cdPCR主要以Fluidigm公司的BioMark HD系統(tǒng)以及Life Technology公司的QuantStudio 3D系統(tǒng)為**。Bio Mark系統(tǒng)采用微泵閥式芯片,以聚二甲基硅氧烷為芯片材料,主要依靠微流控通道與閥門的開閉進(jìn)行原始體系分割,在芯片的反應(yīng)倉進(jìn)行PCR反應(yīng),然后通過類似于基因芯片的方法掃描每個(gè)通孔的熒光信號(hào),進(jìn)行目的序列含量的計(jì)算。QuantStudio 3D系統(tǒng)采用陣列微池式芯片,反應(yīng)液由進(jìn)樣孔直接進(jìn)入各微反應(yīng)池。芯片式dPCR生成微滴體積均一,具有較高的穩(wěn)定性,體系之間影響較小,但技術(shù)操作復(fù)雜,通量有限且實(shí)驗(yàn)成本較高。定量方法不依賴于擴(kuò)增曲線的循環(huán)閾值。山東PCR數(shù)字PCR服務(wù)
聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(polymerasechainreaction,PCR)提出至今已有20年時(shí)間,期間PCR已發(fā)展成為分子生物學(xué)領(lǐng)域的一項(xiàng)關(guān)鍵技術(shù)和常規(guī)技術(shù),極大地推動(dòng)了生命科學(xué)各個(gè)領(lǐng)域的發(fā)展。特別是90年代后期,美國(guó)ABI公司推出的實(shí)時(shí)熒光定量PCR(realtimePCR,qPCR)技術(shù)及相關(guān)產(chǎn)品更是將PCR由體外合成及定性/半定量檢測(cè)技術(shù)發(fā)展成為一種高靈敏、高特異性和精確定量的基因分析技術(shù)。盡管經(jīng)過十幾年時(shí)間的迅速發(fā)展,qPCR 技術(shù)已經(jīng)用于除外傷和營(yíng)養(yǎng)缺乏癥外所有疾病的診斷,但是,在 PCR擴(kuò)增過程中影響其擴(kuò)增效率的因素有很多,不能保證在反應(yīng)過程中擴(kuò)增效率保持不變和實(shí)際樣品與標(biāo)準(zhǔn)樣品以及不同樣品之間的擴(kuò)增效率是相同的,由此導(dǎo)致其定量分析所依賴的基礎(chǔ)——循環(huán)閾值(CT)不是恒定不變的。因此 qPCR 的定量只是“相對(duì)定量”,其準(zhǔn)確度和重現(xiàn)性依然不能夠滿足分子生物學(xué)定量分析的要求。廣東數(shù)字PCR數(shù)字PCR歡迎咨詢常見的300種人、小鼠和大鼠基因表達(dá)Assay均已在QIAcuity數(shù)字PCR平臺(tái)上經(jīng)過驗(yàn)證。
ddPCR主要有Bio-rad公司開發(fā)的QX200系統(tǒng)和Rain Drop系統(tǒng),QX200可以將體系分割成2萬個(gè)微滴,Rain Drop可以分割成100萬-1 000萬個(gè)微滴。ddPCR原理是通過將一個(gè)待分析的PCR反應(yīng)體系進(jìn)行微滴化處理,利用微滴發(fā)生器制成近20 000個(gè)油包水小微滴從而對(duì)原始體系進(jìn)行分割,樣品中的核酸分子隨機(jī)分配到大量**的微滴中,每個(gè)微滴中含有一個(gè)或不含待檢核酸分子。對(duì)微滴體系進(jìn)行擴(kuò)增反應(yīng)以后,分析每個(gè)微滴的熒光信號(hào),進(jìn)行有或無的判斷,將判斷結(jié)果按照泊松分布的原理,通過讀取靶標(biāo)和內(nèi)參核酸的陽性微滴個(gè)數(shù)以及比例從而得到靶分子的拷貝數(shù)及濃度。與芯片式dPCR相比,操作簡(jiǎn)單,可以實(shí)現(xiàn)高通量的檢測(cè),也保證一定程度上的微滴檢測(cè)穩(wěn)定性。
2013年下半年,Life-technologies推出了QuantStudio 3D數(shù)字PCR系統(tǒng), 這也是目前數(shù)字PCR市場(chǎng)上***型號(hào)的產(chǎn)品。采用高密度的納升流控芯片技術(shù),樣本均勻分配至20,000個(gè)單獨(dú)的反應(yīng)孔中。在整個(gè)工作流程中,樣本之間保持完全隔離 ,可以有效地防止樣品交叉污染,減少移液過程,簡(jiǎn)化操作步驟。同時(shí)芯片式設(shè)計(jì)避免了微滴式系統(tǒng)可能面臨的管路堵塞問題。作為L(zhǎng)ife-technologies在OpenArray芯片平臺(tái)之外推出的全新的芯片式數(shù)字PCR系統(tǒng),值得一提的是,這個(gè)全新的系統(tǒng)在設(shè)計(jì)理念上綜合考慮了系統(tǒng)穩(wěn)定性與運(yùn)行成本因素,直接反映了該系統(tǒng)“適合所有分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)室使用的數(shù)字PCR系統(tǒng)”的市場(chǎng)定位。德立替尼***HR+/HER2-轉(zhuǎn)移性乳腺*。
近幾年來,隨著納米制造技術(shù)和微流體技術(shù)(nanofabrication and microfluidics)的發(fā)展,數(shù)字PCR技術(shù)遇到了突破技術(shù)瓶頸的比較好契機(jī)。1997年Kalinina, 、Brown J, 和Silver J使用納升級(jí)芯片進(jìn)行單克隆模板PCR擴(kuò)增,獲得了美國(guó)專利,更重要的是這種采用“電浸潤(rùn)法”進(jìn)行納升級(jí)芯片制造技術(shù)顯露雛形。伴隨二代測(cè)序技術(shù)發(fā)展起來的“油包水PCR”技術(shù),可以一次生成數(shù)萬乃至數(shù)百萬個(gè)納升甚至皮升級(jí)別的單個(gè)油包水微滴,可以作為dPCR的樣品分散載體。不受擴(kuò)增效率的影響,也不必采用看家基因和標(biāo)準(zhǔn)曲線。江蘇Digital PCR數(shù)字PCR歡迎咨詢
數(shù)字PCR需要進(jìn)行分區(qū)后擴(kuò)增。山東PCR數(shù)字PCR服務(wù)
優(yōu)勢(shì):不依賴Ct值,無需標(biāo)準(zhǔn)曲線,即可實(shí)現(xiàn)真正的***定量高精確度、高靈敏度,熒光定量qPCR靈敏度為1%-0.1%,數(shù)字化PCR靈敏度可達(dá)0.01-0.001%。對(duì)干擾分子(背景信號(hào)、PCR抑制劑等)耐受度高,通過信號(hào)的“有”“無”定量而不是Ct值。數(shù)字PCR研究基因表達(dá)遇到基因豐度非常低的,或者樣本濃度低的,可以選擇數(shù)字化PCR,通常CT值大于30的時(shí)候,熒光定量qPCR的精確度和重復(fù)性會(huì)**降低,這個(gè)時(shí)候可考慮數(shù)字化PCR。外泌體里面的micRNA含量是非常低的,提取外泌體也是個(gè)非常費(fèi)時(shí)費(fèi)錢的事情,千辛萬苦提取出來的樣本,保險(xiǎn)起見,用數(shù)字化PCR是非常不錯(cuò)的一個(gè)選擇,而且也非常便宜。山東PCR數(shù)字PCR服務(wù)