重慶單細胞免疫組庫測序

什么是染色質(zhì)可及性？ 正常情況下，DNA與核小體纏繞折疊在一起形成染色質(zhì)，但是DNA的復(fù)制、轉(zhuǎn)錄都是需要將染色體的高級結(jié)構(gòu)解開的，然而解壓并不需要將整個染色體全部打開，而只需要打開一部分，即需要表達基因的區(qū)域。這部分打開的染色質(zhì)，就叫開放染色質(zhì)（open chromatin）。打開染色質(zhì)，允許部分調(diào)控蛋白（比如轉(zhuǎn)錄因子和輔因子）過來與之相結(jié)合的特性，即染色質(zhì)的可及性（chromatin accessibility）。ATAC-seq（Assay for Transposase-Accessible Chromatin with highthroughput sequencing），即利用轉(zhuǎn)座酶研究染色質(zhì)可及性的高通量測序技術(shù)，通俗來說就是將攜帶測序信息的轉(zhuǎn)座酶等插入開放性染色質(zhì)中進行識別，進一步通過高通量測序及生物信息學(xué)分析來挖掘相關(guān)基因信息，以探究生物學(xué)相關(guān)問題。與ScRNA-Seq類似，ScATAC-seq也是在ATAC-Seq的基礎(chǔ)上，解決不同細胞群體的異質(zhì)性的問題，檢出混雜樣品測序所無法得到的異質(zhì)性信息。烈冰單細胞多組學(xué)測序助您深入探究細胞類型特異性和基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)特征。重慶單細胞免疫組庫測序

基于10X Next GEM技術(shù)，單細胞免疫組庫測序一次實驗可以同時檢測近萬個細胞，可在一個樣本中同時獲5'端mRNA表達譜、TCR和BCR的信息，結(jié)合基因的表達譜和V(D)J數(shù)據(jù)進行復(fù)雜組織樣本的是影響免疫應(yīng)答分析，監(jiān)測免疫療法的效果，研究疾病發(fā)生、發(fā)展的分子機制。 烈冰單細胞免疫組庫平臺具備：1000+ TCR/BCR項目經(jīng)驗，一次實驗可同時獲取1000-20000個細胞的文庫構(gòu)建，獲得轉(zhuǎn)錄組和免疫組數(shù)據(jù)； 具備完善的免疫組庫測序和實驗質(zhì)控流程，獲取V(D)J全長序列的配對信息；豐富的免疫組庫測序和數(shù)據(jù)分析經(jīng)驗，實現(xiàn)專屬個性化數(shù)據(jù)分析服務(wù)，搭配單細胞分析云平臺，一鍵導(dǎo)出交互性的動態(tài)結(jié)果報告。單細胞多組學(xué)測序技術(shù)支持單細胞測序技術(shù)提供了單個細胞水平下的科學(xué)研究視角。

RNA測序（RNA-seq）是轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究的重要工具，也是生命科學(xué)領(lǐng)域常用的技術(shù)之一。相比于傳統(tǒng)通路研究低維度、低通量的局限性，轉(zhuǎn)錄組學(xué)有以下優(yōu)勢：1）能夠動態(tài)考察細胞基因組的表達，多維度地反映差異變化；2）可用于研究占RNA絕大部分的非編碼RNA，研究其結(jié)構(gòu)以及在細胞生命活動中的重要調(diào)控作用；3）與蛋白組學(xué)研究相互補充，多角度呈現(xiàn)細胞水平的變化信息。作為轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究的技術(shù)基礎(chǔ)，RNA測序技術(shù)也在不斷地更新迭代，現(xiàn)如今更大通量、更深精度的測序為眾多科研和醫(yī)學(xué)工作者提供了豐富的工具和探索真理的手段。

空間轉(zhuǎn)錄組測序的數(shù)據(jù)分析基本分為三個階段：1. 數(shù)據(jù)的預(yù)處理部分；2. Spot點陣的分群與定義；3. Spot分群的功能與生物學(xué)價值。每一個部分都不可或缺，其結(jié)果都對后續(xù)的分析結(jié)果有重要影響。由于空間轉(zhuǎn)錄組的序列結(jié)構(gòu)與單細胞轉(zhuǎn)錄組測序的左端序列結(jié)構(gòu)是非常接近的，都是Cellbarcode/SpotBarcode + UMI + 捕獲區(qū)域這樣的設(shè)計。右端普遍為捕獲的RNA序列。因此采用單細胞的原始數(shù)據(jù)過濾策略即可，左端可以考慮切下捕獲區(qū)域前的序列區(qū)域作為后續(xù)分析用的序列以減少分析負荷。隨后，采用10X官方的Spatialranger的策略進行后續(xù)分析，解析出位于空間位置中的有效的Spot表達矩陣。測序可準確地分析基因表達差異、基因結(jié)構(gòu)變異、篩選分子標記（SNPs或SSR）等生命科學(xué)重要問題。

烈冰科技于2010年誕生之初便立足于高通量測序行業(yè)，為科研學(xué)者提供專注的測序數(shù)據(jù)分析服務(wù)，先后經(jīng)歷基因芯片時代、基因測序、轉(zhuǎn)錄組測序時代...在科技日新月異的洪流中始終獨占鰲頭。2018年以來，單細胞測序進入發(fā)展的快車道，烈冰作為國內(nèi)首批引進單細胞實驗雙平臺的公司，依托自主研發(fā)的NovelBrain?生物大數(shù)據(jù)分析平臺，為用戶提供一站式全流程的單細胞測序服務(wù)和解決方案。4年的單細胞技術(shù)的積累，烈冰已具備大鼠、小鼠、斑馬魚、猴、裸鼴鼠、水稻、擬南芥等10+物種，皮膚、腦、胰腺、脂肪、心臟、花序等50+組織類型，100+細胞類型，1000+靶標基因，10000+樣本處理經(jīng)驗?？臻g轉(zhuǎn)錄組可展示組織切片中不同區(qū)域的基因表達情況，揭示精細病理區(qū)域的信號通路。重慶單細胞免疫組庫測序

助力探索生命時空多維度的動態(tài)變化的生物學(xué)信息；助力生命健康醫(yī)療大時代！重慶單細胞免疫組庫測序

單細胞測序?qū)嶒炘贅颖炯毎蠙C分選簽，需要對細胞數(shù)量、細胞活性進行準確判斷，這對Single Cell分選標記、建庫、下機數(shù)據(jù)的質(zhì)量都具有著決定性的作用。如若細胞計數(shù)偏高，將會影響建庫的成功率；計數(shù)偏低，則會顯著提高雙細胞的比例；而細胞活率過低，就會使測序數(shù)據(jù)的利用率大打折扣，因此把好單細胞懸液質(zhì)量這一關(guān)尤為重要。而在鋪板過程中，由于不同操作人員手法具有不可避免的差異，不同的液體流速將直接影響單細胞的入孔效果。因此烈冰生物BD Rhapsody單細胞分選平臺配套了專門定制的電動移液器，其具有Prime Treat、Cell Load、Bead Load、Wash、Lysis、Retrieval多種操作模式，來對應(yīng)各種不同的操作。通過已經(jīng)設(shè)定的程序來控制液體的流速，大幅度降低人為操作習(xí)慣帶來的差異，保證實驗操作的一致性。重慶單細胞免疫組庫測序

上海烈冰生物醫(yī)藥科技有限公司是一家生物科技、醫(yī)藥科技、信息科技、計算機科技領(lǐng)域內(nèi)的技術(shù)開發(fā)、技術(shù)服務(wù)、技術(shù)轉(zhuǎn)讓、技術(shù)咨詢，市場營銷策劃，市場信息咨詢與調(diào)查（不得從事社會調(diào)查、社會調(diào)研、民意調(diào)查、民意測驗），從事貨物及技術(shù)的進出口業(yè)務(wù)，計算機、軟件及耗材（除?？兀?，軟件開發(fā)【依法須經(jīng)批準的項目，經(jīng)相關(guān)部門批準后方可開展經(jīng)營活動】的公司，是一家集研發(fā)、設(shè)計、生產(chǎn)和銷售為一體的專業(yè)化公司。烈冰生物深耕行業(yè)多年，始終以客戶的需求為向?qū)?，為客戶提?**的單細胞測序，生物大數(shù)據(jù)云分析平臺，空間轉(zhuǎn)錄組測序，單細胞多組學(xué)測序。烈冰生物致力于把技術(shù)上的創(chuàng)新展現(xiàn)成對用戶產(chǎn)品上的貼心，為用戶帶來良好體驗。烈冰生物始終關(guān)注自身，在風(fēng)云變化的時代，對自身的建設(shè)毫不懈怠，高度的專注與執(zhí)著使烈冰生物在行業(yè)的從容而自信。