病毒基因組測序是疾病診斷、流行病學(xué)調(diào)查和宿主-病原關(guān)系研究的重要手段。病毒的全基因組測序以及對應(yīng)的生物信息學(xué)分析方法是研究病毒進(jìn)化、毒力因子變異、疫病爆發(fā)之間的關(guān)系、疫病傳播途徑、不同遺傳變異的分布模式、疫病發(fā)生地理區(qū)域的基礎(chǔ)。與傳統(tǒng)Sanger測序相比,NG...
病毒全基因組測序定在探普生物長時間運(yùn)行過程中,我們接觸到的對病毒的全基因組進(jìn)行測序項(xiàng)目有比較豐富的應(yīng)用場景。先,從事基因進(jìn)化/疫苗/藥品/抗體研制方向的研究的研究者一定會用到測序。這種場景一般是用密集的sanger測序監(jiān)測某幾個關(guān)鍵基因,搭載一定頻率的全基因組...
深度測序技術(shù)稱為深度測序(deepsequencing),是因?yàn)樗菍鹘y(tǒng)測序技術(shù)的一次**性改變,它通過一次性對幾十萬到幾百萬條DNA分子進(jìn)行序列測定(之前只是幾十至多幾千個堿基),同時,如此的高通量測序使得對一個物種的轉(zhuǎn)錄組和基因組進(jìn)行細(xì)致全方面的分析成為...
宏基因組測序技術(shù)注意事項(xiàng):傳統(tǒng)微生物檢測由于時間長、陽性率低、檢測目標(biāo)單一,限制了傳染疾病的診治。宏基因組測序技術(shù)不依賴于微生物的分離培養(yǎng),克服了傳統(tǒng)的純培養(yǎng)方法的技術(shù)限制,為研究和開發(fā)利用占微生物種類99%以上的未可培養(yǎng)的微生物提供了一種新的途徑和良好的策略...
微生物的相關(guān)知識:微生物因?yàn)轶w積小、質(zhì)量輕、適應(yīng)性強(qiáng)、繁殖能力強(qiáng)等特點(diǎn),普遍分布于自然界中。它們存在于食品、化妝品、飼料、環(huán)境等人們能觸及的各個角落中。某些微生物對產(chǎn)品的污染,不只影響到產(chǎn)品本身的質(zhì)量,更嚴(yán)重的是它危及消費(fèi)者的健康和安全。微生物檢測的檢測項(xiàng)目:...
微生物鑒定方法:首先呢,就是從觀察顯微鏡下甚至光鏡下的微生物的的那個細(xì)胞的形態(tài),比如說,是球菌,還是桿菌,還是弧菌,還是螺旋菌,這都是可以從微生物的單個細(xì)胞形態(tài)上區(qū)分的。還有就是細(xì)胞的形態(tài),比如說是否有鞭毛、芽孢之類的東西,都是微生物鑒別的特征性特征。其次呢就...
對病毒進(jìn)行全基因組測序:在探普生物長時間運(yùn)行過程中,我們接觸到的對病毒的全基因組進(jìn)行測序項(xiàng)目有比較豐富的應(yīng)用場景。先,從事基因進(jìn)化/疫苗/藥品/抗體研制方向的研究的研究者一定會用到測序。這種場景一般是用密集的sanger測序監(jiān)測某幾個關(guān)鍵基因,搭載一定頻率的全...
病毒全基因組測序定:探普生物對病毒的全基因組進(jìn)行測序的實(shí)驗(yàn)基于二代測序技術(shù)。樣本經(jīng)過核酸純化-文庫構(gòu)建-生物信息學(xué)分析這3大基本流程后轉(zhuǎn)換成了序列數(shù)據(jù)。先,在核酸純化環(huán)節(jié),探普提供專門針對性的核酸純化樣本指南,以提高目的物種的核酸純度和得率,與此同時探普生物也...
RNA/DNA病毒測序?qū)Σ《净蚪M進(jìn)行測序是快速了解病毒突變、毒力變化、病毒型別的有效方法??梢愿鶕?jù)病毒基因組大小和類型,采用PCR、RT-PCR或shotgun測序法,對病毒的部分或全長基因組測序,結(jié)果準(zhǔn)確可靠。服務(wù)標(biāo)準(zhǔn):測出的序列準(zhǔn)確性在99%以上;病毒全...
傳統(tǒng)病原微生物檢測方法概況:隨著醫(yī)學(xué)微生物學(xué)研究技術(shù)的不斷發(fā)展,病原學(xué)診斷已不再局限于病原體水平,深入到分子水平、基因水平的檢測手段不斷出現(xiàn)并被應(yīng)用于臨床和實(shí)驗(yàn)。核酸分子雜交技術(shù)、PCR技術(shù)、基因芯片技術(shù)、高通量測序技術(shù)等檢測方法,自動化程度高,快速省時、無污...
未知病原鑒定測序:未知病原鑒定測序?qū)嶒?yàn)基于二代測序技術(shù)。樣本經(jīng)過核酸純化-文庫構(gòu)建-生物信息學(xué)分析這3大基本流程后轉(zhuǎn)換成了病原體的序列數(shù)據(jù)。首先,在核酸純化環(huán)節(jié),探普提供專門針對病原的核酸純化樣本指南,以提高病原純度和得率,與此同時探普生物也提供核酸純化服務(wù)。...
DNA病毒基因組的測序:動物、人、植物被特定病毒株侵染、分離到病毒株、連續(xù)傳代的病毒株往往都需要獲得盡量完整的基因組序列來指導(dǎo)下一步的研究,傳統(tǒng)的sanger測序需要了解序列、設(shè)計引物、做很多PCR,往往效率很低,而NGS作為一種無需特異性引物擴(kuò)增的測序方式,...
病毒全基因組測序相關(guān)知識:病毒全基因組測序,基因測序技術(shù)能鎖定個人病變基因,提前預(yù)防和調(diào)整。自上世紀(jì)90年代初,學(xué)界開始涉足“人類基因組計劃”。而傳統(tǒng)的測序方式是利用光學(xué)測序技術(shù)。用不同顏色的熒光標(biāo)記四種不同的堿基,然后用激光光源去捕捉熒光信號從而獲得待測基因...
探普生物進(jìn)行病毒基因組測序的流程:在探普生物進(jìn)行病毒基因組測序非常簡單,簡而言之,客戶只需要說清楚樣品情況,準(zhǔn)備樣品即可,其他事宜都由探普來進(jìn)行安排。大致流程如下:1)與銷售人員溝通項(xiàng)目需求和樣本情況;2)探普生物工作人員擬定項(xiàng)目合同,雙方協(xié)商合同內(nèi)容后簽字蓋...
微生物鑒定:微生物鑒定可以用微生物對噬菌體的敏感性作為指標(biāo)來鑒定微生物的種屬。因?yàn)楦鞣N噬菌體都有其嚴(yán)格的宿主范圍,不同的細(xì)菌作為噬菌體的宿主對應(yīng)有特定的已知特性的噬菌體,其和噬菌體的作用方式也有接合,轉(zhuǎn)化,轉(zhuǎn)接,溶原性轉(zhuǎn)換和原生質(zhì)體融合等多種方式。部分細(xì)菌可以...
病毒全基因組測序在政策促進(jìn)下,未來3—5年內(nèi),我國將在醫(yī)藥、保養(yǎng)短缺地區(qū)建設(shè)一批高水平臨床醫(yī)治中心、高層次的人才培養(yǎng)基地和高水平的科研創(chuàng)新與轉(zhuǎn)化平臺,培育一批品牌優(yōu)勢明顯、跨區(qū)域提供高水平服務(wù)的集團(tuán)。根據(jù)病毒測序,病毒全基因組測序,病毒宏基因組測序,未知病原鑒...
微生物檢測方法中常用的有平板菌落計數(shù)法,是根據(jù)每個活的細(xì)菌能長出一個菌落的原理設(shè)計的。取一定容量的菌懸液,作一系列的倍比稀釋,然后將定量的稀釋液進(jìn)行平板培養(yǎng),根據(jù)培養(yǎng)出的菌落數(shù),可算出活菌數(shù)。此法靈敏度高,是一種檢測污染活菌數(shù)的方法,也是目前國際上許多國家所采...
病毒全基因組測序定:上海探普生物科技有限公司的對病毒的全基因組進(jìn)行測序有什么優(yōu)勢?全國開設(shè)病毒相關(guān)測序的公司不超過5家,只有探普生物是專門為病毒研究者服務(wù)的,探普生物的研發(fā)團(tuán)隊(duì)和實(shí)驗(yàn)團(tuán)隊(duì)都來自全國各地病毒學(xué)、微生物學(xué)專業(yè)的高校,碩士及以上學(xué)歷成員超過60%,團(tuán)...
全基因組測序相關(guān)知識:全基因組測序是對未知基因組序列的物種進(jìn)行個體的基因組測序。全基因組預(yù)測的意義揭示了人類生、老、病和死的奧秘,使人類從根本上認(rèn)知疾病發(fā)生的原因,做到正確的調(diào)整疾病和盡早的預(yù)防疾病。每個人從開始就繼承了父母的DNA遺傳信息,并且攜帶一生,不易...
微生物因?yàn)轶w積小、質(zhì)量輕、適應(yīng)性強(qiáng)、繁殖能力強(qiáng)等特點(diǎn),普遍分布于自然界中。它們存在于食品、化妝品、飼料、環(huán)境等人們能觸及的各個角落中。某些微生物對產(chǎn)品的污染,不僅影響到產(chǎn)品本身的質(zhì)量,更嚴(yán)重的是它危及消費(fèi)者的健康和安全。微生物檢測的檢測項(xiàng)目:菌落總數(shù)、霉菌和酵...
微生物的相關(guān)知識:微生物因?yàn)轶w積小、質(zhì)量輕、適應(yīng)性強(qiáng)、繁殖能力強(qiáng)等特點(diǎn),普遍分布于自然界中。它們存在于食品、化妝品、飼料、環(huán)境等人們能觸及的各個角落中。某些微生物對產(chǎn)品的污染,不只影響到產(chǎn)品本身的質(zhì)量,更嚴(yán)重的是它危及消費(fèi)者的健康和安全。微生物檢測的檢測項(xiàng)目:...
深度測序和個性化醫(yī)學(xué)的范式相比,P4醫(yī)學(xué)更強(qiáng)調(diào)早期預(yù)測和預(yù)防,強(qiáng)調(diào)對患者了解的系統(tǒng)性和參與性。準(zhǔn)確醫(yī)學(xué)的概念則是在基因測序普及的基礎(chǔ)上,將整個個體的各種信息如生理信息(通過可穿戴設(shè)備可以即時監(jiān)控和收集到)和腸道菌群變化、各種組學(xué)信息(深度測序測定)整合,進(jìn)行準(zhǔn)...
二代測序應(yīng)用的患者類型的推薦:共識明確指出了二代測序應(yīng)用的患者類型及使用的時機(jī)的意見:對于神經(jīng)系統(tǒng)急性傳染/血流傳染/呼吸道傳染患者,3天是二代測序使用的時機(jī),在傳統(tǒng)方法(常規(guī)的生化檢查和培養(yǎng))3天未報陽性且經(jīng)驗(yàn)性調(diào)整無效時,強(qiáng)烈推薦二代測序檢測;對疑似病毒傳...
微生物檢測基礎(chǔ)知識:微生物檢測涉及多行業(yè)和領(lǐng)域,在實(shí)驗(yàn)室檢測中有著重要的地位。將微生物接到適于它生長繁殖的人工培養(yǎng)基上或活的生物體內(nèi)的過程叫做接種。劃線接種這是常用的接種方法。即在固體培養(yǎng)基表面作來回直線形的移動,就可達(dá)到接種的作用。常用的接種工具有接種環(huán),接...
病毒宏基因組測序:宏基因組測序?qū)Νh(huán)境樣本所有微生物基因組DNA進(jìn)行提取和高通量測序,分析樣本環(huán)境中所有微生物基因組信息。宏基因組測序解讀微生物群體的多樣性與豐度信息,分析微生物群體基因組及功能,也探求微生物與環(huán)境、微生物與宿主之間的關(guān)系,發(fā)掘和研究新的功能基因...
能實(shí)現(xiàn)對病毒的全基因組進(jìn)行測序的技術(shù)手段:早期在高通量測序技術(shù)普及之前,對病毒的全基因組進(jìn)行測序是通過非特異性擴(kuò)增+克隆結(jié)合sanger測序來完成的。當(dāng)物種有了參考的序列之后,可以通過特異性擴(kuò)增+sanger測序獲得全基因組序列。Sanger測序準(zhǔn)確度高,讀長...
宏基因組是指特定環(huán)境中全部微生物遺傳物質(zhì)的總和,宏基因組測序以特定環(huán)境中的整個微生物群落作為研究的對象,不需對微生物進(jìn)行分離培養(yǎng),而是提取環(huán)境微生物總DNA進(jìn)行研究。其擺脫了傳統(tǒng)研究中微生物分離培養(yǎng)的技術(shù)限制,在基因組水平解讀微生物群體的多樣性和豐度,探索微生...
新一代測序中基因從頭測序和重測序有什么區(qū)別?從頭測序的原理是生成互相分離的若干組帶放射性標(biāo)記的寡核苷酸,每組寡核苷酸都有固定的起點(diǎn),但卻隨機(jī)終止于特定的一種或者多種殘基上??梢詤^(qū)分長度只差一個核苷酸的不同DNA分子的條件下,對各組寡核苷酸進(jìn)行電泳分析,只要把幾...
病毒研究的發(fā)展常常與病毒培養(yǎng)和檢測方法的進(jìn)步有密切的關(guān)系,特別在脊椎動物病毒方面,小鼠和雞胚接種、組織培養(yǎng)、超速離心、凝膠電泳、電子顯微鏡和免疫測定等技術(shù),對病毒學(xué)的發(fā)展具有深刻的影響。 噬菌體的培養(yǎng)和檢測方法簡單。將噬菌體接種到易感細(xì)菌的肉湯培養(yǎng)物中,經(jīng)18...
深度測序和個性化醫(yī)學(xué)的范式相比,P4醫(yī)學(xué)更強(qiáng)調(diào)早期預(yù)測和預(yù)防,強(qiáng)調(diào)對患者了解的系統(tǒng)性和參與性。準(zhǔn)確醫(yī)學(xué)的概念則是在基因測序普及的基礎(chǔ)上,將整個個體的各種信息如生理信息(通過可穿戴設(shè)備可以即時監(jiān)控和收集到)和腸道菌群變化、各種組學(xué)信息(深度測序測定)整合,進(jìn)行準(zhǔn)...