樣本制備后的保存 為了盡可能地減少轉(zhuǎn)錄組的變化，在對(duì)細(xì)胞進(jìn)行清洗和計(jì)數(shù)后，單細(xì)胞懸液應(yīng)當(dāng)保存于冰上，直至用于后續(xù)的上機(jī)和文庫(kù)制備步驟。在理想狀況下，一旦制備好樣本，應(yīng)當(dāng)在3min鐘內(nèi)將其用于下游步驟。然而，您還有必要了解各類(lèi)細(xì)胞的不同性質(zhì)，因?yàn)檫@可能會(huì)影響細(xì)胞應(yīng)在冰上保存的時(shí)間，以及它們?cè)谥苽浜蠖嗑帽銘?yīng)當(dāng)被盡快使用。例如，有些細(xì)胞（如PBMC）如果在冰上放置一段時(shí)間，它們就開(kāi)始形成團(tuán)塊。這些團(tuán)塊很難解離，增加了堵塞的風(fēng)險(xiǎn)，而且每個(gè)團(tuán)塊被當(dāng)成單細(xì)胞計(jì)數(shù)，又降低了細(xì)胞計(jì)數(shù)的準(zhǔn)確性。此外，有些細(xì)胞更加粘稠，形成團(tuán)塊的速度更快。對(duì)于這些細(xì)胞，必須盡量減少制備和使用之間的時(shí)間差。此外，烈冰開(kāi)展了單細(xì)胞...

烈冰科技于2010年誕生之初便立足于高通量測(cè)序行業(yè)，為科研學(xué)者提供專注的測(cè)序數(shù)據(jù)分析服務(wù)，先后經(jīng)歷基因芯片時(shí)代、基因測(cè)序、轉(zhuǎn)錄組測(cè)序時(shí)代...在科技日新月異的洪流中始終獨(dú)占鰲頭。2018年以來(lái)，單細(xì)胞測(cè)序進(jìn)入發(fā)展的快車(chē)道，烈冰作為國(guó)內(nèi)首批引進(jìn)單細(xì)胞實(shí)驗(yàn)雙平臺(tái)的公司，依托自主研發(fā)的NovelBrain?生物大數(shù)據(jù)分析平臺(tái)，為用戶提供一站式全流程的單細(xì)胞測(cè)序服務(wù)和解決方案。4年的單細(xì)胞技術(shù)的積累，烈冰已具備大鼠、小鼠、斑馬魚(yú)、猴、裸鼴鼠、水稻、擬南芥等10+物種，皮膚、腦、脂肪、心臟、花序等50+組織類(lèi)型，100+細(xì)胞類(lèi)型，1000+靶標(biāo)基因，10000+樣本處理經(jīng)驗(yàn)。十二年測(cè)序經(jīng)驗(yàn)，烈冰生物單細(xì)...

什么時(shí)候要用到去死細(xì)胞的操作呢？跟進(jìn)烈冰生物多年單細(xì)胞測(cè)序服務(wù)經(jīng)驗(yàn)來(lái)看，當(dāng)細(xì)胞懸液進(jìn)行質(zhì)量和活性檢測(cè)后，考慮對(duì)細(xì)胞活性在50%-70%的懸液進(jìn)行去除死細(xì)胞的操作。而太低活性的懸液（小于30%），懸液中細(xì)胞大量死亡，可能已經(jīng)丟失了原組織內(nèi)的細(xì)胞比例和狀態(tài)，失真嚴(yán)重，建議重新收集樣本進(jìn)行新的實(shí)驗(yàn)，保證數(shù)據(jù)的高質(zhì)量和實(shí)驗(yàn)結(jié)果的準(zhǔn)確性。但需要注意到，去除死細(xì)胞的操作會(huì)損失一定的細(xì)胞數(shù)量，因此希望您在提供樣本時(shí)，盡可能提供足量的細(xì)胞，以備實(shí)驗(yàn)過(guò)程中可能存在的細(xì)胞死亡的問(wèn)題，BD Rhapsody單細(xì)胞捕獲平臺(tái)對(duì)樣本起始細(xì)胞量的要求較低，一般提供10萬(wàn)個(gè)細(xì)胞以上均可滿足需求，特殊樣本可詳細(xì)咨詢烈冰生物。單...

烈冰生物在上海、北京、廣州、西安、江西等多地部署單細(xì)胞測(cè)序?qū)嶒?yàn)組中心，多地部署搭建BD Rhapsody單細(xì)胞實(shí)驗(yàn)平臺(tái)，基于微孔的強(qiáng)大的高通量單細(xì)胞分析系統(tǒng)，為您提供可靠的單細(xì)胞分析工作流程，該系統(tǒng)可通過(guò)簡(jiǎn)單的唯恐把工作流程和多重條碼標(biāo)記系統(tǒng)，對(duì)高通量單細(xì)胞進(jìn)行多組學(xué)的信息捕獲，由此捕獲的信息科進(jìn)一步生成各種類(lèi)型的二代測(cè)序（NGS）文庫(kù)。之后對(duì)文庫(kù)進(jìn)行測(cè)序和基于NovelBrain生物大數(shù)據(jù)分析平臺(tái)（云平臺(tái)）的數(shù)據(jù)可視化分析，實(shí)現(xiàn)高位分辨率下的組織內(nèi)基因的表達(dá)差異和表達(dá)豐度。全線搭建BD Rahpsody單細(xì)胞測(cè)序平臺(tái)。成都single cell RNA單細(xì)胞平臺(tái)單細(xì)胞測(cè)序?qū)嶒?yàn)再樣本細(xì)胞上機(jī)分...

多樣本數(shù)據(jù)合并：Fraction of Reads Kept：合并樣本時(shí)，各樣本根據(jù)Mapped Barcoded Reads per Cell數(shù)量計(jì)算出來(lái)的數(shù)據(jù)利用率。如果各樣本間該參數(shù)值相差很大，需要進(jìn)行Downsample處理，以數(shù)據(jù)量少的樣本為基準(zhǔn)將不同樣本中細(xì)胞測(cè)序深度標(biāo)化到同一水平，從而避免因測(cè)序深度差異導(dǎo)致的基因檢測(cè)數(shù)量、基因表達(dá)水平的差異。烈冰科技自主研發(fā)的單細(xì)胞云平臺(tái)致力于幫助每一位客戶定制化分析數(shù)據(jù)，深度解讀數(shù)據(jù)分析結(jié)果，深入挖掘其背后的生物學(xué)意義；從操作便捷、結(jié)果可視化、分析可追溯、系統(tǒng)穩(wěn)定等方面助力單細(xì)胞研究，加速科研進(jìn)程！烈冰生物全國(guó)五大實(shí)驗(yàn)中心，多地部署B(yǎng)D Rah...

多樣本數(shù)據(jù)合并：Fraction of Reads Kept：合并樣本時(shí)，各樣本根據(jù)Mapped Barcoded Reads per Cell數(shù)量計(jì)算出來(lái)的數(shù)據(jù)利用率。如果各樣本間該參數(shù)值相差很大，需要進(jìn)行Downsample處理，以數(shù)據(jù)量少的樣本為基準(zhǔn)將不同樣本中細(xì)胞測(cè)序深度標(biāo)化到同一水平，從而避免因測(cè)序深度差異導(dǎo)致的基因檢測(cè)數(shù)量、基因表達(dá)水平的差異。烈冰科技自主研發(fā)的單細(xì)胞云平臺(tái)致力于幫助每一位客戶定制化分析數(shù)據(jù)，深度解讀數(shù)據(jù)分析結(jié)果，深入挖掘其背后的生物學(xué)意義；從操作便捷、結(jié)果可視化、分析可追溯、系統(tǒng)穩(wěn)定等方面助力單細(xì)胞研究，加速科研進(jìn)程！烈冰實(shí)驗(yàn)室包含從樣本處理到測(cè)序下機(jī)的全套實(shí)驗(yàn)平...

針對(duì)BD Rhapsody單細(xì)胞捕獲平臺(tái)，烈冰生物提供專業(yè)的優(yōu)化試劑和專業(yè)知識(shí)：BD Rhapsody試劑是轉(zhuǎn)為 Rhapsody 系統(tǒng)設(shè)計(jì)，旦性能已得到驗(yàn)證的產(chǎn)品，因此研究人員可以專注于解決生物學(xué)問(wèn)題，而不必花費(fèi)時(shí)間應(yīng)對(duì)多組學(xué)分析的技術(shù)障礙。此外，我們還提基于BD平臺(tái)的單細(xì)胞多組學(xué)服務(wù)，如Ab-Seq檢測(cè)試劑盒使用的抗體已在流式細(xì)胞分析中得到充分研究，這使得研究人員能夠建立真值并迅速加深對(duì)生物學(xué)系統(tǒng)的理解。作為BD中國(guó)單細(xì)胞聯(lián)合實(shí)驗(yàn)室的合作伙伴，我們將繼續(xù)擴(kuò)展檢測(cè)試劑盒和試劑產(chǎn)品組合的范圍，以支持前沿多組學(xué)分析。我們經(jīng)驗(yàn)豐富的專業(yè)客戶服務(wù)團(tuán)隊(duì)可在多組學(xué)分析的各個(gè)方面為您提供幫助。測(cè)序的革新讓...

從單細(xì)胞測(cè)序描述性分析轉(zhuǎn)向復(fù)雜樣本中不同細(xì)胞類(lèi)型的功能解析，越來(lái)越需要一種多組學(xué)的細(xì)胞生物學(xué)視角。通過(guò)單細(xì)胞多組學(xué)——即對(duì)不同組學(xué)的數(shù)據(jù)集進(jìn)行分析和整合——科學(xué)家能夠從同一個(gè)單細(xì)胞來(lái)源中檢測(cè)多種細(xì)胞特征。這些特征包括全轉(zhuǎn)錄組基因表達(dá)、細(xì)胞表面蛋白表達(dá)、免疫組庫(kù)序列（包括T細(xì)胞和B細(xì)胞受體）以及用于了解表觀基因組調(diào)控的開(kāi)放染色質(zhì)區(qū)域。隨著單個(gè)實(shí)驗(yàn)可提供更多信息豐富的數(shù)據(jù)，研究人員的獲益更多，包括保留珍貴樣本、提高生產(chǎn)力、減少因批次效應(yīng)引起的錯(cuò)誤，并節(jié)省更多的高科技資源（從資助基金到人員時(shí)間）。BD Scanner，是您實(shí)驗(yàn)過(guò)程的又一雙眼睛，實(shí)時(shí)監(jiān)測(cè)，精細(xì)質(zhì)控。成都BD Rhapsody單細(xì)胞測(cè)序...

現(xiàn)有的單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)陣營(yíng)在幾個(gè)主要領(lǐng)域存在差別。一個(gè)是基于微流控通道的細(xì)胞與Beads的在通道內(nèi)的動(dòng)態(tài)結(jié)合，通過(guò)油相水相不相容的特點(diǎn)將結(jié)合了的細(xì)胞和Beads進(jìn)行分隔，在這個(gè)空間，單個(gè)細(xì)胞的內(nèi)容物釋放，轉(zhuǎn)錄本或其他生物分析物被標(biāo)記或添加索引，以便下游識(shí)別。BD Rhapsody單細(xì)胞測(cè)序平臺(tái)采用靜態(tài)微孔技術(shù)（Cyto-Seq具有類(lèi)似的技術(shù)原理）。通過(guò)微孔板的物理分隔，將一個(gè)個(gè)單個(gè)細(xì)胞和帶有標(biāo)簽的磁珠，一對(duì)一的“框”在微反應(yīng)的物理平臺(tái)中。這樣，每一個(gè)細(xì)胞都會(huì)結(jié)合一個(gè)磁珠，那么在每一個(gè)磁珠中上長(zhǎng)滿了不同的Cell Barcode和UMI Barcode連接形成的序列，再加上一端PolyT的抓手，這...

烈冰生物單細(xì)胞測(cè)序服務(wù)，為您提供可視化質(zhì)控系統(tǒng)，保證每次實(shí)驗(yàn)的可靠性：BD Rhapsody 掃描儀具有直接成像功能，可在工作流程的不同階段進(jìn)行質(zhì)量控制，如細(xì)胞捕獲率和細(xì)胞多態(tài)率（雙細(xì)胞率）。成像儀指標(biāo)可以確認(rèn)起始細(xì)胞樣本的質(zhì)量，并確認(rèn)微孔板工作流程中每個(gè)步驟的成功完成狀態(tài) ；在細(xì)胞裂解前的步驟中評(píng)估細(xì)胞活性；并對(duì)通過(guò)測(cè)序確定的細(xì)胞回收量進(jìn)行可靠估算。利用這些信息，在進(jìn)行高成本的下游測(cè)序之前，用戶可根據(jù)需要改變方向并解決實(shí)驗(yàn)中遇到的問(wèn)題。這些指標(biāo)允許用戶對(duì)不同工作日間的或者不同研究中心間的工作流程性能進(jìn)行跟蹤。附加流式分選細(xì)胞表面Marker，對(duì)于較低分辨率的標(biāo)志物也能有效鑒定，助力高要求測(cè)序...

所謂的高通量測(cè)序技術(shù)，又名大規(guī)模平行測(cè)序，是將 DNA（或者 cDNA）隨機(jī)片段化、加接頭，制備測(cè)序文庫(kù)，通過(guò)對(duì)文庫(kù)中數(shù)以萬(wàn)計(jì)的克隆(colony)進(jìn)行延伸反應(yīng)，檢測(cè)對(duì)應(yīng)的信號(hào)，獲取序列信息。與傳統(tǒng)測(cè)序法（Sanger法等）相比，高通量測(cè)序技術(shù)在處理大規(guī)模樣品時(shí)具有明顯的優(yōu)勢(shì)，又快（兩天）又多（數(shù)百萬(wàn)克?。?，成為目前組學(xué)研究的主要技術(shù)。單細(xì)胞測(cè)序是一個(gè)系統(tǒng)的工程，開(kāi)展項(xiàng)目前您可能會(huì)先評(píng)估它提供的見(jiàn)解是否與您的研究問(wèn)題相匹配，如果匹配，實(shí)驗(yàn)過(guò)程如何規(guī)劃，實(shí)驗(yàn)平臺(tái)如何選擇，樣本如何制備，數(shù)據(jù)如何分析等等，而在這一切開(kāi)始之前，我們的服務(wù)就已經(jīng)開(kāi)始了，從銷(xiāo)售到實(shí)驗(yàn)到專業(yè)技術(shù)支持，我們開(kāi)通全線對(duì)接渠道，...

機(jī)體為響應(yīng)各種應(yīng)激，其細(xì)胞會(huì)從一種功能“狀態(tài)”轉(zhuǎn)變?yōu)榱硪环N功能“狀態(tài)”；當(dāng)細(xì)胞在不同狀態(tài)之間轉(zhuǎn)變時(shí)，往往會(huì)經(jīng)歷轉(zhuǎn)錄重組，導(dǎo)致一些基因被沉默，一些基因被重新“喚醒”，但純化這些瞬態(tài)細(xì)胞進(jìn)行研究是很困難或不可能的；scRNA-seq擬時(shí)序分析可以讓我們?cè)诓恍枰兓那闆r下查看這些細(xì)胞狀態(tài)。擬時(shí)序分析，即根據(jù)不同細(xì)胞亞群基因表達(dá)量隨時(shí)間的變化情況，構(gòu)建細(xì)胞譜系發(fā)育，但這里的時(shí)間并不是真時(shí)間，而是一個(gè)虛擬的時(shí)間，是指的細(xì)胞與細(xì)胞之間的轉(zhuǎn)化和演替的順序和軌跡。即使在同一個(gè)樣本中，也會(huì)存在多種不同的細(xì)胞形態(tài)。因此，不論測(cè)定了多少樣本，我們都可以采用擬時(shí)序分析對(duì)樣本中的細(xì)胞轉(zhuǎn)化和變化進(jìn)行描述。烈冰生物成立于...

科研的魅力之處，在于無(wú)窮盡的探尋生命的本底，通過(guò)單細(xì)胞測(cè)序，我們對(duì)組織的分子基礎(chǔ)的研究也從初級(jí)到深層，并在單細(xì)胞層面逐漸達(dá)成一致，那么不禁要問(wèn)一句，組織的空間位置到底重不重要？空間異質(zhì)性是功能的關(guān)鍵特征，細(xì)胞的位置信息更能反應(yīng)細(xì)胞命運(yùn)調(diào)控機(jī)制和細(xì)胞譜系發(fā)生過(guò)程。因此時(shí)間和空間即像組織的AB面，而不可否認(rèn)的是，此時(shí)空間坐標(biāo)的記錄，像一個(gè)還未長(zhǎng)大的娃娃，雖未觸及分子基礎(chǔ)研究的深層，但仍在努力攀登探尋生命本底的下一個(gè)高峰。BD單細(xì)胞測(cè)序平臺(tái)同時(shí)兼容單細(xì)胞蛋白組測(cè)序（Ab-seq）和免疫組庫(kù)測(cè)序等工作。蘇州BD單細(xì)胞實(shí)驗(yàn)服務(wù)作為單細(xì)胞測(cè)序的又一個(gè)重要里程碑，BD Rhapsody單細(xì)胞捕獲平臺(tái)整合了儀...

針對(duì)單細(xì)胞測(cè)序的細(xì)胞數(shù)量判斷環(huán)節(jié)：主要是對(duì)細(xì)胞數(shù)量、基因表達(dá)量、測(cè)序質(zhì)量進(jìn)行整體描述。過(guò)濾標(biāo)準(zhǔn)：由于細(xì)胞破碎后游離RNA會(huì)釋放到環(huán)境或孔中，并且測(cè)序中也會(huì)存在一些死細(xì)胞，導(dǎo)致數(shù)據(jù)存在background值。因此，我們需要設(shè)定一定的標(biāo)準(zhǔn)來(lái)過(guò)濾掉假細(xì)胞或死細(xì)胞。以10× Genomics為例，細(xì)胞數(shù)量判斷主要通過(guò)分析UMI Counts-Barcode曲線斜率拐點(diǎn)，當(dāng)存在多個(gè)斜率拐點(diǎn)的時(shí)候，結(jié)合預(yù)期UMI=500時(shí)的細(xì)胞數(shù)量進(jìn)行過(guò)濾。當(dāng)斜率拐點(diǎn)低于UMI=500的時(shí)候，選擇UMI=500作為細(xì)胞的判斷的標(biāo)準(zhǔn)；否則，選擇和預(yù)期細(xì)胞數(shù)量接近的拐點(diǎn)作為細(xì)胞判斷的位置。這樣我們能夠有效獲得真實(shí)的并且在基因...

根據(jù)烈冰多年單細(xì)胞測(cè)序服務(wù)經(jīng)驗(yàn)，為什么不建議您一味的追求高細(xì)胞數(shù)量的捕獲：?jiǎn)渭?xì)胞測(cè)序所有的分析都是基于細(xì)胞聚類(lèi)進(jìn)行，而細(xì)胞聚類(lèi)是在區(qū)分cell和non-cell后，獲得細(xì)胞基因表達(dá)譜，通過(guò)降維（pca），無(wú)監(jiān)督聚類(lèi)以及可視化（t-SNE）得到的。進(jìn)行細(xì)胞聚類(lèi)時(shí)需要考慮到每個(gè)細(xì)胞的基因表達(dá)模式，因此即使是相同的數(shù)據(jù)，在剔除幾個(gè)細(xì)胞的情況下，前后獲得的聚類(lèi)圖也會(huì)出現(xiàn)明顯不同。而當(dāng)細(xì)胞捕獲數(shù)過(guò)多時(shí)，無(wú)論是假陰性和假陽(yáng)性數(shù)據(jù)還是多細(xì)胞數(shù)據(jù)，都會(huì)對(duì)正常細(xì)胞聚類(lèi)產(chǎn)生影響，造成聚類(lèi)結(jié)果失真。這也是很多文章，特別是很多高分文章，為什么單個(gè)樣本捕獲細(xì)胞數(shù)在2000-3000的原因了。烈冰建議單個(gè)樣本捕獲細(xì)胞數(shù)在...

您的珍貴樣本，可以放心依賴烈冰生物BD Rhapsody單細(xì)胞捕獲系統(tǒng)，首先，該系統(tǒng)的技術(shù)原理是基于cyto-seq的微孔技術(shù)，因此不會(huì)因?yàn)闃颖炯?xì)胞體積太大或懸液背景太雜等問(wèn)題導(dǎo)致捕獲通道的堵塞進(jìn)而導(dǎo)致樣本的損失；其次，BD RhapsodyTM單細(xì)胞捕獲系統(tǒng)無(wú)電子元件，便于攜帶，當(dāng)您的樣本需及時(shí)實(shí)驗(yàn)時(shí)，我們可以“拎包上門(mén)”，快速的完成細(xì)胞捕獲部分，不至于珍貴樣本因細(xì)胞活性快速下降帶來(lái)的損失；在這，BD Rhapsody單細(xì)胞捕獲系統(tǒng)對(duì)細(xì)胞數(shù)量包容性較好，細(xì)胞懸液上樣量高達(dá)575ul，針對(duì)樣本中細(xì)胞數(shù)量較少的組織類(lèi)型，也能完成整個(gè)項(xiàng)目的細(xì)胞捕獲工作。截至2022年6月，烈冰助力發(fā)表單細(xì)胞測(cè)序文...

烈冰生物在上海、北京、廣州、西安、江西等多地部署單細(xì)胞測(cè)序?qū)嶒?yàn)組中心，多地部署搭建BD Rhapsody單細(xì)胞實(shí)驗(yàn)平臺(tái)，基于微孔的強(qiáng)大的高通量單細(xì)胞分析系統(tǒng)，為您提供可靠的單細(xì)胞分析工作流程，該系統(tǒng)可通過(guò)簡(jiǎn)單的唯恐把工作流程和多重條碼標(biāo)記系統(tǒng)，對(duì)高通量單細(xì)胞進(jìn)行多組學(xué)的信息捕獲，由此捕獲的信息科進(jìn)一步生成各種類(lèi)型的二代測(cè)序（NGS）文庫(kù)。之后對(duì)文庫(kù)進(jìn)行測(cè)序和基于NovelBrain生物大數(shù)據(jù)分析平臺(tái)（云平臺(tái)）的數(shù)據(jù)可視化分析，實(shí)現(xiàn)高位分辨率下的組織內(nèi)基因的表達(dá)差異和表達(dá)豐度。對(duì)于消化背景雜，樣本初始數(shù)量少，關(guān)注粒細(xì)胞的項(xiàng)目，推薦您使用烈冰BD 單細(xì)胞測(cè)序平臺(tái)。杭州single cell RNA...

單細(xì)胞測(cè)序?qū)嶒?yàn)再樣本細(xì)胞上機(jī)分選簽，需要對(duì)細(xì)胞數(shù)量、細(xì)胞活性進(jìn)準(zhǔn)判斷，這對(duì)Single Cell分選標(biāo)記、建庫(kù)、下機(jī)數(shù)據(jù)的質(zhì)量都具有著決定性的作用。如若細(xì)胞計(jì)數(shù)偏高，將會(huì)影響建庫(kù)的成功率；計(jì)數(shù)偏低，則會(huì)提高雙細(xì)胞的比例；而細(xì)胞活率過(guò)低，就會(huì)使測(cè)序數(shù)據(jù)的利用率大打折扣，因此把好單細(xì)胞懸液質(zhì)量這一關(guān)尤為重要。而在鋪板過(guò)程中，由于不同操作人員手法具有不可避免的差異，不同的液體流速將直接影響單細(xì)胞的入孔效果。因此烈冰生物BD Rhapsody單細(xì)胞分選平臺(tái)配套了專門(mén)定制的電動(dòng)移液器，其具有Prime Treat、Cell Load、Bead Load、Wash、Lysis、Retrieval多種操作模...

單細(xì)胞測(cè)序結(jié)果動(dòng)輒上百G數(shù)據(jù)量，龐大的數(shù)據(jù)對(duì)于分析平臺(tái)和分析能力有著很高的要求，首先針對(duì)下機(jī)數(shù)據(jù)的質(zhì)控環(huán)節(jié)：?jiǎn)渭?xì)胞測(cè)序產(chǎn)生數(shù)億的結(jié)果序列，不可避免的會(huì)出現(xiàn)低質(zhì)量的測(cè)序結(jié)果，存在各種情況的序列污染。因此序列過(guò)濾及質(zhì)量評(píng)估就會(huì)變得極為重要。序列質(zhì)量主要通過(guò)測(cè)序質(zhì)量值Q20/Q30的占比來(lái)表征，即堿基測(cè)序結(jié)果的錯(cuò)誤率在1% / 0.1%以下的比例。理想的測(cè)序結(jié)果reads的堿基質(zhì)量均高于30。保證數(shù)據(jù)獲得后的處理結(jié)果的準(zhǔn)確性，為后續(xù)細(xì)胞類(lèi)型鑒定和功能分析打下堅(jiān)實(shí)基礎(chǔ)。附加流式分選細(xì)胞表面Marker，對(duì)于較低分辨率的標(biāo)志物也能有效鑒定，助力高要求測(cè)序項(xiàng)目。長(zhǎng)沙BD單細(xì)胞平臺(tái)烈冰生物成立于2010年，...

現(xiàn)有的單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)陣營(yíng)在幾個(gè)主要領(lǐng)域存在差別。一個(gè)是基于微流控通道的細(xì)胞與Beads的在通道內(nèi)的動(dòng)態(tài)結(jié)合，通過(guò)油相水相不相容的特點(diǎn)將結(jié)合了的細(xì)胞和Beads進(jìn)行分隔，在這個(gè)空間，單個(gè)細(xì)胞的內(nèi)容物釋放，轉(zhuǎn)錄本或其他生物分析物被標(biāo)記或添加索引，以便下游識(shí)別。BD Rhapsody單細(xì)胞測(cè)序平臺(tái)采用靜態(tài)微孔技術(shù)（Cyto-Seq具有類(lèi)似的技術(shù)原理）。通過(guò)微孔板的物理分隔，將一個(gè)個(gè)單個(gè)細(xì)胞和帶有標(biāo)簽的磁珠，一對(duì)一的“框”在微反應(yīng)的物理平臺(tái)中。這樣，每一個(gè)細(xì)胞都會(huì)結(jié)合一個(gè)磁珠，那么在每一個(gè)磁珠中上長(zhǎng)滿了不同的Cell Barcode和UMI Barcode連接形成的序列，再加上一端PolyT的抓手，這...

樣本制備后的保存 為了盡可能地減少轉(zhuǎn)錄組的變化，在對(duì)細(xì)胞進(jìn)行清洗和計(jì)數(shù)后，單細(xì)胞懸液應(yīng)當(dāng)保存于冰上，直至用于后續(xù)的上機(jī)和文庫(kù)制備步驟。在理想狀況下，一旦制備好樣本，應(yīng)當(dāng)在3min鐘內(nèi)將其用于下游步驟。然而，您還有必要了解各類(lèi)細(xì)胞的不同性質(zhì)，因?yàn)檫@可能會(huì)影響細(xì)胞應(yīng)在冰上保存的時(shí)間，以及它們?cè)谥苽浜蠖嗑帽銘?yīng)當(dāng)被盡快使用。例如，有些細(xì)胞（如PBMC）如果在冰上放置一段時(shí)間，它們就開(kāi)始形成團(tuán)塊。這些團(tuán)塊很難解離，增加了堵塞的風(fēng)險(xiǎn)，而且每個(gè)團(tuán)塊被當(dāng)成單細(xì)胞計(jì)數(shù)，又降低了細(xì)胞計(jì)數(shù)的準(zhǔn)確性。此外，有些細(xì)胞更加粘稠，形成團(tuán)塊的速度更快。對(duì)于這些細(xì)胞，必須盡量減少制備和使用之間的時(shí)間差。助力探索生命時(shí)空多維度...

烈冰生物單細(xì)胞測(cè)序服務(wù)體系，不僅提供10X Genomics和BD Rhapsody兩大國(guó)際認(rèn)可的單細(xì)胞實(shí)驗(yàn)平臺(tái)，在“附加”產(chǎn)品上，我們提供BD FACS Melody流式細(xì)胞儀，滿足您對(duì)特殊細(xì)胞類(lèi)型的富集需求，自主研發(fā)的Panocell單細(xì)胞捕獲芯片，可兼容BD 平臺(tái)全套原裝磁珠、試劑和protocol,為您提供完整的單細(xì)胞多組學(xué)解決方案。從細(xì)胞多樣本分析和染色所需的試劑到檢測(cè)試劑盒，生物信息分析工具，和在線大數(shù)據(jù)分析系統(tǒng)、精簡(jiǎn)方案和專業(yè)團(tuán)隊(duì)技術(shù)支持，烈冰生物可為您提供用于單細(xì)胞多組學(xué)甚至到空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序的各種工具，助您加速科研探索之旅。個(gè)性化制定測(cè)序項(xiàng)目方面，滿足從檢測(cè)基因到蛋白的多組學(xué)測(cè)...

您的珍貴樣本，還可以放心依賴烈冰生物BD Rhapsody單細(xì)胞捕獲系統(tǒng)，BD RhapsodyTM單細(xì)胞捕獲系統(tǒng)采用微孔技術(shù)，對(duì)細(xì)胞的捕獲沒(méi)有偏好性，實(shí)現(xiàn)高達(dá)80%的微孔板捕獲率，由于單個(gè)微孔板中容納了22萬(wàn)+個(gè)微孔，而現(xiàn)階段單細(xì)胞測(cè)序?qū)嶒?yàn)技術(shù)通常要求單個(gè)樣本捕獲3000-5000，至高達(dá)10000個(gè)細(xì)胞，即可滿足科研探索需求，因此這種“泊松分布”的原理類(lèi)似于上樣細(xì)胞的無(wú)限稀釋過(guò)程，但22萬(wàn)+微孔的存在，也對(duì)大體量細(xì)胞數(shù)目的科學(xué)研究有很好的包容性，細(xì)胞通量分為可擴(kuò)展至100-40000個(gè)細(xì)胞的捕獲（單個(gè)微孔板），滿足您的多重需求。豐富的測(cè)序和數(shù)據(jù)分析經(jīng)驗(yàn)，烈冰配套全程個(gè)性化、定制化地?cái)?shù)據(jù)分析...

Single Cell Sequencing技術(shù)，即利用優(yōu)化后的高通量測(cè)序技術(shù)（NGS，Next Generation Sequencing）分析每一個(gè)單個(gè)細(xì)胞的序列信息，從而更高分辨率地揭示細(xì)胞間的細(xì)胞差異以及其在微環(huán)境中的功能情況。那么問(wèn)題來(lái)了，如何獲得單個(gè)細(xì)胞？如果無(wú)法獲得單個(gè)細(xì)胞這一切都是不成立的；如何獲得大批量的單個(gè)細(xì)胞？單個(gè)組織細(xì)胞群體通常在百萬(wàn)級(jí)別以上，如果被檢測(cè)的測(cè)序細(xì)胞數(shù)量過(guò)小精確度不足；如何低成本地獲得大批量單個(gè)細(xì)胞？單細(xì)胞測(cè)序成本非常高，尤其是需要測(cè)2000~3000個(gè)以上的細(xì)胞的時(shí)候，如果單個(gè)細(xì)胞的分選成本也很高，技術(shù)根本無(wú)法普及。所以，正因?yàn)檫@些問(wèn)題的存在使得高通量測(cè)...

針對(duì)單細(xì)胞測(cè)序數(shù)據(jù)分析時(shí)的reads數(shù)、基因表達(dá)量及細(xì)胞數(shù)量判定過(guò)程中：以捕獲5000個(gè)細(xì)胞、100G的測(cè)序量為標(biāo)準(zhǔn)，每個(gè)細(xì)胞的reads數(shù)大約在50k左右；每個(gè)細(xì)胞的基因中位數(shù)取決于樣本的細(xì)胞類(lèi)型，例如成熟的B，T，粒細(xì)胞數(shù)量較多的組織中，由于該類(lèi)型細(xì)胞表達(dá)的基因數(shù)普遍較少，導(dǎo)致基因中位數(shù)下降。而某些疾病組織、或者體外培養(yǎng)的如干細(xì)胞等，他們的基因表達(dá)數(shù)較高，甚至可以超過(guò)1W，這就導(dǎo)致該類(lèi)樣本基因中位數(shù)非常高。因此，我們對(duì)細(xì)胞數(shù)量以及基因中位數(shù)確認(rèn)時(shí)，需要考察實(shí)際組織的細(xì)胞組成。搭建多種測(cè)序數(shù)據(jù)的生物信息分析平臺(tái)，5000+項(xiàng)目檢驗(yàn)，真實(shí)可信賴。湖北BD單細(xì)胞測(cè)序烈冰生物成立于2010年，與時(shí)...

根據(jù)烈冰多年單細(xì)胞測(cè)序服務(wù)經(jīng)驗(yàn)，為什么不建議您一味的追求高細(xì)胞數(shù)量的捕獲：?jiǎn)渭?xì)胞測(cè)序所有的分析都是基于細(xì)胞聚類(lèi)進(jìn)行，而細(xì)胞聚類(lèi)是在區(qū)分cell和non-cell后，獲得細(xì)胞基因表達(dá)譜，通過(guò)降維（pca），無(wú)監(jiān)督聚類(lèi)以及可視化（t-SNE）得到的。進(jìn)行細(xì)胞聚類(lèi)時(shí)需要考慮到每個(gè)細(xì)胞的基因表達(dá)模式，因此即使是相同的數(shù)據(jù)，在剔除幾個(gè)細(xì)胞的情況下，前后獲得的聚類(lèi)圖也會(huì)出現(xiàn)明顯不同。而當(dāng)細(xì)胞捕獲數(shù)過(guò)多時(shí)，無(wú)論是假陰性和假陽(yáng)性數(shù)據(jù)還是多細(xì)胞數(shù)據(jù)，都會(huì)對(duì)正常細(xì)胞聚類(lèi)產(chǎn)生影響，造成聚類(lèi)結(jié)果失真。這也是很多文章，特別是很多高分文章，為什么單個(gè)樣本捕獲細(xì)胞數(shù)在2000-3000的原因了。烈冰建議單個(gè)樣本捕獲細(xì)胞數(shù)在...

烈冰科技自主研發(fā)的單細(xì)胞云平臺(tái)致力于幫助每一位客戶定制化分析數(shù)據(jù)，深度解讀數(shù)據(jù)分析結(jié)果，深入挖掘其背后的生物學(xué)意義；從操作便捷、結(jié)果可視化、分析可追溯、系統(tǒng)穩(wěn)定等方面助力單細(xì)胞研究，加速科研進(jìn)程！此外，烈冰生信團(tuán)隊(duì)根據(jù)豐富的實(shí)戰(zhàn)經(jīng)驗(yàn)為用戶量身打造了一款單細(xì)胞測(cè)序結(jié)果解讀的神兵利器——單細(xì)胞瀏覽器（Single Cell Browser），不但可以將海量復(fù)雜的結(jié)果文件可視化，還是可以實(shí)現(xiàn)三維立體化展示的軟件。專業(yè)的生信代碼交給專業(yè)的烈冰，專業(yè)的生物學(xué)意義交給專業(yè)的您！BD 單細(xì)胞捕獲平臺(tái)搭配BD Scanner，全流程實(shí)時(shí)質(zhì)控，項(xiàng)目質(zhì)量盡在掌握。濟(jì)南scRNA單細(xì)胞測(cè)序服務(wù)單細(xì)胞測(cè)序龐大的數(shù)據(jù)烈...

您的珍貴樣本，可以放心依賴烈冰生物BD Rhapsody單細(xì)胞捕獲系統(tǒng)，首先，該系統(tǒng)的技術(shù)原理是基于cyto-seq的微孔技術(shù)，因此不會(huì)因?yàn)闃颖炯?xì)胞體積太大或懸液背景太雜等問(wèn)題導(dǎo)致捕獲通道的堵塞進(jìn)而導(dǎo)致樣本的損失；其次，BD RhapsodyTM單細(xì)胞捕獲系統(tǒng)無(wú)電子元件，便于攜帶，當(dāng)您的樣本需及時(shí)實(shí)驗(yàn)時(shí)，我們可以“拎包上門(mén)”，快速的完成細(xì)胞捕獲部分，不至于珍貴樣本因細(xì)胞活性快速下降帶來(lái)的損失；在這，BD Rhapsody單細(xì)胞捕獲系統(tǒng)對(duì)細(xì)胞數(shù)量包容性較好，細(xì)胞懸液上樣量高達(dá)575ul，針對(duì)樣本中細(xì)胞數(shù)量較少的組織類(lèi)型，也能完成整個(gè)項(xiàng)目的細(xì)胞捕獲工作。從樣本處理到終端數(shù)據(jù)分析，只要您需要，烈冰提...

對(duì)于單細(xì)胞測(cè)序而言，常常需要先構(gòu)建細(xì)胞圖譜，在此基礎(chǔ)上再開(kāi)展后續(xù)各項(xiàng)分析，并且數(shù)據(jù)分析時(shí)以細(xì)胞聚類(lèi)（cell cluster）為討論對(duì)象，而不是像常規(guī)Bulk測(cè)序一樣以組別為分析對(duì)象，因此單細(xì)胞測(cè)序項(xiàng)目對(duì)樣本入組要求沒(méi)有Bulk測(cè)序那樣嚴(yán)格，但是單細(xì)胞測(cè)序，特別是目的為圖譜研究時(shí)，需要通過(guò)提高樣本復(fù)雜度（增加樣本數(shù)），盡可能的構(gòu)建某一疾病類(lèi)型、群體細(xì)胞圖譜信息。因此，單細(xì)胞測(cè)序?qū)嶒?yàn)設(shè)計(jì)時(shí)首先需要保證生物學(xué)重復(fù)，不同樣本來(lái)源的樣本建議單獨(dú)進(jìn)行細(xì)胞解離和捕獲、建庫(kù)、測(cè)序，以保證捕獲到足夠的細(xì)胞數(shù)，單個(gè)樣本分別捕獲細(xì)胞時(shí)，后續(xù)分析除了整體分析以外，還可以做單樣本分析，保證分析的完備準(zhǔn)確性。烈冰BD ...

從單細(xì)胞測(cè)序描述性分析轉(zhuǎn)向復(fù)雜樣本中不同細(xì)胞類(lèi)型的功能解析，越來(lái)越需要一種多組學(xué)的細(xì)胞生物學(xué)視角。通過(guò)單細(xì)胞多組學(xué)——即對(duì)不同組學(xué)的數(shù)據(jù)集進(jìn)行分析和整合——科學(xué)家能夠從同一個(gè)單細(xì)胞來(lái)源中檢測(cè)多種細(xì)胞特征。這些特征包括全轉(zhuǎn)錄組基因表達(dá)、細(xì)胞表面蛋白表達(dá)、免疫組庫(kù)序列（包括T細(xì)胞和B細(xì)胞受體）以及用于了解表觀基因組調(diào)控的開(kāi)放染色質(zhì)區(qū)域。隨著單個(gè)實(shí)驗(yàn)可提供更多信息豐富的數(shù)據(jù)，研究人員的獲益更多，包括保留珍貴樣本、提高生產(chǎn)力、減少因批次效應(yīng)引起的錯(cuò)誤，并節(jié)省更多的高科技資源（從資助基金到人員時(shí)間）。十二年測(cè)序經(jīng)驗(yàn)，烈冰生物單細(xì)胞多組學(xué)領(lǐng)域的佼佼者。蘇州single cell RNA單細(xì)胞平臺(tái)單細(xì)胞測(cè)序...