基于10XGeomics動態(tài)微流控技術(shù)，利用Tn5轉(zhuǎn)座酶酶切開放染色質(zhì)，形成短片段，單細胞ATAC測序在表觀基因組學水平上，揭示單細胞染色質(zhì)的可及性問題，區(qū)分細胞異質(zhì)性，獲得開放染色質(zhì)的位置、轉(zhuǎn)錄因子的結(jié)合位點、核小體的調(diào)控區(qū)域和染色質(zhì)狀態(tài)等信息，是單細胞表觀遺傳學的重要突破：分析每個細胞數(shù)千個獨特的染色質(zhì)開放區(qū)域，識別細胞類型和細胞狀態(tài)；識別重要的轉(zhuǎn)錄因子，進行譜系和發(fā)育追蹤；探究驅(qū)動細胞類型和狀態(tài)之間基因表達差異的非編碼序列；探究細胞類型特異性和基因調(diào)控網(wǎng)絡特征等。是當前重要的多組學研究基因表達和表觀遺傳學的手段。單個細胞的基因結(jié)構(gòu)和基因表達狀態(tài)，并鑒定細胞的類型。吉林10X Chromi...

細胞計數(shù)和活力評估在評估樣本質(zhì)量時，需要在細胞清洗和過濾之后測定細胞活力，這一點至關(guān)重要。測定細胞活力有許多種方法，烈冰多年單細胞測序經(jīng)驗發(fā)現(xiàn)臺盼藍法在鑒定活細胞與死細胞的比例時效果很好。細胞計數(shù)的準確性以及目標回收量和實際回收量之間的一致性，取決于我們了解樣本中有多少個細胞。一旦過濾和清洗完成，可采用細胞計數(shù)設備（如血球計數(shù)器或自動細胞計數(shù)儀）進行定量。這些設備不但能提供準確的細胞計數(shù)，還能計算出向微流體芯片上樣適量細胞所需的細胞懸液體積。烈冰生物全轉(zhuǎn)錄組測序通過雙文庫構(gòu)建，實現(xiàn)多種RNA的一網(wǎng)打盡。武漢二代測序單細胞測序服務從單細胞測序描述性分析轉(zhuǎn)向復雜樣本中不同細胞類型的功能解析，越來越...

對于單細胞測序而言，常常需要先構(gòu)建細胞圖譜，在此基礎(chǔ)上再開展后續(xù)各項分析，并且數(shù)據(jù)分析時以細胞聚類（cellcluster）為討論對象，而不是像常規(guī)Bulk測序一樣以組別為分析對象，因此單細胞測序項目對樣本入組要求沒有Bulk測序那樣嚴格，但是單細胞測序，特別是目的為圖譜研究時，需要通過提高樣本復雜度（增加樣本數(shù)），盡可能的構(gòu)建某一疾病類型、群體細胞圖譜信息。因此，單細胞測序?qū)嶒炘O計時首先需要保證生物學重復，不同樣本來源的樣本建議單獨進行細胞解離和捕獲、建庫、測序，以保證捕獲到足夠的細胞數(shù)，單個樣本分別捕獲細胞時，后續(xù)分析除了整體分析以外，還可以做單樣本分析，保證分析的完備準確性。烈冰斥巨資引...

10X Genomics單細胞轉(zhuǎn)錄組測序是利用單細胞水平上的高通量測序分析基因表達譜的技術(shù)，也是目前國內(nèi)和國際上公認的單細胞測序大規(guī)模實驗平臺技術(shù)，該平臺基于動態(tài)微流控原理，突破傳統(tǒng)高通量測序的局限性，組織解離后，單個樣本一次上機能捕獲500-20000個細胞， 基于每個細胞分別建庫測序，獲得單個細胞的基因結(jié)構(gòu)和基因表達狀態(tài)，并鑒定細胞的類型，可以在不同樣本間從細胞類型的組成和豐度角度進行比較，反映細胞間的異質(zhì)性，提供足夠靈活的定制測定法以滿足多種實驗需要，并有效縮短實驗是時間和降低測序成本。從樣本處理到終端數(shù)據(jù)分析，只要您需要，烈冰提供全流程的無憂服務。寧波單細胞測序百萬通量平臺烈冰科技作為...

科研的魅力之處，在于無窮盡的探尋生命的本底，通過單細胞測序，我們對組織的分子基礎(chǔ)的研究也從初級到深層，并在單細胞層面逐漸達成一致，那么不禁要問一句，組織的空間位置到底重不重要？空間異質(zhì)性是功能的關(guān)鍵特征，細胞的位置信息更能反應細胞命運調(diào)控機制和細胞譜系發(fā)生過程。因此時間和空間即像組織的AB面，而不可否認的是，此時空間坐標的記錄，像一個還未長大的娃娃，雖未觸及分子基礎(chǔ)研究的深層，但仍在努力攀登探尋生命本底的下一個高峰。烈冰單細胞測序，助力您的深入科學探究。蘇州高通量測序單細胞測序百萬通量平臺多樣本數(shù)據(jù)合并：FractionofReadsKept：合并樣本時，各樣本根據(jù)MappedBarcoded...

RNA測序（RNA-seq）或芯片分析等大量樣本的轉(zhuǎn)錄組學方法作為一類強大的工具，可提供混合樣本的基因表達平均數(shù)據(jù)，幫助科學家開始揭示這種異質(zhì)性。隨后，技術(shù)創(chuàng)新的飛躍在單細胞技術(shù)上達到新高度——使得科學家能夠定義細胞類型特異的基因表達，從過去的平均數(shù)據(jù)中分辨出真正驅(qū)動其表達模式的細胞異質(zhì)性。這讓研究人員能夠更詳細地表征組織異質(zhì)性，鑒定稀有細胞類型，并逐個細胞地仔細分析其分子機制。當獲得了對其研究的生物系統(tǒng)更為真實的圖譜后，研究人員就有了更為堅實可靠的知識基礎(chǔ)，并能在這個基礎(chǔ)上規(guī)劃下一步實驗，以獲取更深入的可行動見解。經(jīng)驗豐富的實驗團隊，為獲得示組織內(nèi)真實表達水平的高質(zhì)量冷凍切片提供硬件和技術(shù)保...

多樣本數(shù)據(jù)合并：FractionofReadsKept：合并樣本時，各樣本根據(jù)MappedBarcodedReadsperCell數(shù)量計算出來的數(shù)據(jù)利用率。如果各樣本間該參數(shù)值相差很大，需要進行Downsample處理，以數(shù)據(jù)量少的樣本為基準將不同樣本中細胞測序深度標化到同一水平，從而避免因測序深度差異導致的基因檢測數(shù)量、基因表達水平的差異。烈冰科技自主研發(fā)的單細胞云平臺致力于幫助每一位客戶定制化分析數(shù)據(jù)，深度解讀數(shù)據(jù)分析結(jié)果，深入挖掘其背后的生物學意義；從操作便捷、結(jié)果可視化、分析可追溯、系統(tǒng)穩(wěn)定等方面助力單細胞研究，加速科研進程！測序可準確地分析基因表達差異、基因結(jié)構(gòu)變異、篩選分子標記（S...

樣本制備后的保存為了盡可能地減少轉(zhuǎn)錄組的變化，在對細胞進行清洗和計數(shù)后，單細胞懸液應當保存于冰上，直至用于后續(xù)的上機和文庫制備步驟。在理想狀況下，一旦制備好樣本，應當在3min鐘內(nèi)將其用于下游步驟。然而，您還有必要了解各類細胞的不同性質(zhì)，因為這可能會影響細胞應在冰上保存的時間，以及它們在制備后多久便應當被盡快使用。例如，有些細胞（如PBMC）如果在冰上放置一段時間，它們就開始形成團塊。這些團塊很難解離，增加了堵塞的風險，而且每個團塊被當成單細胞計數(shù)，又降低了細胞計數(shù)的準確性。此外，有些細胞更加粘稠，形成團塊的速度更快。對于這些細胞，必須盡量減少制備和使用之間的時間差從樣本處理到終端數(shù)據(jù)分析，只...

樣本制備后的保存為了盡可能地減少轉(zhuǎn)錄組的變化，在對細胞進行清洗和計數(shù)后，單細胞懸液應當保存于冰上，直至用于后續(xù)的上機和文庫制備步驟。在理想狀況下，一旦制備好樣本，應當在3min鐘內(nèi)將其用于下游步驟。然而，您還有必要了解各類細胞的不同性質(zhì)，因為這可能會影響細胞應在冰上保存的時間，以及它們在制備后多久便應當被盡快使用。例如，有些細胞（如PBMC）如果在冰上放置一段時間，它們就開始形成團塊。這些團塊很難解離，增加了堵塞的風險，而且每個團塊被當成單細胞計數(shù)，又降低了細胞計數(shù)的準確性。此外，有些細胞更加粘稠，形成團塊的速度更快。對于這些細胞，必須盡量減少制備和使用之間的時間差十二年測序經(jīng)驗，累計服務與5...

烈冰科技自主研發(fā)的單細胞云平臺致力于幫助每一位客戶定制化分析數(shù)據(jù)，深度解讀數(shù)據(jù)分析結(jié)果，深入挖掘其背后的生物學意義；從操作便捷、結(jié)果可視化、分析可追溯、系統(tǒng)穩(wěn)定等方面助力單細胞研究，加速科研進程！此外，烈冰生信團隊根據(jù)豐富的實戰(zhàn)經(jīng)驗為用戶量身打造了一款單細胞測序結(jié)果解讀的神兵利器——單細胞瀏覽器（SingleCellBrowser），不但可以將海量復雜的結(jié)果文件可視化，還是可以實現(xiàn)三維立體化展示的軟件。專業(yè)的生信代碼交給專業(yè)的烈冰，專業(yè)的生物學意義交給專業(yè)的您，詳情請咨詢烈冰生物。高通量測序技術(shù)是對傳統(tǒng)測序一次顛覆性的改變，一次對幾十萬到幾百萬條核酸序列進行測定。上海烈冰單細胞測序服務公司單細...

10XGenomics和Drop-Seq具有類似的技術(shù)原理。從橫向孔道中逐一輸入凝膠微珠，一列縱向孔道輸入細胞，凝膠微珠與細胞碰撞后會吸附在凝膠微珠上，并通過微流控技術(shù)，將之輸入到第二縱向孔道，即油相孔道中。這時候，就形成了一個個油滴并輸出并收集在EP管中。每一個油滴中會落入一個細胞以及一個凝膠微珠，那么在每一個凝膠微珠中上長滿了不同的CellBarcode和UMIBarcode連接形成的序列，再加上一端PolyT的抓手，構(gòu)成我們的捕獲凝膠微珠。而這個凝膠微珠抓手就會使用oligodT抓住mRNA構(gòu)建文庫。單細胞測序技術(shù)的迅速發(fā)展和應用推廣，為從多維度揭示疾病發(fā)展提供了強有力的工具。福州烈冰單...

關(guān)于單細胞測序?qū)嶒灅颖局苽?，這與流式細胞術(shù)用戶熟悉的步驟完全一致，也就是通過酶促或機械消化、細胞分選或其他細胞分離技術(shù)從整個樣本中制備生成活的單細胞懸液。隨后是細胞計數(shù)和質(zhì)量控制步驟，以確保您的樣本有適當濃度的活細胞，并且不含細胞團塊和死細胞碎片。如有必要，您還可以使用抗體對樣本進行染色，標記細胞表面蛋白或其他生物分析物，或者通過FACS來富集感興趣的細胞類型。解離樣本時采取的具體步驟將根據(jù)您的起始材料和實驗目標而定。也許需要額外的制備步驟，具體取決于組織質(zhì)量、樣本豐度、細胞大小，以及是否需要提取出細胞核進行染色質(zhì)可接近性分析。無論具體的考慮因素如何，所有樣本類型都遵循同一個基本原則，那就是生...

截至2022年6月，烈冰生物助力發(fā)表單細胞文章近40篇，從平臺應用比例來看，應用10X Genomics和BD Rhapsody兩大平臺發(fā)文比例各占50%左右，研究類型涵蓋疾病發(fā)展，靶點探索，免疫研究，神經(jīng)發(fā)育，干細胞分化，植物發(fā)育，退行病變，糖尿病，COVID-19等等研究；從發(fā)表期刊水平來看，烈冰生物聯(lián)合發(fā)表的單細胞文章，CNS一區(qū)期刊占比在30%以上，其中包括immunity三篇，Nature子刊3篇（Nature cell biology,Nature Plants，Nature communication）,風濕類領(lǐng)域ARD期刊1篇，CUT 1篇，Advanced Science多篇...

二代測序技術(shù)在測序方法上取得了重大突破，基于“邊合成邊測序”（sequencingbysynthesis）和大規(guī)模平行測序技術(shù)（massiveparallelanalysis,MPS），使測序通量和讀取速度得到極大提升，例如IlluminaSolexa測序儀。Illumina的測序原理可以簡化為四步：樣品文庫構(gòu)建、簇生成、測序和數(shù)據(jù)分析。由于讀長限制，樣品DNA或由RNA逆轉(zhuǎn)錄得到的cDNA需要被打斷成300-500bp的片段，并在3和5端接上3種序列：1）Index，用于區(qū)分樣品來源；2）Adapter，用于結(jié)合測序通道上的位點；3）Primerbindingsite，用于結(jié)合PCR引物...

烈冰與國內(nèi)高校、研究所、醫(yī)院和藥企單位開展深度合作，服務于600+臨床與研究機構(gòu)，1000+客戶和5000+重要科研項目，助力并聯(lián)合發(fā)表300+篇CNS等國際學術(shù)期刊（不完全統(tǒng)計），在單細胞領(lǐng)域，烈冰助力用戶發(fā)表單細胞文獻30+篇，總IF＞300+，IF＞10+以上文章占比65%以上，包含Immunity、NatureCellBiology、NaturePlants、AdvancedScience等生物領(lǐng)域國際主流學術(shù)期刊，已發(fā)表文章研究領(lǐng)域涵蓋包括COVID-19研究、疾病發(fā)生轉(zhuǎn)移機制，免疫研究、腦神經(jīng)、白血病、胚胎發(fā)育、糖尿病、退行性疾病和植物領(lǐng)域研究等。烈冰科技成立10余年，為科研學者提...

10XGenomics是一種基于drop的微流控技術(shù)，液體在配套芯片中的微管道中流動，因此細胞直徑會受到芯片中微管道直徑的限制，微流體通道的直徑約為50~60um，因此捕獲細胞的直徑不能超過40um。當細胞直徑過大時，容易出現(xiàn)管道堵塞，造成GEM生成失敗，對于神經(jīng)科學研究和心血管疾病研究的老師而言，準備采用單細胞技術(shù)用于課題研究的時候，往往會遇到一個尷尬的問題，就是目標細胞，例如神經(jīng)元細胞、成熟心肌細胞由于體積過大，不適用于10X單細胞技術(shù)。其中神經(jīng)元細胞的直徑很大，直接超過了芯片中管道的直徑，雖然心肌細胞直徑低于50um，但是成熟心肌細胞的長度很長，有可能堵塞通道造成實驗失敗，這也是為什么現(xiàn)...

單細胞RNA-seq、RNA-seq和逆轉(zhuǎn)錄qPCR（RT-qPCR）都采用一個共同過程，即分離RNA并將其轉(zhuǎn)化為cDNA進行分析。不過，每種分析在開展方式和獲得的數(shù)據(jù)上有所不同。RNA-seq和RT-qPCR都是先從大量細胞中分離RNA，然后將其轉(zhuǎn)化為cDNA。RNA-seq是使用cDNA來構(gòu)建新一代測序文庫，從而測定整個轉(zhuǎn)錄組的基因表達。RT-qPCR則是從cDNA中擴增特定靶點，并通過熒光測定表達水平。RT-qPCR限于已知靶點，而RNA-seq可實現(xiàn)無偏倚的全轉(zhuǎn)錄組基因表達分析。然而，這兩者只能提供細胞群體內(nèi)基因表達的平均情況。單細胞RNA-seq則在分離RNA之前將單細胞分離到微孔或...

單細胞測序?qū)嶒炘贅颖炯毎蠙C分選簽，需要對細胞數(shù)量、細胞活性進準判斷，這對Single Cell分選標記、建庫、下機數(shù)據(jù)的質(zhì)量都具有著決定性的作用。如若細胞計數(shù)偏高，將會影響建庫的成功率；計數(shù)偏低，則會提高雙細胞的比例；而細胞活率過低，就會使測序數(shù)據(jù)的利用率大打折扣，因此把好單細胞懸液質(zhì)量這一關(guān)尤為重要。而在鋪板過程中，由于不同操作人員手法具有不可避免的差異，不同的液體流速將直接影響單細胞的入孔效果。因此烈冰生物BD Rhapsody單細胞分選平臺配套了專門定制的電動移液器，其具有Prime Treat、Cell Load、Bead Load、Wash、Lysis、Retrieval多種操作模...

作為單細胞測序的一個重要里程碑，10x genomic公司于2016年2月推出10x Chromium Single Cell Gene Expression Solution，此平臺整合了儀器、試劑盒和信息學軟件，能精確對接illumina測序儀，因此可實現(xiàn)大量大細胞的快速高效標記、測序和分析，獲得單細胞水平的基因表達譜和差異情況，并通過對復雜細胞群體進行深入細致分析，繪制大規(guī)模單細胞表達圖譜。 以量化細胞內(nèi)的群體異質(zhì)性，并逐個鑒定細胞類型、細胞狀態(tài)和動態(tài)細胞躍遷。除了有望鑒定新的細胞亞型和稀有細胞群體，單細胞技術(shù)還能更好地了解轉(zhuǎn)錄動態(tài)和基因調(diào)控關(guān)系。全線搭建10x Genomics單細胞測...

烈冰科技自主研發(fā)的單細胞云平臺致力于幫助每一位客戶定制化分析數(shù)據(jù)，深度解讀數(shù)據(jù)分析結(jié)果，深入挖掘其背后的生物學意義；從操作便捷、結(jié)果可視化、分析可追溯、系統(tǒng)穩(wěn)定等方面助力單細胞研究，加速科研進程！此外，烈冰生信團隊根據(jù)豐富的實戰(zhàn)經(jīng)驗為用戶量身打造了一款單細胞測序結(jié)果解讀的神兵利器——單細胞瀏覽器（SingleCellBrowser），不但可以將海量復雜的結(jié)果文件可視化，還是可以實現(xiàn)三維立體化展示的軟件。專業(yè)的生信代碼交給專業(yè)的烈冰，專業(yè)的生物學意義交給專業(yè)的您！烈冰科技成立10余年，為科研學者提供專注的測序數(shù)據(jù)分析服務。武漢10X Chromium X單細胞測序數(shù)據(jù)分析可視化RNA測序（RNA...

基于10X Next GEM技術(shù)，單細胞測序一次實驗可以同時檢測近萬個細胞，可在一個樣本中同時獲3'端mRNA表達譜、如需和免疫組庫（TCR和BCR）的數(shù)據(jù)進行聯(lián)合時，即某些研究還需結(jié)合基因的表達譜和V(D)J數(shù)據(jù)進行復雜組織樣本的是影響免疫應答分析，監(jiān)測免疫療法的效果，研究疾病發(fā)生、發(fā)展的分子機制，可進行單細胞免疫組庫測序： 烈冰單細胞免疫組庫平臺具備：1000+項目經(jīng)驗，一次實驗可同時獲取1000-20000個細胞的文庫構(gòu)建，獲得轉(zhuǎn)錄組和免疫組數(shù)據(jù)； 具備完善的免疫組庫測序和實驗質(zhì)控流程，獲取V(D)J全長序列的配對信息；豐富的免疫組庫測序和數(shù)據(jù)分析經(jīng)驗，實現(xiàn)專屬個性化數(shù)據(jù)分析服務，搭配...

二代測序技術(shù)在測序方法上取得了重大突破，基于“邊合成邊測序”（sequencing by synthesis）和大規(guī)模平行測序技術(shù)（massive parallel analysis,MPS），使測序通量和讀取速度得到極大提升，例如Illumina Solexa測序儀。Illumina的測序原理可以簡化為四步：樣品文庫構(gòu)建、簇生成、測序和數(shù)據(jù)分析。由于讀長限制，樣品DNA或由RNA逆轉(zhuǎn)錄得到的cDNA需要被打斷成300-500bp的片段，并在3'和5'端接上3種序列：1）Index，用于區(qū)分樣品來源；2）Adapter，用于結(jié)合測序通道上的位點；3）Primer binding site，用于...

基因和基因產(chǎn)物并不是單獨運作的，而是參與了相互關(guān)聯(lián)的復雜通路、網(wǎng)絡和分子系統(tǒng)，這些合在一起實現(xiàn)了細胞、組織和生物體的運作。定義這些系統(tǒng)并確定它們的特征和相互作用，對于了解生物系統(tǒng)如何運作至關(guān)重要?！睘榱送苿涌茖W發(fā)現(xiàn)，科學家們需要各種能夠幫助多方位了解其樣本的潛在生物復雜性的研究工具。對于越來越多的研究人員來說，單細胞RNA測序和單細胞多組學——即在單細胞分辨率下對基因表達及其他基于DNA、RNA或蛋白質(zhì)的分析物進行定量分析的基因組方法——在幫助解決他們面臨的生物學問題上已證實是行之有效的。烈冰測序服務已助力300余篇國際期刊研究文章發(fā)表。福州單細胞測序服務公司關(guān)于單細胞測序?qū)嶒灅颖局苽?，這與流...

關(guān)于10X Genomics單細胞平臺的樣本類型和樣本制備 ：10X平臺在上機前需要注意細胞消化后的細胞團塊，獲得分離良好的細胞懸液、無細胞隨便、極少的細胞團塊，且細胞活力高（＞70%）；此外，了解您所研究細胞的大小范圍也很重要。細胞大小通常與細胞表達的轉(zhuǎn)錄本數(shù)量有關(guān)。各種尺寸不同的細胞（一般直徑不大于50μm）均可與我們基因表達解決方案中使用的10X Genomics平臺兼容。一般來說，細胞制備方案將根據(jù)組織來源和細胞類型而變化。每種組織類型都是獨特的，因此，必須在開始任何單細胞實驗之前優(yōu)化樣本制備，烈冰多年樣本解離消化經(jīng)驗，累積10+物種、50+組織的消化protocol，若您的樣本為組織...

科技的發(fā)展讓單細胞測序已經(jīng)應用于疾病發(fā)展過程中的關(guān)鍵過程和事件，如前病變向惡性的轉(zhuǎn)化、惡性向轉(zhuǎn)移性的發(fā)展，以及對多種用藥的反應。單細胞測序技術(shù)作為一個需要將組織解離成為單細胞懸液，或者是采用細胞核捕獲的策略捕獲單細胞核，進而對于每一個單細胞或者細胞核進行測序得到結(jié)果的技術(shù)，其空間定位信息是丟失的。這就衍生出了一個問題就是如果單細胞A與B并不出現(xiàn)在一個組織區(qū)域中他們會互相影響或者轉(zhuǎn)化么？免疫研究中，兩個具有非常強的PDL1-PD1的配對關(guān)系的細胞在組織切片上風馬牛不相及，這樣PDL1-PD1的關(guān)系會生效么？基因測序相關(guān)產(chǎn)品和技術(shù)已由實驗室研究逐漸演變到臨床應用，是下一個改變世界的技術(shù)。重慶10X...

10X Genomics單細胞轉(zhuǎn)錄組測序是利用單細胞水平上的高通量測序分析基因表達譜的技術(shù)，也是目前國內(nèi)和國際上公認的單細胞測序大規(guī)模實驗平臺技術(shù)，該平臺基于動態(tài)微流控原理，突破傳統(tǒng)高通量測序的局限性，組織解離后，單個樣本一次上機能捕獲500-20000個細胞， 基于每個細胞分別建庫測序，獲得單個細胞的基因結(jié)構(gòu)和基因表達狀態(tài)，并鑒定細胞的類型，可以在不同樣本間從細胞類型的組成和豐度角度進行比較，反映細胞間的異質(zhì)性，提供足夠靈活的定制測定法以滿足多種實驗需要，并有效縮短實驗是時間和降低測序成本。烈冰斥巨資引進Novaseq6000，開啟更大通量測序新紀元。北京高通量測序單細胞測序服務公司烈冰生物...

單細胞測序龐大的數(shù)據(jù)烈冰生信團隊傾情研發(fā)的NovelBrain?生信大數(shù)據(jù)分析平臺，可實現(xiàn)零代碼操作、簡單方便：單細胞瀏覽器的操作簡單，不需要命令行操作。簡單拖拽、設置參數(shù)即可運行，即使生信0基礎(chǔ)用戶也可以運用自如；可視化展示海量結(jié)果文件：可視化展示Cluster的基因數(shù)，UMI數(shù)量、線粒體RNA占比信息；以及不同Cluster對應的細胞數(shù)量、基因表達量、RNA表達量、樣本細胞分布、線粒體RNA表達量等；3D立體展示，文章動圖先人一步：單細胞瀏覽器針對t-SNE圖、UMAP圖和pseudotime結(jié)果進行三維立體展示，更加直觀立體的觀察細胞分布和聚類情況。過去的十年，我們是知識的承載者；現(xiàn)在，...

單細胞測序龐大的數(shù)據(jù)烈冰生信團隊傾情研發(fā)的NovelBrain?生信大數(shù)據(jù)分析平臺，可實現(xiàn)零代碼操作、簡單方便：單細胞瀏覽器的操作簡單，不需要命令行操作。簡單拖拽、設置參數(shù)即可運行，即使生信0基礎(chǔ)用戶也可以運用自如；可視化展示海量結(jié)果文件：可視化展示Cluster的基因數(shù)，UMI數(shù)量、線粒體RNA占比信息；以及不同Cluster對應的細胞數(shù)量、基因表達量、RNA表達量、樣本細胞分布、線粒體RNA表達量等；3D立體展示，文章動圖先人一步：單細胞瀏覽器針對t-SNE圖、UMAP圖和pseudotime結(jié)果進行三維立體展示，更加直觀立體的觀察細胞分布和聚類情況。烈冰斥巨資引進Novaseq6000，...

細胞中基因的表達是嚴格按照時間和空間順序發(fā)生，因此細胞類型和基因表達具有時間特異性和空間特異性。時間特異性可以通過收集不同時間點的樣本進行單細胞轉(zhuǎn)錄組測序來分析。但是單細胞轉(zhuǎn)錄組測序（scRNA-Seq）在單細胞懸液制備的過程中破壞了細胞的空間結(jié)構(gòu)，無法給出固態(tài)異質(zhì)化組織中細胞空間排布信息。而空間轉(zhuǎn)錄組可以解決這個問題，其以點陣形式記錄組織切片細胞的空間信息，在保留組織形態(tài)結(jié)構(gòu)的基礎(chǔ)上，獲得細胞/基因的空間表達特異性。單細胞測序技術(shù)的迅速發(fā)展和應用推廣，為從多維度揭示疾病發(fā)展提供了強有力的工具。武漢二代測序單細胞測序多組學測序10X Genomics和Drop-Seq具有類似的技術(shù)原理。從橫向...

為什么需要單細胞分辨率？ 生物學就像宇宙一樣。它非常復雜，有許多獨特的單體，也就是細胞。這些細胞相互作用并扮演不同的角色，在更大的體系中構(gòu)建并驅(qū)動多個過程。就像伽利略探索宇宙的努力一樣，發(fā)現(xiàn)和定義這些細胞也需要高分辨率的工具，才能解開促成生物學復雜性的基因表達異質(zhì)性。單細胞測序能夠在以一個細胞為功能單位中開展生物學研究，闡明具體細節(jié)，構(gòu)建出一幅更大、更精細的圖譜，說明導致產(chǎn)生某種外在表型的不同類型的分子和細胞之間是如何相互作用的：患者為什么會復發(fā)？是什么讓這種疫苗能夠有效防止傳染等等諸多問題。單細胞測序技術(shù)遍地開花，烈冰服務讓您的醫(yī)學研究如虎添翼。長春單細胞測序數(shù)據(jù)分析針對單細胞測序的細胞上樣...