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  • 南京上海烈冰生物空間轉(zhuǎn)錄組測序服務
    南京上海烈冰生物空間轉(zhuǎn)錄組測序服務

    空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)流程:1、組織優(yōu)化由于不同物種、組織來源的樣本所需的比較好透化時間不盡相同,在正式開展空間轉(zhuǎn)錄組測序?qū)嶒炃?,需要利用組織優(yōu)化kit進行條件的摸索。組織優(yōu)化芯片上包含8個捕獲區(qū)域,每個區(qū)域均覆蓋了熒光標記探針,可捕獲mRNA形成帶有熒光標簽的cDNA,隨即可通過熒光成像結(jié)果判定比較好透化時間及組織優(yōu)化條件。2、空間轉(zhuǎn)錄組測序確定組織優(yōu)化條件后,即可進行切片、H&E染色及成像、空間轉(zhuǎn)錄組文庫構(gòu)建及測序分析流程??臻g轉(zhuǎn)錄組測序是高通量測序下的又一重大技術(shù)突破。南京上海烈冰生物空間轉(zhuǎn)錄組測序服務解決空間轉(zhuǎn)錄組測序數(shù)據(jù)分析中由于超大數(shù)據(jù)量、超高的質(zhì)控要求以及繁多分析需求而引起的分析困難,做...

  • 無錫烈冰空間轉(zhuǎn)錄組測序服務公司
    無錫烈冰空間轉(zhuǎn)錄組測序服務公司

    在發(fā)育過程或疾病發(fā)生過程中,組織內(nèi)部的不同細胞經(jīng)歷了復雜的生物學過程,因此,組織內(nèi)部的異質(zhì)性研究是目前揭示重要生物學研究的一個重要研究手段。組織內(nèi)部的異質(zhì)性包括細胞類型的異質(zhì)性和空間位置的異質(zhì)性兩個層面,細胞類型異質(zhì)性可由單細胞測序來完美呈現(xiàn),而空間位置的異質(zhì)性,則需要可高通量地檢測全轉(zhuǎn)錄組空間信息的新型研究方法來解決。烈冰生物真正實現(xiàn)空間轉(zhuǎn)錄組測序的全程把控,做到從實驗設(shè)計、空間信息標記、建庫測序、定制化分析的全流程一站式服務,助力高分文章發(fā)表??臻g轉(zhuǎn)錄組測序數(shù)據(jù)分析,認準烈冰NovelBrain生物信息數(shù)據(jù)分析平臺。無錫烈冰空間轉(zhuǎn)錄組測序服務公司細胞在組織樣本中的相對空間位置關(guān)系對于了解疾...

  • 北京烈冰科技空間轉(zhuǎn)錄組測序服務公司
    北京烈冰科技空間轉(zhuǎn)錄組測序服務公司

    RNA測序(RNA-seq)是轉(zhuǎn)錄組學研究的重要工具,也是生命科學領(lǐng)域常用的技術(shù)之一。相比于傳統(tǒng)通路研究低維度、低通量的局限性,轉(zhuǎn)錄組學有以下優(yōu)勢:1)能夠動態(tài)考察細胞基因組的表達,多維度地反映差異變化;2)可用于研究占RNA絕大部分的非編碼RNA,研究其結(jié)構(gòu)以及在細胞生命活動中的重要調(diào)控作用;3)與蛋白組學研究相互補充,多角度呈現(xiàn)細胞水平的變化信息。作為轉(zhuǎn)錄組學研究的技術(shù)基礎(chǔ),RNA測序技術(shù)也在不斷地更新迭代,現(xiàn)如今更大通量、更深精度的測序為眾多科研和醫(yī)學工作者提供了豐富的工具和探索真理的手段。烈冰實驗室包含從樣本處理到測序下機的全套實驗平臺。北京烈冰科技空間轉(zhuǎn)錄組測序服務公司烈冰提供空間轉(zhuǎn)...

  • 廈門烈冰科技空間轉(zhuǎn)錄組商業(yè)化服務
    廈門烈冰科技空間轉(zhuǎn)錄組商業(yè)化服務

    解決空間轉(zhuǎn)錄組測序數(shù)據(jù)分析中由于超大數(shù)據(jù)量、超高的質(zhì)控要求以及繁多分析需求而引起的分析困難,做到快速可定制化完成空間轉(zhuǎn)錄組分析;擁有行業(yè)先進的3DHISTECH公司的PANNORAMIC系列的數(shù)字切片掃描儀,可以同時實現(xiàn)明場與熒光場下冷凍切片的快速掃描成像;Z-Stack多層聚焦掃描及Extended Focus 景深擴展多層融合掃描模式,進一步提升分辨率和清晰度,保證切片高分辨的數(shù)字圖像信息精細采集;能夠滿足針對分析結(jié)果中感興趣基因的RNA-FISH驗證以及組織切片的免疫組化的高清成像,獲取表達與定位信息。烈冰斥巨資引進Novaseq6000,開啟更大通量測序新紀元。廈門烈冰科技空間轉(zhuǎn)錄組商...

  • 寧波烈冰科技空間轉(zhuǎn)錄組平臺
    寧波烈冰科技空間轉(zhuǎn)錄組平臺

    細胞在組織樣本中的相對空間位置關(guān)系對于了解疾病病理學非常重要。但是scRNA-Seq在單細胞懸液制備的過程中破壞了細胞的空間結(jié)構(gòu),無法給出固態(tài)異質(zhì)化組織中細胞空間排布信息。而空間轉(zhuǎn)錄組可以解決這個問題,通過記錄組織切片細胞的空間信息,捕獲組織切片中的組織學信息;通過免疫熒光進行蛋白組檢測,將基因表達譜映射回組織樣本中的原始位置,同時獲得細胞/基因的空間表達特異性。該技術(shù)可以為神經(jīng)科學,發(fā)育生物學,免疫生理學等領(lǐng)域的研究提供組織和基因表達情況的新視角。十二年測序經(jīng)驗,累計服務與5000余項重要科研項目。寧波烈冰科技空間轉(zhuǎn)錄組平臺所謂的高通量測序技術(shù),又名大規(guī)模平行測序,是將DNA(或者cDNA)...

  • 合肥烈冰生物空間轉(zhuǎn)錄組服務機構(gòu)
    合肥烈冰生物空間轉(zhuǎn)錄組服務機構(gòu)

    空間轉(zhuǎn)錄組測序在病理學中,通過添加基因表達維度,得出形態(tài)學結(jié)論,通過觀察基因表達區(qū)域,了解可能發(fā)生假陰性/假陽性的位置; 在免疫學,研究免疫細胞浸潤、不同區(qū)域的免疫細胞中的基因表達特征;免疫群體擴散、不同類型免疫細胞的空間位置解析; 在神經(jīng)科學,研究大腦皮層層狀組織解析,揭示大腦皮層的結(jié)構(gòu)-功能關(guān)系,正常vs.疾病大腦結(jié)構(gòu)特征分析與疾病相關(guān)的基因表達于特定的大腦皮層; 在發(fā)育生物學,通過解析每個發(fā)育階段不同解剖區(qū)域特有的基因表達特征,解析組織中與形態(tài)形成相關(guān)基因;豐富基因表達的空間注釋信息,創(chuàng)建組織發(fā)育的空間細胞圖譜。烈冰生物全轉(zhuǎn)錄組測序通過雙文庫構(gòu)建,實現(xiàn)多種RNA的一網(wǎng)打盡。合肥烈冰生物空...

  • 合肥空間轉(zhuǎn)錄組
    合肥空間轉(zhuǎn)錄組

    RNA測序(RNA-seq)是轉(zhuǎn)錄組學研究的重要工具,也是生命科學領(lǐng)域常用的技術(shù)之一。相比于傳統(tǒng)通路研究低維度、低通量的局限性,轉(zhuǎn)錄組學有以下優(yōu)勢:1)能夠動態(tài)考察細胞基因組的表達,多維度地反映差異變化;2)可用于研究占RNA絕大部分的非編碼RNA,研究其結(jié)構(gòu)以及在細胞生命活動中的重要調(diào)控作用;3)與蛋白組學研究相互補充,多角度呈現(xiàn)細胞水平的變化信息。作為轉(zhuǎn)錄組學研究的技術(shù)基礎(chǔ),RNA測序技術(shù)也在不斷地更新迭代,現(xiàn)如今更大通量、更深精度的測序為眾多科研和醫(yī)學工作者提供了豐富的工具和探索真理的手段??臻g轉(zhuǎn)錄組測序因其強大的探究疾病--細胞--基因的關(guān)系,一度成為高通量測序技術(shù)的“天花板”。合肥空...

  • 深圳烈冰生物空間轉(zhuǎn)錄組測序
    深圳烈冰生物空間轉(zhuǎn)錄組測序

    多樣本數(shù)據(jù)合并:FractionofReadsKept:合并樣本時,各樣本根據(jù)MappedBarcodedReadsperCell數(shù)量計算出來的數(shù)據(jù)利用率。如果各樣本間該參數(shù)值相差很大,需要進行Downsample處理,以數(shù)據(jù)量少的樣本為基準將不同樣本中細胞測序深度標化到同一水平,從而避免因測序深度差異導致的基因檢測數(shù)量、基因表達水平的差異。烈冰科技自主研發(fā)的單細胞云平臺致力于幫助每一位客戶定制化分析數(shù)據(jù),深入解讀數(shù)據(jù)分析結(jié)果,深入挖掘其背后的生物學意義;從操作便捷、結(jié)果可視化、分析可追溯、系統(tǒng)穩(wěn)定等方面助力單細胞研究,加速科研進程!空間轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)遍地開花,烈冰服務讓您的生物醫(yī)學研究如虎添...

  • 成都烈冰科技空間轉(zhuǎn)錄組測序
    成都烈冰科技空間轉(zhuǎn)錄組測序

    10xGenomics空間轉(zhuǎn)錄組用于文庫構(gòu)建的每張載玻片上有四個捕獲區(qū)域,每個捕獲區(qū)域的大小為6.5x6.5mm,包含5000個被條形碼標記的點(barcodedspots),每個點的直徑為55μm,點和點之間中心的距離為100μm,并且每個點都有一個barcode序列。組織切片的細胞中會釋放出mRNA,遷移到每個spot的mRNA會被標記上相應的barcode序列,然后進行文庫構(gòu)建并進行測序。根據(jù)數(shù)據(jù)的條形碼信息對數(shù)據(jù)進行分析,以確定哪些數(shù)據(jù)來自哪個位置,從而實現(xiàn)空間基因表達的可視化?;驕y序相關(guān)產(chǎn)品和技術(shù)已由實驗室研究逐漸演變到臨床應用,是下一個改變世界的技術(shù)。成都烈冰科技空間轉(zhuǎn)錄組測序作...

  • 武漢scRNA空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析
    武漢scRNA空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析

    10XVisium的實驗主要分為兩部分:組織學板塊和組學板塊。組織學板塊包括樣品的包埋、切片、固定、染色及成像,記錄切片的形態(tài)學信息;組學板塊包括cDNA的合成、擴增、接頭連接和測序,記錄切片的轉(zhuǎn)錄本信息和空間位置信息。具體實驗流程如下:A、切片制備和優(yōu)化:取新鮮組織、冷凍、切片,并進行HE染色成像,優(yōu)化確定切片是否覆蓋靶向區(qū)域。B、切片固定和透化:將組織切片放置在含有與RNA結(jié)合捕獲探針的載玻片上,并進行固定和透化,使細胞中的mRNA得到釋放,并結(jié)合到相應的捕獲探針上,從而獲取基因表達信息。C、逆轉(zhuǎn)和文庫構(gòu)建:以捕獲的RNA為模板,進行cDNA合成,和測序文庫制備。D、高通量上機測序:對制備...

  • 杭州BD Rhapsody空間轉(zhuǎn)錄組商業(yè)化服務
    杭州BD Rhapsody空間轉(zhuǎn)錄組商業(yè)化服務

    生命科學研究的目的之一就是為了解決細胞和組織以及該組織如何影響功能這一難題。測序技術(shù)可提供特定條件下某些 組織中基因的表達信息,不僅可以推斷出相應未知基因的功能,揭示特定調(diào)節(jié)基因的作用機制,而且可以辨別細胞的類型和異質(zhì)性,為疾病診斷提供理論依據(jù)。但由于研究的深入或具體研究方向和內(nèi)容的不同,傳統(tǒng)的轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)顯然不能夠滿足科研工作者們強烈的好奇心,更加直觀地反映組織中基因的表達情況,隨即單細胞轉(zhuǎn)錄組測序(Single-cell RNA-sequencing,scRNA-seq)、空間轉(zhuǎn)錄組(Spatial transcriptomics,ST)測序等一系列技術(shù)應運而生。烈冰生物成立于2010年...

  • 合肥BD空間轉(zhuǎn)錄組服務機構(gòu)
    合肥BD空間轉(zhuǎn)錄組服務機構(gòu)

    相比于常規(guī)的測序手段,空間轉(zhuǎn)錄組測序有幾個明顯的優(yōu)勢:1.將轉(zhuǎn)錄組信息與空間信息對應,體現(xiàn)組織內(nèi)部的異質(zhì)性:每個區(qū)域獨特的條形碼使測序結(jié)果與空間位置形成一一對應關(guān)系。雖然暫時還無法精細到單細胞層面,但是這樣的區(qū)域劃分也已經(jīng)足以展現(xiàn)出組織內(nèi)部不同區(qū)域間的轉(zhuǎn)錄組差異。2.不影響對全組織進行分析:芯片上捕獲的全轉(zhuǎn)錄組在同一個反應中完成測序,能有效降低多次重復實驗中的誤差。測序結(jié)果如果不按照條形碼歸類,則直接體現(xiàn)的是切片全組織的轉(zhuǎn)錄組情況,無需再做單獨檢測。3.為進一步的研究提供指導意見:常規(guī)的轉(zhuǎn)錄組測序,對后續(xù)實驗的指導仍然停留在全組織層面。而空間轉(zhuǎn)錄組測序則可以標識出更有價值的研究區(qū)域,引導研究者...

  • 西安烈冰生物空間轉(zhuǎn)錄組商業(yè)化服務
    西安烈冰生物空間轉(zhuǎn)錄組商業(yè)化服務

    烈冰配置了LEICA CM1950冷凍切片機,搭配切片經(jīng)驗豐富的實驗團隊,可以提供一致性更高、實驗操作更精細的冷凍切片準備方案,保持密切高效的溝通,設(shè)計更適合的實驗方案,確保每一個實驗細節(jié)有效進行;烈冰升級配置尼康相差顯微鏡和CCD成像系統(tǒng),更高清分辨率解析組織切片原始圖像信息,10X,20X,40X,60X更多物鏡選擇,為不同大小的樣本提供更清晰的圖像,更精細的圖像信息采集、拼接策略,為樣本內(nèi)微小區(qū)域的組織學提供更清晰的影像;烈冰生物為您提供一站式全流程高通量測序服務。西安烈冰生物空間轉(zhuǎn)錄組商業(yè)化服務10xGenomics空間轉(zhuǎn)錄組用于文庫構(gòu)建的每張載玻片上有四個捕獲區(qū)域,每個捕獲區(qū)域的大小...

  • 青島烈冰空間轉(zhuǎn)錄組商業(yè)化服務
    青島烈冰空間轉(zhuǎn)錄組商業(yè)化服務

    烈冰提供空間轉(zhuǎn)錄組全流程服務,包括樣本包埋、貼片、選片、HE染色、拍照成像、組織透化、建庫測序以及后續(xù)的FISH驗證等各個步驟,為您提供無憂服務。烈冰搭建了以萊卡CM1950冷凍切片機、尼康多熒光通路全自動掃描顯微鏡、3Dhistech-midi數(shù)字掃描儀為基礎(chǔ)的先進實驗平臺,并制定嚴格規(guī)范的實驗室SOP,經(jīng)過大量的切片、貼片實操演練,對不同類型組織的切片厚度、溫度進行優(yōu)化,確保獲得更好質(zhì)量的冷凍切片。利用NovelBrain云分析平臺,搭建0代碼需求的空間轉(zhuǎn)錄組分析流程,準確快速解析空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)。取同一樣本組織的相鄰區(qū)域進行單細胞轉(zhuǎn)錄組測序,通過單細胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)和空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)的整合分析,...

  • 西安上海烈冰生物空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析可視化
    西安上海烈冰生物空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析可視化

    烈冰提供空間轉(zhuǎn)錄組全流程服務,包括樣本包埋、貼片、選片、HE染色、拍照成像、組織透化、建庫測序以及后續(xù)的FISH驗證等各個步驟,為您提供無憂服務。烈冰搭建了以萊卡CM1950冷凍切片機、尼康多熒光通路全自動掃描顯微鏡、3Dhistech-midi數(shù)字掃描儀為基礎(chǔ)的先進實驗平臺,并制定嚴格規(guī)范的實驗室SOP,經(jīng)過大量的切片、貼片實操演練,對不同類型組織的切片厚度、溫度進行優(yōu)化,確保獲得更好質(zhì)量的冷凍切片。利用NovelBrain云分析平臺,搭建0代碼需求的空間轉(zhuǎn)錄組分析流程,準確快速解析空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)。取同一樣本組織的相鄰區(qū)域進行單細胞轉(zhuǎn)錄組測序,通過單細胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)和空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)的整合分析,...

  • 廈門高通量測序空間轉(zhuǎn)錄組平臺
    廈門高通量測序空間轉(zhuǎn)錄組平臺

    在轉(zhuǎn)錄組學領(lǐng)域,空間轉(zhuǎn)錄組也開辟了新世界。Nature Methods在今年1月份將空間轉(zhuǎn)錄組學評價為2020年度方法,空間轉(zhuǎn)錄組方法近幾年越來越受到歡迎,它將帶領(lǐng)組學在生物學的研究上進入新的階段。從轉(zhuǎn)錄組測序到實現(xiàn)單細胞轉(zhuǎn)錄測序,這一過程為精確認識不同細胞類型提供了巨大的幫助?,F(xiàn)在,新的空間轉(zhuǎn)錄組方法不僅帶來轉(zhuǎn)錄組信息,同時還提供空間信息,幫研究者更好辨別轉(zhuǎn)錄的位置,進一步擴展到單細胞分辨率,這會更大程度提升科學家對單個細胞的認識和解讀??臻g轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)遍地開花,烈冰服務讓您的生物醫(yī)學研究如虎添翼。廈門高通量測序空間轉(zhuǎn)錄組平臺空間轉(zhuǎn)錄組測序的關(guān)鍵就在于,解決了空間位置保留的問題。被放置在芯...

  • 上海BD Rhapsody空間轉(zhuǎn)錄組測序
    上海BD Rhapsody空間轉(zhuǎn)錄組測序

    10XGenomics和Drop-Seq的技術(shù)原理。是利用十字交叉的通道,從橫向孔道中逐一輸入凝膠微珠,縱向孔道輸入細胞,凝膠微珠與細胞碰撞后會吸附在凝膠微珠上,并通過微流控技術(shù),將之輸入到油相孔道中。這時候,就形成了一個個油滴后輸出并收集在EP管中。每一個油滴中會落入一個細胞以及一個凝膠微珠,那么在每一個凝膠微珠中上長滿了不同的CellBarcode和UMIBarcode連接形成的序列,再加上一端PolyT的抓手,構(gòu)成我們的捕獲凝膠微珠。而這個凝膠微珠抓手就會使用oligodT抓住mRNA構(gòu)建文庫,進而完成細胞中RNA的捕獲過程。測序可準確地分析基因表達差異、基因結(jié)構(gòu)變異、篩選分子標記(SN...

  • 濟南烈冰科技空間轉(zhuǎn)錄組測序
    濟南烈冰科技空間轉(zhuǎn)錄組測序

    單細胞測序是指針對單個細胞進行全轉(zhuǎn)錄組測序分析,可精確地描述每一個細胞的狀態(tài),在異質(zhì)性發(fā)育過程中具有不可忽視的應用價值。然而,單細胞測序無法給出固態(tài)異質(zhì)化組織中細胞空間排布信息,對于揭示發(fā)育過程、病理微環(huán)境都存在很大的局限性??臻g轉(zhuǎn)錄組測序以點陣形式記錄病理切片細胞的空間信息并進行測序,可以精確指示點陣內(nèi)的全部基因表達情況??臻g轉(zhuǎn)錄組測序的加入,無疑讓單細胞測序如虎添翼,更精確地勾勒了組織水平的異質(zhì)性。烈冰全線實驗平臺滿足超深度、大規(guī)模發(fā)現(xiàn)和復雜疾病研究的測序。濟南烈冰科技空間轉(zhuǎn)錄組測序空間轉(zhuǎn)錄組測序的數(shù)據(jù)分析基本分為三個階段:1.數(shù)據(jù)的預處理部分;2.Spot點陣的分群與定義;3.Spot分...

  • 成都烈冰生物空間轉(zhuǎn)錄組測序服務公司
    成都烈冰生物空間轉(zhuǎn)錄組測序服務公司

    空間轉(zhuǎn)錄組測序與單細胞測序的結(jié)果不同,這里存在一個概念叫做NumberofSpotsundertissue,即,空間轉(zhuǎn)錄組片子上組織覆蓋的有效的spot位點。這個有效Spot的篩選標準是有UMI以及有序列表達。那么這個時候,貼片的質(zhì)量就成為了制約空間轉(zhuǎn)錄組有效區(qū)域的要點了。如果組織沒有很好地覆蓋到空轉(zhuǎn)片上,那么容易出現(xiàn)雖然有HE染色有組織片子,但是沒有基因表達,即無有效Spot位點。同樣的,另一個就是組織切片的大小,也就是說組織切片在整個玻片的覆蓋面積越小,分析的有效區(qū)域就越少。這兩者基本上決定了整個空間轉(zhuǎn)錄組分析結(jié)果的基礎(chǔ)質(zhì)量??臻g轉(zhuǎn)錄組測序機構(gòu),請認準上海烈冰生物科技。成都烈冰生物空間轉(zhuǎn)錄...

  • 上海高通量測序空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析可視化
    上海高通量測序空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析可視化

    空間轉(zhuǎn)錄組測序的數(shù)據(jù)質(zhì)量和玻片有效區(qū)域的利用率、貼片的質(zhì)量和透化時間息息相關(guān)。貼片質(zhì)量不良會影響總的有效spot數(shù)等;而透化不合理會導致spot的reads數(shù)、基因中位數(shù)等參數(shù)。而在特異性基因表達方面,我們也可以統(tǒng)計空間轉(zhuǎn)錄組群體的特異性基因表達即Markergene,將他們在組織切片以及空轉(zhuǎn)上進行著色。我們也可以對于任意一個已知的基因或者數(shù)據(jù)庫中的一些細胞Marker,然后將其在基因表達在空間轉(zhuǎn)錄組的切片以及HE染色上展示自己的基因表達進而了解,群體中的可能的細胞組成關(guān)系。烈冰引進國際主流空間轉(zhuǎn)錄組測序平臺,提供保留組織內(nèi)部精細區(qū)域的空間信息的轉(zhuǎn)錄組測序。上海高通量測序空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析可視...

  • 廣州BD Rhapsody空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)支持
    廣州BD Rhapsody空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)支持

    空間組測序技術(shù),作為現(xiàn)階段單細胞技術(shù)的重要補充技術(shù)進入了組學的實驗領(lǐng)域以及生物信息學的分析領(lǐng)域。通過單細胞測序(單細胞表達尺度)+空間轉(zhuǎn)錄組測序(空間表達尺度)+數(shù)字病理(臨床診斷尺度)聯(lián)合分析可在空間和時間上描述不斷演變的組織生態(tài)系統(tǒng),多角度深入分析組織的形態(tài)特征、基因組學特征、表觀遺傳調(diào)控因子以及樣本中的免疫微環(huán)境。不同于單細胞測序分析的需求-分析-需求-分析的模式,空間轉(zhuǎn)錄組分析實際上是非常需要研究者和企業(yè)之間的互動的,尤其是對于組織切片的理解,一個在線互相交流空間轉(zhuǎn)錄組測序結(jié)果的系統(tǒng)也是空轉(zhuǎn)分析中不可或缺的一環(huán),也是重中之重??臻g轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)提供了空間轉(zhuǎn)錄組水平下的科學研究視角。廣州...

  • 青島烈冰空間轉(zhuǎn)錄組平臺
    青島烈冰空間轉(zhuǎn)錄組平臺

    空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)流程:1、組織優(yōu)化由于不同物種、組織來源的樣本所需的比較好透化時間不盡相同,在正式開展空間轉(zhuǎn)錄組測序?qū)嶒炃?,需要利用組織優(yōu)化kit進行條件的摸索。組織優(yōu)化芯片上包含8個捕獲區(qū)域,每個區(qū)域均覆蓋了熒光標記探針,可捕獲mRNA形成帶有熒光標簽的cDNA,隨即可通過熒光成像結(jié)果判定比較好透化時間及組織優(yōu)化條件。2、空間轉(zhuǎn)錄組測序確定組織優(yōu)化條件后,即可進行切片、H&E染色及成像、空間轉(zhuǎn)錄組文庫構(gòu)建及測序分析流程。十二年測序經(jīng)驗,累計服務與5000余項重要科研項目。青島烈冰空間轉(zhuǎn)錄組平臺已發(fā)表的關(guān)于空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)有Slide-seq,LCM-seq,seqFISH,MERFISH,Liv...

  • 青島烈冰生物空間轉(zhuǎn)錄組測序服務公司
    青島烈冰生物空間轉(zhuǎn)錄組測序服務公司

    10XGenomics和Drop-Seq的技術(shù)原理。是利用十字交叉的通道,從橫向孔道中逐一輸入凝膠微珠,縱向孔道輸入細胞,凝膠微珠與細胞碰撞后會吸附在凝膠微珠上,并通過微流控技術(shù),將之輸入到油相孔道中。這時候,就形成了一個個油滴后輸出并收集在EP管中。每一個油滴中會落入一個細胞以及一個凝膠微珠,那么在每一個凝膠微珠中上長滿了不同的CellBarcode和UMIBarcode連接形成的序列,再加上一端PolyT的抓手,構(gòu)成我們的捕獲凝膠微珠。而這個凝膠微珠抓手就會使用oligodT抓住mRNA構(gòu)建文庫,進而完成細胞中RNA的捕獲過程。助力探索生命時空多維度的動態(tài)變化的生物學信息;助力生命健康醫(yī)療...

  • 重慶烈冰科技空間轉(zhuǎn)錄組平臺
    重慶烈冰科技空間轉(zhuǎn)錄組平臺

    10xGenomics空間轉(zhuǎn)錄組用于文庫構(gòu)建的每張載玻片上有四個捕獲區(qū)域,每個捕獲區(qū)域的大小為6.5x6.5mm,包含5000個被條形碼標記的點(barcodedspots),每個點的直徑為55μm,點和點之間中心的距離為100μm,并且每個點都有一個barcode序列。組織切片的細胞中會釋放出mRNA,遷移到每個spot的mRNA會被標記上相應的barcode序列,然后進行文庫構(gòu)建并進行測序。根據(jù)數(shù)據(jù)的條形碼信息對數(shù)據(jù)進行分析,以確定哪些數(shù)據(jù)來自哪個位置,從而實現(xiàn)空間基因表達的可視化。附加流式分選細胞表面Marker,對于較低分辨率的標志物也能有效鑒定,助力高要求測序項目。重慶烈冰科技空間轉(zhuǎn)...

  • 杭州高通量測序空間轉(zhuǎn)錄組平臺
    杭州高通量測序空間轉(zhuǎn)錄組平臺

    空間組學可以應用的方向:1.可以鑒定到疾病的空間位置異質(zhì)性:對于阿爾茨海默癥的研宄可以探索到小神經(jīng)質(zhì)細胞趨向于阿爾茨海默神經(jīng)班。 2.建立空間轉(zhuǎn)錄組圖譜構(gòu)建個人空間轉(zhuǎn)錄組圖譜將極大提升科研人員對生物體組織間的細胞差異。3、描述胚胎發(fā)育及空間藍區(qū)胚胎發(fā)育的動態(tài)過程是科研人員一直為之著迷的,空間組學發(fā)展可以清晣的描繪胚胎發(fā)育的藍圖。除了皮膚、胰腺和骨頭組織外,其余樣本類型均可開展10xGenomics空間轉(zhuǎn)錄組研究。10xGenomics公司已經(jīng)測試完畢的組織類型有:人:心勝、腎勝、卵巢、乳房、淋巴結(jié)、大腦、大腸、肺、脾臟小鼠:大腦、眼睛、心勝、腎勝、大腸、肝臟、肺、卵巢,四頭肌、小腸、脾勝、胃、...

  • 杭州BD Rhapsody空間轉(zhuǎn)錄組測序服務公司
    杭州BD Rhapsody空間轉(zhuǎn)錄組測序服務公司

    10XGenomics和Drop-Seq的技術(shù)原理。是利用十字交叉的通道,從橫向孔道中逐一輸入凝膠微珠,縱向孔道輸入細胞,凝膠微珠與細胞碰撞后會吸附在凝膠微珠上,并通過微流控技術(shù),將之輸入到油相孔道中。這時候,就形成了一個個油滴后輸出并收集在EP管中。每一個油滴中會落入一個細胞以及一個凝膠微珠,那么在每一個凝膠微珠中上長滿了不同的CellBarcode和UMIBarcode連接形成的序列,再加上一端PolyT的抓手,構(gòu)成我們的捕獲凝膠微珠。而這個凝膠微珠抓手就會使用oligodT抓住mRNA構(gòu)建文庫,進而完成細胞中RNA的捕獲過程。烈冰空間轉(zhuǎn)錄組測序助您深入探究細胞類型特異性和基因調(diào)控網(wǎng)絡特征...

  • 廣州烈冰科技空間轉(zhuǎn)錄組平臺
    廣州烈冰科技空間轉(zhuǎn)錄組平臺

    單細胞測序技術(shù)是一種在單細胞水平上對基因組、轉(zhuǎn)錄組、表觀組等進行高通量測序分析的技術(shù)。單細胞測序技術(shù)能夠在組學水平揭示細胞間的異質(zhì)性。單細胞水平細胞譜系追蹤技術(shù)位居2018年Science 雜志評選的科學突破。常規(guī)單細胞轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)丟失了細胞在原組織中至關(guān)重要的空間位置信息,而單細胞空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)在進行單細胞轉(zhuǎn)錄組測序的同時保留并記錄了細胞的空間位置信息??臻g轉(zhuǎn)錄組技術(shù)能夠揭示細胞間的相互作用以及細胞所處的微環(huán)境,將成為發(fā)育生物學、神經(jīng)生物學、免疫生物學等領(lǐng)域的研究利器。ATCG堿基的排列組合構(gòu)成了測序的龐大世界。廣州烈冰科技空間轉(zhuǎn)錄組平臺烈冰生信團隊傾情研發(fā)的NovelBrain?生信大數(shù)...

  • 西安BD Rhapsody空間轉(zhuǎn)錄組服務機構(gòu)
    西安BD Rhapsody空間轉(zhuǎn)錄組服務機構(gòu)

    所謂的高通量測序技術(shù),又名大規(guī)模平行測序,是將DNA(或者cDNA)隨機片段化、加接頭,制備測序文庫,通過對文庫中數(shù)以萬計的克隆(colony)進行延伸反應,檢測對應的信號并獲取序列信息。與傳統(tǒng)測序法相比,高通量測序技術(shù)在處理大規(guī)模樣品時具有強大的優(yōu)勢,又快(兩天)又多(數(shù)百萬克?。?,成為目前組學研究的主要技術(shù)。空間轉(zhuǎn)錄組測序是一個系統(tǒng)的工程,開展項目前您可能會先評估它提供的見解是否與您的研究問題相匹配,如果匹配,實驗過程如何規(guī)劃,實驗平臺如何選擇,樣本如何制備,數(shù)據(jù)如何分析等等,而在這一切開始之前,我們的服務就已經(jīng)開始了,從銷售到實驗到專業(yè)技術(shù)支持,我們開通全線對接渠道,幫助您快速定位項目訴...

  • 無錫BD Rhapsody空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析
    無錫BD Rhapsody空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析

    基于橋式PCR技術(shù)的簇生成可以將模版鏈迅速擴增成千上萬倍,保證過程中足夠的測序深度。測序時使用特殊標記的dNTP:1)堿基上通過敏感鍵修飾上不同的熒光基團,用于區(qū)分ATCG;2)3端使用疊氮基團封閉,保證一次循環(huán)只上一個dNTP。每一輪循環(huán)結(jié)束時,會通過高速熒光顯微鏡記錄熒光圖像,再通入試劑除去熒光基團和疊氮基團,開啟下一循環(huán)。通過分析讀取同一位點的熒光,實時獲取模版鏈的堿基序列。由于過程中使用的化學反應并不可控,隨著循環(huán)數(shù)的增大會出現(xiàn)不同步的情況,因此Illumina的讀長只能限制在200bp左右。深度的空間轉(zhuǎn)錄組測序數(shù)據(jù)解讀助力生物健康醫(yī)療時代。無錫BD Rhapsody空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析...

  • 濟南烈冰空間轉(zhuǎn)錄組測序服務
    濟南烈冰空間轉(zhuǎn)錄組測序服務

    10x Genomics空間轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)通過將組織切片的高通量mRNA分析和形態(tài)學背景整合,使基因表達譜可以被定位回它們的原始空間位置。傳統(tǒng)的空間轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)局限于冰凍組織切片。10x Genomics推出全新的針對FFPE樣本的Visium空間基因表達解決方案,該技術(shù)打破從FFPE組織樣本中獲取空間全部轉(zhuǎn)錄組基因表達信息的壁壘,能夠從FFPE樣本中獲取高靈敏度、高特異性的相關(guān)基因的表達信息,在形態(tài)學背景下實現(xiàn)真正的探索發(fā)現(xiàn),進一步擴展空間生物學的可能性。烈冰生物成立于2010年,專注于空間轉(zhuǎn)錄組測序領(lǐng)域科研服務。濟南烈冰空間轉(zhuǎn)錄組測序服務單細胞測序是指針對單個細胞進行全轉(zhuǎn)錄組測序分析,可...

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