p<0.05的篩選標準,在不同的比較組***研究了961種差異累積代謝物(DAM)(表1)。在A果實(AF)與B果實(BF)的相同成熟階段,發(fā)現S3的DAM比S1和S2更豐富,這意味著DAM的主要變化發(fā)生在S3。隨后,利用京都基因和基因組百科全書(KEGG)富集分析進一步了解與兩個東方甜瓜品種相關的生物學機制。其中,參與蔗糖和有機酸代謝的代謝物在果實中的積累差異更大,包括“半乳糖代謝”、“磷酸戊糖途徑”、“果糖和甘露糖代謝”、“亞油酸代謝”和“花生四烯酸”。非靶向代謝組學 土壤非靶向代謝組學 脂質組學研究。浙江血清 血漿做代謝組學
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LC-MS+GC-MS雙平臺代謝組學研究案例,中文標題:***通絡***通過***和抗氧化作用預防及延緩糖尿病視網膜病變發(fā)展的機制研究研究對象:大鼠發(fā)表期刊:Biomedicine&Pharmacotherapy影響因子:6.529發(fā)表時間:2022年2月合作單位:中國中醫(yī)科學院廣安門醫(yī)院運用生物技術:LC-MS+GC-MS雙平臺代謝組學(由鹿明生物提供技術支持)。文章通過對中藥***—***通絡方改善糖尿病病理方面的深入研究,表明在預防及***方面和微觀層面均起到了***效果。同時,也探究出***通絡方的內在作用機制。也為糖尿病視網膜病變的早期***,提供***、有效的***方法。其中LC-MS+GC-MS雙平臺代謝組學有助于對中藥成分進行***的分析,為藥物機制提供參考。浙江細胞代謝組學要多少細胞
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