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10XGenomics是一種基于drop的微流控技術(shù),液體在配套芯片中的微管道中流動(dòng),因此細(xì)胞直徑會(huì)受到芯片中微管道直徑的限制,微流體通道的直徑約為50~60um,因此捕獲細(xì)胞的直徑不能超過(guò)40um。當(dāng)細(xì)胞直徑過(guò)大時(shí),容易出現(xiàn)管道堵塞,造成GEM生成失敗,對(duì)于神經(jīng)科學(xué)研究和心血管疾病研究的老師而言,準(zhǔn)備采用單細(xì)胞技術(shù)用于課題研究的時(shí)候,往往會(huì)遇到一個(gè)尷尬的問(wèn)題,就是目標(biāo)細(xì)胞,例如神經(jīng)元細(xì)胞、成熟心肌細(xì)胞由于體積過(guò)大,不適用于10X單細(xì)胞技術(shù)。其中神經(jīng)元細(xì)胞的直徑很大,直接超過(guò)了芯片中管道的直徑,雖然心肌細(xì)胞直徑低于50um,但是成熟心肌細(xì)胞的長(zhǎng)度很長(zhǎng),有可能堵塞通道造成實(shí)驗(yàn)失敗,這也是為什么現(xiàn)在很多已發(fā)表的心臟單細(xì)胞文章,主要研究方向是心臟發(fā)育的原因了,主要還是因?yàn)槲窗l(fā)育成熟的心肌細(xì)胞比較小,不會(huì)出現(xiàn)堵塞管道的風(fēng)險(xiǎn)。因此可以考慮組織解離后過(guò)40um濾網(wǎng),過(guò)濾掉大細(xì)胞,避免出現(xiàn)管道堵塞、實(shí)驗(yàn)失敗的風(fēng)險(xiǎn)。此種方案的缺點(diǎn)是大細(xì)胞被過(guò)濾掉,丟失相關(guān)細(xì)胞數(shù)據(jù);另外組織解離獲得高質(zhì)量細(xì)胞懸液以后,繼續(xù)做細(xì)胞裂解抽細(xì)胞核,開(kāi)展細(xì)胞核測(cè)序。具體可訪問(wèn)烈冰官網(wǎng)給我們留言,烈小冰將安排專業(yè)技術(shù)為您詳細(xì)解答。烈冰專研單細(xì)胞多組學(xué)測(cè)序領(lǐng)域。上海二代測(cè)序單細(xì)胞測(cè)序平臺(tái)
SingleCellSequencing技術(shù),即利用優(yōu)化后的高通量測(cè)序技術(shù)(NGS,NextGenerationSequencing)分析每一個(gè)單個(gè)細(xì)胞的序列信息,從而更高分辨率地揭示細(xì)胞間的細(xì)胞差異以及其在微環(huán)境中的功能情況。那么問(wèn)題來(lái)了,如何獲得單個(gè)細(xì)胞?如果無(wú)法獲得單個(gè)細(xì)胞這一切都是不成立的;如何獲得大批量的單個(gè)細(xì)胞?單個(gè)組織細(xì)胞群體通常在百萬(wàn)級(jí)別以上,如果被檢測(cè)的測(cè)序細(xì)胞數(shù)量過(guò)小精確度不足;如何低成本地獲得大批量單個(gè)細(xì)胞?單細(xì)胞測(cè)序成本非常高,尤其是需要測(cè)2000~3000個(gè)以上的細(xì)胞的時(shí)候,如果單個(gè)細(xì)胞的分選成本也很高,技術(shù)根本無(wú)法普及。所以,正因?yàn)檫@些問(wèn)題的存在使得高通量測(cè)序在單個(gè)細(xì)胞測(cè)序應(yīng)用中的普及度一直不足,直到幾個(gè)突破性技術(shù)的誕生。吉林10X Chromium X單細(xì)胞測(cè)序價(jià)格單細(xì)胞多組學(xué)測(cè)序可識(shí)別重要的轉(zhuǎn)錄因子,進(jìn)行譜系和發(fā)育追蹤。
單細(xì)胞RNA-seq、RNA-seq和逆轉(zhuǎn)錄qPCR(RT-qPCR)都采用一個(gè)共同過(guò)程,即分離RNA并將其轉(zhuǎn)化為cDNA進(jìn)行分析。不過(guò),每種分析在開(kāi)展方式和獲得的數(shù)據(jù)上有所不同。RNA-seq和RT-qPCR都是先從大量細(xì)胞中分離RNA,然后將其轉(zhuǎn)化為cDNA。RNA-seq是使用cDNA來(lái)構(gòu)建新一代測(cè)序文庫(kù),從而測(cè)定整個(gè)轉(zhuǎn)錄組的基因表達(dá)。RT-qPCR則是從cDNA中擴(kuò)增特定靶點(diǎn),并通過(guò)熒光測(cè)定表達(dá)水平。RT-qPCR限于已知靶點(diǎn),而RNA-seq可實(shí)現(xiàn)無(wú)偏倚的全轉(zhuǎn)錄組基因表達(dá)分析。然而,這兩者只能提供細(xì)胞群體內(nèi)基因表達(dá)的平均情況。單細(xì)胞RNA-seq則在分離RNA之前將單細(xì)胞分離到微孔或單個(gè)微反應(yīng)容器中。然后用細(xì)胞特異性的條形碼標(biāo)記RNA,確保來(lái)自每個(gè)細(xì)胞的cDNA可以追溯到起源細(xì)胞。與RNA-seq相似,帶有條形碼的cDNA也被用于構(gòu)建新一代測(cè)序文庫(kù),從而能夠?qū)γ總€(gè)細(xì)胞的整個(gè)轉(zhuǎn)錄組進(jìn)行基因表達(dá)測(cè)定。
單細(xì)胞測(cè)序是指針對(duì)單個(gè)細(xì)胞進(jìn)行全轉(zhuǎn)錄組測(cè)序分析,可精確地描述每一個(gè)細(xì)胞的狀態(tài),在異質(zhì)性發(fā)育過(guò)程中具有特殊的應(yīng)用價(jià)值。然而,單細(xì)胞測(cè)序無(wú)法給出固態(tài)異質(zhì)化組織中細(xì)胞空間排布信息,對(duì)于揭示發(fā)育過(guò)程、病理微環(huán)境都存在很大的局限性。空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序以點(diǎn)陣形式記錄病理切片細(xì)胞的空間信息并進(jìn)行測(cè)序,可以精確指示點(diǎn)陣內(nèi)的全部基因表達(dá)情況??臻g轉(zhuǎn)錄組測(cè)序的加入,無(wú)疑讓單細(xì)胞測(cè)序如虎添翼,更精確地勾勒了組織水平的異質(zhì)性。搭建多種測(cè)序數(shù)據(jù)的生物信息分析平臺(tái),5000+項(xiàng)目檢驗(yàn),真實(shí)可信賴。
10X Genomics單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序是利用單細(xì)胞水平上的高通量測(cè)序分析基因表達(dá)譜的技術(shù),也是目前國(guó)內(nèi)和國(guó)際上公認(rèn)的單細(xì)胞測(cè)序大規(guī)模實(shí)驗(yàn)平臺(tái)技術(shù),該平臺(tái)基于動(dòng)態(tài)微流控原理,突破傳統(tǒng)高通量測(cè)序的局限性,組織解離后,單個(gè)樣本一次上機(jī)能捕獲500-20000個(gè)細(xì)胞, 基于每個(gè)細(xì)胞分別建庫(kù)測(cè)序,獲得單個(gè)細(xì)胞的基因結(jié)構(gòu)和基因表達(dá)狀態(tài),并鑒定細(xì)胞的類型,可以在不同樣本間從細(xì)胞類型的組成和豐度角度進(jìn)行比較,反映細(xì)胞間的異質(zhì)性,提供足夠靈活的定制測(cè)定法以滿足多種實(shí)驗(yàn)需要,并有效縮短實(shí)驗(yàn)是時(shí)間和降低測(cè)序成本?;驕y(cè)序相關(guān)產(chǎn)品和技術(shù)已由實(shí)驗(yàn)室研究逐漸演變到臨床應(yīng)用,是下一個(gè)改變世界的技術(shù)。南通單細(xì)胞測(cè)序數(shù)據(jù)分析
烈冰斥巨資引進(jìn)Novaseq6000,開(kāi)啟更大通量測(cè)序新紀(jì)元。上海二代測(cè)序單細(xì)胞測(cè)序平臺(tái)
截至2022年6月,烈冰生物助力發(fā)表單細(xì)胞文章近40篇,從平臺(tái)應(yīng)用比例來(lái)看,應(yīng)用10X Genomics和BD Rhapsody兩大平臺(tái)發(fā)文比例各占50%左右,研究類型涵蓋疾病發(fā)展,靶點(diǎn)探索,免疫研究,神經(jīng)發(fā)育,干細(xì)胞分化,植物發(fā)育,退行病變,糖尿病,COVID-19等等研究;從發(fā)表期刊水平來(lái)看,烈冰生物聯(lián)合發(fā)表的單細(xì)胞文章,CNS一區(qū)期刊占比在30%以上,其中包括immunity三篇,Nature子刊3篇(Nature cell biology,Nature Plants,Nature communication),風(fēng)濕類領(lǐng)域ARD期刊1篇,CUT 1篇,Advanced Science多篇,IF大于10分以上文章占比高達(dá)68.5%,烈冰專屬單細(xì)胞測(cè)序服務(wù)團(tuán)隊(duì),將與您攜手譜寫(xiě)下一篇“高分”新文章。上海二代測(cè)序單細(xì)胞測(cè)序平臺(tái)
上海烈冰生物醫(yī)藥科技有限公司一直專注于生物科技、醫(yī)藥科技、信息科技、計(jì)算機(jī)科技領(lǐng)域內(nèi)的技術(shù)開(kāi)發(fā)、技術(shù)服務(wù)、技術(shù)轉(zhuǎn)讓、技術(shù)咨詢,市場(chǎng)營(yíng)銷策劃,市場(chǎng)信息咨詢與調(diào)查(不得從事社會(huì)調(diào)查、社會(huì)調(diào)研、民意調(diào)查、民意測(cè)驗(yàn)),從事貨物及技術(shù)的進(jìn)出口業(yè)務(wù),計(jì)算機(jī)、軟件及耗材(除??兀?,軟件開(kāi)發(fā)【依法須經(jīng)批準(zhǔn)的項(xiàng)目,經(jīng)相關(guān)部門(mén)批準(zhǔn)后方可開(kāi)展經(jīng)營(yíng)活動(dòng)】,是一家醫(yī)藥健康的企業(yè),擁有自己**的技術(shù)體系。公司目前擁有專業(yè)的技術(shù)員工,為員工提供廣闊的發(fā)展平臺(tái)與成長(zhǎng)空間,為客戶提供高質(zhì)的產(chǎn)品服務(wù),深受員工與客戶好評(píng)。公司業(yè)務(wù)范圍主要包括:?jiǎn)渭?xì)胞測(cè)序,生物大數(shù)據(jù)云分析平臺(tái),空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序,單細(xì)胞多組學(xué)測(cè)序等。公司奉行顧客至上、質(zhì)量為本的經(jīng)營(yíng)宗旨,深受客戶好評(píng)。公司憑著雄厚的技術(shù)力量、飽滿的工作態(tài)度、扎實(shí)的工作作風(fēng)、良好的職業(yè)道德,樹(shù)立了良好的單細(xì)胞測(cè)序,生物大數(shù)據(jù)云分析平臺(tái),空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序,單細(xì)胞多組學(xué)測(cè)序形象,贏得了社會(huì)各界的信任和認(rèn)可。