天津BD VDJ單細(xì)胞平臺(tái)

多樣本數(shù)據(jù)合并：FractionofReadsKept：合并樣本時(shí)，各樣本根據(jù)MappedBarcodedReadsperCell數(shù)量計(jì)算出來(lái)的數(shù)據(jù)利用率。如果各樣本間該參數(shù)值相差很大，需要進(jìn)行Downsample處理，以數(shù)據(jù)量少的樣本為基準(zhǔn)將不同樣本中細(xì)胞測(cè)序深度標(biāo)化到同一水平，從而避免因測(cè)序深度差異導(dǎo)致的基因檢測(cè)數(shù)量、基因表達(dá)水平的差異。烈冰科技自主研發(fā)的單細(xì)胞云平臺(tái)致力于幫助每一位客戶定制化分析數(shù)據(jù)，深度解讀數(shù)據(jù)分析結(jié)果，深入挖掘其背后的生物學(xué)意義；從操作便捷、結(jié)果可視化、分析可追溯、系統(tǒng)穩(wěn)定等方面助力單細(xì)胞研究，加速科研進(jìn)程！烈冰一站式單細(xì)胞測(cè)序服務(wù)：立足科學(xué)研究，解碼生命本質(zhì)。天津BD VDJ單細(xì)胞平臺(tái)

關(guān)于單細(xì)胞測(cè)序?qū)嶒?yàn)樣本制備，這與流式細(xì)胞術(shù)用戶熟悉的步驟完全一致，也就是通過(guò)酶促或機(jī)械消化、細(xì)胞分選或其他細(xì)胞分離技術(shù)從整個(gè)樣本中制備生成活的單細(xì)胞懸液。隨后是細(xì)胞計(jì)數(shù)和質(zhì)量控制步驟，以確保您的樣本有適當(dāng)濃度的活細(xì)胞，并且不含細(xì)胞團(tuán)塊和死細(xì)胞碎片。如有必要，您還可以使用抗體對(duì)樣本進(jìn)行染色，標(biāo)記細(xì)胞表面蛋白或其他生物分析物，或者通過(guò)FACS來(lái)富集感興趣的細(xì)胞類型。解離樣本時(shí)采取的具體步驟將根據(jù)您的起始材料和實(shí)驗(yàn)?zāi)繕?biāo)而定。也許需要額外的制備步驟，具體取決于組織質(zhì)量、樣本豐度、細(xì)胞大小，以及是否需要提取出細(xì)胞核進(jìn)行染色質(zhì)可接近性分析。無(wú)論具體的考慮因素如何，所有樣本類型都遵循同一個(gè)基本原則，那就是生成高質(zhì)量的單細(xì)胞懸液。廣州單細(xì)胞平臺(tái)截至2022年6月，烈冰助力發(fā)表單細(xì)胞測(cè)序文章30+篇。

根據(jù)烈冰多年單細(xì)胞測(cè)序服務(wù)經(jīng)驗(yàn)，為什么不建議您一味的追求高細(xì)胞數(shù)量的捕獲：?jiǎn)渭?xì)胞測(cè)序所有的分析都是基于細(xì)胞聚類進(jìn)行，而細(xì)胞聚類是在區(qū)分cell和non-cell后，獲得細(xì)胞基因表達(dá)譜，通過(guò)降維（pca），無(wú)監(jiān)督聚類以及可視化（t-SNE）得到的。進(jìn)行細(xì)胞聚類時(shí)需要考慮到每個(gè)細(xì)胞的基因表達(dá)模式，因此即使是相同的數(shù)據(jù)，在剔除幾個(gè)細(xì)胞的情況下，前后獲得的聚類圖也會(huì)出現(xiàn)明顯不同。而當(dāng)細(xì)胞捕獲數(shù)過(guò)多時(shí)，無(wú)論是假陰性和假陽(yáng)性數(shù)據(jù)還是多細(xì)胞數(shù)據(jù)，都會(huì)對(duì)正常細(xì)胞聚類產(chǎn)生影響，造成聚類結(jié)果失真。這也是很多文章，特別是很多高分文章，為什么單個(gè)樣本捕獲細(xì)胞數(shù)在2000-3000的原因了。烈冰建議單個(gè)樣本捕獲細(xì)胞數(shù)在3000-5000個(gè)時(shí)，數(shù)據(jù)量在100G左右時(shí)，可以滿足分析和文章發(fā)表的多重需求。

烈冰生物成立于2010年，與時(shí)俱進(jìn)，堅(jiān)持為科研學(xué)者提供國(guó)際前沿的高通量測(cè)序?qū)嶒?yàn)和深度的生物信息數(shù)據(jù)分析服務(wù)，已逐步發(fā)展為單細(xì)胞多組學(xué)檢測(cè)服務(wù)****。專注于“單細(xì)胞測(cè)序系列技術(shù)服務(wù)”的專精領(lǐng)域，在上海、北京、廣州、西安和江西等地?fù)碛袛?shù)千平辦公場(chǎng)所，并布局多中心產(chǎn)品研發(fā)生產(chǎn)基地和營(yíng)銷(xiāo)、運(yùn)營(yíng)中心。2016年起連續(xù)被評(píng)為上海市****，60+項(xiàng)自主知識(shí)產(chǎn)權(quán)，轉(zhuǎn)化率近80%。產(chǎn)品覆蓋從單細(xì)胞測(cè)序，核測(cè)序，單細(xì)胞多組學(xué)，空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序等多組學(xué)聯(lián)合的實(shí)驗(yàn)+數(shù)據(jù)分析全流程服務(wù)平臺(tái)。為600+國(guó)內(nèi)高校和醫(yī)院、5000+深度合作學(xué)者用戶、10000+生命科學(xué)探索的重要科研項(xiàng)目在醫(yī)藥開(kāi)發(fā)、科學(xué)研究、醫(yī)學(xué)及臨床研究，疾病分子標(biāo)志物篩選、生命和神經(jīng)發(fā)育研究等提供多層次、多組學(xué)檢測(cè)服務(wù)和解決方案，助力300+CNS國(guó)際學(xué)術(shù)期刊文章發(fā)表，30+篇單細(xì)胞技術(shù)聯(lián)合（助力）發(fā)文，IF10+文章占比＞65%。基于磁珠Barcode和UMI及polyT的探針結(jié)構(gòu)，精細(xì)區(qū)分上萬(wàn)個(gè)細(xì)胞中mRNA的來(lái)源及表達(dá)豐度。

BDRhapsody單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序是利用單細(xì)胞水平上的高通量測(cè)序分析基因表達(dá)譜的技術(shù)，突破傳統(tǒng)高通量測(cè)序的局限性，針對(duì)多種組織類型的樣本，采用BD細(xì)胞懸液制備protocol組織解離后，單個(gè)樣本一次上機(jī)能捕獲500-10000個(gè)細(xì)胞，基于每個(gè)細(xì)胞分別建庫(kù)測(cè)序，獲得單個(gè)細(xì)胞的基因結(jié)構(gòu)和基因表達(dá)狀態(tài)，并鑒定細(xì)胞的類型，可以在不同樣本間從細(xì)胞類型的組成和豐度角度進(jìn)行比較，反映細(xì)胞間的異質(zhì)性，提供足夠靈活的定制測(cè)定法以滿足多種實(shí)驗(yàn)需要，并有效縮短實(shí)驗(yàn)是時(shí)間和降低測(cè)序成本。對(duì)于消化背景雜，樣本初始數(shù)量少，關(guān)注粒細(xì)胞的項(xiàng)目，推薦您使用烈冰BD 單細(xì)胞測(cè)序平臺(tái)。溫州single cell 單細(xì)胞多組學(xué)測(cè)序

烈冰對(duì)于一個(gè)細(xì)胞群體中的每個(gè)細(xì)胞單獨(dú)進(jìn)行建庫(kù)測(cè)序分析。天津BD VDJ單細(xì)胞平臺(tái)

烈冰生物為您的實(shí)驗(yàn)定制工作流程：對(duì)于不同用戶和實(shí)驗(yàn)，單細(xì)胞實(shí)驗(yàn)工作流程往往需要不同程度的樣本操作、質(zhì)量和通量。BD儀器選項(xiàng)可以根據(jù)具體需求進(jìn)行配置。烈冰生物搭建BDFACS流式分選平臺(tái)（如BDFACSMelody），是上游樣本富集的良好選擇。此外，我們具備BDRhapsody單細(xì)胞成像儀提供自動(dòng)化細(xì)胞計(jì)數(shù)和細(xì)胞樣本活性測(cè)試，幫助用戶制備適用于Cartridge微孔板單細(xì)胞捕獲濃度的樣本。掃描儀提供了微孔板上磁珠捕獲細(xì)胞的計(jì)數(shù)。BDRhapsody樣品上樣工作站輕巧便攜，可在實(shí)驗(yàn)室內(nèi)輕松移動(dòng)。搭配烈冰傾情研發(fā)多年的成果NovelBrain生物信息大數(shù)據(jù)分析系統(tǒng)，完成測(cè)序數(shù)據(jù)的生物信息分析和結(jié)果可視化呈現(xiàn)。這些工具包括UMI分析算法和可視化工具，即使沒(méi)有經(jīng)驗(yàn)的用戶也可分析和理解單細(xì)胞數(shù)據(jù)。天津BD VDJ單細(xì)胞平臺(tái)

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