武漢單細(xì)胞BCR測序服務(wù)

來源: 發(fā)布時(shí)間:2022-06-07

烈冰科技自主研發(fā)的單細(xì)胞云平臺致力于幫助每一位客戶定制化分析數(shù)據(jù),深入解讀數(shù)據(jù)分析結(jié)果,深入挖掘其背后的生物學(xué)意義;從操作便捷、結(jié)果可視化、分析可追溯、系統(tǒng)穩(wěn)定等方面助力單細(xì)胞研究,加速科研進(jìn)程!此外,烈冰生信團(tuán)隊(duì)根據(jù)豐富的實(shí)戰(zhàn)經(jīng)驗(yàn)為用戶量身打造了一款單細(xì)胞測序結(jié)果解讀的神兵利器——單細(xì)胞瀏覽器(Single Cell Browser),不僅可以將海量復(fù)雜的結(jié)果文件可視化,還可以實(shí)現(xiàn)分析結(jié)果的三維立體化的展示呈現(xiàn)。專業(yè)的生信代碼交給專業(yè)的烈冰,專業(yè)的生物學(xué)意義交給專業(yè)的您!單細(xì)胞測序因其強(qiáng)大的探究疾病--細(xì)胞--基因的關(guān)系,一度成為高通量測序技術(shù)的“天花板”。武漢單細(xì)胞BCR測序服務(wù)

高通量測序技術(shù)(High-throughput sequencing)又稱“下一代”測序技術(shù)(“Next-generation” sequencing),以能一次并行對幾十萬到幾百萬條DNA分子進(jìn)行序列測定和一般讀長較短等為標(biāo)志。高通量測序技術(shù)是對傳統(tǒng)測序一次顛覆性的改變,一次對幾十萬到幾百萬條DNA分子進(jìn)行序列測定,因此在有些文獻(xiàn)中稱其為下一代測序技術(shù)(next generation sequencing)足見其劃時(shí)代的改變,同時(shí)高通量測序使得對一個(gè)物種的轉(zhuǎn)錄組和基因組進(jìn)行細(xì)致全貌的 分析成為可能,所以又被稱為深度測序(deep sequencing)。而烈冰科技具有專業(yè)生物背景和十二年科研服務(wù)經(jīng)驗(yàn),已助力Nature,immunity等在內(nèi)的300+篇CNS文章發(fā)表。武漢空間轉(zhuǎn)錄組測序公司空間轉(zhuǎn)錄組測序以分子方式定義病理,完成了病理數(shù)字化結(jié)合病理影像化的革新。

所謂的高通量測序技術(shù),又名大規(guī)模平行測序,是將 DNA(或者 cDNA)隨機(jī)片段化、加接頭,制備測序文庫,通過對文庫中數(shù)以萬計(jì)的克隆(colony)進(jìn)行延伸反應(yīng),檢測對應(yīng)的信號并獲取序列信息。與 傳統(tǒng)測序法相比,高通量測序技術(shù)在處理大規(guī)模樣品時(shí)具有強(qiáng)大的優(yōu)勢,又快(兩天)又多(數(shù)百萬克?。蔀槟壳敖M學(xué)研究的主要技術(shù)。單細(xì)胞測序是一個(gè)系統(tǒng)的工程,開展項(xiàng)目前您可能會(huì)先評估它提供的見解是否與您的研究問題相匹配,如果匹配,實(shí)驗(yàn)過程如何規(guī)劃,實(shí)驗(yàn)平臺如何選擇,樣本如何制備,數(shù)據(jù)如何分析等等,而在這一切開始之前,我們的服務(wù)就已經(jīng)開始了,從銷售到實(shí)驗(yàn)到專業(yè)技術(shù)支持,我們開通全線對接渠道,幫助您快速定位項(xiàng)目訴求,提供從實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)到文章發(fā)表的全流程,我們始終是您貼心的科學(xué)合作伙伴。

空間轉(zhuǎn)錄組測序的數(shù)據(jù)分析基本分為三個(gè)階段:1. 數(shù)據(jù)的預(yù)處理部分;2. Spot點(diǎn)陣的分群與定義;3. Spot分群的功能與生物學(xué)價(jià)值。每一個(gè)部分都不可或缺,其結(jié)果都對后續(xù)的分析結(jié)果有重要影響。由于空間轉(zhuǎn)錄組的序列結(jié)構(gòu)與單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序的左端序列結(jié)構(gòu)是非常接近的,都是Cellbarcode/SpotBarcode + UMI + 捕獲區(qū)域這樣的設(shè)計(jì)。右端普遍為捕獲的RNA序列。因此采用單細(xì)胞的原始數(shù)據(jù)過濾策略即可,左端可以考慮切下捕獲區(qū)域前的序列區(qū)域作為后續(xù)分析用的序列以減少分析負(fù)荷。隨后,采用10X官方的Spatialranger的策略進(jìn)行后續(xù)分析,解析出位于空間位置中的有效的Spot表達(dá)矩陣。經(jīng)驗(yàn)豐富的實(shí)驗(yàn)團(tuán)隊(duì),為獲得示組織內(nèi)真實(shí)表達(dá)水平的高質(zhì)量冷凍切片提供硬件和技術(shù)保障。

BD的技術(shù)不再采用利用微流控孔道射出細(xì)胞和射出的磁珠碰撞的過程,進(jìn)行單細(xì)胞捕獲的技術(shù),轉(zhuǎn)而采用CytoSeq特有的蜂窩板技術(shù)。該技術(shù)用20萬+的微孔(該數(shù)量級遠(yuǎn)大于Input細(xì)胞數(shù)量),保證單孔中的單細(xì)胞捕獲。同時(shí)避免了10X中存在的概率碰撞影響捕獲效率的問題,采用微孔捕獲相對會(huì)有更好的捕獲效率(來自兩家企業(yè)商業(yè)宣傳資料比對),保證Input細(xì)胞的高效使用。對于Input細(xì)胞的量更少的情況,可以基于百萬級別的細(xì)胞總量開始進(jìn)行前期處理以及后期捕獲操作。 而在細(xì)胞捕獲完成后,進(jìn)行細(xì)胞裂解后,同樣的也進(jìn)行細(xì)胞中RNA polyA序列的抓取工作。烈冰引進(jìn)國際主流空間轉(zhuǎn)錄組測序平臺,提供保留組織內(nèi)部精細(xì)區(qū)域的空間信息的轉(zhuǎn)錄組測序。溫州單細(xì)胞TCR測序數(shù)據(jù)分析

單細(xì)胞測序技術(shù)遍地開花,烈冰服務(wù)讓您的生物醫(yī)學(xué)研究如虎添翼。武漢單細(xì)胞BCR測序服務(wù)

Fluidigm C1平臺基于富魯達(dá)(Fluidigm?)的微流控技術(shù)應(yīng)用于單細(xì)胞測序(Single Cell RNA Sequencing)領(lǐng)域的商業(yè)化中,該技術(shù)大約在幾個(gè)小時(shí)中可以捕獲96個(gè)左右的細(xì)胞,進(jìn)行各類的Single-Cell測序建庫。當(dāng)然,通量還是比較小。但不可否認(rèn)的是,現(xiàn)在很多非RNA類Single Cell測序,仍然在采用這樣的技術(shù),如Single Cell DNA-Seq,Single Cell ATAC-Seq等,都是采用此技術(shù)進(jìn)行單細(xì)胞分選后再分別用不同試劑盒建庫。所以可以說,至少在10X Genomics、BD或者其他企業(yè)推出有效的Single DNA測序技術(shù)之前,C1仍然會(huì)是市場上的重要組成部分。武漢單細(xì)胞BCR測序服務(wù)

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