無錫烈冰生物單細胞多組學數據分析可視化

單細胞轉錄組測序是在單細胞水平上高通量測序分析基因表達譜的技術，突破傳統(tǒng)高通量測序的局限性，組織解離后，單個樣本一次上機能捕獲500-20000個細胞，基于每個細胞分別建庫測序，獲得單個細胞的基因結構和基因表達狀態(tài)，并鑒定細胞的類型，可以在不同樣本間從細胞類型的組成和豐度角度進行比較，反映細胞間的異質性。而2021年橫空出世的10XGenomicsChromiumX平臺實現(xiàn)了單塊chip上的百萬級別通量的細胞捕獲，系統(tǒng)實現(xiàn)16個通道同時運行，每個通道可捕獲2000-20000個細胞（不混樣），并支持原ChromiumController體統(tǒng)外的多種細胞捕獲百萬級別通量實驗，可準確鑒別稀有細胞類型和適配大規(guī)模單細胞研究。烈冰科技已建立了基于單細胞測序的高通量測序實驗多平臺。無錫烈冰生物單細胞多組學數據分析可視化

烈冰生信團隊傾情研發(fā)的NovelBrain®生信大數據分析平臺，針對龐大的單細胞測序數據，能夠實現(xiàn)細胞類型鑒定的快、精、準：一鍵導入genelist構建個性化基因列表；輕松一點即可展示Marker基因的Featureplot；任意修改Cluster的顏色和名稱助力高效鑒定細胞類型；一鍵獲得t-SNE圖、Heatmap和Violin圖：輕松獲得并下載基因表達的t-SNE圖、Heatmap、Violin圖，還可以通過調節(jié)寬、高和系數比例來調節(jié)美觀。平臺上線300+task自主分析工具、50+pipeline工作流模板，幫助烈冰生信分析團隊和自主分析用戶實現(xiàn)分析工具和模板的快速調用和一站式全流程自動化分析，節(jié)省您的工作時間并提升整體工作效率。南京single cell 單細胞多組學單細胞多組學測序技術整合了單細胞各個組學特征, 提供了揭示細胞內復雜分子調控網絡及其互動關系的機會。

BDRhapsody單細胞分選系統(tǒng)集成了熒光顯微成像系統(tǒng)，可以對不同熒光標記的細胞進行檢測并計數。在進行質量評估之前，首先要將細胞的培養(yǎng)體系更換成上機所需的Buffer。在這個過程中，需要進行多次離心、重懸操作，烈冰Novelbio單細胞實驗團隊推薦采用水平轉子離心機來進行這步操作。這種離心機可以有效減少細胞在多次更換Buffer過程中的損失，尤其是對于細胞量較少的樣本來說，顯得非常有必要。更換完Buffer之后，還需要將細胞進行過篩操作，去除較大的細胞團，獲得較為純凈的單細胞懸液。

機體為響應各種應激，其細胞會從一種功能“狀態(tài)”轉變?yōu)榱硪环N功能“狀態(tài)”；當細胞在不同狀態(tài)之間轉變時，往往會經歷轉錄重組，導致一些基因被“沉默”，一些基因被重新“喚醒”，但純化這些瞬態(tài)細胞進行研究是很困難或不可能的；scRNA-seq擬時序分析可以讓我們在不需要純化的情況下查看這些細胞狀態(tài)。擬時序分析，即根據不同細胞亞群基因表達量隨時間的變化情況，構建細胞譜系發(fā)育，但這里的時間并不是真時間，而是一個虛擬的時間，是指的細胞與細胞之間的轉化和演替的順序和軌跡。即使在同一個樣本中，也會存在多種不同的細胞形態(tài)。因此，不論測定了多少樣本，我們都可以采用擬時序分析對樣本中的細胞轉化和變化進行描述。分子檢測型單細胞多組學測序技術中也有一些集 中于探究單細胞內表觀遺傳組各層面的變化及關聯(lián)。

單細胞多組學技術優(yōu)勢：1. 構建蛋白質數據庫，大幅度提高蛋白質鑒定數量；2. 不同層面表達水平分析，構建表達“全景圖”；3. 多組學交叉驗證：深層次挖掘其中調控機制；4. 對基因突變信息在蛋白水平上進行驗證；5.精細醫(yī)療：實現(xiàn)genomics到protegenomics的轉變。生物領域各個研究方面，1. 農林領域：抗逆脅迫機制，生長發(fā)育機制，育種保護研究等；2. 畜牧業(yè)：肉類及乳品質研究，致病機理研究等；3. 基礎醫(yī)學、臨床診斷：生物標志物，疾病機理機制，疾病分型等；4. 生物醫(yī)藥：藥物作用機理，藥效評價，藥物開發(fā)等；5. 微生物領域：致病機理，耐藥機制，病原體-宿主相互作用研究等；6. 海洋水產：漁業(yè)資源，海水養(yǎng)殖，漁業(yè)環(huán)境與水產品安全等；7. 生物能源、環(huán)境科學領域：發(fā)酵過程優(yōu)化，生物燃料生產，環(huán)境危定風險評估研究等；8.食品營養(yǎng)：食品儲藏及加工條件優(yōu)化，食品組分及品質鑒定，功能性食品開發(fā)，食品安全監(jiān)檢測等。單細胞多組學可從整體層面快速有效地探尋疾病發(fā)生、發(fā)展的根本原因或藥物作用靶點等信息。無錫烈冰生物單細胞多組學數據分析可視化

單細胞多組學的研究對生物標志物的發(fā)現(xiàn)，細胞分化發(fā)育研究等均有重要意義。無錫烈冰生物單細胞多組學數據分析可視化

烈冰生物已空間轉錄組測序服務提供從一個組織切片樣本中獲取包括空間信息在內的全部轉錄組數據，從而可以區(qū)分和定位功能基因在特定組織區(qū)域內的活躍表達。其可以檢測組織樣本中的所有基因活動，并繪制活動發(fā)生的位置，這將有助于科學家更好地構建生物圖譜，并進一步理解疾病和生物學過程。目前，空間轉錄組主要應用于多種疾病、免疫、發(fā)育、神經和病理學等研究領域。烈冰生物具有專業(yè)的實驗團隊、豐富的切片經驗，配置了國際主流的儀器設備，實驗團隊針對不同組織類型優(yōu)化完善實驗方案，并制定了嚴謹規(guī)范的實驗室SOP流程，保證空間轉錄組切片的質量，全優(yōu)保障測序數據質量。無錫烈冰生物單細胞多組學數據分析可視化

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