無錫單細(xì)胞多組學(xué)測(cè)序

來源: 發(fā)布時(shí)間:2022-09-07

據(jù)不完全統(tǒng)計(jì),截至2022年6月,烈冰生物助力發(fā)表單細(xì)胞文章近40篇,從平臺(tái)應(yīng)用比例來看,應(yīng)用10XGenomics和BDRhapsody兩大平臺(tái)發(fā)文比例各占50%左右,研究類型涵蓋疾病發(fā)展,靶點(diǎn)探索,免疫研究,神經(jīng)發(fā)育,干細(xì)胞分化,植物發(fā)育,退行病變,糖尿病,COVID-19等等研究;從發(fā)表期刊水平來看,烈冰生物聯(lián)合發(fā)表的單細(xì)胞文章,CNS一區(qū)期刊占比在30%以上,其中包括immunity三篇,Nature子刊3篇(Naturecellbiology,NaturePlants,Naturecommunication),風(fēng)濕類領(lǐng)域ARD期刊1篇,CUT1篇,AdvancedScience多篇,IF大于10分以上文章占比高達(dá)68.5%,烈冰專屬單細(xì)胞測(cè)序服務(wù)團(tuán)隊(duì),將與您攜手譜寫下一篇“高分”新文章。全線搭建BD Rahpsody單細(xì)胞測(cè)序平臺(tái)。無錫單細(xì)胞多組學(xué)測(cè)序

SingleCellSequencing技術(shù),即利用優(yōu)化后的高通量測(cè)序技術(shù)(NGS,NextGenerationSequencing)分析每一個(gè)單個(gè)細(xì)胞的序列信息,從而更高分辨率地揭示細(xì)胞間的細(xì)胞差異以及其在微環(huán)境中的功能情況。那么問題來了,如何獲得單個(gè)細(xì)胞?如果無法獲得單個(gè)細(xì)胞這一切都是不成立的;如何獲得大批量的單個(gè)細(xì)胞?單個(gè)組織細(xì)胞群體通常在百萬級(jí)別以上,如果被檢測(cè)的測(cè)序細(xì)胞數(shù)量過小精確度不足;如何低成本地獲得大批量單個(gè)細(xì)胞?單細(xì)胞測(cè)序成本非常高,尤其是需要測(cè)2000~3000個(gè)以上的細(xì)胞的時(shí)候,如果單個(gè)細(xì)胞的分選成本也很高,技術(shù)根本無法普及。所以,正因?yàn)檫@些問題的存在使得高通量測(cè)序在單個(gè)細(xì)胞測(cè)序應(yīng)用中的普及度一直不足,直到幾個(gè)單細(xì)胞測(cè)序突破性技術(shù)的誕生。珠海BD VDJ單細(xì)胞測(cè)序服務(wù)截至2022年6月,烈冰助力發(fā)表單細(xì)胞測(cè)序文章30+篇。

現(xiàn)有的單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)陣營(yíng)在幾個(gè)主要領(lǐng)域存在差別。一個(gè)是基于微流控通道的細(xì)胞與Beads的在通道內(nèi)的動(dòng)態(tài)結(jié)合,通過油相水相不相容的特點(diǎn)將結(jié)合了的細(xì)胞和Beads進(jìn)行分隔,在這個(gè)空間,單個(gè)細(xì)胞的內(nèi)容物釋放,轉(zhuǎn)錄本或其他生物分析物被標(biāo)記或添加索引,以便下游識(shí)別。BDRhapsody單細(xì)胞測(cè)序平臺(tái)采用靜態(tài)微孔技術(shù)(Cyto-Seq具有類似的技術(shù)原理)。通過微孔板的物理分隔,將一個(gè)個(gè)單個(gè)細(xì)胞和帶有標(biāo)簽的磁珠,一對(duì)一的“框”在微反應(yīng)的物理平臺(tái)中。這樣,每一個(gè)細(xì)胞都會(huì)結(jié)合一個(gè)磁珠,那么在每一個(gè)磁珠中上長(zhǎng)滿了不同的CellBarcode和UMIBarcode連接形成的序列,再加上一端PolyT的抓手,這個(gè)抓手就會(huì)使用oligodT抓住mRNA構(gòu)建文庫(kù)。

如在現(xiàn)有研究方法基礎(chǔ)上,進(jìn)行特定亞細(xì)胞區(qū)域的蛋白質(zhì)組學(xué)、相互作用蛋白質(zhì)組學(xué)以及某種特定翻譯后修飾類型的蛋白質(zhì)組學(xué)的研究等。這將有助于諸多生化過程以及致病機(jī)理的全新認(rèn)識(shí)與發(fā)現(xiàn)。隨著基于單細(xì)胞蛋白質(zhì)組學(xué)質(zhì)譜研究方法的不斷發(fā)展,單細(xì)胞分析方法的靈敏度、蛋白質(zhì)的覆蓋度、細(xì)胞通量、空間分辨率以及多組學(xué)的兼容能力會(huì)不斷突破我們的認(rèn)知極限。更重要的是,單細(xì)胞分析在臨床診斷、疾病分型以及細(xì)胞發(fā)展機(jī)制這些重大生命科學(xué)領(lǐng)域方面的應(yīng)用將會(huì)越來越大。對(duì)于消化背景雜,樣本初始數(shù)量少,關(guān)注粒細(xì)胞的項(xiàng)目,推薦您使用烈冰BD 單細(xì)胞測(cè)序平臺(tái)。

您的珍貴樣本,還可以放心依賴烈冰生物BDRhapsody單細(xì)胞捕獲系統(tǒng),BDRhapsodyTM單細(xì)胞捕獲系統(tǒng)采用微孔技術(shù),對(duì)細(xì)胞的捕獲沒有偏好性,實(shí)現(xiàn)高達(dá)80%的微孔板捕獲率,由于單個(gè)微孔板中容納了22萬+個(gè)微孔,而現(xiàn)階段單細(xì)胞測(cè)序?qū)嶒?yàn)技術(shù)通常要求單個(gè)樣本捕獲3000-5000,至高達(dá)10000個(gè)細(xì)胞,即可滿足科研探索需求,因此這種“泊松分布”的原理類似于上樣細(xì)胞的無限稀釋過程,但22萬+微孔的存在,也對(duì)大體量細(xì)胞數(shù)目的科學(xué)研究有很好的包容性,細(xì)胞通量分為可擴(kuò)展至100-40000個(gè)細(xì)胞的捕獲(單個(gè)微孔板),滿足您的多重需求。單細(xì)胞多組學(xué)測(cè)序可識(shí)別重要的轉(zhuǎn)錄因子,進(jìn)行譜系和發(fā)育追蹤。上海scRNA單細(xì)胞多組學(xué)測(cè)序

烈冰對(duì)于一個(gè)細(xì)胞群體中的每個(gè)細(xì)胞單獨(dú)進(jìn)行建庫(kù)測(cè)序分析。無錫單細(xì)胞多組學(xué)測(cè)序

烈冰生信團(tuán)隊(duì)傾情研發(fā)的NovelBrain®生信大數(shù)據(jù)分析平臺(tái),針對(duì)龐大的單細(xì)胞測(cè)序數(shù)據(jù),能夠?qū)崿F(xiàn)細(xì)胞類型鑒定的快、精、準(zhǔn):一鍵導(dǎo)入genelist構(gòu)建個(gè)性化基因列表;輕松一點(diǎn)即可展示Marker基因的Featureplot;任意修改Cluster的顏色和名稱助力高效鑒定細(xì)胞類型;一鍵獲得t-SNE圖、Heatmap和Violin圖:輕松獲得并下載基因表達(dá)的t-SNE圖、Heatmap、Violin圖,還可以通過調(diào)節(jié)寬、高和系數(shù)比例來調(diào)節(jié)美觀。平臺(tái)上線300+task自主分析工具、50+pipeline工作流模板,幫助烈冰生信分析團(tuán)隊(duì)和自主分析用戶實(shí)現(xiàn)分析工具和模板的快速調(diào)用和一站式全流程自動(dòng)化分析,節(jié)省工作時(shí)間并提升整體工作效率。無錫單細(xì)胞多組學(xué)測(cè)序

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