安徽多組學(xué)邁杰轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)NGS平臺共同合作

    1977年，WalterGilbert和FrederickSanger發(fā)明了***臺測序儀，并應(yīng)用其測定了***個基因組序列，噬菌體X174，全長5375個堿基。由此開始，人類獲得了探索生命遺傳本質(zhì)的能力，生命科學(xué)的研究進(jìn)入了基因組學(xué)的時代，到至今為止的四十年時間內(nèi)，測序技術(shù)已取得了相當(dāng)大的發(fā)展，從***代發(fā)展到了第三代測序技術(shù)。Sanger所發(fā)明的測序方法被稱為***代測序技術(shù)，該技術(shù)直到現(xiàn)在依然被***使用，但是其一次只能獲得一條長度在700～1000個堿基的序列，無法滿足現(xiàn)代科學(xué)發(fā)展對生物基因序列獲取的迫切需求。高通量測序(High-ThroughputSequencing,HTS)是對傳統(tǒng)Sanger測序的**性變革，其解決了一代測序一次只能測定一條序列的限制，一次運(yùn)行即可同時得到幾十萬到幾百萬條核酸分子的序列，因此也被稱為新一代測序(NextGenerationSequencing,NGS)或第二代測序。第二代測序技術(shù)雖然測序的通量**增加，但是其獲得單條序列長度很短，想要得到準(zhǔn)確的基因序列信息依賴于較高的測序覆蓋度和準(zhǔn)確的序列拼接技術(shù)，因此**終得到的結(jié)果中會存在一定的錯誤信息。因此，科研人員又發(fā)明了第三代測序技術(shù)也稱為單分子測序技術(shù)，該技術(shù)在保證測序通量的基礎(chǔ)上，對單條長序列進(jìn)行從頭測序。 邁杰轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)擁有全技術(shù)平臺及豐富的伴隨診斷開發(fā)經(jīng)驗，為藥企合作伙伴提供一體化開發(fā)服務(wù)。安徽多組學(xué)邁杰轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)NGS平臺共同合作

    訂購說明：服務(wù)簡介：基本流程：客戶提供：**終交付：間充質(zhì)干細(xì)胞（mesenchymalstemcells，MSC）是迄今研究**接近臨床且適應(yīng)疾病**豐富的干細(xì)胞（造血干*用于血液系統(tǒng)疾?。?，其研究在國內(nèi)外進(jìn)展迅速。盡管間充質(zhì)干細(xì)胞技術(shù)相對成熟，但各實驗室仍然會面對諸多問題。對于科研實驗室，人員流動大，技術(shù)積累和穩(wěn)定困難，有些技術(shù)隨著人員的更替而流失；對于企業(yè)實驗室，面臨的問題主要有兩個，一是全平臺建設(shè)和維護(hù)成本高，二是非第三方數(shù)據(jù)可信度常受到質(zhì)疑。MSC來源***，主要包括骨髓、臍帶、胎盤、羊膜、胎兒、臍帶血、外周血等，不同的組織來源細(xì)胞略有差異，但總體特性一致，在合適的培養(yǎng)體系下細(xì)胞趨于一致。不同物種的MSC也得到分離，主要包括人、大鼠、小鼠、豬、犬等，不同物種來源的表面標(biāo)志物有所差異，但分化性能基本相同。弗元生物的間充質(zhì)干細(xì)胞技術(shù)平臺由從事間充質(zhì)干細(xì)胞研究十余年的人員領(lǐng)銜建立，具有極為豐富的理論基礎(chǔ)和實戰(zhàn)經(jīng)驗，旨在為該領(lǐng)域的研究人員提供便利的條件，讓實驗更簡單，讓數(shù)據(jù)更可靠。主要服務(wù)技術(shù)：間充質(zhì)干細(xì)胞原代分離培養(yǎng)：（物種：人、大鼠、小鼠、兔、犬、豬等；組織：胎盤、羊膜、臍帶、脂肪、骨髓、血液等）。福建專注邁杰轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)NGS平臺經(jīng)驗豐富邁杰轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)開發(fā)的伴隨診斷試劑盒,基因突變檢測試劑盒,檢測范圍全。

    降低引物的擴(kuò)增效率，也需要重新設(shè)計并合成引物。3、初次復(fù)合擴(kuò)增時，各個引物在反應(yīng)體系中的濃度均為μm；之后對引物濃度進(jìn)行調(diào)整，獲得進(jìn)行pcr擴(kuò)增時各個引物的**佳濃度。經(jīng)過上述步驟，獲得引物組合。引物組合由120條引物組成，用于檢測68個基因座。各個基因座的名稱、擴(kuò)增基因座對應(yīng)的引物名稱和引物的核苷酸序列依次見表1中第1列、第2列和第3列。進(jìn)行pcr擴(kuò)增時各個引物的**佳濃度見表1中第5列。表1各個基因座對應(yīng)的引物在hg38人類參考基因組(hg38人類基因組的信息見網(wǎng)址./goldenpath/hg38/bigzips/)中的pcr擴(kuò)增產(chǎn)物的長度和核苷酸序列詳見表2。各個str基因座的pcr擴(kuò)增產(chǎn)物的長度范圍分布見圖1。表2三、基于二代測序技術(shù)檢測68個基因座的試劑盒的制備基于二代測序技術(shù)檢測68個基因座的試劑盒包括引物混合物；引物混合物由步驟二制備的120條引物混合而成。實施例2、實施例1制備的試劑盒檢測標(biāo)準(zhǔn)品2800m的str分型及其應(yīng)用一、實施例1制備的試劑盒檢測標(biāo)準(zhǔn)品2800m的str分型1、dna樣本準(zhǔn)備取標(biāo)準(zhǔn)品2800m，用超純水稀釋，獲得濃度為1ng/μl的標(biāo)準(zhǔn)品2800m水溶液。2、pcr擴(kuò)增以標(biāo)準(zhǔn)品2800m水溶液為模板，采用實施例1步驟三制備的引物混合物進(jìn)行pcr擴(kuò)增，得到pcr擴(kuò)增產(chǎn)物。

  上述任一所述復(fù)合擴(kuò)增體系還可包括進(jìn)行pcr擴(kuò)增反應(yīng)所需的試劑。所述“進(jìn)行pcr擴(kuò)增反應(yīng)所需的試劑”不包括pcr擴(kuò)增反應(yīng)所需的引物。上述任一所述復(fù)合擴(kuò)增體系可為20μl，由10μl2×mastermix、上述任一所述引物組合和模板組成。2×mastermix具體可為德國qiagen公司的產(chǎn)品。所述模板具體可為濃度為1ng/μl的標(biāo)準(zhǔn)品2800m的水溶液或樣品的基因組dna。所述樣品可為人口腔拭子。所述標(biāo)準(zhǔn)品2800m具體可為promega公司的產(chǎn)品，產(chǎn)品目錄號為dd7251。含有上述任一所述引物組合的試劑盒也屬于本發(fā)明的保護(hù)范圍；所述試劑盒的用途可為(h1)-(h5)中的至少一種：(h1)str分型；(h2)y-str分型；(h3)個體識別；(h4)親權(quán)鑒定；(h5)種族推斷。本發(fā)明還保護(hù)上述任一所述復(fù)合擴(kuò)增體系或上述任一所述試劑盒的制備方法；該制備方法包括將上述任一所述引物組合中的各條引物單獨(dú)包裝的步驟。本發(fā)明還保護(hù)上述任一所述引物組合或上述任一所述復(fù)合擴(kuò)增體系在制備試劑盒中的應(yīng)用；所述試劑盒的用途可為(h1)-(h5)中的至少一種：。邁杰轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)希望能和創(chuàng)新型藥企共同探索創(chuàng)新生物標(biāo)志物的臨床應(yīng)用潛力。

    既節(jié)約時間又降低測序成本。目前，基于法庭科學(xué)領(lǐng)域運(yùn)用**多的ngs系統(tǒng)為illumina公司的miseqfgxtm系統(tǒng)和thermofisher公司的iontorrentpgmtm系統(tǒng)，但針對以上平臺的二代測序商業(yè)化str分型試劑盒的研發(fā)尚處于起步階段，主要有powerseqautosystem(promega，madison，wi,usa)、forenseqtmdnasignatureprepkit(illumina，sandiego，ca，usa)和precisionidglobalfilerngsstrkit(termofisher，waltham，ma，usa)。但以上試劑盒涉及的y-str相對較少，三個試劑盒分別包含了1個y-str基因座、26個y-str基因座、2個y-str基因座。同時存在試劑盒價格昂貴，配套的數(shù)據(jù)分析軟件只能針對各自開發(fā)試劑盒，參數(shù)的設(shè)置相對固定，只能對固有基因座的測序數(shù)據(jù)進(jìn)行分析，不利于法醫(yī)學(xué)實際應(yīng)用。因此，構(gòu)建一種適用于當(dāng)前主流二代測序檢測平臺miseqfgxtm系統(tǒng)及開放性測序數(shù)據(jù)分析軟件straitrazor、myflq等，且能容納更多y-str基因座的復(fù)合擴(kuò)增體系具有一定的意義。技術(shù)實現(xiàn)要素：本發(fā)明的目的是制備檢測更多y-str基因座的試劑盒，提高了父系親緣關(guān)系分析能力和鑒定效能。本發(fā)明首先保護(hù)引物組合，可包括引物1—引物120；引物1—引物120均為單鏈dna分子，核苷酸序列依次可如seqid**—seqid**20所示。邁杰轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)擁有豐富的伴隨診斷開發(fā)經(jīng)驗，高質(zhì)量的管理體系和高素質(zhì)的研發(fā)團(tuán)隊。山西多靶點(diǎn)邁杰轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)NGS平臺誠信合作

邁杰轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)蛋白免疫產(chǎn)品開發(fā)平臺可提供基于IHC平臺的體外診斷試劑盒以及蛋白抗體原料一站式開發(fā)服務(wù)。安徽多組學(xué)邁杰轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)NGS平臺共同合作

    降低引物的擴(kuò)增效率，也需要重新設(shè)計并合成引物。3、初次復(fù)合擴(kuò)增時，各個引物在反應(yīng)體系中的濃度均為μm；之后對引物濃度進(jìn)行調(diào)整，獲得進(jìn)行pcr擴(kuò)增時各個引物的**佳濃度。經(jīng)過上述步驟，獲得引物組合。引物組合由120條引物組成，用于檢測68個基因座。各個基因座的名稱、擴(kuò)增基因座對應(yīng)的引物名稱和引物的核苷酸序列依次見表1中第1列、第2列和第3列。進(jìn)行pcr擴(kuò)增時各個引物的**佳濃度見表1中第5列。表1各個基因座對應(yīng)的引物在hg38人類參考基因組(hg38人類基因組的信息見網(wǎng)址./goldenpath/hg38/bigzips/)中的pcr擴(kuò)增產(chǎn)物的長度和核苷酸序列詳見表2。各個str基因座的pcr擴(kuò)增產(chǎn)物的長度范圍分布見圖1。表2三、基于二代測序技術(shù)檢測68個基因座的試劑盒的制備基于二代測序技術(shù)檢測68個基因座的試劑盒包括引物混合物；引物混合物由步驟二制備的120條引物混合而成。實施例2、實施例1制備的試劑盒檢測標(biāo)準(zhǔn)品2800m的str分型及其應(yīng)用一、實施例1制備的試劑盒檢測標(biāo)準(zhǔn)品2800m的str分型1、dna樣本準(zhǔn)備取標(biāo)準(zhǔn)品2800m，用超純水稀釋，獲得濃度為1ng/μl的標(biāo)準(zhǔn)品2800m水溶液。2、pcr擴(kuò)增以標(biāo)準(zhǔn)品2800m水溶液為模板，采用實施例1步驟三制備的引物混合物進(jìn)行pcr擴(kuò)增，得到pcr擴(kuò)增產(chǎn)物。安徽多組學(xué)邁杰轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)NGS平臺共同合作