IL-1β的合成與釋放受到非常嚴(yán)格的調(diào)控,免疫系統(tǒng)已經(jīng)進(jìn)化出幾種機(jī)制來調(diào)節(jié)IL-1β的過度產(chǎn)生或失調(diào),可分為病原體相關(guān)分子模式分子(PAMPs)和損傷相關(guān)分子模式分子(DAMPs)。入侵微生物通過PAMPs識別,DAMPs是受損或瀕臨死亡的細(xì)胞釋放的內(nèi)源性配體...
GSEA基本原理從方法上來講,GSEA主要分為基因集進(jìn)行排序、計算富集分?jǐn)?shù)(EnrichmentScore,ES)、估計富集分?jǐn)?shù)的***性水平并進(jìn)行多重假設(shè)檢驗三個步驟。**步對輸入的所有基因集L進(jìn)行排序,通常來說初始輸入的基因數(shù)據(jù)為表達(dá)矩陣,排序...
棒棒糖圖是直觀顯示蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)上的突變點**簡單且有效的方式。許多致*基因具有比任何其他基因座更頻繁突變的優(yōu)先位點。這些位點被認(rèn)為是突變熱點,棒棒糖圖可以用于顯示突變熱點以及其他突變位點。并可以對比不同**/亞型的突變位點。 基本原理 將蛋白質(zhì)結(jié)...
一次性處理96個樣本,只需2小時出結(jié)果,效率是傳統(tǒng)方法的 十倍 以上。1.CRP是在24小時候升高,3天后達(dá)峰值后降低●2.TNF-a在預(yù)后不良組逐漸升高●3.IL-64小時即明顯升高●4.IL-84小時明顯升高,值與預(yù)后相關(guān),預(yù)后不良組下降不明顯●5.IL-...
LASSO回歸:更多的變量在擬合時往往可以給出一個看似更好的模型,但是同時也面臨過度擬合的危險。此時如果用全新的數(shù)據(jù)去驗證模型(Validation),通常效果很差。一般來說,變量數(shù)大于數(shù)據(jù)點數(shù)量很多,或者某一個離散變量有太多獨特值時,都有可能過度...
IL-22保護(hù)其靶細(xì)胞免受損傷,抑制其分化和/或增加其增殖。這些效應(yīng)不為其他細(xì)胞因子有。使用小鼠模型的研究表明,增強IL22-IL22R系統(tǒng)(例如通過應(yīng)用IL-22)可能對炎癥性腸病、酒精性肝病和胰腺損傷、移植物抗宿主病(GVHD)和選定***的移植有有益的影...
LASSO是一種機(jī)器學(xué)習(xí)算法,通常被用來構(gòu)建可以預(yù)測預(yù)后情況的基因模型。也可以篩選與特定性狀相關(guān)性強的基因。LASSO對于高維度、強相關(guān)、小樣本的生存資料數(shù)據(jù)有較好的效果。LASSO的基本思想是在回歸系數(shù)的***值之和小于一個常數(shù)的約束條件下,使殘...
t-SNE(t分布隨機(jī)鄰域嵌入)是一種用于探索高維數(shù)據(jù)的非線性降維算法。它將多維數(shù)據(jù)映射到適合于人類觀察的兩個或多個維度。t-SNE非線性降維算法通過基于具有多個特征的數(shù)據(jù)點的相似性識別觀察到的簇來在數(shù)據(jù)中找到模式。另外t-SNE的輸出可以作為其他...
cox風(fēng)險比例回歸模型:產(chǎn)品詳情產(chǎn)品評論(0)比例風(fēng)險回歸模型,又稱Cox回歸模型,是由英國統(tǒng)計學(xué)家。模型可以用來描述了不隨時間變化的多個特征對于在某一時刻死亡率的影響。它是生存分析中的一個重要的模型。應(yīng)用場景cox比例風(fēng)險回歸模型,由英國統(tǒng)計學(xué)家...
TMB**突變負(fù)荷**突變負(fù)荷(TMB)作為免疫療法的生物標(biāo)志物,能夠較好的預(yù)測患者免疫***的療效。基于**突變負(fù)荷,可以從一種新的角度探尋基因跟免疫及預(yù)后的關(guān)系。一般應(yīng)用場景:基于TMB預(yù)測不同性狀的免疫***療效、不同基因表達(dá)或突變對免疫**...
STEM基因表達(dá)趨勢分析數(shù)據(jù)要求表達(dá)譜芯片或測序數(shù)據(jù)(已經(jīng)過預(yù)處理)下游分析得到***富集的時間表達(dá)模式之后的分析有:1.時間表達(dá)模式中基因的功能富集2.時間表達(dá)模式中基因表達(dá)與性狀之間的相關(guān)性挖掘模塊的關(guān)鍵信息:1.找到時間表達(dá)模式中的**基因2...
棒棒糖圖是直觀顯示蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)上的突變點**簡單且有效的方式。許多致*基因具有比任何其他基因座更頻繁突變的優(yōu)先位點。這些位點被認(rèn)為是突變熱點,棒棒糖圖可以用于顯示突變熱點以及其他突變位點。并可以對比不同**/亞型的突變位點。 基本原理 將蛋白質(zhì)結(jié)...
bubbles(不同分組的基因表達(dá)或通路富集展示): Bubbles可以同時展示pvalue和表達(dá)量。例如展示motif的pvalue和motif對應(yīng)的轉(zhuǎn)錄因子的表達(dá)量,方便快速看出轉(zhuǎn)錄因子富集且高表達(dá)所在的group,預(yù)示著該分組對細(xì)胞狀態(tài)的改變(例如細(xì)...
bubbles(不同分組的基因表達(dá)或通路富集展示): Bubbles可以同時展示pvalue和表達(dá)量。例如展示motif的pvalue和motif對應(yīng)的轉(zhuǎn)錄因子的表達(dá)量,方便快速看出轉(zhuǎn)錄因子富集且高表達(dá)所在的group,預(yù)示著該分組對細(xì)胞狀態(tài)的改變(例如細(xì)...
GeneInteraction基因互作:基因相互作用指miRNA、lncRNA、circRNA或其它RNA介導(dǎo)DNA轉(zhuǎn)錄,從而影響mRNA的表達(dá)過程。通俗意義上來說,基因互作關(guān)系指基于序列預(yù)測的靶基因?qū)?。miRNA通過與靶mRNA的結(jié)合,或促使mR...
術(shù)語解釋:Cox回歸:又稱比例風(fēng)險回歸模型(proportionalhazardsmodel,簡稱Cox模型),是由英國統(tǒng)計學(xué)家。該模型以生存結(jié)局和生存時間為應(yīng)變量,可同時分析多種因素對于生存期長短的影響。Cox模型能分析帶有截尾生存時間的資料,且...
GSEA分析:GSEA全名為GeneSetEnrichmentAnalysis(基因集富集分析)。用以分析特定基因集(如關(guān)注的GO條目或KEGGPathway)在兩個生物學(xué)狀態(tài)(如**與對照,高齡與低齡)中是否存在差異。能夠研究基因變化的生物學(xué)意義...
術(shù)語解釋:Cox回歸:又稱比例風(fēng)險回歸模型(proportionalhazardsmodel,簡稱Cox模型),是由英國統(tǒng)計學(xué)家。該模型以生存結(jié)局和生存時間為應(yīng)變量,可同時分析多種因素對于生存期長短的影響。Cox模型能分析帶有截尾生存時間的資料,且...
術(shù)語解釋:Cox回歸:又稱比例風(fēng)險回歸模型(proportionalhazardsmodel,簡稱Cox模型),是由英國統(tǒng)計學(xué)家。該模型以生存結(jié)局和生存時間為應(yīng)變量,可同時分析多種因素對于生存期長短的影響。Cox模型能分析帶有截尾生存時間的資料,且...
子宮內(nèi)膜異位癥(EM)是由于具有生長功能的子宮內(nèi)膜在子宮被覆面及宮體肌層以外的地方生長繁殖,進(jìn)而對正常組織侵襲而形成的一種婦科疾病,普通人群發(fā)病率可占到10%~15%,不孕婦女及慢性盆腔疼痛患者發(fā)生率可占到30%左右。隨著分期的增加,細(xì)胞因子水平逐漸升高,隨著...
細(xì)胞因子在新生兒膿毒血癥中的應(yīng)用研究,******48小時后,IL-6/8水平***下降;PCT水平?jīng)]有***變化,CRP升高q可幫助臨床獲取***進(jìn)展,減少不必要的******強度;<60Day新生兒,有以下2個或更多的癥狀被納入:發(fā)熱或體溫不穩(wěn)定;呼吸困難...
目前幾種抑制IL-6、IL-6R或相關(guān)信號因子的抗體已經(jīng)被開發(fā)出來,并可用于***幾種慢性炎癥性疾病。IL-6拮抗劑Siltuximab*阻斷IL-6的經(jīng)典和反式信號,而IL-6R抗體tocilizumab和sarilumab則可抑制IL-6的所有三種信號模式...
IL-22主要作用于各種***的上皮細(xì)胞、胰腺細(xì)胞和肝細(xì)胞,以及一些成纖維細(xì)胞。上皮細(xì)胞:IL-22增加***結(jié)合蛋白(β-defensin 2 (BD2), BD3, S100A7, S100A8, S100A9, lipocalin 2 (LCN2))、基...
移植排斥的產(chǎn)生主要為毒性T細(xì)胞的***;T細(xì)胞***后,表面IL-2R表達(dá)增加,同時入血的可溶性IL-2R也會升高?!炷I移植三天后sIL-2R水平仍持續(xù)在高水平,未下降到移植前80%以下,尤其是高于移植前水平;§sIL-2R隨肌酐恢復(fù)到穩(wěn)定期水平以后又明顯升高...
細(xì)胞標(biāo)記物是鑒定特定細(xì)胞群的有效方式,然而,可表這這些標(biāo)記物的細(xì)胞類型通常不止一種。因此,為進(jìn)行細(xì)胞免疫分型,流式細(xì)胞術(shù)染色方法需要同時使用兩種以上的抗體。通過同時使用多種抗體(每一種都與不同的熒光染料偶聯(lián))評估細(xì)胞標(biāo)記韌的特異性表這,特定細(xì)胞群得以鑒定和定量...
IL-6通過其獨特的受體系統(tǒng)而具有多種生物學(xué)活性,通過IL-6R和gp130兩個受體分子發(fā)揮其生物學(xué)活性。IL-6R主要表達(dá)于T細(xì)胞、單核細(xì)胞、活化的B細(xì)胞和中性粒細(xì)胞等造血細(xì)胞。gp130在人體內(nèi)普遍表達(dá)。gp130還用于IL-6家族其他成員的信號傳遞,如L...
TNF-α:活動性RA滑膜中的主要細(xì)胞因子之一,誘導(dǎo)其他炎癥細(xì)胞因子產(chǎn)生,***內(nèi)皮細(xì)胞表達(dá)粘附分子,趨化白細(xì)胞至關(guān)節(jié)內(nèi)引起關(guān)節(jié)炎癥;協(xié)同IL-1作用于破骨細(xì)胞,抑制軟骨細(xì)胞蛋白多糖的合成,促進(jìn)金屬蛋白酶的合成,造成股和軟骨的破壞。pIL-6與TNF-α水平的...
**壞死因子α(TNF-α)是一種主要由巨噬細(xì)胞和單核細(xì)胞產(chǎn)生的促炎細(xì)胞因子,并參與正常炎癥反應(yīng)和免疫反應(yīng)。在許多病理狀態(tài)下產(chǎn)生增多,包括敗血癥、惡性**、心臟衰竭和慢性炎性疾病。在重癥類風(fēng)濕關(guān)節(jié)炎患者的血液及關(guān)節(jié)中都可發(fā)現(xiàn)**壞死因子增多。TNF-α濃度與自...
白血病精確的診斷分型是正確選用化療方案的前提。目前國際上通用的是細(xì)胞形態(tài)學(xué)(Morphology)、免疫字 (Immunology)、細(xì)胞遺傳學(xué)(Cytogenetics)和分子生物學(xué)(Molecul ar)分型,即我們常說的MICM給型。流式細(xì)胞術(shù)可以對異質(zhì)...
細(xì)胞因子在自身免疫性疾病中的應(yīng)用,q實質(zhì)就是免疫調(diào)節(jié)的紊亂Th1和Th2平衡失調(diào)是免疫紊亂的主要表現(xiàn)qqqT、B細(xì)胞的活化和過度的炎癥反應(yīng)是病理基礎(chǔ)qqq細(xì)胞因子參與和介導(dǎo)了免疫活化和炎癥反應(yīng)Th1及其分泌的細(xì)胞因子主要參與的自身免疫?。篒型糖尿病,類風(fēng)濕性關(guān)...