從單細(xì)胞測(cè)序描述性分析轉(zhuǎn)向復(fù)雜樣本中不同細(xì)胞類型的功能解析，越來(lái)越需要一種多組學(xué)的細(xì)胞生物學(xué)視角。通過(guò)單細(xì)胞多組學(xué)——即對(duì)不同組學(xué)的數(shù)據(jù)集進(jìn)行分析和整合——科學(xué)家能夠從同一個(gè)單細(xì)胞來(lái)源中檢測(cè)多種細(xì)胞特征。這些特征包括全轉(zhuǎn)錄組基因表達(dá)、細(xì)胞表面蛋白表達(dá)、免疫組庫(kù)...

關(guān)于10X Genomics單細(xì)胞平臺(tái)的樣本類型和樣本制備 ：10X平臺(tái)在上機(jī)前需要注意細(xì)胞消化后的細(xì)胞團(tuán)塊，獲得分離良好的細(xì)胞懸液、無(wú)細(xì)胞隨便、極少的細(xì)胞團(tuán)塊，且細(xì)胞活力高（＞70%）；此外，了解您所研究細(xì)胞的大小范圍也很重要。細(xì)胞大小通常與細(xì)胞表達(dá)的轉(zhuǎn)錄本...

針對(duì)單細(xì)胞測(cè)序的細(xì)胞數(shù)量判斷環(huán)節(jié)：主要是對(duì)細(xì)胞數(shù)量、基因表達(dá)量、測(cè)序質(zhì)量進(jìn)行整體描述。過(guò)濾標(biāo)準(zhǔn)：由于細(xì)胞破碎后游離RNA會(huì)釋放到環(huán)境或孔中，并且測(cè)序中也會(huì)存在一些死細(xì)胞，導(dǎo)致數(shù)據(jù)存在background值。因此，我們需要設(shè)定一定的標(biāo)準(zhǔn)來(lái)過(guò)濾掉假細(xì)胞或死細(xì)胞。以...

根據(jù)烈冰多年單細(xì)胞測(cè)序服務(wù)經(jīng)驗(yàn)，為什么不建議您一味的追求高細(xì)胞數(shù)量的捕獲：?jiǎn)渭?xì)胞測(cè)序所有的分析都是基于細(xì)胞聚類進(jìn)行，而細(xì)胞聚類是在區(qū)分cell和non-cell后，獲得細(xì)胞基因表達(dá)譜，通過(guò)降維（pca），無(wú)監(jiān)督聚類以及可視化（t-SNE）得到的。進(jìn)行細(xì)胞聚類時(shí)...

所謂的高通量測(cè)序技術(shù)，又名大規(guī)模平行測(cè)序，是將 DNA（或者 cDNA）隨機(jī)片段化、加接頭，制備測(cè)序文庫(kù)，通過(guò)對(duì)文庫(kù)中數(shù)以萬(wàn)計(jì)的克隆(colony)進(jìn)行延伸反應(yīng)，檢測(cè)對(duì)應(yīng)的信號(hào)，獲取序列信息。與傳統(tǒng)測(cè)序法（Sanger法等）相比，高通量測(cè)序技術(shù)在處理大規(guī)模樣品...

從單細(xì)胞測(cè)序描述性分析轉(zhuǎn)向復(fù)雜樣本中不同細(xì)胞類型的功能解析，越來(lái)越需要一種多組學(xué)的細(xì)胞生物學(xué)視角。通過(guò)單細(xì)胞多組學(xué)——即對(duì)不同組學(xué)的數(shù)據(jù)集進(jìn)行分析和整合——科學(xué)家能夠從同一個(gè)單細(xì)胞來(lái)源中檢測(cè)多種細(xì)胞特征。這些特征包括全轉(zhuǎn)錄組基因表達(dá)、細(xì)胞表面蛋白表達(dá)、免疫組庫(kù)...

根據(jù)烈冰多年單細(xì)胞測(cè)序服務(wù)經(jīng)驗(yàn)，為什么不建議您一味的追求高細(xì)胞數(shù)量的捕獲：?jiǎn)渭?xì)胞測(cè)序所有的分析都是基于細(xì)胞聚類進(jìn)行，而細(xì)胞聚類是在區(qū)分cell和non-cell后，獲得細(xì)胞基因表達(dá)譜，通過(guò)降維（pca），無(wú)監(jiān)督聚類以及可視化（t-SNE）得到的。進(jìn)行細(xì)胞聚類時(shí)...

您的珍貴樣本，可以放心依賴烈冰生物BD Rhapsody單細(xì)胞捕獲系統(tǒng)，首先，該系統(tǒng)的技術(shù)原理是基于cyto-seq的微孔技術(shù)，因此不會(huì)因?yàn)闃颖炯?xì)胞體積太大或懸液背景太雜等問(wèn)題導(dǎo)致捕獲通道的堵塞進(jìn)而導(dǎo)致樣本的損失；其次，BD RhapsodyTM單細(xì)胞捕獲系統(tǒng)...

烈冰生物BD Rhapsody平臺(tái)，采用精簡(jiǎn)的工作流程助力您的實(shí)驗(yàn)成功： 1.制備單細(xì)胞懸液：可使用碧迪醫(yī)療單細(xì)胞多樣本分析試劑盒和 /或BD Ab-seq寡核苷酸偶聯(lián)抗體( Ab-Oligos)將細(xì)胞染色 2.微孔板預(yù)充和處理:使用自動(dòng)移液器進(jìn)行液體交換 3...

基于測(cè)序的數(shù)據(jù)能夠?qū)⒄蔑@其強(qiáng)大之處，因?yàn)樗軌蛄私馔粏渭?xì)胞的多種生物分析指標(biāo)。如果說(shuō)單細(xì)胞基因表達(dá)提供了一種顏色的詳細(xì)信息，那么單細(xì)胞多組學(xué)提供了同一細(xì)節(jié)的全彩色圖譜，為您帶來(lái)樣本的真實(shí)視圖。烈冰自2019年引進(jìn)的BD Rhapsody單細(xì)胞平臺(tái)以來(lái)，能夠從...

現(xiàn)有的單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)陣營(yíng)在幾個(gè)主要領(lǐng)域存在差別。一個(gè)是基于微流控通道的細(xì)胞與Beads的在通道內(nèi)的動(dòng)態(tài)結(jié)合，通過(guò)油相水相不相容的特點(diǎn)將結(jié)合了的細(xì)胞和Beads進(jìn)行分隔，在這個(gè)空間，單個(gè)細(xì)胞的內(nèi)容物釋放，轉(zhuǎn)錄本或其他生物分析物被標(biāo)記或添加索引，以便下游識(shí)別。BD...

多樣本數(shù)據(jù)合并：Fraction of Reads Kept：合并樣本時(shí)，各樣本根據(jù)Mapped Barcoded Reads per Cell數(shù)量計(jì)算出來(lái)的數(shù)據(jù)利用率。如果各樣本間該參數(shù)值相差很大，需要進(jìn)行Downsample處理，以數(shù)據(jù)量少的樣本為基準(zhǔn)將不...

關(guān)于單細(xì)胞測(cè)序?qū)嶒?yàn)樣本制備，這與流式細(xì)胞術(shù)用戶熟悉的步驟完全一致，也就是通過(guò)酶促或機(jī)械消化、細(xì)胞分選或其他細(xì)胞分離技術(shù)從整個(gè)樣本中制備生成活的單細(xì)胞懸液。隨后是細(xì)胞計(jì)數(shù)和質(zhì)量控制步驟，以確保您的樣本有適當(dāng)濃度的活細(xì)胞，并且不含細(xì)胞團(tuán)塊和死細(xì)胞碎片。如有必要，您...

所謂的高通量測(cè)序技術(shù)，又名大規(guī)模平行測(cè)序，是將 DNA（或者 cDNA）隨機(jī)片段化、加接頭，制備測(cè)序文庫(kù)，通過(guò)對(duì)文庫(kù)中數(shù)以萬(wàn)計(jì)的克隆(colony)進(jìn)行延伸反應(yīng)，檢測(cè)對(duì)應(yīng)的信號(hào)，獲取序列信息。與傳統(tǒng)測(cè)序法（Sanger法等）相比，高通量測(cè)序技術(shù)在處理大規(guī)模樣品...

烈冰生物搭建近10臺(tái)BD Rhapsody平臺(tái)，目前為全國(guó)范圍內(nèi)的高校、醫(yī)院和研究所等單位的科研學(xué)者提供服務(wù)，BD Rhapsody平臺(tái)采用U型微孔板，1個(gè)板即對(duì)應(yīng)1個(gè)樣本（不混樣的情況下），每個(gè)通道一般捕獲細(xì)胞數(shù)在1000-10000個(gè)之間，而上限可捕獲40...

烈冰生物單細(xì)胞測(cè)序服務(wù)體系，不僅提供10X Genomics和BD Rhapsody兩大國(guó)際認(rèn)可的單細(xì)胞實(shí)驗(yàn)平臺(tái)，在“附加”產(chǎn)品上，我們提供BD FACS Melody流式細(xì)胞儀，滿足您對(duì)特殊細(xì)胞類型的富集需求，自主研發(fā)的Panocell單細(xì)胞捕獲芯片，可兼容...

對(duì)于單細(xì)胞測(cè)序而言，常常需要先構(gòu)建細(xì)胞圖譜，在此基礎(chǔ)上再開(kāi)展后續(xù)各項(xiàng)分析，并且數(shù)據(jù)分析時(shí)以細(xì)胞聚類（cell cluster）為討論對(duì)象，而不是像常規(guī)Bulk測(cè)序一樣以組別為分析對(duì)象，因此單細(xì)胞測(cè)序項(xiàng)目對(duì)樣本入組要求沒(méi)有Bulk測(cè)序那樣嚴(yán)格，但是單細(xì)胞測(cè)序，特...

單細(xì)胞測(cè)序龐大的數(shù)據(jù)烈冰生信團(tuán)隊(duì)傾情研發(fā)的NovelBrain?生信大數(shù)據(jù)分析平臺(tái)，可實(shí)現(xiàn)零代碼操作、簡(jiǎn)單方便：?jiǎn)渭?xì)胞瀏覽器的操作簡(jiǎn)單，不需要命令行操作。簡(jiǎn)單拖拽、設(shè)置參數(shù)即可運(yùn)行，即使生信0基礎(chǔ)用戶也可以運(yùn)用自如；可視化展示海量結(jié)果文件：可視化展示Clust...

關(guān)于單細(xì)胞測(cè)序?qū)嶒?yàn)樣本制備，這與流式細(xì)胞術(shù)用戶熟悉的步驟完全一致，也就是通過(guò)酶促或機(jī)械消化、細(xì)胞分選或其他細(xì)胞分離技術(shù)從整個(gè)樣本中制備生成活的單細(xì)胞懸液。隨后是細(xì)胞計(jì)數(shù)和質(zhì)量控制步驟，以確保您的樣本有適當(dāng)濃度的活細(xì)胞，并且不含細(xì)胞團(tuán)塊和死細(xì)胞碎片。如有必要，您...

細(xì)胞計(jì)數(shù)和活力評(píng)估在評(píng)估樣本質(zhì)量時(shí)，需要在細(xì)胞清洗和過(guò)濾之后測(cè)定細(xì)胞活力，這一點(diǎn)至關(guān)重要。測(cè)定細(xì)胞活力有許多種方法，烈冰多年單細(xì)胞測(cè)序經(jīng)驗(yàn)發(fā)現(xiàn)臺(tái)盼藍(lán)法在鑒定活細(xì)胞與死細(xì)胞的比例時(shí)效果很好。細(xì)胞計(jì)數(shù)的準(zhǔn)確性以及目標(biāo)回收量和實(shí)際回收量之間的一致性，取決于我們了解樣...

您的珍貴樣本，還可以放心依賴烈冰生物BD Rhapsody單細(xì)胞捕獲系統(tǒng)，BD RhapsodyTM單細(xì)胞捕獲系統(tǒng)采用微孔技術(shù)，對(duì)細(xì)胞的捕獲沒(méi)有偏好性，實(shí)現(xiàn)高達(dá)80%的微孔板捕獲率，由于單個(gè)微孔板中容納了22萬(wàn)+個(gè)微孔，而現(xiàn)階段單細(xì)胞測(cè)序?qū)嶒?yàn)技術(shù)通常要求單個(gè)樣...

烈冰生物BD Rhapsody平臺(tái)，采用精簡(jiǎn)的工作流程助力您的實(shí)驗(yàn)成功： 1.制備單細(xì)胞懸液：可使用碧迪醫(yī)療單細(xì)胞多樣本分析試劑盒和 /或BD Ab-seq寡核苷酸偶聯(lián)抗體( Ab-Oligos)將細(xì)胞染色 2.微孔板預(yù)充和處理:使用自動(dòng)移液器進(jìn)行液體交換 3...

針對(duì)單細(xì)胞測(cè)序的細(xì)胞數(shù)量判斷環(huán)節(jié)：主要是對(duì)細(xì)胞數(shù)量、基因表達(dá)量、測(cè)序質(zhì)量進(jìn)行整體描述。過(guò)濾標(biāo)準(zhǔn)：由于細(xì)胞破碎后游離RNA會(huì)釋放到環(huán)境或孔中，并且測(cè)序中也會(huì)存在一些死細(xì)胞，導(dǎo)致數(shù)據(jù)存在background值。因此，我們需要設(shè)定一定的標(biāo)準(zhǔn)來(lái)過(guò)濾掉假細(xì)胞或死細(xì)胞。以...

關(guān)于單細(xì)胞測(cè)序?qū)嶒?yàn)樣本制備，這與流式細(xì)胞術(shù)用戶熟悉的步驟完全一致，也就是通過(guò)酶促或機(jī)械消化、細(xì)胞分選或其他細(xì)胞分離技術(shù)從整個(gè)樣本中制備生成活的單細(xì)胞懸液。隨后是細(xì)胞計(jì)數(shù)和質(zhì)量控制步驟，以確保您的樣本有適當(dāng)濃度的活細(xì)胞，并且不含細(xì)胞團(tuán)塊和死細(xì)胞碎片。如有必要，您...

烈冰生物BD Rhapsody平臺(tái)，采用精簡(jiǎn)的工作流程助力您的實(shí)驗(yàn)成功： 1.制備單細(xì)胞懸液：可使用碧迪醫(yī)療單細(xì)胞多樣本分析試劑盒和 /或BD Ab-seq寡核苷酸偶聯(lián)抗體( Ab-Oligos)將細(xì)胞染色 2.微孔板預(yù)充和處理:使用自動(dòng)移液器進(jìn)行液體交換 3...

烈冰生物BD Rhapsody平臺(tái)，采用精簡(jiǎn)的工作流程助力您的實(shí)驗(yàn)成功： 1.制備單細(xì)胞懸液：可使用碧迪醫(yī)療單細(xì)胞多樣本分析試劑盒和 /或BD Ab-seq寡核苷酸偶聯(lián)抗體( Ab-Oligos)將細(xì)胞染色 2.微孔板預(yù)充和處理:使用自動(dòng)移液器進(jìn)行液體交換 3...

關(guān)于BD Rhapsody單細(xì)胞平臺(tái)的樣本類型和樣本制備 ：在上機(jī)前需要注意細(xì)胞消化后的細(xì)胞團(tuán)塊，獲得分離良好的細(xì)胞懸液、且細(xì)胞活力高（＞70%）；此外，了解您所研究細(xì)胞的大小范圍也很重要。細(xì)胞大小通常與細(xì)胞表達(dá)的轉(zhuǎn)錄本數(shù)量有關(guān)。各種尺寸不同的細(xì)胞（一般直徑不...

基因和基因產(chǎn)物并不是單獨(dú)運(yùn)作的，而是參與了相互關(guān)聯(lián)的復(fù)雜通路、網(wǎng)絡(luò)和分子系統(tǒng)，這些合在一起實(shí)現(xiàn)了細(xì)胞、組織和生物體的運(yùn)作。定義這些系統(tǒng)并確定它們的特征和相互作用，對(duì)于了解生物系統(tǒng)如何運(yùn)作至關(guān)重要?！睘榱送苿?dòng)科學(xué)發(fā)現(xiàn)，科學(xué)家們需要各種能夠幫助多方位了解其樣本的潛...

針對(duì)單細(xì)胞測(cè)序的細(xì)胞上樣數(shù)，為什么不建議捕獲到的細(xì)胞數(shù)量越高越好？一味地追求高數(shù)量的細(xì)胞捕獲可能會(huì)存在一些問(wèn)題。例如在上機(jī)細(xì)胞懸液濃度固定時(shí)，如果目標(biāo)細(xì)胞捕獲數(shù)增加到8000甚至10000，上樣細(xì)胞懸液體積勢(shì)必增加，在細(xì)胞懸液質(zhì)量不是很理想（細(xì)胞活性5%、結(jié)團(tuán)...

烈冰生物成立于2010年，與時(shí)俱進(jìn)，堅(jiān)持為科研學(xué)者提供國(guó)際前沿的高通量測(cè)序?qū)嶒?yàn)和深度的生物信息數(shù)據(jù)分析服務(wù)，已逐步發(fā)展為單細(xì)胞多組學(xué)檢測(cè)服務(wù)****。專注于“單細(xì)胞測(cè)序系列技術(shù)服務(wù)”的專精領(lǐng)域，在上海、北京、廣州、西安和江西等地?fù)碛袛?shù)千平辦公場(chǎng)所，并布局多...