杭州single cell 單細胞平臺

來源: 發(fā)布時間:2022-07-24

Single Cell Sequencing技術,即利用優(yōu)化后的高通量測序技術(NGS,Next Generation Sequencing)分析每一個單個細胞的序列信息,從而更高分辨率地揭示細胞間的細胞差異以及其在微環(huán)境中的功能情況。那么問題來了,如何獲得單個細胞?如果無法獲得單個細胞這一切都是不成立的;如何獲得大批量的單個細胞?單個組織細胞群體通常在百萬級別以上,如果被檢測的測序細胞數(shù)量過小精確度不足;如何低成本地獲得大批量單個細胞?單細胞測序成本非常高,尤其是需要測2000~3000個以上的細胞的時候,如果單個細胞的分選成本也很高,技術根本無法普及。所以,正因為這些問題的存在使得高通量測序在單個細胞測序應用中的普及度一直不足,直到幾個單細胞測序突破性技術的誕生。搭配BD FACSMelody流式分選儀,全線搭建BD Rahpsody單細胞測序平臺。杭州single cell 單細胞平臺

針對單細胞測序的細胞數(shù)量判斷環(huán)節(jié):主要是對細胞數(shù)量、基因表達量、測序質量進行整體描述。過濾標準:由于細胞破碎后游離RNA會釋放到環(huán)境或孔中,并且測序中也會存在一些死細胞,導致數(shù)據(jù)存在background值。因此,我們需要設定一定的標準來過濾掉假細胞或死細胞。以10× Genomics為例,細胞數(shù)量判斷主要通過分析UMI Counts-Barcode曲線斜率拐點,當存在多個斜率拐點的時候,結合預期UMI=500時的細胞數(shù)量進行過濾。當斜率拐點低于UMI=500的時候,選擇UMI=500作為細胞的判斷的標準;否則,選擇和預期細胞數(shù)量接近的拐點作為細胞判斷的位置。這樣我們能夠有效獲得真實的并且在基因數(shù)量上可以分析的數(shù)據(jù)。江蘇BD VDJ單細胞測序服務助力探索生命時空多維度的動態(tài)變化的生物學信息;助力醫(yī)療健康時代!

從單細胞測序描述性分析轉向復雜樣本中不同細胞類型的功能解析,越來越需要一種多組學的細胞生物學視角。通過單細胞多組學——即對不同組學的數(shù)據(jù)集進行分析和整合——科學家能夠從同一個單細胞來源中檢測多種細胞特征。這些特征包括全轉錄組基因表達、細胞表面蛋白表達、免疫組庫序列(包括T細胞和B細胞受體)以及用于了解表觀基因組調控的開放染色質區(qū)域。隨著單個實驗可提供更多信息豐富的數(shù)據(jù),研究人員的獲益更多,包括保留珍貴樣本、提高生產力、減少因批次效應引起的錯誤,并節(jié)省更多的高科技資源(從資助基金到人員時間)。

為什么需要單細胞分辨率? 生物學就像宇宙一樣。它非常復雜,有許多獨特的單體,也就是細胞。這些細胞相互作用并扮演不同的角色,在更大的體系中構建并驅動多個過程。就像伽利略探索宇宙的努力一樣,發(fā)現(xiàn)和定義這些細胞也需要高分辨率的工具,才能解開促成生物學復雜性的基因表達異質性。單細胞測序能夠在以一個細胞為功能單位中開展生物學研究,闡明具體細節(jié),構建出一幅更大、更精細的圖譜,說明導致產生某種外在表型的不同類型的分子和細胞之間是如何相互作用的:患者為什么會復發(fā)?是什么讓這種疫苗能夠有效防止傳染等等諸多問題。烈冰科技已建立了多種國際和國內主流的高通量測序實驗平臺和自主研發(fā)國產化實驗平臺。

烈冰生物單細胞測序服務體系,不僅提供10X Genomics和BD Rhapsody兩大國際認可的單細胞實驗平臺,在“附加”產品上,我們提供BD FACS Melody流式細胞儀,滿足您對特殊細胞類型的富集需求,自主研發(fā)的Panocell單細胞捕獲芯片,可兼容BD 平臺全套原裝磁珠、試劑和protocol,為您提供完整的單細胞多組學解決方案。從細胞多樣本分析和染色所需的試劑到檢測試劑盒,生物信息分析工具,和在線大數(shù)據(jù)分析系統(tǒng)、精簡方案和專業(yè)團隊技術支持,烈冰生物可為您提供用于單細胞多組學甚至到空間轉錄組測序的各種工具,助您加速科研探索之旅。自2019年起,烈冰生物BD單細胞測序平臺已助力發(fā)表近20篇一區(qū)CNS高分文章。青島scRNA單細胞平臺

對于消化背景雜,樣本初始數(shù)量少,關注粒細胞的項目,推薦您使用烈冰BD 單細胞測序平臺。杭州single cell 單細胞平臺

科研的魅力之處,在于無窮盡的探尋生命的本底,通過單細胞測序,我們對組織的分子基礎的研究也從初級到深層,并在單細胞層面逐漸達成一致,那么不禁要問一句,組織的空間位置到底重不重要?空間異質性是功能的關鍵特征,細胞的位置信息更能反應細胞命運調控機制和細胞譜系發(fā)生過程。因此時間和空間即像組織的AB面,而不可否認的是,此時空間坐標的記錄,像一個還未長大的娃娃,雖未觸及分子基礎研究的深層,但仍在努力攀登探尋生命本底的下一個高峰。杭州single cell 單細胞平臺

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