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由于高通量測序?qū)嶒灧椒ㄏ嚓P(guān)的測序成本,使得單細(xì)胞實驗往往非常昂貴,烈冰生物BDRhapsody單細(xì)胞測序服務(wù)珍視您的每一份樣本,在平臺搭建前,我們測試評估了BDRhapsody的性能,與BD官方公布的數(shù)據(jù)結(jié)合來看,將人293T和小鼠NIH/3T3細(xì)胞的1:1混合物以不同濃度上樣到BDRhapsody卡式芯片上。存儲的cDNA分子普遍擴(kuò)增并進(jìn)行低通量測序(每個細(xì)胞月8700個讀數(shù))。在測序數(shù)據(jù)中檢測到1109個細(xì)胞的上樣條件下,每個細(xì)胞中,來自每個細(xì)胞的平均99.4%的分子經(jīng)檢測為人或小鼠,這表明微孔之間的串?dāng)_非常小,在測序數(shù)據(jù)中檢測到1000個或更少細(xì)胞的上樣密度下,多重態(tài)發(fā)生率接近零,并且在15000個細(xì)胞下小于5%。單細(xì)胞測序因其強(qiáng)大的探究疾病--細(xì)胞--基因的關(guān)系,一度成為高通量測序技術(shù)的“天花板”。溫州single cell 單細(xì)胞測序
針對BDRhapsody單細(xì)胞捕獲平臺,烈冰生物提供專業(yè)的優(yōu)化試劑和專業(yè)知識:BDRhapsody試劑是轉(zhuǎn)為Rhapsody系統(tǒng)設(shè)計,旦性能已得到驗證的產(chǎn)品,因此研究人員可以專注于解決生物學(xué)問題,而不必花費時間應(yīng)對多組學(xué)分析的技術(shù)障礙。此外,我們還提基于BD平臺的單細(xì)胞多組學(xué)服務(wù),如Ab-Seq檢測試劑盒使用的抗體已在流式細(xì)胞分析中得到充分研究,這使得研究人員能夠建立真值并迅速加深對生物學(xué)系統(tǒng)的理解。作為BD中國單細(xì)胞聯(lián)合實驗室的合作伙伴,我們將繼續(xù)擴(kuò)展檢測試劑盒和試劑產(chǎn)品組合的范圍,以支持前沿多組學(xué)分析。我們經(jīng)驗豐富的專業(yè)客戶服務(wù)團(tuán)隊可在多組學(xué)分析的各個方面為您提供幫助。杭州single cell RNA單細(xì)胞服務(wù)機(jī)構(gòu)烈冰測序服務(wù)已助力300余篇國際期刊研究文章發(fā)表。
關(guān)于BDRhapsody單細(xì)胞平臺的樣本類型和樣本制備:在上機(jī)前需要注意細(xì)胞消化后的細(xì)胞團(tuán)塊,獲得分離良好的細(xì)胞懸液、且細(xì)胞活力高(>70%);此外,了解您所研究細(xì)胞的大小范圍也很重要。細(xì)胞大小通常與細(xì)胞表達(dá)的轉(zhuǎn)錄本數(shù)量有關(guān)。各種尺寸不同的細(xì)胞(一般直徑不大于50μm)均可與我們基因表達(dá)解決方案中使用的BDRhapsody平臺兼容。一般來說,細(xì)胞制備方案將根據(jù)組織來源和細(xì)胞類型而變化。每種組織類型都是獨特的,因此,必須在開始任何單細(xì)胞實驗之前優(yōu)化樣本制備,烈冰多年樣本解離消化經(jīng)驗,累積10+物種、50+組織的消化protocol,若您的樣本為組織,且尚未成功將組織樣本消化成單細(xì)胞懸液,烈冰將盡可能提供技術(shù)及實驗上的幫助。
基因和基因產(chǎn)物并不是單獨運作的,而是參與了相互關(guān)聯(lián)的復(fù)雜通路、網(wǎng)絡(luò)和分子系統(tǒng),這些合在一起實現(xiàn)了細(xì)胞、組織和生物體的運作。定義這些系統(tǒng)并確定它們的特征和相互作用,對于了解生物系統(tǒng)如何運作至關(guān)重要。”為了推動科學(xué)發(fā)現(xiàn),科學(xué)家們需要各種能夠幫助多方位了解其樣本的潛在生物復(fù)雜性的研究工具。對于越來越多的研究人員來說,單細(xì)胞RNA測序和單細(xì)胞多組學(xué)——即在單細(xì)胞分辨率下對基因表達(dá)及其他基于DNA、RNA或蛋白質(zhì)的分析物進(jìn)行定量分析的基因組方法——在幫助解決他們面臨的生物學(xué)問題上已證實是行之有效的。BD平臺基于cyto-seq技術(shù),實現(xiàn)細(xì)胞和磁珠的一對一結(jié)合。
烈冰生物在上海、北京、廣州、西安、江西等多地部署單細(xì)胞測序?qū)嶒灲M中心,多地部署搭建BDRhapsody單細(xì)胞實驗平臺,基于微孔的強(qiáng)大的高通量單細(xì)胞分析系統(tǒng),為您提供可靠的單細(xì)胞分析工作流程,該系統(tǒng)可通過簡單的唯恐把工作流程和多重條碼標(biāo)記系統(tǒng),對高通量單細(xì)胞進(jìn)行多組學(xué)的信息捕獲,由此捕獲的信息科進(jìn)一步生成各種類型的二代測序(NGS)文庫。之后對文庫進(jìn)行測序和基于NovelBrain生物大數(shù)據(jù)分析平臺(云平臺)的數(shù)據(jù)可視化分析,實現(xiàn)高位分辨率下的組織內(nèi)基因的表達(dá)差異和表達(dá)豐度?;诖胖锽arcode和UMI及polyT的探針結(jié)構(gòu),精細(xì)區(qū)分上萬個細(xì)胞中mRNA的來源及表達(dá)豐度。杭州single cell RNA單細(xì)胞服務(wù)機(jī)構(gòu)
十二年測序經(jīng)驗,烈冰生物單細(xì)胞多組學(xué)領(lǐng)域的佼佼者。溫州single cell 單細(xì)胞測序
什么時候要用到去死細(xì)胞的操作呢?跟進(jìn)烈冰生物多年單細(xì)胞測序服務(wù)經(jīng)驗來看,當(dāng)細(xì)胞懸液進(jìn)行質(zhì)量和活性檢測后,考慮對細(xì)胞活性在50%-70%的懸液進(jìn)行去除死細(xì)胞的操作。而太低活性的懸液(小于30%),懸液中細(xì)胞大量死亡,可能已經(jīng)丟失了原組織內(nèi)的細(xì)胞比例和狀態(tài),失真嚴(yán)重,建議重新收集樣本進(jìn)行新的實驗,保證數(shù)據(jù)的高質(zhì)量和實驗結(jié)果的準(zhǔn)確性。但需要注意到,去除死細(xì)胞的操作會損失一定的細(xì)胞數(shù)量,因此希望您在提供樣本時,盡可能提供足量的細(xì)胞,以備實驗過程中可能存在的細(xì)胞死亡的問題,BDRhapsody單細(xì)胞捕獲平臺對樣本起始細(xì)胞量的要求較低,一般提供10萬個細(xì)胞以上均可滿足需求,特殊樣本可詳細(xì)咨詢烈冰生物。溫州single cell 單細(xì)胞測序
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