在機(jī)體免疫細(xì)胞之間、免疫細(xì)胞和非免疫細(xì)胞之間傳遞信息，在免疫應(yīng)答與調(diào)節(jié)、免疫細(xì)胞分化和發(fā)育、炎癥反應(yīng)中發(fā)揮重要作用，有助于疾病的預(yù)防、診斷和***。重癥***如SARS冠狀病毒、H7N9流感病毒***患者體內(nèi)常存在細(xì)胞因子風(fēng)暴，也因細(xì)胞因子風(fēng)暴導(dǎo)致患者死亡；*...

檢測(cè)流程：1號(hào)檢測(cè)?。け绢?lèi)型和捕獲｛敞球相結(jié)合鄉(xiāng)孵育60分鐘3i先j條后的微球復(fù)合物加入中自應(yīng)笠吻素標(biāo)記二衍，iif育30給鐘：再次洗滌后的微！<J?復(fù)合物加入鏈霉親和蒙標(biāo)記的PE熒光試劑，孵育20分鐘；如再次洗滌后的做球復(fù)合物上流武細(xì)...

N6-甲基脫氧腺苷(6mA)是原核生物和真核生物的DNA修飾類(lèi)型之一，在細(xì)菌、藻類(lèi)及植物基因組中***存在，在DNA錯(cuò)配修復(fù)、染色體分離和毒力調(diào)節(jié)中發(fā)揮作用。6mA免疫沉淀測(cè)序(6mA-IPSeq)通過(guò)特異性抗體富集6mA甲基化的DN**段，然后結(jié)...

t-SNE（t分布隨機(jī)鄰域嵌入）是一種用于探索高維數(shù)據(jù)的非線(xiàn)性降維算法。它將多維數(shù)據(jù)映射到適合于人類(lèi)觀察的兩個(gè)或多個(gè)維度。t-SNE非線(xiàn)性降維算法通過(guò)基于具有多個(gè)特征的數(shù)據(jù)點(diǎn)的相似性識(shí)別觀察到的簇來(lái)在數(shù)據(jù)中找到模式。另外t-SNE的輸出可以作為其他...

全基因組甲基化測(cè)序(WholeGenomeBisulfiteSequencing,WGBS)是結(jié)合重亞硫酸鹽Bisulfite處理和高通量測(cè)序，對(duì)有參考基因組進(jìn)行全基因組的單堿基分辨率的甲基化檢測(cè)“金標(biāo)準(zhǔn)”方案，***用于人、哺乳動(dòng)物及農(nóng)林牧漁方向...

cfDNA，cellfreeDNA，就是血液中游離的自身DNA，這些DNA多是從身體的細(xì)胞或者白血球破裂釋放出來(lái)的，基本上都是無(wú)害的，不用多久會(huì)被自身清理掉。不過(guò)值得一提的是，當(dāng)孕婦懷孕的時(shí)候，胎兒的DNA也會(huì)同時(shí)釋放到母親的血液里頭去，這是當(dāng)前火...

數(shù)字PCR（Digital PCR-dPCR）技術(shù)是一種新的核酸檢測(cè)和定量方法，與傳統(tǒng)定量PCR（qPCR）技術(shù)不同，數(shù)字PCR采用***定量的方式，不依賴(lài)于標(biāo)準(zhǔn)曲線(xiàn)和參照樣本，直接檢測(cè)目標(biāo)序列的拷貝數(shù)。由于這種檢測(cè)方式具有比傳統(tǒng)qPCR更加出色的靈敏度和特異...

近幾年來(lái)，隨著納米制造技術(shù)和微流體技術(shù)（nanofabrication and microfluidics）的發(fā)展，數(shù)字PCR技術(shù)遇到了突破技術(shù)瓶頸的比較好契機(jī)。1997年Kalinina, 、Brown J, 和Silver J使用納升級(jí)芯片進(jìn)行單克隆模板P...

數(shù)字PCR采用的策略概括起來(lái)非常簡(jiǎn)單，就是“分而治之”（divide and conquer），這種做法非常類(lèi)似于計(jì)算機(jī)科學(xué)中的“分治算法”，將一個(gè)標(biāo)準(zhǔn)PCR反應(yīng)分配到大量微小的反應(yīng)器中，在每個(gè)反應(yīng)器中包含或不包含一個(gè)或多個(gè)拷貝的目標(biāo)分子( DNA模板) ，實(shí)...

PCR擴(kuò)增效率的高低直接影響**終信號(hào)的判讀和實(shí)驗(yàn)結(jié)果分析。在進(jìn)行熱循環(huán)實(shí)驗(yàn)時(shí)，需檢查樣品的密封性以及PCR反應(yīng)板是否和PCR儀熱蓋完全接觸，確保PCR過(guò)程中樣品反應(yīng)液沒(méi)有蒸發(fā)。QIAcuity數(shù)字PCR系統(tǒng)采用**的微反應(yīng)腔室封閉方式，固態(tài)的物理分割和封閉可...

液滴數(shù)字PCR源于乳液PCR( emulsion PCR) 技術(shù)，即將DNA模板與連接引物的磁性微球以極低的濃度(比如單拷貝) 包裹于油水兩相形成的納升至皮升級(jí)液滴中進(jìn)行 PCR 擴(kuò)增，擴(kuò)增后的產(chǎn)物富集在磁性微球上，收集破乳后進(jìn)行測(cè)序。通過(guò)油水兩相間隔得到的以...

將待測(cè)DNA經(jīng)過(guò)亞硫酸鹽處理，通過(guò)PCR擴(kuò)增過(guò)程引入T7啟動(dòng)子序列，經(jīng)T7DNA聚合酶的體外轉(zhuǎn)錄過(guò)程得到各樣本RNA產(chǎn)物，經(jīng)堿基特異性酶切處理，得到RNA小片段，并用飛行質(zhì)譜檢測(cè)每個(gè)片段的分子量，***EpiTYPER程序完成數(shù)據(jù)的自動(dòng)化處理并報(bào)告...

PPImodule蛋白質(zhì)互作蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用（protein-proteininteraction,PPI）是指兩個(gè)或兩個(gè)以上的蛋白質(zhì)分子通過(guò)非共價(jià)鍵形成蛋白質(zhì)復(fù)合體（proteincomplex）的過(guò)程。PPImodule是指共表達(dá)蛋白模塊...

芯片平臺(tái)作為目前比較成熟的篩選工具，已經(jīng)在很多領(lǐng)域有了相應(yīng)的應(yīng)用。多家芯片公司在DNA甲基化這塊兒有了相應(yīng)的產(chǎn)品提供，其中應(yīng)用**為***的就Agilent平臺(tái)和Illumina平臺(tái)，相應(yīng)的產(chǎn)品包括AgilentHumanCpGIslandMicr...

Agilent平臺(tái)因?yàn)镸eDIP技術(shù)本身的特點(diǎn)，都不能到達(dá)單堿基的分辨率，而Illumina的Infinium和GoldenGate檢測(cè)技術(shù)卻做得到。Illumina的Infinium甲基化檢測(cè)技術(shù)來(lái)源與前期的SNP檢測(cè)，采用的是單堿基延伸的原理。...

PCA主成分分析測(cè)序技術(shù)的發(fā)展使得現(xiàn)在能夠從宏觀角度分析基因表達(dá)，但是也在一定程度上增加了數(shù)據(jù)分析難度。許多基因之間可能存在相關(guān)性，如果分別對(duì)每個(gè)基因進(jìn)行分析，分析往往是孤立的，盲目減少指標(biāo)會(huì)損失很多有用的信息。PCA(PrincipalCompo...

industryTemplateFFPE樣本只需要室溫運(yùn)輸。重慶WGBS技術(shù)服務(wù)歡迎咨詢(xún) Chip-Seq 是指通過(guò)染色質(zhì)免疫共沉淀技術(shù)（ChIP）特異性地富集目的蛋白結(jié)合的DN**段，并對(duì)其進(jìn)行純化和文庫(kù)構(gòu)建；然后對(duì)富集得到的DN**段進(jìn)行高通量測(cè)序，通過(guò)...

微生物定植對(duì)腸道免疫和代謝相關(guān)基因DNA甲基化的影響——團(tuán)隊(duì)成員發(fā)表 Early microbial colonization affects DNA methylation of genes related to intestinal imm...

PCA主成分分析測(cè)序技術(shù)的發(fā)展使得現(xiàn)在能夠從宏觀角度分析基因表達(dá)，但是也在一定程度上增加了數(shù)據(jù)分析難度。許多基因之間可能存在相關(guān)性，如果分別對(duì)每個(gè)基因進(jìn)行分析，分析往往是孤立的，盲目減少指標(biāo)會(huì)損失很多有用的信息。PCA(PrincipalCompo...

下游分析針對(duì)LASSO獲得的基因模型（或稱(chēng)基因Panel）的驗(yàn)證：1.計(jì)算風(fēng)險(xiǎn)指數(shù)RiskScore2.繪制ROC曲線(xiàn)、DCA曲線(xiàn)、列線(xiàn)圖進(jìn)行驗(yàn)證3.繪制生KM存曲線(xiàn)對(duì)基因模型中的基因進(jìn)行解釋和分析：1.基因注釋2.靶向藥物分析應(yīng)用示例：文獻(xiàn)1：P...

不同分組的全基因組拷貝數(shù)變化的比較：**初目的：不同分組的拷貝數(shù)變異在染色體水平和染色體臂水平的展示和比較。應(yīng)用：不同分組的全基因組拷貝數(shù)變化的比較，展示genome-wideDNAcopy-numberprofiles。不同染色體臂的變異與臨床表...

云生物專(zhuān)注于生物醫(yī)藥科研平臺(tái)服務(wù)及基因檢測(cè)定制，包括測(cè)序、芯片、數(shù)據(jù)庫(kù)建設(shè)、軟件開(kāi)發(fā)以及其他科研解決方案和民用型基因檢測(cè)產(chǎn)品。云生物擁有多個(gè)經(jīng)驗(yàn)豐富、可提供一對(duì)一個(gè)性化定制分析服務(wù)的實(shí)驗(yàn)室平臺(tái)，包括基因調(diào)控（ATAC-seq、CHIP-seq、Hi-C測(cè)序）、...

基因組組裝：首先，利用ABySS v2.0.2初步組裝Illumina測(cè)序數(shù)據(jù)，然后利用blasR比對(duì)Pacbio三代數(shù)據(jù)，根據(jù)比對(duì)結(jié)果對(duì)單分子測(cè)序數(shù)據(jù)進(jìn)行一次矯正與糾錯(cuò)，目的在于減少單分子長(zhǎng)序列中單堿基、插入缺失的錯(cuò)誤；***利用糾正過(guò)的單分子測(cè)序數(shù)據(jù)與二代...

葉綠體基因組中的突變事件通常聚集在“熱點(diǎn)”中，這些突變動(dòng)態(tài)產(chǎn)生分散在葉綠體基因組中的高度可變區(qū)。Oresitrophe和Mukdenia提供了一個(gè)理想的模型，通過(guò)分析Oresitrophe和Mukdenia的葉綠體基因數(shù)據(jù)，我們開(kāi)發(fā)了豐富的遺傳資源，包括cp熱...

基因功能注釋?zhuān)夯蝾A(yù)測(cè)得到樣品的氨基酸序列后，與已知的蛋白數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行比對(duì)，把樣品的基因和其相對(duì)應(yīng)的功能注釋信息結(jié)合起來(lái)，得到注釋結(jié)果。由于每一條序列比對(duì)結(jié)果可能超過(guò)一條，為保證其生物意義，注釋時(shí)保留一條比較好比對(duì)結(jié)果作為該基因的注釋。樣品氨基酸序列...

體液樣本收集外泌體。1、選擇血清還是血漿？推薦大多數(shù)研究選擇血漿。血液凝固過(guò)程中血小板會(huì)產(chǎn)生大量外泌體，含量占血清中外泌體的50%以上，選擇血漿可避免不必要的影響。2、注意抗凝劑的選擇肝素類(lèi)抗凝劑與PCR假陰性有關(guān)，這可能是因?yàn)楦嗡嘏c引物和/或酶有...

植物線(xiàn)粒體（pMtDNA）復(fù)雜性概況 1. 相比于動(dòng)物線(xiàn)粒體基因組的大小（10-20k），已知的pMtDNA大小變異非常劇烈，從190k-11Mb不等 2. 重復(fù)序列變異范圍**片段結(jié)構(gòu)變異很常見(jiàn) 3. pMtDNA中基因的SNP同義突變...

虎耳草科植物葉綠體基因組比較：五種虎耳草葉綠體基因組相對(duì)保守，基因組沒(méi)有重排；與其他葉綠體基因組相比，葉綠體基因組較??；rps16內(nèi)含子從Penthorum chinense參考基因組中丟失，M. rossii和O. rupifraga中rpl2內(nèi)含子丟失。 ...

葉綠體多態(tài)基因組SSR的開(kāi)發(fā)和驗(yàn)證：葉綠體基因組具有古老的遺傳模式，對(duì)進(jìn)化過(guò)程具有獨(dú)特見(jiàn)解，cpSSR基因座通常分布在整個(gè)非編碼區(qū)域，其序列變異高于編碼區(qū)，cpSSR標(biāo)記可用于揭示群體遺傳變異和系統(tǒng)地理學(xué)模式。在Oresitrophe和Mukden...

標(biāo)準(zhǔn)分析： 1.測(cè)序數(shù)據(jù)概況 (1) 原始測(cè)序數(shù)據(jù)說(shuō)明 (2) 測(cè)序數(shù)據(jù)質(zhì)控及統(tǒng)計(jì) (3) 三代測(cè)序數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì) 2.基因組組裝 3. 基因組組分分析 (1) 編碼基因分析 (2) ORFs掃描及跨膜結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè) (...