云生物專注于生物醫(yī)藥科研平臺(tái)服務(wù)及基因檢測(cè)定制,包括測(cè)序、芯片、數(shù)據(jù)庫(kù)建設(shè)、軟件開(kāi)發(fā)以及其他科研解決方案和民用型基因檢測(cè)產(chǎn)品。云生物擁有多個(gè)經(jīng)驗(yàn)豐富、可提供一對(duì)一個(gè)性化定制分析服務(wù)的實(shí)驗(yàn)室平臺(tái),包括基因調(diào)控(ATAC-seq、CHIP-seq、Hi-C測(cè)序)、分子生物(數(shù)字PCR、熒光定量PCR、焦磷酸測(cè)序、PGM)、核酸測(cè)序(基因組、轉(zhuǎn)錄組、多樣性)、芯片檢測(cè)(基因芯片、蛋白芯片、組織芯片、PCR芯片)、蛋白代謝(蛋白組、代謝組、脂質(zhì)組)、形態(tài)影像(免疫組化)、蛋白定量(定量Wes檢測(cè))、細(xì)胞生物(細(xì)胞生物學(xué)、ips、CRISPR/Cas9、細(xì)胞株構(gòu)建)、生物信息(在線系統(tǒng)、軟件開(kāi)發(fā)、相關(guān)數(shù)據(jù)庫(kù))和轉(zhuǎn)化應(yīng)用(Microbe Trakr)等等。那么小基因組測(cè)序的優(yōu)勢(shì)都有哪些呢?浙江物種分類(lèi)小基因組測(cè)序銷(xiāo)售
葉綠體基因組 | “**”遺傳資源開(kāi)發(fā)新模式:葉綠體基因組結(jié)構(gòu)和特征:三個(gè)樣品的完整葉綠體基因組基本信息,包含由LSC(87,496-87,604bp)和SSC(18,222-18,342bp)區(qū)域分開(kāi)的兩個(gè)IR拷貝(25,507-25,519bp)。編碼相同的131個(gè)基因組,其中113個(gè)是獨(dú)特的,18個(gè)在IR區(qū)域中重復(fù)。113個(gè)獨(dú)特的基因包含79個(gè)蛋白質(zhì)編碼基因,30個(gè)tRNA基因和4個(gè)rRNA基因。14個(gè)含有一個(gè)內(nèi)含子(6個(gè)tRNA基因和8個(gè)蛋白質(zhì)編碼基因),3個(gè)含有兩個(gè)內(nèi)含子(rps12,clpP,ycf3)。 rps12基因的5'-末端外顯子位于LSC區(qū)域,基因的內(nèi)含子和3'-末端外顯子位于IR區(qū)域。浙江物種分類(lèi)小基因組測(cè)序銷(xiāo)售植物葉綠體和線粒體怎么取樣?
非編碼RNA分析:非編碼RNA(ncRNA)執(zhí)行多種生物學(xué)功能的RNA分子,其本身并不攜帶翻譯為蛋白質(zhì)的信息,直接在RNA水平對(duì)生命活動(dòng)發(fā)揮作用。相比于“垃圾RNA”的舊觀念,人們開(kāi)始認(rèn)識(shí)到生物體內(nèi)富含的這類(lèi)RNA的無(wú)窮潛力。研究非編碼RNA不僅為了解生物體的基因表達(dá)調(diào)控系統(tǒng)和生長(zhǎng)提供了重要信息。對(duì)于葉綠體而言,非編碼RNA的主要類(lèi)型包括rrn5,rrn4.5,rrn16,rrn23;植物線粒體的非編碼RNA類(lèi)型包括rrn5,rrn18,rrn26;***和動(dòng)物線粒體的非編碼RNA類(lèi)型包括rrnS,rrnL。
技術(shù)優(yōu)勢(shì):
1. 業(yè)內(nèi)**的mtDNA&cpDNA富集抽提服務(wù):自主研發(fā)的細(xì)胞器基因組富集提取技術(shù),高效實(shí)現(xiàn)高質(zhì)量細(xì)胞器基因組富集。
2. 一對(duì)一的生物信息分析,人工基因注釋矯正:告別在線注釋平臺(tái)的偏差,滿足NCBI數(shù)據(jù)庫(kù)上傳要求,高質(zhì)量結(jié)果交付,助力高水平研究。
3. **技術(shù)團(tuán)隊(duì)負(fù)責(zé)人均9年以上從業(yè)經(jīng)驗(yàn),項(xiàng)目經(jīng)驗(yàn)豐富,提供可以個(gè)性化方案定制。
4. 已完成葉綠體&線粒體基因組項(xiàng)目數(shù)百例,96%以上樣本實(shí)現(xiàn)完成圖水平交付。
5. 配套數(shù)據(jù)庫(kù)構(gòu)建服務(wù),提升科研水準(zhǔn),助力高水平研究發(fā)表。 小基因組測(cè)序的好處有很多。
葉綠體基因組楝科植物葉綠體揭示物種進(jìn)化遺傳標(biāo)記:以無(wú)患子科Acerbuergerianum為外群的系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)顯示4種新的楝科是印度楝(Azadirachtaindica)的單系姊妹進(jìn)化枝。在這個(gè)分支內(nèi),Cedrelaodorata和Entandrophragmacylindricum聚類(lèi)在一起,Khayasenegalensis和Carapaguianensis聚類(lèi)到一起。那么楝科葉綠體基因組標(biāo)簽區(qū)(BarcodingRegion)存在哪些潛在的特異性cpDNA變異?這些變異有何意義?文章選取了五種楝科植物和五種非楝科物種(無(wú)患子目和薔薇亞綱)cpDNA的matK基因(cpDNA保守基因之一,用于遺傳條碼)進(jìn)行比較分析,旨在鑒定潛在的楝科。鑒定了16個(gè)SNP位置,其中五個(gè)楝科個(gè)體顯示相同的核苷酸,其與相同位置的非楝科物種的核苷酸不同。在從GenBank下載的100個(gè)楝科物種的matK基因,序列多重比對(duì)進(jìn)一步分析這16個(gè)SNP位置。其中三個(gè)SNP位于matK基因的3’-末端,編碼C-末端與線粒體II內(nèi)含子的結(jié)構(gòu)域X同源的結(jié)構(gòu)域,并且與N-末端區(qū)域相比具有更高的堿性氨基酸。潛在的楝科特異性SNP的進(jìn)一步驗(yàn)證對(duì)木材或木制品的分類(lèi)學(xué)差異具有很大意義。 云生物提供小基因組測(cè)序建庫(kù)流程。甘肅動(dòng)植物線粒體基因組小基因組測(cè)序要多少錢(qián)
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eggNOG全稱為evolutionarygenealogyofgenes:Non-supervisedOrthologousGroups,是一個(gè)蛋白聚類(lèi)數(shù)據(jù)庫(kù),帶有功能描述和功能類(lèi)別說(shuō)明,由EMBL(歐洲分子生物實(shí)驗(yàn)室)維護(hù)。包含1,133個(gè)物種、共721,801個(gè)直系同源組、共41個(gè)不同水平的直系同源組分類(lèi),整合了5,214,234個(gè)蛋白序列。分別更新了4,873個(gè)COG數(shù)據(jù)庫(kù)信息和4,850個(gè)KOG數(shù)據(jù)庫(kù)信息。GO全稱為GeneOntology,一套國(guó)際標(biāo)準(zhǔn)化的基因功能描述的分類(lèi)系統(tǒng)。GO其分為三大類(lèi):1)細(xì)胞組分(CellularComponent):用于描述亞細(xì)胞結(jié)構(gòu)、位置和大分子復(fù)合物,如核仁、端粒和識(shí)別起始的復(fù)合物等;2)分子功能(MolecularFunction):用于描述基因、基因產(chǎn)物個(gè)體的功能,如與碳水化合物結(jié)合或ATP水解酶活性等;3)生物過(guò)程(BiologicalProcess):用來(lái)描述基因編碼的產(chǎn)物所參與的生物過(guò)程,如有絲分裂或嘌呤代謝等。Swiss-Prot,是2002年由UniProtconsortium建立的基因數(shù)據(jù)庫(kù),其特點(diǎn)在注釋結(jié)果經(jīng)過(guò)實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證,可靠性較高,可用作其他數(shù)據(jù)的參考。 浙江物種分類(lèi)小基因組測(cè)序銷(xiāo)售