目前對(duì)我國首例輸入性裂谷熱病例病毒進(jìn)行全基因組測(cè)定,分析其進(jìn)化來源及潛在變異.方法提取樣本核酸,非特異性反轉(zhuǎn)錄擴(kuò)增病毒基因組RNA,使用IonTorrent二代測(cè)序儀進(jìn)行病毒全基因組測(cè)定.對(duì)獲得的基因組數(shù)據(jù)進(jìn)行序列拼接、比對(duì)、進(jìn)化樹構(gòu)建和關(guān)鍵位點(diǎn)分析.結(jié)果通過...

二代測(cè)序技術(shù)的出現(xiàn)對(duì)社會(huì)帶來了重大的影響，主要體現(xiàn)在以下幾個(gè)方面：1.促進(jìn)科學(xué)研究進(jìn)步：二代測(cè)序技術(shù)的高通量性能使得基因組學(xué)與生物學(xué)研究能夠更加深入。它加快了基因功能解析、基因變異檢測(cè)和系統(tǒng)生物學(xué)研究等方面的進(jìn)展。這為生物醫(yī)學(xué)、農(nóng)業(yè)科學(xué)、環(huán)境科學(xué)等領(lǐng)域提供了更...

哪些應(yīng)用場(chǎng)景需要對(duì)病毒的全基因組進(jìn)行測(cè)序？在探普生物長時(shí)間運(yùn)行過程中，我們接觸到的對(duì)病毒的全基因組進(jìn)行測(cè)序項(xiàng)目有比較豐富的應(yīng)用場(chǎng)景。先，從事基因進(jìn)化/疫苗/藥品/抗體研制方向的研究的研究者一定會(huì)用到測(cè)序。這種場(chǎng)景一般是用密集的sanger測(cè)序監(jiān)測(cè)某幾個(gè)關(guān)鍵基因...

病毒基因組測(cè)序的標(biāo)準(zhǔn)有：測(cè)序的完成程度，決定著基因組的下游應(yīng)用，包括設(shè)計(jì)診斷產(chǎn)品、反向遺傳系統(tǒng)以及開發(fā)調(diào)整對(duì)策等。研究團(tuán)隊(duì)希望能夠通過五條標(biāo)準(zhǔn)來填補(bǔ)這樣的空白，這些標(biāo)準(zhǔn)涵蓋了完成病毒基因組的整個(gè)階段，使用不依賴測(cè)序技術(shù)的簡單條件規(guī)定了五個(gè)類別。不同...

病毒基因組測(cè)序包括完成圖測(cè)序、掃描圖測(cè)序和重測(cè)序三個(gè)層面，通過二代/三代測(cè)序平臺(tái)，獲得病毒的基因組的序列信息，并在結(jié)構(gòu)基因組學(xué)、比較基因組學(xué)層面通過差異分析、同源基因分析、共線性分析、物種進(jìn)化分析等手段探究病毒的毒力系統(tǒng)、基因組的進(jìn)化與演變歷程等。對(duì)疑似傳染標(biāo)...

二代測(cè)序是一種高通量測(cè)序技術(shù)，也被稱為次代測(cè)序或高通量測(cè)序。與傳統(tǒng)的Sanger測(cè)序技術(shù)相比，二代測(cè)序具有更快、更經(jīng)濟(jì)和更高效的特點(diǎn)。在二代測(cè)序中，DNA樣本首先被打斷成短片段。接下來，這些片段會(huì)通過特殊的方法進(jìn)行擴(kuò)增和連接，形成了所謂的文庫（li...

高通量測(cè)序技術(shù)又稱“下一代“測(cè)序技術(shù)或深度測(cè)序技術(shù)，可以一次性對(duì)幾十萬至幾百萬條DNA分子進(jìn)行序列測(cè)定?，F(xiàn)已普遍應(yīng)用在基因組測(cè)序、基因表達(dá)分析、非編碼小分子RNA鑒定、轉(zhuǎn)錄因子靶基因篩選及DNA甲基化等相關(guān)的研究領(lǐng)域。高通量測(cè)序技術(shù)是對(duì)傳統(tǒng)測(cè)序一次性的改變，一...

近年來，新發(fā)人畜共患病呈現(xiàn)逐年遞增的趨勢(shì)，人類想要征服新發(fā)人畜共患病，就必須提前發(fā)掘潛在的新的致病的病原，并針對(duì)新病原進(jìn)行基因組分析、流行病學(xué)調(diào)查、致病機(jī)制及疫苗開發(fā)等方面的研究。病毒宏基因組學(xué)是在宏基因組學(xué)基礎(chǔ)上發(fā)展起來研究特定環(huán)境中病毒的新興技術(shù)，該技術(shù)結(jié)...

傳統(tǒng)上，人類血液被認(rèn)為是無菌的。微生物血漿細(xì)胞游離DNA（mcfDNA）可能有兩種來源，包括微生物（細(xì)菌，病毒或噬菌體）的易位，這是指屬于人類微生物組的微生物細(xì)胞或其組成部分通過與外部環(huán)境連通的上皮粘膜進(jìn)入循環(huán)系統(tǒng)。另外，當(dāng)組織粘膜被局部傳染（例如口腔，肺和皮...

病原微生物二代測(cè)序也稱宏基因組測(cè)序（mNGS）是目前臨床上針對(duì)病原較常用的基因測(cè)序方法。通過對(duì)疑似傳染標(biāo)本采集提取后（無需培養(yǎng)）直接進(jìn)行高通量測(cè)序，利用病原微生物數(shù)據(jù)庫比對(duì)和分析后可以獲得疑似致病微生物種屬信息?；贜GS的宏基因組學(xué)檢測(cè)技術(shù)在2014年被用于...

目前技術(shù)的進(jìn)一步成熟，未來二代測(cè)序病原體檢測(cè)應(yīng)進(jìn)一步在成本下降、診斷標(biāo)準(zhǔn)完善、質(zhì)量控制提升等方面進(jìn)行完善。同時(shí)應(yīng)進(jìn)一步增加大樣本量的研究，以建立中國傳染病原體宏基因組學(xué)檢測(cè)的標(biāo)準(zhǔn)規(guī)范。對(duì)于懷疑神經(jīng)系統(tǒng)急性傳染的患者，如有條件，推薦在抽取腦脊液時(shí)同步留取2mL腦...

病毒宏基因組測(cè)序可直接對(duì)樣本中的核酸進(jìn)行高通量測(cè)序，鑒定樣本中可能存在的病原菌，輔助臨床決策。覆蓋細(xì)菌、病毒、寄生蟲、衣原體、立克次氏體、螺旋體等13396種微生物；同時(shí)進(jìn)行耐藥基因檢測(cè)，涵蓋266種耐藥菌，2984種抗性基因。宏基因組測(cè)序在新發(fā)腹瀉病毒鑒定中...

未知病原鑒定測(cè)序：未知病原鑒定測(cè)序?qū)嶒?yàn)基于二代測(cè)序技術(shù)。樣本經(jīng)過核酸純化-文庫構(gòu)建-生物信息學(xué)分析這3大基本流程后轉(zhuǎn)換成了病原體的序列數(shù)據(jù)。首先，在核酸純化環(huán)節(jié)，探普提供專門針對(duì)病原的核酸純化樣本指南，以提高病原純度和得率，與此同時(shí)探普生物也提供核酸純化服務(wù)。...

微生物鑒定能用微生物對(duì)噬菌體的敏感性作為指標(biāo)來鑒定微生物的種屬。因?yàn)楦鞣N噬菌體都有其嚴(yán)格的宿主范圍，不同的細(xì)菌作為噬菌體的宿主對(duì)應(yīng)有特定的已知特性的噬菌體，其和噬菌體的作用方式也有接合，轉(zhuǎn)化，轉(zhuǎn)接，溶原性轉(zhuǎn)換和原生質(zhì)體融合等多種方式。部分細(xì)菌可以采用血清學(xué)反應(yīng)...

實(shí)現(xiàn)病原微生物種類鑒定有哪些技術(shù)手段？病原微生物的研究歷史不算長。發(fā)展至今已經(jīng)有了成套的檢測(cè)體系。利用不同類別的微生物有其本身不同于其他微生物的特點(diǎn)，如從培養(yǎng)形態(tài)、顯微鏡觀測(cè)形態(tài)、生物學(xué)功能、致病性、生物化學(xué)反應(yīng)、抗原抗體反應(yīng)、核酸序列等方面，都可以進(jìn)行相當(dāng)程...

微生物鑒定的傳統(tǒng)的鑒定方法雖然仍被普遍使用，但存在兩大缺點(diǎn)。它們只適用于可以體外培養(yǎng)的生物體，而且一些菌株表現(xiàn)出不符合已知種屬模式的獨(dú)特的生化特性。許多現(xiàn)代方法并不依賴于活的培養(yǎng)物，它們常常能揭示通過傳統(tǒng)方法檢測(cè)不到的有機(jī)體之間的細(xì)微差別。PCR，包括實(shí)時(shí)熒光...

病毒是地球上數(shù)量多的生物實(shí)體，其中細(xì)菌病毒(即噬菌體)約有1031個(gè)類群，從海洋到陸地再到人體幾乎都是它們的棲息地。研究者將病毒視為調(diào)節(jié)人類生態(tài)系統(tǒng)的重要成員，人體內(nèi)主要包括真核病毒和噬菌體，包括雙鏈DNA(double-strandedDNA,dsDNA)，...

未知病原微生物鑒定：除了利用病毒的致病性定量檢測(cè)病毒外，還可應(yīng)用物理方法，如在電子顯微鏡下計(jì)數(shù)病毒顆粒，或用紫外分光光度計(jì)測(cè)定提純病毒的蛋白和核酸量，這些方法所測(cè)得的數(shù)據(jù)包括了的病毒粒。植物病毒的培養(yǎng)和檢測(cè)大都是在整株植物上進(jìn)行的醫(yī)學(xué)教育|網(wǎng)搜集整理。從搗碎的...

病毒鑒定常用方法有哪些？病原學(xué)檢測(cè)主要適用于急性期血液標(biāo)本，一般認(rèn)為發(fā)病7天內(nèi)檢測(cè)陽性率高。（1）核酸檢測(cè)：采用熒光定量RT-PCR方法，是目前早期診斷寨卡病毒病的主要檢測(cè)手段。（2）病毒分離：將標(biāo)本接種于蚊源細(xì)胞（C6/36）或哺乳動(dòng)物細(xì)胞（BHK21、Ve...

微生物檢測(cè)的相關(guān)知識(shí)：在保藏厭氧菌種或研究微生物的動(dòng)力時(shí)常采用此法。做穿刺接種時(shí)，用的接種工具是接種針。用的培養(yǎng)基一般是半固體培養(yǎng)基。它的做法是：用接種針蘸取少量的菌種，沿半固體培養(yǎng)基中心向管底作直線穿刺，如某細(xì)菌具有鞭毛而能運(yùn)動(dòng)，則在穿刺線周圍能夠生長。澆混...

未知病原鑒定方法：免疫學(xué)方法：包括免疫熒光、酶聯(lián)免疫吸附試驗(yàn)等技術(shù)，通過檢測(cè)患者體液中的病原體特異性抗體或抗原，來鑒定病原體。免疫學(xué)方法具有高度的特異性和敏感性，常用于病原體的初篩和鑒定。生物芯片技術(shù)：生物芯片是一種高通量檢測(cè)技術(shù)，可以同時(shí)檢測(cè)多個(gè)病原體，快速...

病原微生物檢測(cè)方法-多種PCR結(jié)合使用，基因芯片技術(shù)與多重PCR結(jié)合可以通過PCR對(duì)目的基因進(jìn)行放大，通過基因芯片的熒光探針增加檢測(cè)的靈敏性和特異性，使得兩種檢測(cè)技術(shù)的優(yōu)勢(shì)互補(bǔ)，已應(yīng)用于病原微生物的檢測(cè)。將病原體特異性基因作為靶基因設(shè)計(jì)出引物與探針，進(jìn)行多重P...

未知病原鑒定測(cè)序?qū)嶒?yàn)基于二代測(cè)序技術(shù)。樣本經(jīng)過核酸純化-文庫構(gòu)建-生物信息學(xué)分析這3大基本流程后轉(zhuǎn)換成了病原體的序列數(shù)據(jù)。首先，在核酸純化環(huán)節(jié)，探普提供專門針對(duì)病原的核酸純化樣本指南，以提高病原純度和得率，與此同時(shí)探普生物也提供核酸純化服務(wù)。第二，文庫構(gòu)建環(huán)節(jié)...

鑒定未知病原體的技術(shù)有哪些？快速測(cè)試片是指以紙片、紙膜、膠片等作為培養(yǎng)基載體，將特定的培養(yǎng)基和顯色物質(zhì)附著在上面，通過微生物在上面的生長、顯色來測(cè)定食品中微生物的方法。細(xì)菌總數(shù)檢測(cè)紙片的研制始于20世紀(jì)80年代，其主要優(yōu)點(diǎn)是簡便、實(shí)用、經(jīng)濟(jì)、操作性強(qiáng)。近年來以...

微生物鑒定方法：1.從觀察顯微鏡下甚至光鏡下的微生物的的那個(gè)細(xì)胞的形態(tài)，比如說，是球菌，還是桿菌，還是弧菌，還是螺旋菌，這都是可以從微生物的單個(gè)細(xì)胞形態(tài)上區(qū)分的。還有就是細(xì)胞的形態(tài)，比如說是否有鞭毛、芽孢之類的東西，都是微生物鑒別的特征性特征。2.就是觀察細(xì)菌...

臨床微生物鑒定必須經(jīng)歷的過程：1.分離培養(yǎng)：臨床細(xì)菌學(xué)不可缺少的基本技術(shù)，是獲得純培養(yǎng)物的必要手段，即使自動(dòng)化儀器先進(jìn)的現(xiàn)在也只能對(duì)純菌作出鑒定。2.細(xì)菌的菌落、色素、溶血性、氣味是鑒定的重要特征。3.形態(tài)學(xué)鑒定：如奴卡菌、紅球菌。4.動(dòng)力在各種細(xì)菌鑒定：針對(duì)...

微生物的相關(guān)知識(shí)：微生物因?yàn)轶w積小、質(zhì)量輕、適應(yīng)性強(qiáng)、繁殖能力強(qiáng)等特點(diǎn)，普遍分布于自然界中。它們存在于食品、化妝品、飼料、環(huán)境等人們能觸及的各個(gè)角落中。某些微生物對(duì)產(chǎn)品的污染，不只影響到產(chǎn)品本身的質(zhì)量，更嚴(yán)重的是它危及消費(fèi)者的健康和安全。微生物檢測(cè)的檢測(cè)項(xiàng)目：...

未知病原鑒定測(cè)序：未知病原鑒定測(cè)序?qū)嶒?yàn)基于二代測(cè)序技術(shù)。樣本經(jīng)過核酸純化-文庫構(gòu)建-生物信息學(xué)分析這3大基本流程后轉(zhuǎn)換成了病原體的序列數(shù)據(jù)。首先，在核酸純化環(huán)節(jié)，探普提供專門針對(duì)病原的核酸純化樣本指南，以提高病原純度和得率，與此同時(shí)探普生物也提供核酸純化服務(wù)。...

臨床微生物鑒定必須經(jīng)歷的過程：1.分離培養(yǎng)：臨床細(xì)菌學(xué)不可缺少的基本技術(shù)，是獲得純培養(yǎng)物的必要手段，即使自動(dòng)化儀器先進(jìn)的現(xiàn)在也只能對(duì)純菌作出鑒定。2.細(xì)菌的菌落、色素、溶血性、氣味是鑒定的重要特征。3.形態(tài)學(xué)鑒定：如奴卡菌、紅球菌。4.動(dòng)力在各種細(xì)菌鑒定：針對(duì)...

病原微生物檢測(cè)方法中的多種PCR結(jié)合使用，基因芯片技術(shù)與多重PCR結(jié)合可以通過PCR對(duì)目的基因進(jìn)行放大，通過基因芯片的熒光探針增加檢測(cè)的靈敏性和特異性，使得兩種檢測(cè)技術(shù)的優(yōu)勢(shì)互補(bǔ)，已應(yīng)用于病原微生物的檢測(cè)。將病原體特異性基因作為靶基因設(shè)計(jì)出引物與探針，進(jìn)行多重...