西安上海烈冰生物空間轉錄組數(shù)據(jù)分析可視化

烈冰提供空間轉錄組全流程服務，包括樣本包埋、貼片、選片、HE染色、拍照成像、組織透化、建庫測序以及后續(xù)的FISH驗證等各個步驟，為您提供無憂服務。烈冰搭建了以萊卡CM1950冷凍切片機、尼康多熒光通路全自動掃描顯微鏡、3Dhistech-midi數(shù)字掃描儀為基礎的先進實驗平臺，并制定嚴格規(guī)范的實驗室SOP，經(jīng)過大量的切片、貼片實操演練，對不同類型組織的切片厚度、溫度進行優(yōu)化，確保獲得更好質量的冷凍切片。利用NovelBrain云分析平臺，搭建0代碼需求的空間轉錄組分析流程，準確快速解析空間轉錄組數(shù)據(jù)。取同一樣本組織的相鄰區(qū)域進行單細胞轉錄組測序，通過單細胞轉錄組數(shù)據(jù)和空間轉錄組數(shù)據(jù)的整合分析，判定空間區(qū)域內的細胞類別，精確解析組織空間內的異質化信息。烈冰全線實驗平臺滿足超深度、大規(guī)模發(fā)現(xiàn)和復雜疾病研究的測序。西安上海烈冰生物空間轉錄組數(shù)據(jù)分析可視化

烈冰科技自主研發(fā)的單細胞云平臺致力于幫助每一位客戶定制化分析數(shù)據(jù)，深入解讀數(shù)據(jù)分析結果，深入挖掘其背后的生物學意義；從操作便捷、結果可視化、分析可追溯、系統(tǒng)穩(wěn)定等方面助力單細胞研究，加速科研進程！此外，烈冰生信團隊根據(jù)豐富的實戰(zhàn)經(jīng)驗為用戶量身打造了一款單細胞測序結果解讀的神兵利器——單細胞瀏覽器（SingleCellBrowser），不僅可以將海量復雜的結果文件可視化，還可以實現(xiàn)分析結果的三維立體化的展示呈現(xiàn)。專業(yè)的生信代碼交給專業(yè)的烈冰，專業(yè)的生物學意義交給專業(yè)的您！重慶scRNA空間轉錄組多組學測序空間轉錄組測序，上海烈冰生物科技很靠譜。

在轉錄組學領域，空間轉錄組也開辟了新世界。Nature Methods在今年1月份將空間轉錄組學評價為2020年度方法，空間轉錄組方法近幾年越來越受到歡迎，它將帶領組學在生物學的研究上進入新的階段。從轉錄組測序到實現(xiàn)單細胞轉錄測序，這一過程為精確認識不同細胞類型提供了巨大的幫助?，F(xiàn)在，新的空間轉錄組方法不僅帶來轉錄組信息，同時還提供空間信息，幫研究者更好辨別轉錄的位置，進一步擴展到單細胞分辨率，這會更大程度提升科學家對單個細胞的認識和解讀。

基于橋式PCR技術的簇生成可以將模版鏈迅速擴增成千上萬倍，保證過程中足夠的測序深度。測序時使用特殊標記的dNTP：1）堿基上通過敏感鍵修飾上不同的熒光基團，用于區(qū)分ATCG；2）3端使用疊氮基團封閉，保證一次循環(huán)只上一個dNTP。每一輪循環(huán)結束時，會通過高速熒光顯微鏡記錄熒光圖像，再通入試劑除去熒光基團和疊氮基團，開啟下一循環(huán)。通過分析讀取同一位點的熒光，實時獲取模版鏈的堿基序列。由于過程中使用的化學反應并不可控，隨著循環(huán)數(shù)的增大會出現(xiàn)不同步的情況，因此Illumina的讀長只能限制在200bp左右。空間轉錄組測序技術遍地開花，烈冰服務讓您的生物醫(yī)學研究如虎添翼。

細胞中基因的表達是嚴格按照時間和空間順序發(fā)生，因此細胞類型和基因表達具有時間特異性和空間特異性。時間特異性可以通過收集不同時間點的樣本進行單細胞轉錄組測序來分析。但是單細胞測序結果動輒上百G數(shù)據(jù)量，龐大的數(shù)據(jù)對于分析平臺和分析能力有著很高的要求，單細胞轉錄組測序（scRNA-Seq）在單細胞懸液制備的過程中破壞了細胞的空間結構，無法給出固態(tài)異質化組織中細胞空間排布信息。而空間轉錄組可以解決這個問題，其以點陣形式記錄組織切片細胞的空間信息。烈冰生物為您提供一站式全流程高通量測序服務。杭州烈冰科技空間轉錄組數(shù)據(jù)分析可視化

空間轉錄組測序技術的迅速發(fā)展和應用推廣，為從多維度揭示疾病進展提供了強有力的工具。西安上海烈冰生物空間轉錄組數(shù)據(jù)分析可視化

機體為響應各種應激，其細胞會從一種功能“狀態(tài)”轉變?yōu)榱硪环N功能“狀態(tài)”；當細胞在不同狀態(tài)之間轉變時，往往會經(jīng)歷轉錄重組，導致一些基因被“沉默”，一些基因被重新“喚醒”，但純化這些瞬態(tài)細胞進行研究是很困難或不可能的；scRNA-seq擬時序分析可以讓我們在不需要純化的情況下查看這些細胞狀態(tài)。擬時序分析，即根據(jù)不同細胞亞群基因表達量隨時間的變化情況，構建細胞譜系發(fā)育，但這里的時間并不是真時間，而是一個虛擬的時間，是指的細胞與細胞之間的轉化和演替的順序和軌跡。即使在同一個樣本中，也會存在多種不同的細胞形態(tài)。因此，不論測定了多少樣本，我們都可以采用擬時序分析對樣本中的細胞轉化和變化進行描述。西安上海烈冰生物空間轉錄組數(shù)據(jù)分析可視化

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