網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)還受到許多毒理學(xué)研究者的高度重視。基于網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)、系統(tǒng)生物學(xué)等的研究提出了網(wǎng)絡(luò)毒理學(xué)研究的理念,即根據(jù)構(gòu)建網(wǎng)絡(luò)模型來研究藥物的毒理學(xué)性質(zhì)。通過對(duì)網(wǎng)絡(luò)模型的關(guān)聯(lián)分析及揭示藥物的不良反應(yīng)及機(jī)制。從相關(guān)數(shù)據(jù)庫中提取出基因、蛋白、不良反應(yīng)等要素,將這些要素作為節(jié)點(diǎn),運(yùn)用計(jì)算機(jī)技術(shù)構(gòu)建不良反應(yīng)-藥物-基因、靶點(diǎn)網(wǎng)絡(luò)模型,推測(cè)和判斷藥物的不良反應(yīng)及產(chǎn)生不良反應(yīng)的物質(zhì)。該研究思路不只為毒理學(xué)研究帶來了全新視角,也為藥物的安全性評(píng)價(jià)提供了新的依據(jù)。范驍輝等討論了建立網(wǎng)絡(luò)毒理學(xué)及中藥網(wǎng)絡(luò)毒理學(xué)研究思路,談到復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建及分析技術(shù)的快速發(fā)展為網(wǎng)絡(luò)毒理學(xué)的誕生奠定了基礎(chǔ)。建立中藥網(wǎng)絡(luò)毒理學(xué),有望為開展有毒...
網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)是基于系統(tǒng)生物學(xué)的理論,對(duì)生物系統(tǒng)的網(wǎng)絡(luò)分析,選取特定信號(hào)節(jié)點(diǎn)進(jìn)行多靶點(diǎn)藥物分子設(shè)計(jì)的新學(xué)科,其強(qiáng)調(diào)對(duì)信號(hào)通路的多途徑調(diào)節(jié),提高藥物的醫(yī)療效果,降低不良反應(yīng),從而提高新藥臨床試驗(yàn)的成功率,節(jié)約藥物研發(fā)費(fèi)用,使藥物設(shè)計(jì)更趨向合理化,其使用各種數(shù)據(jù)庫和軟件可以快速將藥物有效成分與疾病作用機(jī)制進(jìn)行預(yù)測(cè)。其中,徐雅等采用網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)研究了車前子的降壓作用機(jī)制,發(fā)現(xiàn)了車前子中有6種化學(xué)活性成分,對(duì)應(yīng)157個(gè)作用靶點(diǎn),映射后對(duì)應(yīng)90個(gè)作用靶點(diǎn),通過KEGG通路富集分析,獲得了36條發(fā)揮降壓作用的通路信息;馬新稱等也采用網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)研究了鉤藤醫(yī)療的作用機(jī)制,發(fā)現(xiàn)鉤藤中有11個(gè)潛在活性成分,29個(gè)作用靶...
網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)融合了系統(tǒng)生物學(xué)及多向藥理學(xué)的思想并迅速發(fā)展,成為當(dāng)前新藥發(fā)現(xiàn)和新藥創(chuàng)制的研究策略。它作為一門新興的交叉學(xué)科,除受到各學(xué)科理論的限制外,還受到各方面技術(shù)上的限制,如有限的數(shù)據(jù)庫信息量、不能準(zhǔn)確反映機(jī)體狀況等,在一定程度上影響了其科學(xué)性?,F(xiàn)在越來越多的研究人員開始關(guān)注網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué),其相關(guān)學(xué)科的研究也在不斷深入,隨著疾病和藥物的相關(guān)數(shù)據(jù)不斷增多,計(jì)算機(jī)技術(shù)和計(jì)算分析軟件的不斷完善,相信未來網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)將被越來越多地運(yùn)用于到藥學(xué)領(lǐng)域的研究中。隨著網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)的影響力和應(yīng)用日益普遍,網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)在理論分析、算法發(fā)展和實(shí)際應(yīng)用等方面。河南臨床網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)哪家好傳統(tǒng)中藥歷史悠久,在醫(yī)療復(fù)雜慢性疾病方面具有...
網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)是于2007年由英國鄧迪大學(xué)藥理學(xué)家Hopkins初次提出,是基于系統(tǒng)生物學(xué)的理論,融合多向藥理學(xué)、生物信息學(xué)、計(jì)算機(jī)科學(xué)等多學(xué)科的技術(shù)和內(nèi)容,進(jìn)行“疾病表型-基因-靶點(diǎn)-藥物”等多層次網(wǎng)絡(luò)的構(gòu)建,探索藥物與疾病間相關(guān)性,指導(dǎo)新藥研發(fā),闡明藥物作用機(jī)制,其整體性、系統(tǒng)性及藥物成分間相互作用,“多成分-多靶點(diǎn)-多途徑”構(gòu)建網(wǎng)絡(luò),經(jīng)過拓?fù)鋮?shù)分析,以及蛋白相互作用網(wǎng)絡(luò)圖、柱狀圖、氣泡圖等可視化,將藥物作用于靶點(diǎn),作用機(jī)制以及各生理病理過程等闡明清楚,與中醫(yī)藥特點(diǎn)不謀而合。將其應(yīng)用于中醫(yī)藥研究中的創(chuàng)新點(diǎn)是基于經(jīng)典的復(fù)方中藥、中藥材,用于新藥研發(fā),以藥測(cè)病,以傳統(tǒng)醫(yī)學(xué)為疾病靶標(biāo),挖掘疾病作用...
網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)是基于系統(tǒng)生物學(xué)理論和生物系統(tǒng)網(wǎng)絡(luò)分析來設(shè)計(jì)藥物的一門新興學(xué)科。它綜合探索藥物對(duì)疾病網(wǎng)絡(luò)的干預(yù)和影響,揭示多分子藥物協(xié)同醫(yī)療疾病的奧秘。這些概念反映了多組分、多靶點(diǎn)和系統(tǒng)調(diào)控的思想,與中醫(yī)辨證論治的研究思路有許多相似之處,強(qiáng)調(diào)對(duì)病因病機(jī)的周全認(rèn)識(shí)。網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)可以用來預(yù)測(cè)和鑒別中藥的靶標(biāo)和有效成分,闡明其作用機(jī)制,系統(tǒng)地解釋方子的用藥規(guī)律,探索真實(shí)世界方子的規(guī)律,發(fā)現(xiàn)新的適應(yīng)癥和新的活性化合物,研究藥物重新定位等。評(píng)價(jià)用于驗(yàn)證網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)分析結(jié)果的試驗(yàn)設(shè)計(jì)、檢測(cè)方法等具體實(shí)現(xiàn)過程的合理性。天津醫(yī)學(xué)網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)分析費(fèi)用網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)一方面其整體性、系統(tǒng)性的特點(diǎn)與中醫(yī)藥“整體觀念”、“辨證論治”的...
網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)是基于網(wǎng)絡(luò)分析的方法得到結(jié)果,為驗(yàn)證其方法的可靠性,可進(jìn)一步進(jìn)行實(shí)驗(yàn)確證。驗(yàn)證方法包括體內(nèi)實(shí)驗(yàn)和體外實(shí)驗(yàn)兩種。張新莊等運(yùn)用網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)方法預(yù)測(cè)熱毒寧注射液抗流感病毒的分子作用機(jī)制,并通過體外流感病毒神經(jīng)氨酸酶篩選模型對(duì)網(wǎng)絡(luò)預(yù)測(cè)結(jié)果進(jìn)行驗(yàn)證,結(jié)果表明具有高節(jié)點(diǎn)度和高介數(shù)的木犀草素呈現(xiàn)較強(qiáng)的阻止作用,高節(jié)點(diǎn)度和低介數(shù)的槲皮素呈現(xiàn)較弱的阻止作用,充分證實(shí)節(jié)點(diǎn)度和介數(shù)在預(yù)測(cè)網(wǎng)絡(luò)關(guān)鍵節(jié)點(diǎn)時(shí)的重要作用。Sheng等運(yùn)用網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)的方法分析了復(fù)方血栓通膠囊抗血栓的藥理學(xué)機(jī)制。揭示了復(fù)方活性成分在凝血、纖溶和血小板聚集方面發(fā)揮的作用。并使用LPS誘導(dǎo)的DIC大鼠模型驗(yàn)證了復(fù)方血栓通膠囊能夠明顯阻止凝血...
評(píng)價(jià)用于驗(yàn)證網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)分析結(jié)果的試驗(yàn)設(shè)計(jì)、檢測(cè)方法等具體實(shí)現(xiàn)過程的合理性。主要的評(píng)價(jià)內(nèi)容包括:1、驗(yàn)證模型,評(píng)價(jià)結(jié)果驗(yàn)證所采用的模型,如計(jì)算機(jī)模型、實(shí)驗(yàn)?zāi)P?、臨床研究隊(duì)列等;2、檢測(cè)指標(biāo),評(píng)價(jià)結(jié)果驗(yàn)證所參考的具體檢測(cè)指標(biāo),包括計(jì)算機(jī)模擬的輸出結(jié)果、算法效能的檢測(cè)指標(biāo)、實(shí)驗(yàn)或臨床試驗(yàn)的檢測(cè)指標(biāo)等。對(duì)于新開發(fā)的網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)分析算法,需根據(jù)結(jié)果類型提供適宜的性能評(píng)價(jià)指標(biāo),對(duì)其預(yù)測(cè)結(jié)果進(jìn)行驗(yàn)證,必要時(shí)可采用標(biāo)準(zhǔn)數(shù)據(jù)集進(jìn)行驗(yàn)證。評(píng)價(jià)數(shù)據(jù)信息的提取與轉(zhuǎn)換、軟件/算法的開發(fā)、網(wǎng)絡(luò)的構(gòu)建與分析以及實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證等流程是否規(guī)范。湖南護(hù)理網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)的中心理論:“網(wǎng)絡(luò)靶標(biāo)”理論網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)的中心理論在于靶標(biāo)網(wǎng)絡(luò)的建...
在中藥研究領(lǐng)域,網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)會(huì)逐漸扮演重要的角色,中醫(yī)藥將不再是“偽科學(xué)”,中醫(yī)藥的研究可以充分運(yùn)用網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)研究方法,證實(shí)中藥及其復(fù)方中的多種活性成分是通過多途徑、多環(huán)節(jié)、多靶點(diǎn)來醫(yī)療復(fù)雜疾病的,將傳統(tǒng)中醫(yī)藥的優(yōu)勢(shì)和較新的科學(xué)技術(shù)相結(jié)合,明確中藥及其復(fù)方在體內(nèi)作用的物質(zhì)基礎(chǔ)及作用機(jī)制,使中醫(yī)藥擺脫藥理作用機(jī)制不明,藥效成分不明的窘境,將中醫(yī)藥現(xiàn)代化并推向世界。中藥藥效評(píng)價(jià)是借鑒西藥評(píng)價(jià)體系,如單因素觀察評(píng)價(jià)模式,這種模式對(duì)對(duì)復(fù)方中藥的藥效評(píng)價(jià)并不周全。中藥講究辨證論治、用藥靈活,且中醫(yī)和西醫(yī)對(duì)疾病本質(zhì)的認(rèn)識(shí)也相差較大,因此,中藥的藥效也應(yīng)該從多角度、多層次去評(píng)價(jià)。在網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)評(píng)價(jià)中,要求從可靠...
中醫(yī)藥學(xué)主要包括了2個(gè)方面:中醫(yī)學(xué)和中藥學(xué),而中醫(yī)學(xué)是以中醫(yī)藥理論為基礎(chǔ),結(jié)合實(shí)踐經(jīng)驗(yàn)進(jìn)行研究的一門學(xué)科,研究人類生命活動(dòng)健康與疾病的轉(zhuǎn)化規(guī)律及其預(yù)防、診斷、醫(yī)療、康復(fù)和保健的綜合性學(xué)科,注重整體觀念和辨證論治;而中藥學(xué)是研究中藥基礎(chǔ)理論和各味中藥的來源、采制、性能、功效和臨床應(yīng)用等相關(guān)知識(shí)的學(xué)科,基礎(chǔ)理論主要包括中藥的性能、功效和配伍規(guī)律等。但二者并未分開,共同在中醫(yī)藥理論的基礎(chǔ)上組成了中醫(yī)藥學(xué),中醫(yī)藥離不開中藥的物質(zhì)基礎(chǔ),而中藥離不開中醫(yī)學(xué)的理論指導(dǎo)。目前無論是單味中藥材、還是中藥復(fù)方及其配伍,其成分復(fù)雜多樣,各成分之間相互協(xié)同或拮抗、作用于相同或不同靶點(diǎn)、不同藥效途徑發(fā)揮臨床療效,其藥效...
在網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)研究中,針對(duì)不同的分析對(duì)象(疾病、藥物)和分析目的(數(shù)據(jù)庫開發(fā)、算法開發(fā)、機(jī)制研究、診療發(fā)現(xiàn)、藥物研發(fā)等),必需開展的評(píng)價(jià)內(nèi)容,以保證分析結(jié)果的真實(shí)可信。在基礎(chǔ)性評(píng)價(jià)之上,針對(duì)不同的分析對(duì)象和分析目,可選擇開展的評(píng)價(jià)內(nèi)容,使評(píng)價(jià)活動(dòng)更加深入和客觀,以提升網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)分析結(jié)果的可信度。主要評(píng)價(jià)藥物的物質(zhì)基礎(chǔ)、生物靶標(biāo)等基礎(chǔ)數(shù)據(jù)來源及收集方法的可靠性。評(píng)價(jià)內(nèi)容如下:1、數(shù)據(jù)來源:評(píng)價(jià)使用數(shù)據(jù)的出處,如文獻(xiàn)、數(shù)據(jù)庫、實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)等;2、數(shù)據(jù)信息:評(píng)價(jià)使用數(shù)據(jù)的整體情況,如數(shù)據(jù)總量、收集時(shí)間、相關(guān)數(shù)據(jù)庫版本等;3、關(guān)聯(lián)信息:評(píng)價(jià)不同數(shù)據(jù)間進(jìn)行關(guān)聯(lián)的相關(guān)內(nèi)容,如關(guān)聯(lián)信息的數(shù)量、種類等。中藥網(wǎng)絡(luò)藥理...
近年來,網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)在中醫(yī)藥領(lǐng)域應(yīng)用普遍,張雨等主要從藥效物質(zhì)基礎(chǔ)、作用機(jī)制、新藥研發(fā)、新適應(yīng)癥、中藥配伍規(guī)律等方面介紹網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)在中藥復(fù)方研究領(lǐng)域中的應(yīng)用及存在的問題,為中藥復(fù)方的作用機(jī)制研究提供了新方向。邢心睿等采用網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)對(duì)各類疾病作用機(jī)制進(jìn)行預(yù)測(cè),為解決中藥有效成分不清、作用機(jī)制不明等問題提供了新思路。可見網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)近年來在中醫(yī)藥運(yùn)用之普遍,并且在新藥研發(fā)、先導(dǎo)化合物的發(fā)現(xiàn)、中藥藥的性、中藥配伍規(guī)律、中藥藥效作用機(jī)制和中藥復(fù)方新適應(yīng)癥的挖掘和探索等方面發(fā)揮著重要作用,不只可以運(yùn)用于藥物醫(yī)療疾病的活性成分和作用機(jī)制研究,并且還可以運(yùn)用于已知藥物篩選活性成分和作用靶點(diǎn)及通路,從而發(fā)現(xiàn)藥物的...
網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)是運(yùn)用系統(tǒng)生物學(xué)的方法,基于“藥物-成分-靶點(diǎn)-疾病”的相互作用網(wǎng)絡(luò),通過數(shù)據(jù)庫分析將眾多已有的研究結(jié)果相結(jié)合,從復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)關(guān)系中系統(tǒng)研究藥物對(duì)疾病的網(wǎng)絡(luò)化干預(yù)方式及影響。分子對(duì)接則是基于鎖鑰模型,利用分子理學(xué)原理,模擬配體與受體的相互作用,預(yù)測(cè)二者之間結(jié)合模式及作用強(qiáng)度,從而進(jìn)行藥物靶點(diǎn)的虛擬篩選及藥效成分預(yù)測(cè)的一種方法,多用于新藥研發(fā)等藥物研究。網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)和分子對(duì)接本質(zhì)上都是工具,是**過時(shí)的研究手段。傳統(tǒng)藥理學(xué)研究多針對(duì)單一通路,通過實(shí)驗(yàn)手段逐一篩選靶點(diǎn),存在選擇較為主觀及效率低下等原因。在中藥復(fù)方研究中,因其中藥復(fù)方成分較多,無法簡單地進(jìn)行一一對(duì)應(yīng)。而網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)研究,更加符合中...
中藥網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)能較好地體現(xiàn)中醫(yī)藥整體觀,可用于闡釋中藥醫(yī)療疾病的物質(zhì)基礎(chǔ)和作用機(jī)制,常規(guī)研究思路可分為以下步驟:1、成分收集及處理:通過檢索數(shù)據(jù)庫、文獻(xiàn),收集中藥所含化學(xué)成分。對(duì)化學(xué)成分進(jìn)行ADMET篩選。2、成分靶標(biāo)的收集:基于數(shù)據(jù)庫,對(duì)經(jīng)ADMET篩選后的化學(xué)成分進(jìn)行靶標(biāo)收集。3、疾病靶標(biāo)的收集:基于數(shù)據(jù)庫,對(duì)疾病靶標(biāo)進(jìn)行收集。4、成分與疾病共同靶標(biāo)的確認(rèn):采用韋恩圖進(jìn)行確認(rèn)。5、成分--共同靶標(biāo)網(wǎng)絡(luò)的建立與分析:采用Cytoscape軟件,建立成分--共同靶標(biāo)網(wǎng)絡(luò),并進(jìn)行拓?fù)浞治?,預(yù)測(cè)物質(zhì)基礎(chǔ)和關(guān)鍵靶標(biāo)。6、基因富集分析:對(duì)共同靶標(biāo)進(jìn)行基因富集分析,預(yù)測(cè)中藥醫(yī)療疾病的關(guān)鍵通路。7、實(shí)驗(yàn)驗(yàn)...
網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)是運(yùn)用多種數(shù)據(jù)庫及軟件綜合分析、篩選、構(gòu)建網(wǎng)絡(luò)圖,其中主要的數(shù)據(jù)庫、軟件及相關(guān)作用如下:中藥系統(tǒng)藥理學(xué)數(shù)據(jù)庫和分析平臺(tái)(TCMSP)主要用于藥物化合物成分及相關(guān)靶標(biāo)的篩選;通用蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫(Uniprot)用于靶標(biāo)蛋白基因的搜索篩選;有機(jī)小分子生物活性數(shù)據(jù)庫(Pubchem/OMIM)用于藥物化合物2D、3D結(jié)構(gòu)搜索;人類基因數(shù)據(jù)庫(GeneCards)用于疾病基因搜索篩選;在線韋恩圖反映藥物篩選靶標(biāo)基因與疾病基因的交集基因;蛋白互作平臺(tái)數(shù)據(jù)庫(STRING)用于構(gòu)建蛋白相互作用網(wǎng)絡(luò)(PPI);生物學(xué)信息注釋數(shù)據(jù)庫(DAVIDv6.8)用于GO分類富集和KEGG通路富集分析;在線云平...
在網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)評(píng)價(jià)中,要求從可靠性、規(guī)范性和合理性三個(gè)方面進(jìn)行評(píng)價(jià)。具體要求如下:1、可靠性評(píng)價(jià):評(píng)估主要數(shù)據(jù)及其關(guān)聯(lián)信息的獲取、軟件算法與分析方法的設(shè)計(jì)以及驗(yàn)證方法的選擇與模型構(gòu)建是否可靠、能否滿足分析要求。2、規(guī)范性評(píng)價(jià):評(píng)價(jià)數(shù)據(jù)信息的提取與轉(zhuǎn)換、軟件/算法的開發(fā)、網(wǎng)絡(luò)的構(gòu)建與分析以及實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證等流程是否規(guī)范,相關(guān)技術(shù)方法的應(yīng)用是否準(zhǔn)確,用于保障分析結(jié)果的準(zhǔn)確性和可重現(xiàn)性。3、合理性評(píng)價(jià):評(píng)估數(shù)據(jù)篩選與過濾、網(wǎng)絡(luò)分析指標(biāo)的選擇與閾值的確定、驗(yàn)證模型及檢測(cè)指標(biāo)的選擇等內(nèi)容是否合理性,評(píng)價(jià)要素與評(píng)價(jià)指標(biāo)可參考附錄表。生物網(wǎng)絡(luò)是采用數(shù)學(xué)領(lǐng)域圖論的研究手段,借助復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)的研究方法。重慶醫(yī)學(xué)專業(yè)網(wǎng)絡(luò)藥理...
通過構(gòu)建藥物-靶點(diǎn)-疾病之間的復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)分析藥物的作用機(jī)制,使藥理研究由傳統(tǒng)尋找單一靶點(diǎn)轉(zhuǎn)向綜合網(wǎng)絡(luò)分析。同時(shí),通過網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)分析可發(fā)現(xiàn),在不同發(fā)展階段的同一疾病,由不同的功能基因或功能蛋白調(diào)控;而部分功能蛋白可在多個(gè)疾病中起中樞(Hub)調(diào)控作用,與中醫(yī)藥理論的“同病異治”和“異病同治”相似。而中藥復(fù)方所含化學(xué)成分較復(fù)雜和藥理作用具有多靶點(diǎn)多層次的特點(diǎn),與網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)具有天然的兼容性。網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)能夠從整體性分析和闡述中藥復(fù)方的作用機(jī)理,有利于推動(dòng)中藥復(fù)方的深入研究和擴(kuò)大臨床適應(yīng)癥的發(fā)展。網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)它綜合探索藥物對(duì)疾病網(wǎng)絡(luò)的干預(yù)和影響,揭示多分子藥物協(xié)同醫(yī)療疾病的奧秘。江西職業(yè)醫(yī)藥網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)分析傳...
網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)的研究離不開生物網(wǎng)絡(luò)的構(gòu)建。生物網(wǎng)絡(luò)是采用數(shù)學(xué)領(lǐng)域圖論的研究手段,借助復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)的研究方法,將生物體中各種物質(zhì)及其相互作用加以抽象,如將構(gòu)成系統(tǒng)內(nèi)的各個(gè)組分抽象成節(jié)點(diǎn),他們之間的聯(lián)系或相互作用關(guān)系描繪成邊,由節(jié)點(diǎn)和邊構(gòu)成的圖就是網(wǎng)絡(luò),結(jié)尾組成一個(gè)包含多個(gè)體、多層次相互作用的復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)。包括生物分子為基礎(chǔ)的蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)、信號(hào)通路網(wǎng)絡(luò)、代謝網(wǎng)絡(luò)、基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)、miRNA網(wǎng)絡(luò)、生物過程網(wǎng)絡(luò)、組織網(wǎng)絡(luò)等。中藥藥效物質(zhì)基礎(chǔ)是指中藥發(fā)揮藥效的活性成分體系。四川初級(jí)網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)服務(wù)網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)的研究思路:網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)是通過各數(shù)據(jù)庫及軟件進(jìn)行高通量分支和整體篩選,先進(jìn)行藥物靜態(tài)化合物小分子篩選,篩選對(duì)應(yīng)...
網(wǎng)絡(luò)的節(jié)點(diǎn)包括基因、通路、疾病、化合物、蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)域、生物學(xué)進(jìn)程、蛋白質(zhì)、代謝物、藥物、內(nèi)源性小分子等。邊表示的相互作用包括實(shí)驗(yàn)測(cè)定理化相互作用、基因調(diào)控相互作用、基因共表達(dá)等其他相互作用。不同的節(jié)點(diǎn)和邊構(gòu)成了豐富的生物網(wǎng)絡(luò)。常見的網(wǎng)絡(luò)為“化合物-靶標(biāo)-基因”網(wǎng)絡(luò),“化合物-靶標(biāo)-通路”網(wǎng)絡(luò),“化合物-靶標(biāo)”網(wǎng)絡(luò)。網(wǎng)絡(luò)分析通常包括網(wǎng)絡(luò)拓?fù)鋵W(xué)信息計(jì)算、隨機(jī)網(wǎng)絡(luò)生成和比較以及網(wǎng)絡(luò)分層和聚類。常用的網(wǎng)絡(luò)拓?fù)鋵W(xué)分析內(nèi)容包括度(degree)、介數(shù)(betweenness)、較短路徑(shortestpath)、瓶頸(bottleneck)、中心節(jié)點(diǎn)(hub)、模塊(moldule)、楔點(diǎn)(chokep...
評(píng)價(jià)數(shù)據(jù)收集過程中,針對(duì)信息的傳遞途徑、信息的處理過程等內(nèi)容進(jìn)行合理性評(píng)價(jià)。要的評(píng)價(jià)內(nèi)容包括:1、數(shù)據(jù)溯源,評(píng)價(jià)擬分析的數(shù)據(jù)能否追溯,如參考文獻(xiàn)具體信息、實(shí)驗(yàn)或臨床試驗(yàn)詳細(xì)結(jié)果等;2、數(shù)據(jù)篩選,對(duì)擬分析數(shù)據(jù)進(jìn)行選擇的相關(guān)過程進(jìn)行評(píng)價(jià),如篩選原則、篩選條件等;針對(duì)藥效成分的篩選,應(yīng)充分考慮分析對(duì)象、吸收途徑、藥效部位、顯效成分、代謝形式、生物利用度、成藥的性等影響藥效學(xué)行為因素,選取影響藥效學(xué)行為的參數(shù)進(jìn)行藥效成分篩選。針對(duì)靶標(biāo)或靶標(biāo)間相互作用等信息的篩選,應(yīng)著重考察數(shù)據(jù)的可信度、獲取方法合理性等因素。近年來,網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)在中醫(yī)藥領(lǐng)域應(yīng)用普遍。江西醫(yī)學(xué)專業(yè)網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)價(jià)格李梢等提出中醫(yī)學(xué)是以整體、動(dòng)...
通過構(gòu)建藥物-靶點(diǎn)-疾病之間的復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)分析藥物的作用機(jī)制,使藥理研究由傳統(tǒng)尋找單一靶點(diǎn)轉(zhuǎn)向綜合網(wǎng)絡(luò)分析。同時(shí),通過網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)分析可發(fā)現(xiàn),在不同發(fā)展階段的同一疾病,由不同的功能基因或功能蛋白調(diào)控;而部分功能蛋白可在多個(gè)疾病中起中樞(Hub)調(diào)控作用,與中醫(yī)藥理論的“同病異治”和“異病同治”相似。而中藥復(fù)方所含化學(xué)成分較復(fù)雜和藥理作用具有多靶點(diǎn)多層次的特點(diǎn),與網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)具有天然的兼容性。網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)能夠從整體性分析和闡述中藥復(fù)方的作用機(jī)理,有利于推動(dòng)中藥復(fù)方的深入研究和擴(kuò)大臨床適應(yīng)癥的發(fā)展。中醫(yī)藥的療效大家在平常應(yīng)用中大家都是認(rèn)可的,但是其中機(jī)理大家不是比較清楚,可能于中醫(yī)藥的整體觀有關(guān)。福建臨床網(wǎng)...
在中藥研究領(lǐng)域,網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)會(huì)逐漸扮演重要的角色,中醫(yī)藥將不再是“偽科學(xué)”,中醫(yī)藥的研究可以充分運(yùn)用網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)研究方法,證實(shí)中藥及其復(fù)方中的多種活性成分是通過多途徑、多環(huán)節(jié)、多靶點(diǎn)來醫(yī)療復(fù)雜疾病的,將傳統(tǒng)中醫(yī)藥的優(yōu)勢(shì)和較新的科學(xué)技術(shù)相結(jié)合,明確中藥及其復(fù)方在體內(nèi)作用的物質(zhì)基礎(chǔ)及作用機(jī)制,使中醫(yī)藥擺脫藥理作用機(jī)制不明,藥效成分不明的窘境,將中醫(yī)藥現(xiàn)代化并推向世界。中藥藥效評(píng)價(jià)是借鑒西藥評(píng)價(jià)體系,如單因素觀察評(píng)價(jià)模式,這種模式對(duì)對(duì)復(fù)方中藥的藥效評(píng)價(jià)并不周全。中藥講究辨證論治、用藥靈活,且中醫(yī)和西醫(yī)對(duì)疾病本質(zhì)的認(rèn)識(shí)也相差較大,因此,中藥的藥效也應(yīng)該從多角度、多層次去評(píng)價(jià)。在網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)評(píng)價(jià)中,要求從可靠...
網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)數(shù)據(jù)的獲取和驗(yàn)證:1、高通量高內(nèi)涵技術(shù):該技術(shù)是指在保持細(xì)胞、組織或整體動(dòng)物結(jié)構(gòu)和功能完整性的條件下,一次性檢測(cè)成百上千個(gè)處理且同時(shí)檢測(cè)被篩樣品對(duì)活細(xì)胞、組織或整體動(dòng)物的多個(gè)表型作用,具有均質(zhì)、多維表型檢測(cè)、實(shí)時(shí)動(dòng)態(tài)監(jiān)測(cè)和可視化的特點(diǎn)。2、雙高通量基因表達(dá)檢測(cè)技術(shù):該技術(shù)具有檢測(cè)樣品高通量、檢測(cè)目標(biāo)基因高通量的雙高通量特點(diǎn),可以驗(yàn)證所需基礎(chǔ)數(shù)據(jù)和網(wǎng)絡(luò)模型。Fakhari等在2002年提出的聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(PCR)芯片技術(shù),具有操作流程簡單、特異性強(qiáng)、靈敏度高、重復(fù)性好等特點(diǎn)。3、分子相互作用技術(shù):該技術(shù)是用來揭示藥物作用原理,驗(yàn)證網(wǎng)絡(luò)預(yù)測(cè)模型,揭示藥物分子與機(jī)體生物大分子之間的相互作...
中藥網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)要解決的一個(gè)中心問題是,如何在疾病相關(guān)網(wǎng)絡(luò)的背景下,評(píng)價(jià)中藥的多成分、多靶點(diǎn)的協(xié)同作用。根據(jù)中方子劑成分復(fù)雜、靶點(diǎn)不清、以周全調(diào)節(jié)的方式干預(yù)復(fù)雜疾病的特點(diǎn),研究者們提出了一些中藥網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)的研究路線,如圖1就是一個(gè)典型的中藥復(fù)方研究的網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)路線圖。這個(gè)路線圖包括數(shù)據(jù)獲取和網(wǎng)絡(luò)分析兩大部分。需要獲取的數(shù)據(jù)包括中方子劑的有效活性成分、活性化合物的靶點(diǎn)和疾病相關(guān)基因等?;谶@些數(shù)據(jù),構(gòu)建和分析疾病相關(guān)網(wǎng)絡(luò)、藥物影響網(wǎng)絡(luò),識(shí)別疾病和藥物影響的信號(hào)通路和生物學(xué)過程,能幫助我們闡明中方子劑的作用機(jī)制。中藥網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)已成為近年來研究的熱點(diǎn)和國家自然基金重點(diǎn)支持的領(lǐng)域。山東醫(yī)學(xué)網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)分析...
中藥具有多成分、多靶點(diǎn)、調(diào)節(jié)方式多樣的特點(diǎn),蘊(yùn)含了極大的信息量。采用西醫(yī)單靶標(biāo)、單成分的研究思路來研究中藥,比較難體現(xiàn)中藥的系統(tǒng)性,不能科學(xué)解釋中藥復(fù)方的藥效物質(zhì)基礎(chǔ)及組方規(guī)律等問題。隨著網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)技術(shù)的提出,單靶標(biāo)、單成分研究思路開始向整體探究、系統(tǒng)調(diào)節(jié)轉(zhuǎn)變。2007年,Yildirim等首先應(yīng)用了網(wǎng)絡(luò)生物學(xué)的概念,通過對(duì)藥物與基因、蛋白相互作用數(shù)據(jù)進(jìn)行集成分析,發(fā)現(xiàn)多數(shù)藥物是通過間接調(diào)節(jié)發(fā)揮作用,而非直接作用于疾病相關(guān)蛋白。在此基礎(chǔ)上,Hopkins于同年提出了網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)(networkpharmacology)研究方法,認(rèn)為藥物是作用于多個(gè)靶點(diǎn),并通過多靶點(diǎn)間的相互作用產(chǎn)生增效減毒的效果...
網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)的研究離不開生物網(wǎng)絡(luò)的構(gòu)建。生物網(wǎng)絡(luò)是采用數(shù)學(xué)領(lǐng)域圖論的研究手段,借助復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)的研究方法,將生物體中各種物質(zhì)及其相互作用加以抽象,如將構(gòu)成系統(tǒng)內(nèi)的各個(gè)組分抽象成節(jié)點(diǎn),他們之間的聯(lián)系或相互作用關(guān)系描繪成邊,由節(jié)點(diǎn)和邊構(gòu)成的圖就是網(wǎng)絡(luò),結(jié)尾組成一個(gè)包含多個(gè)體、多層次相互作用的復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)。包括生物分子為基礎(chǔ)的蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)、信號(hào)通路網(wǎng)絡(luò)、代謝網(wǎng)絡(luò)、基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)、miRNA網(wǎng)絡(luò)、生物過程網(wǎng)絡(luò)、組織網(wǎng)絡(luò)等。中藥網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)已成為近年來研究的熱點(diǎn)和國家自然基金重點(diǎn)支持的領(lǐng)域。黑龍江職業(yè)醫(yī)藥網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)費(fèi)用評(píng)價(jià)數(shù)據(jù)收集過程中,針對(duì)信息的傳遞途徑、信息的處理過程等內(nèi)容進(jìn)行合理性評(píng)價(jià)。要的評(píng)價(jià)內(nèi)容包括:...
“中醫(yī)藥網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)”理論中藥系統(tǒng)藥理學(xué)是近年來發(fā)展起來的新興學(xué)科,以中醫(yī)藥基本理論為指導(dǎo)來研究疾病的發(fā)生機(jī)制,從而為醫(yī)療復(fù)雜疾病提供新的方法和思路,其注重整體觀念。系統(tǒng)藥理學(xué)是從細(xì)胞、分子、網(wǎng)絡(luò)到組織、部位等多種水平來研究藥物與人體之間相互作用及其規(guī)律和本質(zhì)的一門學(xué)科,其采取實(shí)驗(yàn)和理論計(jì)算相結(jié)合的方法,可以快速篩選有效的藥物分子,確定其在人體分子層面的生物靶標(biāo),預(yù)測(cè)藥物可能存在的不良反應(yīng)及其機(jī)制,并研究疾病的發(fā)生機(jī)制,從而達(dá)到通過調(diào)控細(xì)胞內(nèi)的復(fù)雜生物網(wǎng)絡(luò)來提高藥效、降低不良反應(yīng)和醫(yī)療疾病的目的。其在中藥多成分、多靶點(diǎn)、多通路、多功能以及中藥配伍等方面進(jìn)行研究,體現(xiàn)了中藥中單個(gè)成分對(duì)應(yīng)多靶點(diǎn)、多...
針對(duì)用于篩選重要作用靶標(biāo)(群)、關(guān)鍵藥效成分(群)等要素分析指標(biāo)進(jìn)行合理性評(píng)價(jià),包括軟件/算法參數(shù)、網(wǎng)絡(luò)分析參數(shù)等。其中,網(wǎng)絡(luò)分析參數(shù)包括節(jié)點(diǎn)與邊的特征(如節(jié)點(diǎn)度、節(jié)點(diǎn)中心性、邊權(quán)重等)、網(wǎng)絡(luò)的凝聚性(如密度、聚類系數(shù)、子圖、連通性等)、網(wǎng)絡(luò)的可分割性(如層次聚類、譜分割等)、網(wǎng)絡(luò)模塊性、網(wǎng)絡(luò)基序等。針對(duì)研究的具體疾病,應(yīng)該綜合考慮以上指標(biāo),建立合理的病證生物分子網(wǎng)絡(luò),確定適宜的網(wǎng)絡(luò)靶標(biāo)。如使用全新計(jì)算方法確定藥效成分群與網(wǎng)絡(luò)靶標(biāo),還應(yīng)該考察所選藥效成分及網(wǎng)絡(luò)靶標(biāo)對(duì)整體網(wǎng)絡(luò)穩(wěn)態(tài)的重要性。在生物網(wǎng)絡(luò)中,大多數(shù)節(jié)點(diǎn)度較小,而一小部分節(jié)點(diǎn)度比較大,度值大的節(jié)點(diǎn)被認(rèn)為是中心節(jié)點(diǎn)。山西中醫(yī)藥網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)服...
網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)是基于系統(tǒng)生物學(xué)理論和生物系統(tǒng)網(wǎng)絡(luò)分析來設(shè)計(jì)藥物的一門新興學(xué)科。它綜合探索藥物對(duì)疾病網(wǎng)絡(luò)的干預(yù)和影響,揭示多分子藥物協(xié)同醫(yī)療疾病的奧秘。這些概念反映了多組分、多靶點(diǎn)和系統(tǒng)調(diào)控的思想,與中醫(yī)辨證論治的研究思路有許多相似之處,強(qiáng)調(diào)對(duì)病因病機(jī)的周全認(rèn)識(shí)。網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)可以用來預(yù)測(cè)和鑒別中藥的靶標(biāo)和有效成分,闡明其作用機(jī)制,系統(tǒng)地解釋方子的用藥規(guī)律,探索真實(shí)世界方子的規(guī)律,發(fā)現(xiàn)新的適應(yīng)癥和新的活性化合物,研究藥物重新定位等。評(píng)價(jià)用于驗(yàn)證網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)分析結(jié)果的試驗(yàn)設(shè)計(jì)、檢測(cè)方法等具體實(shí)現(xiàn)過程的合理性。江蘇中藥網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)服務(wù)費(fèi)用中藥網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)(其實(shí)不是中藥也適用)的分析思路一般有兩類:其一,基于網(wǎng)絡(luò)藥...
2007年英國Dundee大學(xué)藥理學(xué)家AndrewL.Hopkins率先提出了網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)”概念。該概念是基于系統(tǒng)生物學(xué)、基因組學(xué)、蛋白組學(xué)、多向藥理學(xué)等學(xué)科的理論,運(yùn)用組學(xué)、高通量篩選、網(wǎng)絡(luò)可視化及網(wǎng)絡(luò)分析等技術(shù)揭示藥物、基因、靶點(diǎn)、疾病之間復(fù)雜的生物網(wǎng)絡(luò)關(guān)系,在此基礎(chǔ)上分析、預(yù)測(cè)藥物的藥理學(xué)機(jī)制并通過相應(yīng)的實(shí)驗(yàn)來驗(yàn)證、評(píng)估藥物的藥效、不良反應(yīng)及作用機(jī)制,發(fā)現(xiàn)高效低毒的藥物。網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)是基于系統(tǒng)生物學(xué)的理論,對(duì)生物系統(tǒng)的網(wǎng)絡(luò)分析,選取特定信號(hào)節(jié)點(diǎn)進(jìn)行多靶點(diǎn)藥物分子設(shè)計(jì)的新學(xué)科。網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)強(qiáng)調(diào)對(duì)信號(hào)通路的多途徑調(diào)節(jié),提高藥物的醫(yī)療效果,降低毒副作用,從而提高新藥臨床試驗(yàn)的成功率,節(jié)省藥物的研發(fā)費(fèi)...
一些單一成分的化學(xué)藥物可能作用于蛋白受體、離子通道、跨膜信號(hào)傳導(dǎo)分子和酶等多個(gè)不同類型的靶點(diǎn)。靶點(diǎn)與靶點(diǎn)之間的聯(lián)系十分復(fù)雜,許多疾病的發(fā)病機(jī)理也非常復(fù)雜,導(dǎo)致藥物的作用機(jī)制變得更為復(fù)雜。網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)能從分子、基因水平上去分析單一成分藥物作用于不同靶點(diǎn)、細(xì)胞和部位的行為,能系統(tǒng)地預(yù)測(cè)和揭示藥物的作用及機(jī)理,從而評(píng)價(jià)藥物作用的有效性和安全性。黃明峰等用網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)方法探討活血化瘀中藥醫(yī)療的作用機(jī)理,為研究中藥多成分、多靶點(diǎn)、多途徑作用模式開辟了新的途徑,為醫(yī)療作用機(jī)理的闡釋提供有力的理論基礎(chǔ)和新思路,為闡釋中藥的配伍作用、協(xié)同機(jī)理等提供技術(shù)支持。網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)已在越來越多地應(yīng)用到中藥作用機(jī)制的研究中。湖南...