成都BD Rhapsody單細胞測序

來源: 發(fā)布時間:2022-07-26

從單細胞測序描述性分析轉(zhuǎn)向復雜樣本中不同細胞類型的功能解析,越來越需要一種多組學的細胞生物學視角。通過單細胞多組學——即對不同組學的數(shù)據(jù)集進行分析和整合——科學家能夠從同一個單細胞來源中檢測多種細胞特征。這些特征包括全轉(zhuǎn)錄組基因表達、細胞表面蛋白表達、免疫組庫序列(包括T細胞和B細胞受體)以及用于了解表觀基因組調(diào)控的開放染色質(zhì)區(qū)域。隨著單個實驗可提供更多信息豐富的數(shù)據(jù),研究人員的獲益更多,包括保留珍貴樣本、提高生產(chǎn)力、減少因批次效應引起的錯誤,并節(jié)省更多的高科技資源(從資助基金到人員時間)。BD Scanner,是您實驗過程的又一雙眼睛,實時監(jiān)測,精細質(zhì)控。成都BD Rhapsody單細胞測序

什么時候要用到去死細胞的操作呢?跟進烈冰生物多年單細胞測序服務(wù)經(jīng)驗來看,當細胞懸液進行質(zhì)量和活性檢測后,考慮對細胞活性在50%-70%的懸液進行去除死細胞的操作。而太低活性的懸液(小于30%),懸液中細胞大量死亡,可能已經(jīng)丟失了原組織內(nèi)的細胞比例和狀態(tài),失真嚴重,建議重新收集樣本進行新的實驗,保證數(shù)據(jù)的高質(zhì)量和實驗結(jié)果的準確性。但需要注意到,去除死細胞的操作會損失一定的細胞數(shù)量,因此希望您在提供樣本時,盡可能提供足量的細胞,以備實驗過程中可能存在的細胞死亡的問題,BD Rhapsody單細胞捕獲平臺對樣本起始細胞量的要求較低,一般提供10萬個細胞以上均可滿足需求,特殊樣本可詳細咨詢烈冰生物。蘇州BD VDJ單細胞實驗服務(wù)烈冰實驗室包含從樣本處理到測序下機的全套實驗平臺。

單細胞測序龐大的數(shù)據(jù)烈冰生信團隊傾情研發(fā)的NovelBrain?生信大數(shù)據(jù)分析平臺,可實現(xiàn)零代碼操作、簡單方便:單細胞瀏覽器的操作簡單,不需要命令行操作。簡單拖拽、設(shè)置參數(shù)即可運行,即使生信0基礎(chǔ)用戶也可以運用自如;可視化展示海量結(jié)果文件:可視化展示Cluster的基因數(shù),UMI數(shù)量、線粒體RNA占比信息;以及不同Cluster對應的細胞數(shù)量、基因表達量、RNA表達量、樣本細胞分布、線粒體RNA表達量等;3D立體展示,文章動圖先人一步:單細胞瀏覽器針對t-SNE圖、UMAP圖和pseudotime結(jié)果進行三維立體展示,更加直觀立體的觀察細胞分布和聚類情況。

烈冰科技自主研發(fā)的單細胞云平臺致力于幫助每一位客戶定制化分析數(shù)據(jù),深度解讀數(shù)據(jù)分析結(jié)果,深入挖掘其背后的生物學意義;從操作便捷、結(jié)果可視化、分析可追溯、系統(tǒng)穩(wěn)定等方面助力單細胞研究,加速科研進程!此外,烈冰生信團隊根據(jù)豐富的實戰(zhàn)經(jīng)驗為用戶量身打造了一款單細胞測序結(jié)果解讀的神兵利器——單細胞瀏覽器(Single Cell Browser),不但可以將海量復雜的結(jié)果文件可視化,還是可以實現(xiàn)三維立體化展示的軟件。專業(yè)的生信代碼交給專業(yè)的烈冰,專業(yè)的生物學意義交給專業(yè)的您!測序的革新讓科學研究從個體基因差異逐漸轉(zhuǎn)為個體細胞的基因差異。

烈冰生物單細胞測序服務(wù),為您提供可視化質(zhì)控系統(tǒng),保證每次實驗的可靠性:BD Rhapsody 掃描儀具有直接成像功能,可在工作流程的不同階段進行質(zhì)量控制,如細胞捕獲率和細胞多態(tài)率(雙細胞率)。成像儀指標可以確認起始細胞樣本的質(zhì)量,并確認微孔板工作流程中每個步驟的成功完成狀態(tài) ;在細胞裂解前的步驟中評估細胞活性;并對通過測序確定的細胞回收量進行可靠估算。利用這些信息,在進行高成本的下游測序之前,用戶可根據(jù)需要改變方向并解決實驗中遇到的問題。這些指標允許用戶對不同工作日間的或者不同研究中心間的工作流程性能進行跟蹤。單細胞測序因其強大的探究疾病--細胞--基因的關(guān)系,一度成為高通量測序技術(shù)的“天花板”。南京BD單細胞實驗平臺

烈冰測序服務(wù)已助力300余篇國際期刊研究文章發(fā)表。成都BD Rhapsody單細胞測序

烈冰科技于2010年誕生之初便立足于高通量測序行業(yè),為科研學者提供專注的測序數(shù)據(jù)分析服務(wù),先后經(jīng)歷基因芯片時代、基因測序、轉(zhuǎn)錄組測序時代...在科技日新月異的洪流中始終獨占鰲頭。2018年以來,單細胞測序進入發(fā)展的快車道,烈冰作為國內(nèi)首批引進單細胞實驗雙平臺的公司,依托自主研發(fā)的NovelBrain?生物大數(shù)據(jù)分析平臺,為用戶提供一站式全流程的單細胞測序服務(wù)和解決方案。4年的單細胞技術(shù)的積累,烈冰已具備大鼠、小鼠、斑馬魚、猴、裸鼴鼠、水稻、擬南芥等10+物種,皮膚、腦、脂肪、心臟、花序等50+組織類型,100+細胞類型,1000+靶標基因,10000+樣本處理經(jīng)驗。成都BD Rhapsody單細胞測序

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