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烈冰科技作為國內(nèi)同時擁有10X Genomics和BD Rhapsody雙分選平臺的測序服務(wù)商及云計算服務(wù)供應(yīng)商,經(jīng)過多年實戰(zhàn),擁有豐富的單細(xì)胞懸液制備和分選經(jīng)驗,實測BD Rhapsody對能夠高效捕獲粒細(xì)胞。針對不同的分選平臺、建庫方法,實戰(zhàn)總結(jié)搭建出不同...
所謂的高通量測序技術(shù),又名大規(guī)模平行測序,是將 DNA(或者 cDNA)隨機片段化、加接頭,制備測序文庫,通過對文庫中數(shù)以萬計的克隆(colony)進行延伸反應(yīng),檢測對應(yīng)的信號并獲取序列信息。與 傳統(tǒng)測序法相比,高通量測序技術(shù)在處理大規(guī)模樣品時具有強大的優(yōu)勢,...
烈冰生物已空間轉(zhuǎn)錄組測序服務(wù)提供從一個組織切片樣本中獲取包括空間信息在內(nèi)的全部轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù),從而可以區(qū)分和定位功能基因在特定組織區(qū)域內(nèi)的活躍表達。其可以檢測組織樣本中的所有基因活動,并繪制活動發(fā)生的位置,這將有助于科學(xué)家更好地構(gòu)建生物圖譜,并進一步理解疾病和生物...
同恒檢測可以實現(xiàn)方法開發(fā)驗證、配方成分檢測、元素分析測定、綜合解決方案、結(jié)構(gòu)分析確證、指定成分分析、腐蝕分析、模擬實驗、未知物成分分析、異物分析工業(yè)診斷、含量檢測測定等服務(wù)項目,業(yè)務(wù)范圍不僅涵蓋了傳統(tǒng)的日化、消費品、金屬、材料、保健食品、農(nóng)藥、紡織、涂料、醫(yī)療...
什么是染色質(zhì)可及性? 正常情況下,DNA與核小體纏繞折疊在一起形成染色質(zhì),但是DNA的復(fù)制、轉(zhuǎn)錄都是需要將染色體的高級結(jié)構(gòu)解開的,然而解壓并不需要將整個染色體全部打開,而只需要打開一部分,即需要表達基因的區(qū)域。這部分打開的染色質(zhì),就叫開放染色質(zhì)(open ch...
烈冰科技自主研發(fā)的單細(xì)胞云平臺致力于幫助每一位客戶定制化分析數(shù)據(jù),深入解讀數(shù)據(jù)分析結(jié)果,深入挖掘其背后的生物學(xué)意義;從操作便捷、結(jié)果可視化、分析可追溯、系統(tǒng)穩(wěn)定等方面助力單細(xì)胞研究,加速科研進程!此外,烈冰生信團隊根據(jù)豐富的實戰(zhàn)經(jīng)驗為用戶量身打造了一款單細(xì)胞測...
單細(xì)胞測序技術(shù)(Single Cell Sequencing)從一種新興的研究角度,借助已有的高通量測序手段,幫助研究者在疾病樣本的異質(zhì)性、樣本微環(huán)境、發(fā)育學(xué)、免疫學(xué)以及其他領(lǐng)域中進行單細(xì)胞層面的數(shù)據(jù)解析,解決了Bulk Population Sequenci...
基于10X Next GEM技術(shù),單細(xì)胞免疫組庫測序一次實驗可以同時檢測近萬個細(xì)胞,可在一個樣本中同時獲5'端mRNA表達譜、TCR和BCR的信息,結(jié)合基因的表達譜和V(D)J數(shù)據(jù)進行復(fù)雜組織樣本的是影響免疫應(yīng)答分析,監(jiān)測免疫療法的效果,研究疾病發(fā)生、發(fā)展的...
基于10X Geomics 動態(tài)微流控技術(shù),利用Tn5轉(zhuǎn)座酶酶切開放染色質(zhì),形成短片段,單細(xì)胞ATAC測序在表觀基因組學(xué)水平上,揭示單細(xì)胞染色質(zhì)的可及性問題,區(qū)分細(xì)胞異質(zhì)性,獲得開放染色質(zhì)的位置、轉(zhuǎn)錄因子的結(jié)合位點、核小體的調(diào)控區(qū)域和染色質(zhì)狀態(tài)等信息,是單細(xì)胞...
空間組測序技術(shù),作為現(xiàn)階段單細(xì)胞技術(shù)的重要補充技術(shù)進入了組學(xué)的實驗領(lǐng)域以及生物信息學(xué)的分析領(lǐng)域。通過單細(xì)胞測序(單細(xì)胞表達尺度)+ 空間轉(zhuǎn)錄組測序(空間表達尺度)+數(shù)字病理(臨床診斷尺度)聯(lián)合分析可在空間和時間上描述不斷演變的組織生態(tài)系統(tǒng),多角度深入分析組織的...
空間轉(zhuǎn)錄組測序的數(shù)據(jù)質(zhì)量和玻片有效區(qū)域的利用率、貼片的質(zhì)量和透化時間息息相關(guān)。貼片質(zhì)量不良會影響總的有效spot數(shù)等;而透化不合理會導(dǎo)致spot的reads數(shù)、基因中位數(shù)等參數(shù)。而 在特異性基因表達方面,我們也可以統(tǒng)計空間轉(zhuǎn)錄組群體的特異性基因表達即Marke...
所謂的高通量測序技術(shù),又名大規(guī)模平行測序,是將 DNA(或者 cDNA)隨機片段化、加接頭,制備測序文庫,通過對文庫中數(shù)以萬計的克隆(colony)進行延伸反應(yīng),檢測對應(yīng)的信號并獲取序列信息。與 傳統(tǒng)測序法相比,高通量測序技術(shù)在處理大規(guī)模樣品時具有強大的優(yōu)勢,...
單細(xì)胞測序?qū)嶒炘贅颖炯?xì)胞上機分選簽,需要對細(xì)胞數(shù)量、細(xì)胞活性進行準(zhǔn)確判斷,這對Single Cell分選標(biāo)記、建庫、下機數(shù)據(jù)的質(zhì)量都具有著決定性的作用。如若細(xì)胞計數(shù)偏高,將會影響建庫的成功率;計數(shù)偏低,則會顯著提高雙細(xì)胞的比例;而細(xì)胞活率過低,就會使測序數(shù)據(jù)的...
單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序是在單細(xì)胞水平上高通量測序分析基因表達譜的技術(shù),突破傳統(tǒng)高通量測序的局限性,組織解離后,單個樣本一次上機能捕獲500-20000個細(xì)胞, 基于每個細(xì)胞分別建庫測序,獲得單個細(xì)胞的基因結(jié)構(gòu)和基因表達狀態(tài),并鑒定細(xì)胞的類型,可以在不同樣本間從細(xì)胞類...
免疫組庫測序有必要做嗎? 對于十的十二次方個以上的抗原識別基數(shù)來說,群體和個體間的免疫組庫的豐富程度能夠直接反應(yīng)機體免疫系統(tǒng)情況,通常TCR/BCR的亞型越多,機體識別病原的能力越強,越不容易患病,但超過一定限度,也容易引發(fā)自身免疫性疾病。且機體的免疫組庫也不...
RNA測序(RNA-seq)是轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究的重要工具,也是生命科學(xué)領(lǐng)域常用的技術(shù)之一。相比于傳統(tǒng)通路研究低維度、低通量的局限性,轉(zhuǎn)錄組學(xué)有以下優(yōu)勢:1)能夠動態(tài)考察細(xì)胞基因組的表達,多維度地反映差異變化;2)可用于研究占RNA絕大部分的非編碼RNA,研究其結(jié)構(gòu)...
空間轉(zhuǎn)錄組測序的數(shù)據(jù)分析基本分為三個階段:1. 數(shù)據(jù)的預(yù)處理部分;2. Spot點陣的分群與定義;3. Spot分群的功能與生物學(xué)價值。每一個部分都不可或缺,其結(jié)果都對后續(xù)的分析結(jié)果有重要影響。由于空間轉(zhuǎn)錄組的序列結(jié)構(gòu)與單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序的左端序列結(jié)構(gòu)是非常接近...
烈冰科技于2010年誕生之初便立足于高通量測序行業(yè),為科研學(xué)者提供專注的測序數(shù)據(jù)分析服務(wù),先后經(jīng)歷基因芯片時代、基因測序、轉(zhuǎn)錄組測序時代...在科技日新月異的洪流中始終獨占鰲頭。2018年以來,單細(xì)胞測序進入發(fā)展的快車道,烈冰作為國內(nèi)首批引進單細(xì)胞實驗雙平臺的...
不同類型的細(xì)胞或者在不同的條件下,活細(xì)胞中染色質(zhì)的結(jié)構(gòu)是在不斷變化的,比如說各種應(yīng)激反應(yīng)(stimulus response)和抗逆反應(yīng)(stress response)等,也就是說染色質(zhì)的可及性是會隨細(xì)胞類型和外界刺激的改變而發(fā)生變化,而染色質(zhì)開放區(qū)域的定向...
細(xì)胞中基因的表達是嚴(yán)格按照時間和空間順序發(fā)生,因此細(xì)胞類型和基因表達具有時間特異性和空間特異性。時間特異性可以通過收集不同時間點的樣本進行單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序來分析。但是單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序(scRNA-Seq)在單細(xì)胞懸液制備的過程中破壞了細(xì)胞的空間結(jié)構(gòu),無法給出固...
當(dāng)下,單細(xì)胞測序已經(jīng)廣泛應(yīng)用于多種疾病發(fā)展過程中的關(guān)鍵過程和事件,如疾病從輕癥病變向惡性的轉(zhuǎn)化、惡性向轉(zhuǎn)移病變的發(fā)展,以及疾病對多種藥物的反應(yīng)等等。單細(xì)胞測序技術(shù)作為一個需要將組織解離成為單細(xì)胞懸液,或者是采用細(xì)胞核捕獲的策略捕獲單細(xì)胞核,進而對于每一個單細(xì)胞...
同恒檢測可以實現(xiàn)方法開發(fā)驗證、配方成分檢測、元素分析測定、綜合解決方案、結(jié)構(gòu)分析確證、指定成分分析、腐蝕分析、模擬實驗、未知物成分分析、異物分析工業(yè)診斷、含量檢測測定等服務(wù)項目,業(yè)務(wù)范圍不僅涵蓋了傳統(tǒng)的日化、消費品、金屬、材料、保健食品、農(nóng)藥、紡織、涂料、醫(yī)療...
其實,空間轉(zhuǎn)錄組的概念早就已經(jīng)存在了,目前已經(jīng)發(fā)表的空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)有 Slide-seq , LCM-seq , seqFISH, MERFISH , Liver single cell zonation , Geo-seq and Tomo-seq。但是這些...
相對于Smart-Seq技術(shù)在細(xì)胞數(shù)量上的問題,BD和10X這兩個平臺普遍提供的細(xì)胞數(shù)量都在1-6K不等的測序細(xì)胞量,這個量級的測序細(xì)胞量已經(jīng)可以說能夠完全覆蓋絕大部分組織的Single Cell群體類型。因此,這兩種技術(shù)對于基于基因表達進行準(zhǔn)確細(xì)胞分型上,無...
隨著單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)(scRNA-Seq)的蓬勃發(fā)展,其在在胚胎發(fā)育,腫瘤細(xì)胞異質(zhì)性,免疫細(xì)胞轉(zhuǎn)化等多方面屢建奇功,但是由于細(xì)胞形態(tài)的不同和單細(xì)胞制備中細(xì)胞敏感性的差異等因素影響,scRNA-Seq在數(shù)據(jù)分析時可能會出現(xiàn)細(xì)胞類型占比失真,個別細(xì)胞類型丟失等...
基于10X Next GEM技術(shù),單細(xì)胞免疫組庫測序一次實驗可以同時檢測近萬個細(xì)胞,可在一個樣本中同時獲5'端mRNA表達譜、TCR和BCR的信息,結(jié)合基因的表達譜和V(D)J數(shù)據(jù)進行復(fù)雜組織樣本的是影響免疫應(yīng)答分析,監(jiān)測免疫療法的效果,研究疾病發(fā)生、發(fā)展的...
基于橋式PCR技術(shù)的簇生成可以將模版鏈迅速擴增成千上萬倍,保證過程中足夠的測序深度。測序時使用特殊標(biāo)記的dNTP:1)堿基上通過敏感鍵修飾上不同的熒光基團,用于區(qū)分ATCG;2)3'端使用疊氮基團封閉,保證一次循環(huán)只上一個dNTP。每一輪循環(huán)結(jié)束時,會通過高速...
烈冰科技于2010年誕生之初便立足于高通量測序行業(yè),為科研學(xué)者提供專注的測序數(shù)據(jù)分析服務(wù),先后經(jīng)歷基因芯片時代、基因測序、轉(zhuǎn)錄組測序時代...在科技日新月異的洪流中始終獨占鰲頭。2018年以來,單細(xì)胞測序進入發(fā)展的快車道,烈冰作為國內(nèi)首批引進單細(xì)胞實驗雙平臺的...
單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序是在單細(xì)胞水平上高通量測序分析基因表達譜的技術(shù),突破傳統(tǒng)高通量測序的局限性,組織解離后,單個樣本一次上機能捕獲500-20000個細(xì)胞, 基于每個細(xì)胞分別建庫測序,獲得單個細(xì)胞的基因結(jié)構(gòu)和基因表達狀態(tài),并鑒定細(xì)胞的類型,可以在不同樣本間從細(xì)胞類...