烈冰科技自主研發(fā)的單細(xì)胞云平臺(tái)致力于幫助每一位客戶定制化分析數(shù)據(jù),深度解讀數(shù)據(jù)分析結(jié)果,深入挖掘其背后的生物學(xué)意義;從操作便捷、結(jié)果可視化、分析可追溯、系統(tǒng)穩(wěn)定等方面助力單細(xì)胞研究,加速科研進(jìn)程!此外,烈冰生信團(tuán)隊(duì)根據(jù)豐富的實(shí)戰(zhàn)經(jīng)驗(yàn)為用戶量身打造了一款單細(xì)胞測(cè)序結(jié)果解讀的神兵利器——單細(xì)胞瀏覽器(SingleCellBrowser),不但可以將海量復(fù)雜的結(jié)果文件可視化,還是可以實(shí)現(xiàn)三維立體化展示的軟件。專業(yè)的生信代碼交給專業(yè)的烈冰,專業(yè)的生物學(xué)意義交給專業(yè)的您!烈冰全線實(shí)驗(yàn)平臺(tái)滿足超深度、大規(guī)模發(fā)現(xiàn)和復(fù)雜疾病研究的測(cè)序。無錫BD VDJ單細(xì)胞實(shí)驗(yàn)服務(wù)烈冰生信團(tuán)隊(duì)傾情研發(fā)的NovelBrain?...
從單細(xì)胞測(cè)序描述性分析轉(zhuǎn)向復(fù)雜樣本中不同細(xì)胞類型的功能解析,越來越需要一種多組學(xué)的細(xì)胞生物學(xué)視角。通過單細(xì)胞多組學(xué)——即對(duì)不同組學(xué)的數(shù)據(jù)集進(jìn)行分析和整合——科學(xué)家能夠從同一個(gè)單細(xì)胞來源中檢測(cè)多種細(xì)胞特征。這些特征包括全轉(zhuǎn)錄組基因表達(dá)、細(xì)胞表面蛋白表達(dá)、免疫組庫(kù)序列(包括T細(xì)胞和B細(xì)胞受體)以及用于了解表觀基因組調(diào)控的開放染色質(zhì)區(qū)域。隨著單個(gè)實(shí)驗(yàn)可提供更多信息豐富的數(shù)據(jù),研究人員的獲益更多,包括保留珍貴樣本、提高生產(chǎn)力、減少因批次效應(yīng)引起的錯(cuò)誤,并節(jié)省更多的高科技資源(從資助基金到人員時(shí)間)。烈冰測(cè)序服務(wù)已助力300余篇國(guó)際期刊研究文章發(fā)表。寧波single cell RNA單細(xì)胞服務(wù)機(jī)構(gòu)烈冰生...
由于高通量測(cè)序?qū)嶒?yàn)方法相關(guān)的測(cè)序成本,使得單細(xì)胞實(shí)驗(yàn)往往非常昂貴,烈冰生物BDRhapsody單細(xì)胞測(cè)序服務(wù)珍視您的每一份樣本,在平臺(tái)搭建前,我們測(cè)試評(píng)估了BDRhapsody的性能,與BD官方公布的數(shù)據(jù)結(jié)合來看,將人293T和小鼠NIH/3T3細(xì)胞的1:1混合物以不同濃度上樣到BDRhapsody卡式芯片上。存儲(chǔ)的cDNA分子普遍擴(kuò)增并進(jìn)行低通量測(cè)序(每個(gè)細(xì)胞月8700個(gè)讀數(shù))。在測(cè)序數(shù)據(jù)中檢測(cè)到1109個(gè)細(xì)胞的上樣條件下,每個(gè)細(xì)胞中,來自每個(gè)細(xì)胞的平均99.4%的分子經(jīng)檢測(cè)為人或小鼠,這表明微孔之間的串?dāng)_非常小,在測(cè)序數(shù)據(jù)中檢測(cè)到1000個(gè)或更少細(xì)胞的上樣密度下,多重態(tài)發(fā)生率接近零,并且在...
多樣本數(shù)據(jù)合并:FractionofReadsKept:合并樣本時(shí),各樣本根據(jù)MappedBarcodedReadsperCell數(shù)量計(jì)算出來的數(shù)據(jù)利用率。如果各樣本間該參數(shù)值相差很大,需要進(jìn)行Downsample處理,以數(shù)據(jù)量少的樣本為基準(zhǔn)將不同樣本中細(xì)胞測(cè)序深度標(biāo)化到同一水平,從而避免因測(cè)序深度差異導(dǎo)致的基因檢測(cè)數(shù)量、基因表達(dá)水平的差異。烈冰科技自主研發(fā)的單細(xì)胞云平臺(tái)致力于幫助每一位客戶定制化分析數(shù)據(jù),深度解讀數(shù)據(jù)分析結(jié)果,深入挖掘其背后的生物學(xué)意義;從操作便捷、結(jié)果可視化、分析可追溯、系統(tǒng)穩(wěn)定等方面助力單細(xì)胞研究,加速科研進(jìn)程!單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)遍地開花,烈冰BD 單細(xì)胞測(cè)序服務(wù)讓您的醫(yī)學(xué)研...
機(jī)體為響應(yīng)各種應(yīng)激,其細(xì)胞會(huì)從一種功能“狀態(tài)”轉(zhuǎn)變?yōu)榱硪环N功能“狀態(tài)”;當(dāng)細(xì)胞在不同狀態(tài)之間轉(zhuǎn)變時(shí),往往會(huì)經(jīng)歷轉(zhuǎn)錄重組,導(dǎo)致一些基因被沉默,一些基因被重新“喚醒”,但純化這些瞬態(tài)細(xì)胞進(jìn)行研究是很困難或不可能的;scRNA-seq擬時(shí)序分析可以讓我們?cè)诓恍枰兓那闆r下查看這些細(xì)胞狀態(tài)。擬時(shí)序分析,即根據(jù)不同細(xì)胞亞群基因表達(dá)量隨時(shí)間的變化情況,構(gòu)建細(xì)胞譜系發(fā)育,但這里的時(shí)間并不是真時(shí)間,而是一個(gè)虛擬的時(shí)間,是指的細(xì)胞與細(xì)胞之間的轉(zhuǎn)化和演替的順序和軌跡。即使在同一個(gè)樣本中,也會(huì)存在多種不同的細(xì)胞形態(tài)。因此,不論測(cè)定了多少樣本,我們都可以采用擬時(shí)序分析對(duì)樣本中的細(xì)胞轉(zhuǎn)化和變化進(jìn)行描述。烈冰科技成立1...
單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序是在單細(xì)胞水平上高通量測(cè)序分析基因表達(dá)譜的技術(shù),突破傳統(tǒng)高通量測(cè)序的局限性,組織解離后,單個(gè)樣本一次上機(jī)能捕獲500-20000個(gè)細(xì)胞,基于每個(gè)細(xì)胞分別建庫(kù)測(cè)序,獲得單個(gè)細(xì)胞的基因結(jié)構(gòu)和基因表達(dá)狀態(tài),并鑒定細(xì)胞的類型,可以在不同樣本間從細(xì)胞類型的組成和豐度角度進(jìn)行比較,反映細(xì)胞間的異質(zhì)性。而2021年橫空出世的10XGenomicsChromiumX平臺(tái)實(shí)現(xiàn)了單塊chip上的百萬級(jí)別通量的細(xì)胞捕獲,系統(tǒng)實(shí)現(xiàn)16個(gè)通道同時(shí)運(yùn)行,每個(gè)通道可捕獲2000-20000個(gè)細(xì)胞(不混樣),并支持原ChromiumController體統(tǒng)外的多種細(xì)胞捕獲百萬級(jí)別通量實(shí)驗(yàn),可準(zhǔn)確鑒別稀有細(xì)胞類...
機(jī)體為響應(yīng)各種應(yīng)激,其細(xì)胞會(huì)從一種功能“狀態(tài)”轉(zhuǎn)變?yōu)榱硪环N功能“狀態(tài)”;當(dāng)細(xì)胞在不同狀態(tài)之間轉(zhuǎn)變時(shí),往往會(huì)經(jīng)歷轉(zhuǎn)錄重組,導(dǎo)致一些基因被沉默,一些基因被重新“喚醒”,但純化這些瞬態(tài)細(xì)胞進(jìn)行研究是很困難或不可能的;scRNA-seq擬時(shí)序分析可以讓我們?cè)诓恍枰兓那闆r下查看這些細(xì)胞狀態(tài)。擬時(shí)序分析,即根據(jù)不同細(xì)胞亞群基因表達(dá)量隨時(shí)間的變化情況,構(gòu)建細(xì)胞譜系發(fā)育,但這里的時(shí)間并不是真時(shí)間,而是一個(gè)虛擬的時(shí)間,是指的細(xì)胞與細(xì)胞之間的轉(zhuǎn)化和演替的順序和軌跡。即使在同一個(gè)樣本中,也會(huì)存在多種不同的細(xì)胞形態(tài)。因此,不論測(cè)定了多少樣本,我們都可以采用擬時(shí)序分析對(duì)樣本中的細(xì)胞轉(zhuǎn)化和變化進(jìn)行描述。BD Scan...
如在現(xiàn)有研究方法基礎(chǔ)上,進(jìn)行特定亞細(xì)胞區(qū)域的蛋白質(zhì)組學(xué)、相互作用蛋白質(zhì)組學(xué)以及某種特定翻譯后修飾類型的蛋白質(zhì)組學(xué)的研究等。這將有助于諸多生化過程以及致病機(jī)理的全新認(rèn)識(shí)與發(fā)現(xiàn)。隨著基于單細(xì)胞蛋白質(zhì)組學(xué)質(zhì)譜研究方法的不斷發(fā)展,單細(xì)胞分析方法的靈敏度、蛋白質(zhì)的覆蓋度、細(xì)胞通量、空間分辨率以及多組學(xué)的兼容能力會(huì)不斷突破我們的認(rèn)知極限。更重要的是,單細(xì)胞分析在臨床診斷、疾病分型以及細(xì)胞發(fā)展機(jī)制這些重大生命科學(xué)領(lǐng)域方面的應(yīng)用將會(huì)越來越大。烈冰專注單細(xì)胞多組學(xué)測(cè)序領(lǐng)域。無錫單細(xì)胞測(cè)序服務(wù)單細(xì)胞測(cè)序方法不但改進(jìn)了實(shí)驗(yàn)過程,還幫助科學(xué)家在健康和疾病研究的關(guān)鍵領(lǐng)域取得新進(jìn)展。那些過去從轉(zhuǎn)錄平均值或單項(xiàng)參數(shù)讀取中無...
由于高通量測(cè)序?qū)嶒?yàn)方法相關(guān)的測(cè)序成本,使得單細(xì)胞實(shí)驗(yàn)往往非常昂貴,烈冰生物BDRhapsody單細(xì)胞測(cè)序服務(wù)珍視您的每一份樣本,在平臺(tái)搭建前,我們測(cè)試評(píng)估了BDRhapsody的性能,與BD官方公布的數(shù)據(jù)結(jié)合來看,將人293T和小鼠NIH/3T3細(xì)胞的1:1混合物以不同濃度上樣到BDRhapsody卡式芯片上。存儲(chǔ)的cDNA分子普遍擴(kuò)增并進(jìn)行低通量測(cè)序(每個(gè)細(xì)胞月8700個(gè)讀數(shù))。在測(cè)序數(shù)據(jù)中檢測(cè)到1109個(gè)細(xì)胞的上樣條件下,每個(gè)細(xì)胞中,來自每個(gè)細(xì)胞的平均99.4%的分子經(jīng)檢測(cè)為人或小鼠,這表明微孔之間的串?dāng)_非常小,在測(cè)序數(shù)據(jù)中檢測(cè)到1000個(gè)或更少細(xì)胞的上樣密度下,多重態(tài)發(fā)生率接近零,并且在...
機(jī)體為響應(yīng)各種應(yīng)激,其細(xì)胞會(huì)從一種功能“狀態(tài)”轉(zhuǎn)變?yōu)榱硪环N功能“狀態(tài)”;當(dāng)細(xì)胞在不同狀態(tài)之間轉(zhuǎn)變時(shí),往往會(huì)經(jīng)歷轉(zhuǎn)錄重組,導(dǎo)致一些基因被沉默,一些基因被重新“喚醒”,但純化這些瞬態(tài)細(xì)胞進(jìn)行研究是很困難或不可能的;scRNA-seq擬時(shí)序分析可以讓我們?cè)诓恍枰兓那闆r下查看這些細(xì)胞狀態(tài)。擬時(shí)序分析,即根據(jù)不同細(xì)胞亞群基因表達(dá)量隨時(shí)間的變化情況,構(gòu)建細(xì)胞譜系發(fā)育,但這里的時(shí)間并不是真時(shí)間,而是一個(gè)虛擬的時(shí)間,是指的細(xì)胞與細(xì)胞之間的轉(zhuǎn)化和演替的順序和軌跡。即使在同一個(gè)樣本中,也會(huì)存在多種不同的細(xì)胞形態(tài)。因此,不論測(cè)定了多少樣本,我們都可以采用擬時(shí)序分析對(duì)樣本中的細(xì)胞轉(zhuǎn)化和變化進(jìn)行描述。深度的單細(xì)胞測(cè)...
什么時(shí)候要用到去死細(xì)胞的操作呢?跟進(jìn)烈冰生物多年單細(xì)胞測(cè)序服務(wù)經(jīng)驗(yàn)來看,當(dāng)細(xì)胞懸液進(jìn)行質(zhì)量和活性檢測(cè)后,考慮對(duì)細(xì)胞活性在50%-70%的懸液進(jìn)行去除死細(xì)胞的操作。而太低活性的懸液(小于30%),懸液中細(xì)胞大量死亡,可能已經(jīng)丟失了原組織內(nèi)的細(xì)胞比例和狀態(tài),失真嚴(yán)重,建議重新收集樣本進(jìn)行新的實(shí)驗(yàn),保證數(shù)據(jù)的高質(zhì)量和實(shí)驗(yàn)結(jié)果的準(zhǔn)確性。但需要注意到,去除死細(xì)胞的操作會(huì)損失一定的細(xì)胞數(shù)量,因此希望您在提供樣本時(shí),盡可能提供足量的細(xì)胞,以備實(shí)驗(yàn)過程中可能存在的細(xì)胞死亡的問題,BDRhapsody單細(xì)胞捕獲平臺(tái)對(duì)樣本起始細(xì)胞量的要求較低,一般提供10萬個(gè)細(xì)胞以上均可滿足需求,特殊樣本可詳細(xì)咨詢烈冰生物。單細(xì)...
科研的魅力之處,在于無窮盡的探尋生命的本底,通過單細(xì)胞測(cè)序,我們對(duì)組織的分子基礎(chǔ)的研究也從初級(jí)到深層,并在單細(xì)胞層面逐漸達(dá)成一致,那么不禁要問一句,組織的空間位置到底重不重要?空間異質(zhì)性是功能的關(guān)鍵特征,細(xì)胞的位置信息更能反應(yīng)細(xì)胞命運(yùn)調(diào)控機(jī)制和細(xì)胞譜系發(fā)生過程。因此時(shí)間和空間即像組織的AB面,而不可否認(rèn)的是,此時(shí)空間坐標(biāo)的記錄,像一個(gè)還未長(zhǎng)大的娃娃,雖未觸及分子基礎(chǔ)研究的深層,但仍在努力攀登探尋生命本底的下一個(gè)高峰。附加流式分選細(xì)胞表面Marker,對(duì)于較低分辨率的標(biāo)志物也能有效鑒定,助力高要求測(cè)序項(xiàng)目。珠海BD單細(xì)胞實(shí)驗(yàn)平臺(tái)烈冰生物BDRhapsody單細(xì)胞分析系統(tǒng),可平行分析成千上萬個(gè)單細(xì)...
樣本制備后的保存為了盡可能地減少轉(zhuǎn)錄組的變化,在對(duì)細(xì)胞進(jìn)行清洗和計(jì)數(shù)后,單細(xì)胞懸液應(yīng)當(dāng)保存于冰上,直至用于后續(xù)的上機(jī)和文庫(kù)制備步驟。在理想狀況下,一旦制備好樣本,應(yīng)當(dāng)在3min鐘內(nèi)將其用于下游步驟。然而,您還有必要了解各類細(xì)胞的不同性質(zhì),因?yàn)檫@可能會(huì)影響細(xì)胞應(yīng)在冰上保存的時(shí)間,以及它們?cè)谥苽浜蠖嗑帽銘?yīng)當(dāng)被盡快使用。例如,有些細(xì)胞(如PBMC)如果在冰上放置一段時(shí)間,它們就開始形成團(tuán)塊。這些團(tuán)塊很難解離,增加了堵塞的風(fēng)險(xiǎn),而且每個(gè)團(tuán)塊被當(dāng)成單細(xì)胞計(jì)數(shù),又降低了細(xì)胞計(jì)數(shù)的準(zhǔn)確性。此外,有些細(xì)胞更加粘稠,形成團(tuán)塊的速度更快。對(duì)于這些細(xì)胞,必須盡量減少制備和使用之間的時(shí)間差。單個(gè)細(xì)胞的基因結(jié)構(gòu)和基因表...
從單細(xì)胞測(cè)序描述性分析轉(zhuǎn)向復(fù)雜樣本中不同細(xì)胞類型的功能解析,越來越需要一種多組學(xué)的細(xì)胞生物學(xué)視角。通過單細(xì)胞多組學(xué)——即對(duì)不同組學(xué)的數(shù)據(jù)集進(jìn)行分析和整合——科學(xué)家能夠從同一個(gè)單細(xì)胞來源中檢測(cè)多種細(xì)胞特征。這些特征包括全轉(zhuǎn)錄組基因表達(dá)、細(xì)胞表面蛋白表達(dá)、免疫組庫(kù)序列(包括T細(xì)胞和B細(xì)胞受體)以及用于了解表觀基因組調(diào)控的開放染色質(zhì)區(qū)域。隨著單個(gè)實(shí)驗(yàn)可提供更多信息豐富的數(shù)據(jù),研究人員的獲益更多,包括保留珍貴樣本、提高生產(chǎn)力、減少因批次效應(yīng)引起的錯(cuò)誤,并節(jié)省更多的高科技資源(從資助基金到人員時(shí)間)。烈冰專注單細(xì)胞多組學(xué)測(cè)序領(lǐng)域。上海single cell RNA單細(xì)胞測(cè)序服務(wù)公司樣本制備后的保存為了盡...
針對(duì)BDRhapsody單細(xì)胞捕獲平臺(tái),烈冰生物提供專業(yè)的優(yōu)化試劑和專業(yè)知識(shí):BDRhapsody試劑是轉(zhuǎn)為Rhapsody系統(tǒng)設(shè)計(jì),旦性能已得到驗(yàn)證的產(chǎn)品,因此研究人員可以專注于解決生物學(xué)問題,而不必花費(fèi)時(shí)間應(yīng)對(duì)多組學(xué)分析的技術(shù)障礙。此外,我們還提基于BD平臺(tái)的單細(xì)胞多組學(xué)服務(wù),如Ab-Seq檢測(cè)試劑盒使用的抗體已在流式細(xì)胞分析中得到充分研究,這使得研究人員能夠建立真值并迅速加深對(duì)生物學(xué)系統(tǒng)的理解。作為BD中國(guó)單細(xì)胞聯(lián)合實(shí)驗(yàn)室的合作伙伴,我們將繼續(xù)擴(kuò)展檢測(cè)試劑盒和試劑產(chǎn)品組合的范圍,以支持前沿多組學(xué)分析。我們經(jīng)驗(yàn)豐富的專業(yè)客戶服務(wù)團(tuán)隊(duì)可在多組學(xué)分析的各個(gè)方面為您提供幫助。烈冰科技成立10余年...
單細(xì)胞獲得困難,不同組織要求不盡相同難以搞定?烈冰2000+項(xiàng)目消化經(jīng)驗(yàn),100+組織類型解離protocol,精心設(shè)計(jì)不同組織實(shí)驗(yàn)的解離、細(xì)胞懸浮實(shí)驗(yàn)體系,確保單細(xì)胞的獲得。凍存樣本無法實(shí)驗(yàn),珍貴樣本無法使用?烈冰采用國(guó)際認(rèn)可的凍存組織復(fù)蘇技術(shù)以及死細(xì)胞過濾技術(shù),確保凍存組織使用。珍貴樣本,細(xì)胞數(shù)量太少,消化背景雜無法做單細(xì)胞?采用國(guó)際認(rèn)可的10XGenomics,BDRhapsody雙平臺(tái)模式,根據(jù)樣本實(shí)際情況和用戶需求提供客觀有效的實(shí)驗(yàn)方案,細(xì)胞量少,背景雜也能做單細(xì)胞。單細(xì)胞RNA分類精度不足,部分細(xì)胞無法細(xì)分?烈冰同時(shí)采用單細(xì)胞蛋白質(zhì)組與單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序技術(shù),真正做到從上游到下游的全...
烈冰生物在上海、北京、廣州、西安、江西等多地部署單細(xì)胞測(cè)序?qū)嶒?yàn)組中心,多地部署搭建BDRhapsody單細(xì)胞實(shí)驗(yàn)平臺(tái),基于微孔的強(qiáng)大的高通量單細(xì)胞分析系統(tǒng),為您提供可靠的單細(xì)胞分析工作流程,該系統(tǒng)可通過簡(jiǎn)單的唯恐把工作流程和多重條碼標(biāo)記系統(tǒng),對(duì)高通量單細(xì)胞進(jìn)行多組學(xué)的信息捕獲,由此捕獲的信息科進(jìn)一步生成各種類型的二代測(cè)序(NGS)文庫(kù)。之后對(duì)文庫(kù)進(jìn)行測(cè)序和基于NovelBrain生物大數(shù)據(jù)分析平臺(tái)(云平臺(tái))的數(shù)據(jù)可視化分析,實(shí)現(xiàn)高位分辨率下的組織內(nèi)基因的表達(dá)差異和表達(dá)豐度。烈冰生物作為BD 中國(guó)聯(lián)合成立單細(xì)胞測(cè)序?qū)嶒?yàn)室,為推動(dòng)單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)發(fā)展貢獻(xiàn)中國(guó)力量。BD VDJ單細(xì)胞測(cè)序服務(wù)烈冰科技于...
單細(xì)胞獲得困難,不同組織要求不盡相同難以搞定?烈冰2000+項(xiàng)目消化經(jīng)驗(yàn),100+組織類型解離protocol,精心設(shè)計(jì)不同組織實(shí)驗(yàn)的解離、細(xì)胞懸浮實(shí)驗(yàn)體系,確保單細(xì)胞的獲得。凍存樣本無法實(shí)驗(yàn),珍貴樣本無法使用?烈冰采用國(guó)際認(rèn)可的凍存組織復(fù)蘇技術(shù)以及死細(xì)胞過濾技術(shù),確保凍存組織使用。珍貴樣本,細(xì)胞數(shù)量太少,消化背景雜無法做單細(xì)胞?采用國(guó)際認(rèn)可的10XGenomics,BDRhapsody雙平臺(tái)模式,根據(jù)樣本實(shí)際情況和用戶需求提供客觀有效的實(shí)驗(yàn)方案,細(xì)胞量少,背景雜也能做單細(xì)胞。單細(xì)胞RNA分類精度不足,部分細(xì)胞無法細(xì)分?烈冰同時(shí)采用單細(xì)胞蛋白質(zhì)組與單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序技術(shù),真正做到從上游到下游的全...
BDRhapsody單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序是利用單細(xì)胞水平上的高通量測(cè)序分析基因表達(dá)譜的技術(shù),突破傳統(tǒng)高通量測(cè)序的局限性,針對(duì)多種組織類型的樣本,采用BD細(xì)胞懸液制備protocol組織解離后,單個(gè)樣本一次上機(jī)能捕獲500-10000個(gè)細(xì)胞,基于每個(gè)細(xì)胞分別建庫(kù)測(cè)序,獲得單個(gè)細(xì)胞的基因結(jié)構(gòu)和基因表達(dá)狀態(tài),并鑒定細(xì)胞的類型,可以在不同樣本間從細(xì)胞類型的組成和豐度角度進(jìn)行比較,反映細(xì)胞間的異質(zhì)性,提供足夠靈活的定制測(cè)定法以滿足多種實(shí)驗(yàn)需要,并有效縮短實(shí)驗(yàn)是時(shí)間和降低測(cè)序成本。烈冰實(shí)驗(yàn)室包含從樣本處理到測(cè)序下機(jī)的全套實(shí)驗(yàn)平臺(tái)。上海BD Rhapsody單細(xì)胞服務(wù)機(jī)構(gòu)您的珍貴樣本,還可以放心依賴烈冰生物BD...
烈冰生信團(tuán)隊(duì)傾情研發(fā)的NovelBrain?生信大數(shù)據(jù)分析平臺(tái),針對(duì)龐大的單細(xì)胞測(cè)序數(shù)據(jù),能夠?qū)崿F(xiàn)細(xì)胞類型鑒定的快、精、準(zhǔn):一鍵導(dǎo)入genelist構(gòu)建個(gè)性化基因列表;輕松一點(diǎn)即可展示Marker基因的Featureplot;任意修改Cluster的顏色和名稱助力高效鑒定細(xì)胞類型;一鍵獲得t-SNE圖、Heatmap和Violin圖:輕松獲得并下載基因表達(dá)的t-SNE圖、Heatmap、Violin圖,還可以通過調(diào)節(jié)寬、高和系數(shù)比例來調(diào)節(jié)美觀。平臺(tái)上線300+task自主分析工具、50+pipeline工作流模板,幫助烈冰生信分析團(tuán)隊(duì)和自主分析用戶實(shí)現(xiàn)分析工具和模板的快速調(diào)用和一站式全流程自動(dòng)...
烈冰科技自主研發(fā)的單細(xì)胞云平臺(tái)致力于幫助每一位客戶定制化分析數(shù)據(jù),深度解讀數(shù)據(jù)分析結(jié)果,深入挖掘其背后的生物學(xué)意義;從操作便捷、結(jié)果可視化、分析可追溯、系統(tǒng)穩(wěn)定等方面助力單細(xì)胞研究,加速科研進(jìn)程!此外,烈冰生信團(tuán)隊(duì)根據(jù)豐富的實(shí)戰(zhàn)經(jīng)驗(yàn)為用戶量身打造了一款單細(xì)胞測(cè)序結(jié)果解讀的神兵利器——單細(xì)胞瀏覽器(SingleCellBrowser),不但可以將海量復(fù)雜的結(jié)果文件可視化,還是可以實(shí)現(xiàn)三維立體化展示的軟件。專業(yè)的生信代碼交給專業(yè)的烈冰,專業(yè)的生物學(xué)意義交給專業(yè)的您!烈冰BD Rahpsody單細(xì)胞測(cè)序平臺(tái),助力您的深入科學(xué)探究。廣東BD VDJ單細(xì)胞服務(wù)機(jī)構(gòu)烈冰科技于2010年誕生之初便立足于高通...
烈冰生物在上海、北京、廣州、西安、江西等多地部署單細(xì)胞測(cè)序?qū)嶒?yàn)組中心,多地部署搭建BDRhapsody單細(xì)胞實(shí)驗(yàn)平臺(tái),基于微孔的強(qiáng)大的高通量單細(xì)胞分析系統(tǒng),為您提供可靠的單細(xì)胞分析工作流程,該系統(tǒng)可通過簡(jiǎn)單的唯恐把工作流程和多重條碼標(biāo)記系統(tǒng),對(duì)高通量單細(xì)胞進(jìn)行多組學(xué)的信息捕獲,由此捕獲的信息科進(jìn)一步生成各種類型的二代測(cè)序(NGS)文庫(kù)。之后對(duì)文庫(kù)進(jìn)行測(cè)序和基于NovelBrain生物大數(shù)據(jù)分析平臺(tái)(云平臺(tái))的數(shù)據(jù)可視化分析,實(shí)現(xiàn)高位分辨率下的組織內(nèi)基因的表達(dá)差異和表達(dá)豐度。測(cè)序的革新讓科學(xué)研究從個(gè)體基因差異逐漸轉(zhuǎn)為個(gè)體細(xì)胞的基因差異。寧波scRNA單細(xì)胞平臺(tái)烈冰科技于2010年誕生之初便立足于...
據(jù)不完全統(tǒng)計(jì),截至2022年6月,烈冰生物助力發(fā)表單細(xì)胞文章近40篇,從平臺(tái)應(yīng)用比例來看,應(yīng)用10XGenomics和BDRhapsody兩大平臺(tái)發(fā)文比例各占50%左右,研究類型涵蓋疾病發(fā)展,靶點(diǎn)探索,免疫研究,神經(jīng)發(fā)育,干細(xì)胞分化,植物發(fā)育,退行病變,糖尿病,COVID-19等等研究;從發(fā)表期刊水平來看,烈冰生物聯(lián)合發(fā)表的單細(xì)胞文章,CNS一區(qū)期刊占比在30%以上,其中包括immunity三篇,Nature子刊3篇(Naturecellbiology,NaturePlants,Naturecommunication),風(fēng)濕類領(lǐng)域ARD期刊1篇,CUT1篇,AdvancedScience多篇,...
多樣本數(shù)據(jù)合并:FractionofReadsKept:合并樣本時(shí),各樣本根據(jù)MappedBarcodedReadsperCell數(shù)量計(jì)算出來的數(shù)據(jù)利用率。如果各樣本間該參數(shù)值相差很大,需要進(jìn)行Downsample處理,以數(shù)據(jù)量少的樣本為基準(zhǔn)將不同樣本中細(xì)胞測(cè)序深度標(biāo)化到同一水平,從而避免因測(cè)序深度差異導(dǎo)致的基因檢測(cè)數(shù)量、基因表達(dá)水平的差異。烈冰科技自主研發(fā)的單細(xì)胞云平臺(tái)致力于幫助每一位客戶定制化分析數(shù)據(jù),深度解讀數(shù)據(jù)分析結(jié)果,深入挖掘其背后的生物學(xué)意義;從操作便捷、結(jié)果可視化、分析可追溯、系統(tǒng)穩(wěn)定等方面助力單細(xì)胞研究,加速科研進(jìn)程!烈冰一站式單細(xì)胞測(cè)序服務(wù):立足科學(xué)研究,解碼生命本質(zhì)。天津B...
根據(jù)烈冰多年單細(xì)胞測(cè)序服務(wù)經(jīng)驗(yàn),為什么不建議您一味的追求高細(xì)胞數(shù)量的捕獲:?jiǎn)渭?xì)胞測(cè)序所有的分析都是基于細(xì)胞聚類進(jìn)行,而細(xì)胞聚類是在區(qū)分cell和non-cell后,獲得細(xì)胞基因表達(dá)譜,通過降維(pca),無監(jiān)督聚類以及可視化(t-SNE)得到的。進(jìn)行細(xì)胞聚類時(shí)需要考慮到每個(gè)細(xì)胞的基因表達(dá)模式,因此即使是相同的數(shù)據(jù),在剔除幾個(gè)細(xì)胞的情況下,前后獲得的聚類圖也會(huì)出現(xiàn)明顯不同。而當(dāng)細(xì)胞捕獲數(shù)過多時(shí),無論是假陰性和假陽性數(shù)據(jù)還是多細(xì)胞數(shù)據(jù),都會(huì)對(duì)正常細(xì)胞聚類產(chǎn)生影響,造成聚類結(jié)果失真。這也是很多文章,特別是很多高分文章,為什么單個(gè)樣本捕獲細(xì)胞數(shù)在2000-3000的原因了。烈冰建議單個(gè)樣本捕獲細(xì)胞數(shù)在...
烈冰生物在上海、北京、廣州、西安、江西等多地部署單細(xì)胞測(cè)序?qū)嶒?yàn)組中心,多地部署搭建BDRhapsody單細(xì)胞實(shí)驗(yàn)平臺(tái),基于微孔的強(qiáng)大的高通量單細(xì)胞分析系統(tǒng),為您提供可靠的單細(xì)胞分析工作流程,該系統(tǒng)可通過簡(jiǎn)單的唯恐把工作流程和多重條碼標(biāo)記系統(tǒng),對(duì)高通量單細(xì)胞進(jìn)行多組學(xué)的信息捕獲,由此捕獲的信息科進(jìn)一步生成各種類型的二代測(cè)序(NGS)文庫(kù)。之后對(duì)文庫(kù)進(jìn)行測(cè)序和基于NovelBrain生物大數(shù)據(jù)分析平臺(tái)(云平臺(tái))的數(shù)據(jù)可視化分析,實(shí)現(xiàn)高位分辨率下的組織內(nèi)基因的表達(dá)差異和表達(dá)豐度。烈冰生物為您提供多平臺(tái)一站式全流程BD單細(xì)胞測(cè)序服務(wù)。廈門scRNA單細(xì)胞服務(wù)機(jī)構(gòu)烈冰生物為您的實(shí)驗(yàn)定制工作流程:對(duì)于不同...
根據(jù)烈冰多年單細(xì)胞測(cè)序服務(wù)經(jīng)驗(yàn),為什么不建議您一味的追求高細(xì)胞數(shù)量的捕獲:?jiǎn)渭?xì)胞測(cè)序所有的分析都是基于細(xì)胞聚類進(jìn)行,而細(xì)胞聚類是在區(qū)分cell和non-cell后,獲得細(xì)胞基因表達(dá)譜,通過降維(pca),無監(jiān)督聚類以及可視化(t-SNE)得到的。進(jìn)行細(xì)胞聚類時(shí)需要考慮到每個(gè)細(xì)胞的基因表達(dá)模式,因此即使是相同的數(shù)據(jù),在剔除幾個(gè)細(xì)胞的情況下,前后獲得的聚類圖也會(huì)出現(xiàn)明顯不同。而當(dāng)細(xì)胞捕獲數(shù)過多時(shí),無論是假陰性和假陽性數(shù)據(jù)還是多細(xì)胞數(shù)據(jù),都會(huì)對(duì)正常細(xì)胞聚類產(chǎn)生影響,造成聚類結(jié)果失真。這也是很多文章,特別是很多高分文章,為什么單個(gè)樣本捕獲細(xì)胞數(shù)在2000-3000的原因了。烈冰建議單個(gè)樣本捕獲細(xì)胞數(shù)在...
烈冰生信團(tuán)隊(duì)傾情研發(fā)的NovelBrain?生信大數(shù)據(jù)分析平臺(tái),針對(duì)龐大的單細(xì)胞測(cè)序數(shù)據(jù),能夠?qū)崿F(xiàn)細(xì)胞類型鑒定的快、精、準(zhǔn):一鍵導(dǎo)入genelist構(gòu)建個(gè)性化基因列表;輕松一點(diǎn)即可展示Marker基因的Featureplot;任意修改Cluster的顏色和名稱助力高效鑒定細(xì)胞類型;一鍵獲得t-SNE圖、Heatmap和Violin圖:輕松獲得并下載基因表達(dá)的t-SNE圖、Heatmap、Violin圖,還可以通過調(diào)節(jié)寬、高和系數(shù)比例來調(diào)節(jié)美觀。平臺(tái)上線300+task自主分析工具、50+pipeline工作流模板,幫助烈冰生信分析團(tuán)隊(duì)和自主分析用戶實(shí)現(xiàn)分析工具和模板的快速調(diào)用和一站式全流程自動(dòng)...
BDRhapsody單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序是利用單細(xì)胞水平上的高通量測(cè)序分析基因表達(dá)譜的技術(shù),突破傳統(tǒng)高通量測(cè)序的局限性,針對(duì)多種組織類型的樣本,采用BD細(xì)胞懸液制備protocol組織解離后,單個(gè)樣本一次上機(jī)能捕獲500-10000個(gè)細(xì)胞,基于每個(gè)細(xì)胞分別建庫(kù)測(cè)序,獲得單個(gè)細(xì)胞的基因結(jié)構(gòu)和基因表達(dá)狀態(tài),并鑒定細(xì)胞的類型,可以在不同樣本間從細(xì)胞類型的組成和豐度角度進(jìn)行比較,反映細(xì)胞間的異質(zhì)性,提供足夠靈活的定制測(cè)定法以滿足多種實(shí)驗(yàn)需要,并有效縮短實(shí)驗(yàn)是時(shí)間和降低測(cè)序成本。烈冰科技成立10余年,為科研學(xué)者提供專注的測(cè)序數(shù)據(jù)分析服務(wù)。重慶single cell RNA單細(xì)胞服務(wù)機(jī)構(gòu)烈冰生物單細(xì)胞測(cè)序服務(wù)...
烈冰科技于2010年誕生之初便立足于高通量測(cè)序行業(yè),為科研學(xué)者提供專注的測(cè)序數(shù)據(jù)分析服務(wù),先后經(jīng)歷基因芯片時(shí)代、基因測(cè)序、轉(zhuǎn)錄組測(cè)序時(shí)代...在科技日新月異的洪流中始終獨(dú)占鰲頭。2018年以來,單細(xì)胞測(cè)序進(jìn)入發(fā)展的快車道,烈冰作為國(guó)內(nèi)首批引進(jìn)單細(xì)胞實(shí)驗(yàn)雙平臺(tái)的公司,依托自主研發(fā)的NovelBrain?生物大數(shù)據(jù)分析平臺(tái),為用戶提供一站式全流程的單細(xì)胞測(cè)序服務(wù)和解決方案。4年的單細(xì)胞技術(shù)的積累,烈冰已具備大鼠、小鼠、斑馬魚、猴、裸鼴鼠、水稻、擬南芥等10+物種,皮膚、腦、脂肪、心臟、花序等50+組織類型,100+細(xì)胞類型,1000+靶標(biāo)基因,10000+樣本處理經(jīng)驗(yàn)。助力探索生命時(shí)空多維度的動(dòng)態(tài)...