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基于10X Next GEM技術(shù),單細胞免疫組庫測序一次實驗可以同時檢測近萬個細胞,可在一個樣本中同時獲5'端mRNA表達譜、TCR和BCR的信息,結(jié)合基因的表達譜和V(D)J數(shù)據(jù)進行復雜組織樣本的是影響免疫應答分析,監(jiān)測免疫療法的效果,研究疾病發(fā)生、發(fā)展的分子機制。 烈冰平臺 1/ 1000+ TCR/BCR項目經(jīng)驗,一次實驗可同時獲取1000-10000個細胞的文庫構(gòu)建,獲得轉(zhuǎn)錄組和免疫組數(shù)據(jù)。 2/ 具備完善的免疫組庫測序和實驗質(zhì)控流程,獲取V(D)J全長序列的配對信息 3/ 豐富的免疫組庫測序和數(shù)據(jù)分析經(jīng)驗,實現(xiàn)專屬個性化數(shù)據(jù)分析服務,搭配單細胞分析云平臺,一鍵導出交互性的動態(tài)結(jié)果報告。烈冰智造PanoCell單細胞捕獲,媲美國際主流的單細胞平臺。常州全轉(zhuǎn)錄組測序
烈冰生物生信分析團隊緊追國際前沿、整合添加多項國際期刊認可的空轉(zhuǎn)分析工具,構(gòu)建一套完整的數(shù)據(jù)分析流程;精心研發(fā)空轉(zhuǎn)結(jié)果瀏覽器,可同步展示空間轉(zhuǎn)錄組與單細胞測序分析結(jié)果,詳細深入地解析空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)。完成從Raw data(原始數(shù)據(jù))到Spot-Gene的具有定位信息的表達矩陣的過程后,就進入了空轉(zhuǎn)的第二步,去進行Spot的Cluster的過程,熟悉單細胞測序的研究者知道,Cluster在單細胞測序中往往表示為細胞的類型,也就是說能聚在一起采用算法分為一個群體細胞是一個Celltype(當然分情況也會有不同)。而在空轉(zhuǎn)中,也正是由于前面提到了細胞的非單一性,導致了這里的分群并不是單純的同一細胞類型,而應該認為是具有相同細胞組成的點陣區(qū)域,或者說是近似的組織結(jié)構(gòu)區(qū)域。重慶RNA測序技術(shù)支持單細胞測序技術(shù)的迅速發(fā)展和應用推廣,為從多維度揭示疾病進展提供了強有力的工具。
什么是染色質(zhì)可及性? 正常情況下,DNA與核小體纏繞折疊在一起形成染色質(zhì),但是DNA的復制、轉(zhuǎn)錄都是需要將染色體的高級結(jié)構(gòu)解開的,然而解壓并不需要將整個染色體全部打開,而只需要打開一部分,即需要表達基因的區(qū)域。這部分打開的染色質(zhì),就叫開放染色質(zhì)(open chromatin)。打開染色質(zhì),允許部分調(diào)控蛋白(比如轉(zhuǎn)錄因子和輔因子)過來與之相結(jié)合的特性,即染色質(zhì)的可及性(chromatin accessibility)。ATAC-seq(Assay for Transposase-Accessible Chromatin with highthroughput sequencing),即利用轉(zhuǎn)座酶研究染色質(zhì)可及性的高通量測序技術(shù),通俗來說就是將攜帶測序信息的轉(zhuǎn)座酶等插入開放性染色質(zhì)中進行識別,進一步通過高通量測序及生物信息學分析來挖掘相關(guān)基因信息,以探究生物學相關(guān)問題。與ScRNA-Seq類似,ScATAC-seq也是在ATAC-Seq的基礎(chǔ)上,解決不同細胞群體的異質(zhì)性的問題,檢出混雜樣品測序所無法得到的異質(zhì)性信息。
烈冰科技自主研發(fā)的單細胞云平臺致力于幫助每一位客戶定制化分析數(shù)據(jù),深入解讀數(shù)據(jù)分析結(jié)果,深入挖掘其背后的生物學意義;從操作便捷、結(jié)果可視化、分析可追溯、系統(tǒng)穩(wěn)定等方面助力單細胞研究,加速科研進程!此外,烈冰生信團隊根據(jù)豐富的實戰(zhàn)經(jīng)驗為用戶量身打造了一款單細胞測序結(jié)果解讀的神兵利器——單細胞瀏覽器(Single Cell Browser),不僅可以將海量復雜的結(jié)果文件可視化,還可以實現(xiàn)分析結(jié)果的三維立體化的展示呈現(xiàn)。專業(yè)的生信代碼交給專業(yè)的烈冰,專業(yè)的生物學意義交給專業(yè)的您!烈冰生物成立于2010年,專注于單細胞測序領(lǐng)域科研服務。
多樣本數(shù)據(jù)合并:Fraction of Reads Kept:合并樣本時,各樣本根據(jù)Mapped Barcoded Reads per Cell數(shù)量計算出來的數(shù)據(jù)利用率。如果各樣本間該參數(shù)值相差很大,需要進行Downsample處理,以數(shù)據(jù)量少的樣本為基準將不同樣本中細胞測序深度標化到同一水平,從而避免因測序深度差異導致的基因檢測數(shù)量、基因表達水平的差異。烈冰科技自主研發(fā)的單細胞云平臺致力于幫助每一位客戶定制化分析數(shù)據(jù),深入解讀數(shù)據(jù)分析結(jié)果,深入挖掘其背后的生物學意義;從操作便捷、結(jié)果可視化、分析可追溯、系統(tǒng)穩(wěn)定等方面助力單細胞研究,加速科研進程!高通量測序技術(shù)是對傳統(tǒng)測序一次翻天覆地的改變,一次對幾十萬到幾百萬條核酸序列進行測定。深圳空間轉(zhuǎn)錄組測序服務
烈冰科技成立10余年,為科研學者提供專注的測序數(shù)據(jù)分析服務。常州全轉(zhuǎn)錄組測序
烈冰科技于2010年誕生之初便立足于高通量測序行業(yè),為科研學者提供專注的測序數(shù)據(jù)分析服務,先后經(jīng)歷基因芯片時代、基因測序、轉(zhuǎn)錄組測序時代...在科技日新月異的洪流中始終獨占鰲頭。2018年以來,單細胞測序進入發(fā)展的快車道,烈冰作為國內(nèi)首批引進單細胞實驗雙平臺的公司,依托自主研發(fā)的NovelBrain?生物大數(shù)據(jù)分析平臺,為用戶提供一站式全流程的單細胞測序服務和解決方案。4年的單細胞技術(shù)的積累,烈冰已具備大鼠、小鼠、斑馬魚、猴、裸鼴鼠、水稻、擬南芥等10+物種,皮膚、腦、胰腺、脂肪、心臟、花序等50+組織類型,100+細胞類型,1000+靶標基因,10000+樣本處理經(jīng)驗。常州全轉(zhuǎn)錄組測序
上海烈冰生物醫(yī)藥科技有限公司致力于醫(yī)藥健康,以科技創(chuàng)新實現(xiàn)***管理的追求。烈冰生物作為生物科技、醫(yī)藥科技、信息科技、計算機科技領(lǐng)域內(nèi)的技術(shù)開發(fā)、技術(shù)服務、技術(shù)轉(zhuǎn)讓、技術(shù)咨詢,市場營銷策劃,市場信息咨詢與調(diào)查(不得從事社會調(diào)查、社會調(diào)研、民意調(diào)查、民意測驗),從事貨物及技術(shù)的進出口業(yè)務,計算機、軟件及耗材(除??兀?,軟件開發(fā)【依法須經(jīng)批準的項目,經(jīng)相關(guān)部門批準后方可開展經(jīng)營活動】的企業(yè)之一,為客戶提供良好的單細胞測序,生物大數(shù)據(jù)云分析平臺,空間轉(zhuǎn)錄組測序,單細胞多組學測序。烈冰生物繼續(xù)堅定不移地走高質(zhì)量發(fā)展道路,既要實現(xiàn)基本面穩(wěn)定增長,又要聚焦關(guān)鍵領(lǐng)域,實現(xiàn)轉(zhuǎn)型再突破。烈冰生物創(chuàng)始人陳岱,始終關(guān)注客戶,創(chuàng)新科技,竭誠為客戶提供良好的服務。