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中藥網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)能較好地體現(xiàn)中醫(yī)藥整體觀,可用于闡釋中藥醫(yī)療疾病的物質(zhì)基礎(chǔ)和作用機制,常規(guī)研究思路可分為以下步驟:1、成分收集及處理:通過檢索數(shù)據(jù)庫、文獻,收集中藥所含化學(xué)成分。對化學(xué)成分進行ADMET篩選。2、成分靶標(biāo)的收集:基于數(shù)據(jù)庫,對經(jīng)ADMET篩選后的化學(xué)成分進行靶標(biāo)收集。3、疾病靶標(biāo)的收集:基于數(shù)據(jù)庫,對疾病靶標(biāo)進行收集。4、成分與疾病共同靶標(biāo)的確認(rèn):采用韋恩圖進行確認(rèn)。5、成分--共同靶標(biāo)網(wǎng)絡(luò)的建立與分析:采用Cytoscape軟件,建立成分--共同靶標(biāo)網(wǎng)絡(luò),并進行拓?fù)浞治?,預(yù)測物質(zhì)基礎(chǔ)和關(guān)鍵靶標(biāo)。6、基因富集分析:對共同靶標(biāo)進行基因富集分析,預(yù)測中藥醫(yī)療疾病的關(guān)鍵通路。7、實驗驗證:采用適當(dāng)技術(shù),對預(yù)測的中藥物質(zhì)基礎(chǔ)和作用機制進行實驗驗證?;诰W(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)形成藥物分子設(shè)計新模式,是發(fā)展創(chuàng)新藥物的重要途徑。江蘇中藥網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)費用
網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)基本的研究思路是通過液質(zhì)聯(lián)用或在線中藥化學(xué)成分?jǐn)?shù)據(jù)庫(如TCMSP數(shù)據(jù)庫、TCMID數(shù)據(jù)庫、BATMAN-TCM數(shù)據(jù)庫等)獲取中藥復(fù)方或單味中藥的化學(xué)成分(研究中方子體的話就可以跳過此步驟),然后通過公共數(shù)據(jù)庫(如PharmMapper數(shù)據(jù)庫、SwissTargetPrediction數(shù)據(jù)庫等)或高通量測序/組學(xué)的數(shù)據(jù)對各成分相應(yīng)的蛋白靶點進行預(yù)測。通過疾病數(shù)據(jù)庫(OMIM數(shù)據(jù)庫、Genecards數(shù)據(jù)庫、DrugBank數(shù)據(jù)庫等)或者TCGA/GEO獲取疾病的靶點信息或者疾病中差異表達的基因,將中藥各成分對應(yīng)的靶點和疾病對應(yīng)的靶點取交集即為中藥成分醫(yī)療疾病的潛在作用靶點。采用Cytoscape構(gòu)建成分-靶點、靶點-相關(guān)互作蛋白的網(wǎng)絡(luò)進行網(wǎng)絡(luò)拓?fù)浞治觯⒗蒙镄畔W(xué)軟件將潛在作用靶點進行GO、KEGG富集分析,初步揭示中藥復(fù)方/單味中藥/中方子體的作用機制,結(jié)尾利用實驗進行驗證。上海初級網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)分析服務(wù)價格成分與疾病共同靶標(biāo)的確認(rèn):采用韋恩圖進行確認(rèn)。
網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)還受到許多毒理學(xué)研究者的高度重視?;诰W(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)、系統(tǒng)生物學(xué)等的研究提出了網(wǎng)絡(luò)毒理學(xué)研究的理念,即根據(jù)構(gòu)建網(wǎng)絡(luò)模型來研究藥物的毒理學(xué)性質(zhì)。通過對網(wǎng)絡(luò)模型的關(guān)聯(lián)分析及揭示藥物的不良反應(yīng)及機制。從相關(guān)數(shù)據(jù)庫中提取出基因、蛋白、不良反應(yīng)等要素,將這些要素作為節(jié)點,運用計算機技術(shù)構(gòu)建不良反應(yīng)-藥物-基因、靶點網(wǎng)絡(luò)模型,推測和判斷藥物的不良反應(yīng)及產(chǎn)生不良反應(yīng)的物質(zhì)。該研究思路不只為毒理學(xué)研究帶來了全新視角,也為藥物的安全性評價提供了新的依據(jù)。范驍輝等討論了建立網(wǎng)絡(luò)毒理學(xué)及中藥網(wǎng)絡(luò)毒理學(xué)研究思路,談到復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建及分析技術(shù)的快速發(fā)展為網(wǎng)絡(luò)毒理學(xué)的誕生奠定了基礎(chǔ)。建立中藥網(wǎng)絡(luò)毒理學(xué),有望為開展有毒中藥的毒性成分篩查、致毒機制和配伍禁忌等研究提供了新的手段,不只為提高中藥的安全性和合理用藥提供技術(shù)支持,也必將推進中藥現(xiàn)代化的進程。
網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)的研究離不開生物網(wǎng)絡(luò)的構(gòu)建。生物網(wǎng)絡(luò)是采用數(shù)學(xué)領(lǐng)域圖論的研究手段,借助復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)的研究方法,將生物體中各種物質(zhì)及其相互作用加以抽象,如將構(gòu)成系統(tǒng)內(nèi)的各個組分抽象成節(jié)點,他們之間的聯(lián)系或相互作用關(guān)系描繪成邊,由節(jié)點和邊構(gòu)成的圖就是網(wǎng)絡(luò),結(jié)尾組成一個包含多個體、多層次相互作用的復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)。包括生物分子為基礎(chǔ)的蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)、信號通路網(wǎng)絡(luò)、代謝網(wǎng)絡(luò)、基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)、miRNA網(wǎng)絡(luò)、生物過程網(wǎng)絡(luò)、組織網(wǎng)絡(luò)等。網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)它具有中醫(yī)辨證的特點和中藥醫(yī)療的整體觀。
網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)是基于系統(tǒng)生物學(xué)理論和生物系統(tǒng)網(wǎng)絡(luò)分析來設(shè)計藥物的一門新興學(xué)科。它綜合探索藥物對疾病網(wǎng)絡(luò)的干預(yù)和影響,揭示多分子藥物協(xié)同醫(yī)療疾病的奧秘。這些概念反映了多組分、多靶點和系統(tǒng)調(diào)控的思想,與中醫(yī)辨證論治的研究思路有許多相似之處,強調(diào)對病因病機的周全認(rèn)識。網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)可以用來預(yù)測和鑒別中藥的靶標(biāo)和有效成分,闡明其作用機制,系統(tǒng)地解釋方子的用藥規(guī)律,探索真實世界方子的規(guī)律,發(fā)現(xiàn)新的適應(yīng)癥和新的活性化合物,研究藥物重新定位等。網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)能夠從整體性分析和中藥復(fù)方的作用機理,利于推動中藥復(fù)方的深入研究和擴大臨床適應(yīng)癥的發(fā)展。甘肅醫(yī)療網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)價格
藥物靶點在人體生物網(wǎng)絡(luò)中以一定的規(guī)律分布,且不同種類藥物的靶點在網(wǎng)絡(luò)中分布的位置各不相同。江蘇中藥網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)費用
中藥網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)要解決的一個中心問題是,如何在疾病相關(guān)網(wǎng)絡(luò)的背景下,評價中藥的多成分、多靶點的協(xié)同作用。根據(jù)中方子劑成分復(fù)雜、靶點不清、以周全調(diào)節(jié)的方式干預(yù)復(fù)雜疾病的特點,研究者們提出了一些中藥網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)的研究路線,如圖1就是一個典型的中藥復(fù)方研究的網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)路線圖。這個路線圖包括數(shù)據(jù)獲取和網(wǎng)絡(luò)分析兩大部分。需要獲取的數(shù)據(jù)包括中方子劑的有效活性成分、活性化合物的靶點和疾病相關(guān)基因等。基于這些數(shù)據(jù),構(gòu)建和分析疾病相關(guān)網(wǎng)絡(luò)、藥物影響網(wǎng)絡(luò),識別疾病和藥物影響的信號通路和生物學(xué)過程,能幫助我們闡明中方子劑的作用機制。江蘇中藥網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)費用
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