烈冰生物單細胞轉(zhuǎn)錄組測序

來源: 發(fā)布時間:2022-07-25

單細胞測序?qū)嶒炘贅颖炯毎蠙C分選簽,需要對細胞數(shù)量、細胞活性進準判斷,這對Single Cell分選標記、建庫、下機數(shù)據(jù)的質(zhì)量都具有著決定性的作用。如若細胞計數(shù)偏高,將會影響建庫的成功率;計數(shù)偏低,則會提高雙細胞的比例;而細胞活率過低,就會使測序數(shù)據(jù)的利用率大打折扣,因此把好單細胞懸液質(zhì)量這一關(guān)尤為重要。而在鋪板過程中,由于不同操作人員手法具有不可避免的差異,不同的液體流速將直接影響單細胞的入孔效果。因此烈冰生物BD Rhapsody單細胞分選平臺配套了專門定制的電動移液器,其具有Prime Treat、Cell Load、Bead Load、Wash、Lysis、Retrieval多種操作模式,來對應(yīng)各種不同的操作。通過已經(jīng)設(shè)定的程序來控制液體的流速,大幅度降低人為操作習(xí)慣帶來的差異,保證實驗操作的一致性。烈冰對于一個細胞群體中的每個細胞單獨進行建庫測序分析。烈冰生物單細胞轉(zhuǎn)錄組測序

烈冰生信團隊傾情研發(fā)的NovelBrain?生信大數(shù)據(jù)分析平臺,針對龐大的單細胞測序數(shù)據(jù),能夠?qū)崿F(xiàn)細胞類型鑒定的快、精、準:一鍵導(dǎo)入gene list構(gòu)建個性化基因列表;輕松一點即可展示Marker基因的Feature plot;任意修改Cluster的顏色和名稱助力高效鑒定細胞類型;一鍵獲得t-SNE圖、Heatmap和Violin圖:輕松獲得并下載基因表達的t-SNE圖、Heatmap、Violin圖,還可以通過調(diào)節(jié)寬、高和系數(shù)比例來調(diào)節(jié)美觀。平臺上線300+task自主分析工具、50+pipeline工作流模板,幫助烈冰生信分析團隊和自主分析用戶實現(xiàn)分析工具和模板的快速調(diào)用和一站式全流程自動化分析,節(jié)省工作時間并提升整體工作效率。青島single cell RNA單細胞服務(wù)機構(gòu)單細胞測序是高通量測序下的又一重大技術(shù)突破。

針對單細胞測序數(shù)據(jù)分析時的reads數(shù)、基因表達量及細胞數(shù)量判定過程中:以捕獲5000個細胞、100G的測序量為標準,每個細胞的reads數(shù)大約在50k左右;每個細胞的基因中位數(shù)取決于樣本的細胞類型,例如成熟的B,T,粒細胞數(shù)量較多的組織中,由于該類型細胞表達的基因數(shù)普遍較少,導(dǎo)致基因中位數(shù)下降。而某些疾病組織、或者體外培養(yǎng)的如干細胞等,他們的基因表達數(shù)較高,甚至可以超過1W,這就導(dǎo)致該類樣本基因中位數(shù)非常高。因此,我們對細胞數(shù)量以及基因中位數(shù)確認時,需要考察實際組織的細胞組成。

烈冰科技自主研發(fā)的單細胞云平臺致力于幫助每一位客戶定制化分析數(shù)據(jù),深度解讀數(shù)據(jù)分析結(jié)果,深入挖掘其背后的生物學(xué)意義;從操作便捷、結(jié)果可視化、分析可追溯、系統(tǒng)穩(wěn)定等方面助力單細胞研究,加速科研進程!此外,烈冰生信團隊根據(jù)豐富的實戰(zhàn)經(jīng)驗為用戶量身打造了一款單細胞測序結(jié)果解讀的神兵利器——單細胞瀏覽器(Single Cell Browser),不但可以將海量復(fù)雜的結(jié)果文件可視化,還是可以實現(xiàn)三維立體化展示的軟件。專業(yè)的生信代碼交給專業(yè)的烈冰,專業(yè)的生物學(xué)意義交給專業(yè)的您!對于消化背景雜,樣本初始數(shù)量少,關(guān)注粒細胞的項目,推薦您使用烈冰BD 單細胞測序平臺。

現(xiàn)有的單細胞測序技術(shù)陣營在幾個主要領(lǐng)域存在差別。一個是基于微流控通道的細胞與Beads的在通道內(nèi)的動態(tài)結(jié)合,通過油相水相不相容的特點將結(jié)合了的細胞和Beads進行分隔,在這個空間,單個細胞的內(nèi)容物釋放,轉(zhuǎn)錄本或其他生物分析物被標記或添加索引,以便下游識別。BD Rhapsody單細胞測序平臺采用靜態(tài)微孔技術(shù)(Cyto-Seq具有類似的技術(shù)原理)。通過微孔板的物理分隔,將一個個單個細胞和帶有標簽的磁珠,一對一的“框”在微反應(yīng)的物理平臺中。這樣,每一個細胞都會結(jié)合一個磁珠,那么在每一個磁珠中上長滿了不同的Cell Barcode和UMI Barcode連接形成的序列,再加上一端PolyT的抓手,這個抓手就會使用oligo dT抓住mRNA構(gòu)建文庫。搭配BD FACSMelody流式分選儀,全線搭建BD Rahpsody單細胞測序平臺。云南BD單細胞多組學(xué)測序

單細胞測序因其強大的探究疾病--細胞--基因的關(guān)系,一度成為高通量測序技術(shù)的“天花板”。烈冰生物單細胞轉(zhuǎn)錄組測序

在政策促進下,未來3—5年內(nèi),我國將在醫(yī)藥健康短缺地區(qū)建設(shè)一批高水平臨床醫(yī)治中心、高層次的人才 培養(yǎng)基地和高水平的科研創(chuàng)新與轉(zhuǎn)化平臺,培育一批品牌優(yōu)勢明顯、跨區(qū)域提供高水平服務(wù)的集團。打造一批以為依托的“互聯(lián)網(wǎng)+醫(yī)藥健康”協(xié)作平臺。這定將給相關(guān)企業(yè),帶來非常大的發(fā)展機遇。2019年醫(yī)藥健康新政頻出,無論是醫(yī)藥研發(fā)企業(yè)還是生產(chǎn)企業(yè),都面臨了很多挑戰(zhàn)。隨著2020年離我們已經(jīng)越來越近,遵循政策導(dǎo)向,調(diào)整企業(yè)布局將成為未來企業(yè)戰(zhàn)略布局的重中之重。隨著我國醫(yī)藥健康深入推進、“兩票制”進一步推行,以及各項行業(yè)政策的出臺,使得我國冷鏈物流市場規(guī)模不斷擴大。對于冷鏈物流行業(yè)而言,“十三五”規(guī)劃時期是冷鏈物流調(diào)整和發(fā)展的關(guān)鍵時期。隨著西方健康服務(wù)理念的進入及國內(nèi)需求市場的飛速增長,國內(nèi)以體檢為重點的有限責(zé)任公司(自然)得到了飛速發(fā)展,尤其是近年來,健康服務(wù)機構(gòu)飛速發(fā)展。盡管中國老年健康服務(wù)目前仍處于初始發(fā)展階段,但近年來我國出臺了一些扶持政策,市場空間逐漸打開。烈冰生物單細胞轉(zhuǎn)錄組測序

上海烈冰生物醫(yī)藥科技有限公司發(fā)展規(guī)模團隊不斷壯大,現(xiàn)有一支專業(yè)技術(shù)團隊,各種專業(yè)設(shè)備齊全。專業(yè)的團隊大多數(shù)員工都有多年工作經(jīng)驗,熟悉行業(yè)專業(yè)知識技能,致力于發(fā)展NovelBio,烈冰生物,NovelBrain,PanoCell,烈冰智造的品牌。公司以用心服務(wù)為重點價值,希望通過我們的專業(yè)水平和不懈努力,將生物科技、醫(yī)藥科技、信息科技、計算機科技領(lǐng)域內(nèi)的技術(shù)開發(fā)、技術(shù)服務(wù)、技術(shù)轉(zhuǎn)讓、技術(shù)咨詢,市場營銷策劃,市場信息咨詢與調(diào)查(不得從事社會調(diào)查、社會調(diào)研、民意調(diào)查、民意測驗),從事貨物及技術(shù)的進出口業(yè)務(wù),計算機、軟件及耗材(除??兀?,軟件開發(fā)【依法須經(jīng)批準的項目,經(jīng)相關(guān)部門批準后方可開展經(jīng)營活動】等業(yè)務(wù)進行到底。烈冰生物始終以質(zhì)量為發(fā)展,把顧客的滿意作為公司發(fā)展的動力,致力于為顧客帶來***的單細胞測序,生物大數(shù)據(jù)云分析平臺,空間轉(zhuǎn)錄組測序,單細胞多組學(xué)測序。