溫州BD空間轉錄組測序

為同時獲得空間表達和組織學背景信息，該方案首先將FFPE組織切片置于Visium基因芯片上進行組織學染色和成像，然后利用切片下方Visium基因芯片上的探針進行表達定量。由于FFPE樣本通常存在RNA高度降解的問題，針對FFPE樣本的Visium空間基因表達解決方案無法像新鮮凍存組織樣本一樣利用完整mRNA具有的poly（dA）序列進行mRNA捕獲。該方案采用針對編碼基因的成對RNA模板連接探針（RTL）與mRNA雜交。左側探針（LHS）具有部分Read 2序列，右側探針（RHS）具有合成的poly(A)序列。左右探針與mRNA雜交后彼此連接，而mRNA被RNase降解。組織透化后，被連接的成對探針與芯片上包含空間Barcode、UMI和poly(dT）序列的引物序列捕獲，并且空間Barcode和UMI序列被延伸到成對探針序列上。攜帶空間Barcode的探針序列用于進行測序文庫構建和測序。測序序列上的空間Barcode用于將測序序列定位到組織切片圖像上，UMI用于基因表達定量。烈冰實驗室包含從樣本處理到測序下機的全套實驗平臺。溫州BD空間轉錄組測序

相比于常規(guī)的測序手段，空間轉錄組測序有幾個明顯的優(yōu)勢：1.將轉錄組信息與空間信息對應，體現(xiàn)組織內(nèi)部的異質性：每個區(qū)域獨特的條形碼使測序結果與空間位置形成一一對應關系。雖然暫時還無法精細到單細胞層面，但是這樣的區(qū)域劃分也已經(jīng)足以展現(xiàn)出組織內(nèi)部不同區(qū)域間的轉錄組差異。2.不影響對全組織進行分析：芯片上捕獲的全轉錄組在同一個反應中完成測序，能有效降低多次重復實驗中的誤差。測序結果如果不按照條形碼歸類，則直接體現(xiàn)的是切片全組織的轉錄組情況，無需再做單獨檢測。3.為進一步的研究提供指導意見：常規(guī)的轉錄組測序，對后續(xù)實驗的指導仍然停留在全組織層面。而空間轉錄組測序則可以標識出更有價值的研究區(qū)域，引導研究者將組織進一步細分。寧波高通量測序空間轉錄組數(shù)據(jù)分析可視化烈冰科技已建立了基于空間轉錄組的高通量測序實驗多平臺。

烈冰與國內(nèi)高校、研究所、醫(yī)院和藥企單位開展深度合作，服務于600+臨床與研究機構，1000+客戶和5000+重要科研項目，助力并聯(lián)合發(fā)表300+篇CNS等國際學術期刊（不完全統(tǒng)計），在單細胞領域，烈冰助力用戶發(fā)表單細胞文獻30+篇，總IF＞300+，IF＞10+以上文章占比65%以上，包含Immunity、NatureCellBiology、NaturePlants、AdvancedScience等生物領域國際主流學術期刊，已發(fā)表文章研究領域涵蓋包括COVID-19研究、疾病發(fā)生轉移機制，免疫研究、腦神經(jīng)、白血病、胚胎發(fā)育、糖尿病、退行性疾病和植物領域研究等。

10x Genomics空間轉錄組測序技術通過將組織切片的高通量mRNA分析和形態(tài)學背景整合，使基因表達譜可以被定位回它們的原始空間位置。傳統(tǒng)的空間轉錄組測序技術局限于冰凍組織切片。10x Genomics推出全新的針對FFPE樣本的Visium空間基因表達解決方案，該技術打破從FFPE組織樣本中獲取空間全部轉錄組基因表達信息的壁壘，能夠從FFPE樣本中獲取高靈敏度、高特異性的相關基因的表達信息，在形態(tài)學背景下實現(xiàn)真正的探索發(fā)現(xiàn)，進一步擴展空間生物學的可能性?？臻g轉錄組測序是高通量測序下的又一重大技術突破。

基因測序是基因檢測的方法之一，其又叫基因譜測序，是國際上公認的一種基因檢測標準。高通量測序技術是對傳統(tǒng)測序一次顛覆性的改變，一次對幾十萬到幾百萬條核酸序列進行測定，被稱為下一代測序技術(nextgenerationsequencing)，足見其劃時代的改變，同時高通量測序使得對一個物種的轉錄組和基因組進行細致全貌的分析成為可能，所以又被稱為深度測序(deepsequencing)?；驕y序相關產(chǎn)品和技術已由實驗室研究逐漸演變到臨床應用，可以說，基因測序技術將是下一個改變世界的技術。烈冰斥巨資引進Novaseq6000，開啟更大通量測序新紀元。無錫烈冰科技空間轉錄組平臺

高通量測序技術是對傳統(tǒng)測序一次翻天覆地的改變，一次對幾十萬到幾百萬條核酸序列進行測定。溫州BD空間轉錄組測序

高通量測序技術（High-throughputsequencing）又稱“下一代”測序技術（“Next-generation”sequencing），以能一次并行對幾十萬到幾百萬條DNA分子進行序列測定和一般讀長較短等為標志。高通量測序技術是對傳統(tǒng)測序一次顛覆性的改變，一次對幾十萬到幾百萬條DNA分子進行序列測定，因此在有些文獻中稱其為下一代測序技術(nextgenerationsequencing)足見其劃時代的改變，同時高通量測序使得對一個物種的轉錄組和基因組進行細致全貌的分析成為可能，所以又被稱為深度測序(deepsequencing)。而烈冰科技具有專業(yè)生物背景和十二年科研服務經(jīng)驗，已助力Nature，immunity等在內(nèi)的300+篇CNS文章發(fā)表。溫州BD空間轉錄組測序

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