成都單細(xì)胞測(cè)序數(shù)據(jù)分析

來(lái)源: 發(fā)布時(shí)間:2022-06-02

空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序的數(shù)據(jù)質(zhì)量和玻片有效區(qū)域的利用率、貼片的質(zhì)量和透化時(shí)間息息相關(guān)。貼片質(zhì)量不良會(huì)影響總的有效spot數(shù)等;而透化不合理會(huì)導(dǎo)致spot的reads數(shù)、基因中位數(shù)等參數(shù)。而 在特異性基因表達(dá)方面,我們也可以統(tǒng)計(jì)空間轉(zhuǎn)錄組群體的特異性基因表達(dá)即Markergene,將他們?cè)诮M織切片以及空轉(zhuǎn)上進(jìn)行著色。我們也可以對(duì)于任意一個(gè)已知的基因或者數(shù)據(jù)庫(kù)中的一些細(xì)胞Marker,然后將其在基因表達(dá)在空間轉(zhuǎn)錄組的切片以及HE染色上展示自己的基因表達(dá)進(jìn)而了解,群體中的可能的細(xì)胞組成關(guān)系。 烈冰斥巨資引進(jìn)Novaseq6000,開啟更大通量測(cè)序新紀(jì)元。成都單細(xì)胞測(cè)序數(shù)據(jù)分析

烈冰與國(guó)內(nèi)高校、研究所、醫(yī)院和藥企單位開展深度合作,服務(wù)于600+臨床與研究機(jī)構(gòu),1000+客戶和5000+重要科研項(xiàng)目,助力并聯(lián)合發(fā)表300+篇CNS等國(guó)際學(xué)術(shù)期刊(不完全統(tǒng)計(jì)),在單細(xì)胞領(lǐng)域,烈冰助力用戶發(fā)表單細(xì)胞文獻(xiàn)30+篇,總IF>300+,IF>10+以上文章占比65%以上,包含Immunity、Nature Cell Biology、Nature Plants 、Advanced Science等生物領(lǐng)域國(guó)際主流學(xué)術(shù)期刊,已發(fā)表文章研究領(lǐng)域涵蓋包括COVID-19研究、疾病發(fā)生轉(zhuǎn)移機(jī)制,免疫研究、腦神經(jīng)、白血病、胚胎發(fā)育、糖尿病、退行性疾病和植物領(lǐng)域研究等。重慶10X單細(xì)胞測(cè)序分析空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序以分子方式定義病理,完成了病理數(shù)字化結(jié)合病理影像化的革新。

單細(xì)胞測(cè)序是指針對(duì)單個(gè)細(xì)胞進(jìn)行全轉(zhuǎn)錄組測(cè)序分析,可精確地描述每一個(gè)細(xì)胞的狀態(tài),在異質(zhì)性發(fā)育過(guò)程中具有不可忽視的應(yīng)用價(jià)值。然而,單細(xì)胞測(cè)序無(wú)法給出固態(tài)異質(zhì)化組織中細(xì)胞空間排布信息,對(duì)于揭示發(fā)育過(guò)程、病理微環(huán)境都存在很大的局限性??臻g轉(zhuǎn)錄組測(cè)序以點(diǎn)陣形式記錄病理切片細(xì)胞的空間信息并進(jìn)行測(cè)序,可以精確指示點(diǎn)陣內(nèi)的全部基因表達(dá)情況??臻g轉(zhuǎn)錄組測(cè)序的加入,無(wú)疑讓單細(xì)胞測(cè)序如虎添翼,更精確地勾勒了組織水平的異質(zhì)性。

科研的魅力之處,在于無(wú)窮盡的探尋生命的本底,通過(guò)單細(xì)胞測(cè)序,我們對(duì)組織的分子基礎(chǔ)的研究也從初級(jí)到深層,并在單細(xì)胞層面逐漸達(dá)成一致,那么不禁要問(wèn)一句,組織的空間位置到底重不重要?空間異質(zhì)性是不同疾病樣本功能的關(guān)鍵特征,細(xì)胞的位置信息更能反應(yīng)細(xì)胞命運(yùn)調(diào)控機(jī)制和細(xì)胞譜系發(fā)生過(guò)程。因此時(shí)間和空間即像組織的AB面,而不可否認(rèn)的是,此時(shí)空間坐標(biāo)的記錄,像一個(gè)還未長(zhǎng)大的娃娃,雖未觸及分子基礎(chǔ)研究的深層,但仍在努力攀登探尋生命本底的下一個(gè)高峰。測(cè)序可準(zhǔn)確地分析基因表達(dá)差異、基因結(jié)構(gòu)變異、篩選分子標(biāo)記(SNPs或SSR)等生命科學(xué)重要問(wèn)題。

隨著單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序技術(shù)(scRNA-Seq)的蓬勃發(fā)展,其在在胚胎發(fā)育,腫瘤細(xì)胞異質(zhì)性,免疫細(xì)胞轉(zhuǎn)化等多方面屢建奇功,但是由于細(xì)胞形態(tài)的不同和單細(xì)胞制備中細(xì)胞敏感性的差異等因素影響,scRNA-Seq在數(shù)據(jù)分析時(shí)可能會(huì)出現(xiàn)細(xì)胞類型占比失真,個(gè)別細(xì)胞類型丟失等情況。為了克服單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)的局限性,單細(xì)胞核轉(zhuǎn)錄組測(cè)序技術(shù)(snRNA-Seq)應(yīng)運(yùn)而生,snRNA-Seq可利用凍存組織直接制備單細(xì)胞核進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測(cè)序,不僅克服了細(xì)胞形態(tài)差異致使的細(xì)胞捕獲差異,還克服了單細(xì)胞測(cè)序必須使用新鮮樣本的多個(gè)局限性。自主研發(fā)PanoCell單細(xì)胞實(shí)驗(yàn)測(cè)序平臺(tái)。上海單細(xì)胞多組學(xué)測(cè)序數(shù)據(jù)分析

深度的單細(xì)胞測(cè)序數(shù)據(jù)解讀助力生物健康醫(yī)療時(shí)代。成都單細(xì)胞測(cè)序數(shù)據(jù)分析

近年來(lái),我國(guó)醫(yī)藥健康以8%的速度增長(zhǎng),預(yù)計(jì)到2020年,我國(guó)醫(yī)用物流總額將達(dá)到3.8萬(wàn)億元,冷鏈物流的醫(yī)藥市場(chǎng)規(guī)?;蚩蛇_(dá)到1200億元,冷鏈物流市場(chǎng)不斷擴(kuò)大?!盎ヂ?lián)網(wǎng)+醫(yī)藥”流通行動(dòng)計(jì)劃的深入推進(jìn),以及電商巨頭的進(jìn)駐,勢(shì)必會(huì)讓傳統(tǒng)醫(yī)用物流企業(yè)迎來(lái)變革和創(chuàng)新,同時(shí)也給行業(yè)帶來(lái)新的發(fā)展機(jī)遇。我國(guó)高度重視單細(xì)胞測(cè)序,生物大數(shù)據(jù)云分析平臺(tái),空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序,單細(xì)胞多組學(xué)測(cè)序的供應(yīng)保證工作,推動(dòng)研發(fā)和供應(yīng)保證也是深化醫(yī)藥衛(wèi)生體制改進(jìn)的重要任務(wù)。醫(yī)藥相關(guān)部門多次發(fā)布政策文件,鼓勵(lì)單細(xì)胞測(cè)序,生物大數(shù)據(jù)云分析平臺(tái),空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序,單細(xì)胞多組學(xué)測(cè)序的研發(fā)和生產(chǎn),提高醫(yī)藥的供應(yīng)保證能力??傮w而言,健康科技行業(yè)前景光明。在過(guò)去五年里,這一行業(yè)的穩(wěn)健增長(zhǎng)已經(jīng)給未上市有限責(zé)任公司(自然)公司帶來(lái)逾270億美元的收入,14家公司的估值超過(guò)10億美元。另外,2019年退出總價(jià)值已經(jīng)超過(guò)2018年,達(dá)到創(chuàng)紀(jì)錄的80億美元,這在很大程度上是因?yàn)閺?qiáng)勁IPO的推動(dòng)。生物科技、醫(yī)藥科技、信息科技、計(jì)算機(jī)科技領(lǐng)域內(nèi)的技術(shù)開發(fā)、技術(shù)服務(wù)、技術(shù)轉(zhuǎn)讓、技術(shù)咨詢,市場(chǎng)營(yíng)銷策劃,市場(chǎng)信息咨詢與調(diào)查(不得從事社會(huì)調(diào)查、社會(huì)調(diào)研、民意調(diào)查、民意測(cè)驗(yàn)),從事貨物及技術(shù)的進(jìn)出口業(yè)務(wù),計(jì)算機(jī)、軟件及耗材(除??兀浖_發(fā)【依法須經(jīng)批準(zhǔn)的項(xiàng)目,經(jīng)相關(guān)部門批準(zhǔn)后方可開展經(jīng)營(yíng)活動(dòng)】是我國(guó)國(guó)民經(jīng)濟(jì)重要組成部分之一,具有高產(chǎn)出、高危險(xiǎn)、高技術(shù)密集型特點(diǎn),有很強(qiáng)的技術(shù)壁壘。而且對(duì)于保護(hù)和增進(jìn)大家健康、提高生活質(zhì)量,為計(jì)劃生育、救災(zāi)防疫、**戰(zhàn)備以及促進(jìn)經(jīng)濟(jì)發(fā)展和社會(huì)進(jìn)步均具有十分重要的作用。成都單細(xì)胞測(cè)序數(shù)據(jù)分析

上海烈冰生物醫(yī)藥科技有限公司致力于醫(yī)藥健康,以科技創(chuàng)新實(shí)現(xiàn)***管理的追求。烈冰生物作為生物科技、醫(yī)藥科技、信息科技、計(jì)算機(jī)科技領(lǐng)域內(nèi)的技術(shù)開發(fā)、技術(shù)服務(wù)、技術(shù)轉(zhuǎn)讓、技術(shù)咨詢,市場(chǎng)營(yíng)銷策劃,市場(chǎng)信息咨詢與調(diào)查(不得從事社會(huì)調(diào)查、社會(huì)調(diào)研、民意調(diào)查、民意測(cè)驗(yàn)),從事貨物及技術(shù)的進(jìn)出口業(yè)務(wù),計(jì)算機(jī)、軟件及耗材(除專控),軟件開發(fā)【依法須經(jīng)批準(zhǔn)的項(xiàng)目,經(jīng)相關(guān)部門批準(zhǔn)后方可開展經(jīng)營(yíng)活動(dòng)】的企業(yè)之一,為客戶提供良好的單細(xì)胞測(cè)序,生物大數(shù)據(jù)云分析平臺(tái),空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序,單細(xì)胞多組學(xué)測(cè)序。烈冰生物繼續(xù)堅(jiān)定不移地走高質(zhì)量發(fā)展道路,既要實(shí)現(xiàn)基本面穩(wěn)定增長(zhǎng),又要聚焦關(guān)鍵領(lǐng)域,實(shí)現(xiàn)轉(zhuǎn)型再突破。烈冰生物創(chuàng)始人陳岱,始終關(guān)注客戶,創(chuàng)新科技,竭誠(chéng)為客戶提供良好的服務(wù)。