傳統(tǒng)的血清學與分子生物學方法如ELISA與PCR，由于病原微生物的特異性差異，有時只能用于病原微生物特定種甚至特定種特定株系分離物的檢測；而電鏡與生物學接種鑒定方法又難以將病原微生物鑒定至物種水平。相比之下，高通量測序技術可以提供一條新的病原微生物鑒定途徑。病...

病原微生物二代測序也稱宏基因組測序（mNGS）是目前臨床上針對病原較常用的基因測序方法。通過對疑似傳染標本采集提取后（無需培養(yǎng)）直接進行高通量測序，利用病原微生物數(shù)據(jù)庫比對和分析后可以獲得疑似致病微生物種屬信息。基于NGS的宏基因組學檢測技術在2014年被用于...

基因芯片技術指的是通過微電子技術和微加工技術，將海量的基因寡核苷酸進行高密度且有序排列，使其排列在纖維膜和硅片等載體上，從而形成信息檢測芯片。采用基因芯片技術對檢測樣品DNA經(jīng)過PCR技術擴增后制備的探針點樣在基因芯片的表面，經(jīng)過熒光標記的寡核苷酸點和芯片表面...

傳統(tǒng)病原微生物檢測方法：隨著醫(yī)學微生物學研究技術的不斷發(fā)展，病原學診斷已不再局限于病原體水平，深入到分子水平、基因水平的檢測手段不斷出現(xiàn)并被應用于臨床和實驗。核酸分子雜交技術、PCR技術、基因芯片技術、高通量測序技術等檢測方法，自動化程度高，快速省時、無污染、...

病毒宏基因組學應用：病毒宏基因組學已經(jīng)應用到人類、動物和環(huán)境中，涉及到農(nóng)業(yè)、工業(yè)及畜牧業(yè)等各個領域，其應用范圍已延伸到海洋、湖水、熱泉、下水道等無機環(huán)境，以及組織病料、血液、呼吸道、動物排泄物等有機環(huán)境。應用病毒宏基因組學的方法研究佛羅里達綠海龜?shù)睦w維狀瘤組織...

微生物的相關知識：微生物因為體積小、質(zhì)量輕、適應性強、繁殖能力強等特點，普遍分布于自然界中。它們存在于食品、化妝品、飼料、環(huán)境等人們能觸及的各個角落中。某些微生物對產(chǎn)品的污染，不只影響到產(chǎn)品本身的質(zhì)量，更嚴重的是它危及消費者的健康和安全。微生物檢測的檢測項目：...

病毒是由一種核酸分子（DNA或RNA）與蛋白質(zhì)（Protein）構成或只由蛋白質(zhì)構成（如朊病毒）。根據(jù)遺傳物質(zhì)的組成，可分為單鏈DNA病毒（ssDNA）、雙鏈DNA病毒（dsDNA）、單鏈RNA病毒（ssRNA）、雙鏈RNA病毒（dsRNA）和蛋白質(zhì)病毒（如朊...

探普生物的病毒測序：由于探普生物具備處理大量多樣的病毒樣本的經(jīng)驗，熟知各類病毒樣本的特性，因此對于樣本準備有獨特的方法指南，這就為后續(xù)的分析結果打下了牢固的基礎，減少了客戶和公司之間的摩擦，也幾乎沒有售后問題。獨有的實驗和分析流程可兼容高復雜度低濃度的病毒核酸...

宏基因組是1998年提出的新名詞，其定義為“thegenomesofthetotalmicrobiotafoundinnature”,即生境中全部微小生物遺傳物質(zhì)的總和。它包含了可培養(yǎng)的和未可培養(yǎng)的微生物的基因，目前主要指環(huán)境樣品中的細菌和的基因組總和。而所謂...

微生物鑒定的方法：微生物鑒定的傳統(tǒng)的鑒定方法雖然仍被普遍使用，但存在兩大缺點。它們只適用于可以體外培養(yǎng)的生物體，而且一些菌株表現(xiàn)出不符合已知種屬模式的獨特的生化特性。許多現(xiàn)代方法并不依賴于活的培養(yǎng)物，它們常常能揭示通過傳統(tǒng)方法檢測不到的有機體之間的細微差別。P...

宏基因組測序的挑戰(zhàn)：背景干擾，病原樣本深藏在大量宿主和其它微生物之內(nèi)，臨床病原常為起始量低，背景噪音大的復雜樣本，大量宿主信號掩蓋了微量病原信號，致使敏感性偏低，難以有效區(qū)分。另外，因為RNA病毒需先轉化為互補DNA(cDNA)再進行測序，因此病原宏基因組測序...

對病毒的全基因組進行測序的價格合理，樣品具備什么條件才可以獲得比較質(zhì)量的組裝效果？其他公司對用于測序的樣本的要求較高。探普生物對病毒的全基因組進行測序是基于探普的專有流程，樣本要求非常低，不要求粒子純化，不要求總量到達微克，按探普的專門的收樣標準和送樣流程進行...

病毒宏基因組學應用：病毒宏基因組學已經(jīng)應用到人類、動物和環(huán)境中，涉及到農(nóng)業(yè)、工業(yè)及畜牧業(yè)等各個領域，其應用范圍已延伸到海洋、湖水、熱泉、下水道等無機環(huán)境，以及組織病料、血液、呼吸道、動物排泄物等有機環(huán)境。應用病毒宏基因組學的方法研究佛羅里達綠海龜?shù)睦w維狀瘤組織...

微生物因為體積小、質(zhì)量輕、適應性強、繁殖能力強等特點，普遍分布于自然界中。它們存在于食品、化妝品、飼料、環(huán)境等人們能觸及的各個角落中。某些微生物對產(chǎn)品的污染，不僅影響到產(chǎn)品本身的質(zhì)量，更嚴重的是它危及消費者的健康和安全。微生物檢測的檢測項目：菌落總數(shù)、霉菌和酵...

高通量測序應用于臨床感鑒定高通量測序臨床應用的劣勢有：1)測序成本，尤其是海量數(shù)據(jù)的計算機輔助分析速度及成本；2)人體標本及標本處理過程均不是無菌狀態(tài)，難以區(qū)分健康攜帶和污染信號，尤其是條件病原體；3)難以確定高通量測序鎖定的可能病原體和目前疾病狀態(tài)的因果關系...

微生物檢測的相關知識：在保藏厭氧菌種或研究微生物的動力時常采用此法。做穿刺接種時，用的接種工具是接種針。用的培養(yǎng)基一般是半固體培養(yǎng)基。它的做法是：用接種針蘸取少量的菌種，沿半固體培養(yǎng)基中心向管底作直線穿刺，如某細菌具有鞭毛而能運動，則在穿刺線周圍能夠生長。澆混...

病毒宏基因組測序：宏基因組測序對環(huán)境樣本所有微生物基因組DNA進行提取和高通量測序，分析樣本環(huán)境中所有微生物基因組信息。宏基因組測序解讀微生物群體的多樣性與豐度信息，分析微生物群體基因組及功能，也探求微生物與環(huán)境、微生物與宿主之間的關系，發(fā)掘和研究新的功能基因...

病毒全基因組測序定中為了便于新發(fā)或罕見病毒性傳染病的篩查檢測,利用多重置換擴增技術,以負鏈RNA病毒—發(fā)熱伴血小板減少綜合征病毒和正鏈RNA病毒—登革病毒為模擬樣本探索臨床樣本中RNA病毒基因組非特異性擴增方法。研究中通過梯度稀釋的RNA病毒模擬樣本中可能存在...

探普生物的病毒測序：由于探普生物具備處理大量多樣的病毒樣本的經(jīng)驗，熟知各類病毒樣本的特性，因此對于樣本準備有獨特的方法指南，這就為后續(xù)的分析結果打下了牢固的基礎，減少了客戶和公司之間的摩擦，也幾乎沒有售后問題。獨有的實驗和分析流程可兼容高復雜度低濃度的病毒核酸...

目前技術的進一步成熟，未來二代測序病原體檢測應進一步在成本下降、診斷標準完善、質(zhì)量控制提升等方面進行完善。同時應進一步增加大樣本量的研究，以建立中國傳染病原體宏基因組學檢測的標準規(guī)范。對于懷疑神經(jīng)系統(tǒng)急性傳染的患者，如有條件，推薦在抽取腦脊液時同步留取2mL腦...

狀病毒的發(fā)現(xiàn)，病原宏基因組測序功不可沒。對一種新病毒進行鑒定和檢測，其中非常關鍵的步驟就是獲得病毒的全基因組信息。在此次病情監(jiān)測和防控中，病原宏基因組測序發(fā)揮了至關重要的作用，利用其技術優(yōu)勢，研究人員在五天內(nèi)就鑒定并分析出冠狀病毒的基因組，而2003年SARS...

深度測序數(shù)據(jù)：目前深度測序數(shù)據(jù)是生物醫(yī)學領域數(shù)量增加快、應用廣的數(shù)據(jù)，對這些數(shù)據(jù)的管理、分析和應用給生物信息學帶來了巨大的挑戰(zhàn)。早期的測序技術是“測定沒有計算快”，下一代測序技術發(fā)展以來，變?yōu)槿缃竦摹坝嬎銢]有測定快”。深度測序數(shù)據(jù)的迅猛增長使得數(shù)據(jù)科學分析方面...

需要對病毒的全基因組進行測序的應用場景：在探普生物長時間運行過程中，我們接觸到的對病毒的全基因組進行測序項目有比較豐富的應用場景。先，從事基因進化/疫苗/藥品/抗體研制方向的研究的研究者一定會用到測序。這種場景一般是用密集的sanger測序監(jiān)測某幾個關鍵基因，...

病毒相關知識：病毒是地球上數(shù)量多的生物實體，其中細菌病毒(即噬菌體)約有1031個類群，從海洋到陸地再到人體幾乎都是它們的棲息地。研究者將病毒視為調(diào)節(jié)人類生態(tài)系統(tǒng)的重要成員，人體內(nèi)主要包括真核病毒和噬菌體，包括雙鏈DNA(double-strandedDNA,...

微生物鑒定方法：首先呢，就是從觀察顯微鏡下甚至光鏡下的微生物的的那個細胞的形態(tài)，比如說，是球菌，還是桿菌，還是弧菌，還是螺旋菌，這都是可以從微生物的單個細胞形態(tài)上區(qū)分的。還有就是細胞的形態(tài)，比如說是否有鞭毛、芽孢之類的東西，都是微生物鑒別的特征性特征。其次呢就...

第二代測序技術的應用：第二代測序技術(NGS)因其快速和靈敏的檢測特點已成為植物病毒學研究的強有力工具，這一技術具有非序列依賴性的優(yōu)勢,能同時檢測植物樣品中可培養(yǎng)和不可培養(yǎng)的、含量高及含量低的所有的DNA病毒、RNA病毒以及類病毒,它的出現(xiàn)極大地變革和推進了病...

微生物鑒定可以用微生物對噬菌體的敏感性作為指標來鑒定微生物的種屬。因為各種噬菌體都有其嚴格的宿主范圍，不同的細菌作為噬菌體的宿主對應有特定的已知特性的噬菌體，其和噬菌體的作用方式也有接合，轉化，轉接，溶原性轉換和原生質(zhì)體融合等多種方式。部分細菌可以采用血清學反...

微生物檢測方法：計數(shù)器測定法即用血細胞計數(shù)器進行計數(shù)。取一定體積的樣品細胞懸液置于血細胞計數(shù)器的計數(shù)室內(nèi)，用顯微鏡觀察計數(shù)。由于計數(shù)室的容積是一定的(0.1mm3)，因而根據(jù)計數(shù)器刻度內(nèi)的細菌數(shù)，可計算樣品中的含菌數(shù)。本法簡便易行，可立即得出結果，不僅適于細菌...

未知病原微生物樣本需要經(jīng)歷：核酸純化-文庫構建-生物信息學分析這三大基本流程才能完成鑒定。高通量測序技術之解決疑難鑒定問題并提高檢測的靈敏度，在病原微生物檢測與鑒定方面，對一些非典型癥狀的樣品，依靠先驗知識與傳統(tǒng)檢測方法無法有效對病原微生物進行檢測時，高通量測...

病毒相關知識：病毒是地球上數(shù)量多的生物實體，其中細菌病毒(即噬菌體)約有1031個類群，從海洋到陸地再到人體幾乎都是它們的棲息地。研究者將病毒視為調(diào)節(jié)人類生態(tài)系統(tǒng)的重要成員，人體內(nèi)主要包括真核病毒和噬菌體，包括雙鏈DNA(double-strandedDNA,...