浙江專注邁杰轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)NGS平臺經(jīng)驗豐富

來源: 發(fā)布時間:2022-06-14

    ***代測序技術(shù)常見問題及解決方法樣品測序無信號此時測序完全失敗,**可能的原因是待測樣品出現(xiàn)了降解或引物失效,從而導(dǎo)致測序引物與待測樣品無法結(jié)合。此時探索造成測序失敗的具體原因并無實際意義,**快速、簡便的辦法是重新提供質(zhì)量合格的引物和樣品再次進(jìn)行測序。樣品測序信號差此種情況可能是引物或模板的質(zhì)量不高或是引物和模板的匹配性不好引起的,但**有可能的原因是待測樣品濃度偏低。待測樣品濃度偏低可能是由于PCR效率較低,也可能是PCR與測序間隔時間過長,導(dǎo)致PCR產(chǎn)物降解。建議PCR完成后盡快進(jìn)行測序,如果PCR產(chǎn)物濃度本身較低,可以使用PCR產(chǎn)物作為模板進(jìn)行二次PCR,也可以對PCR產(chǎn)物進(jìn)行克隆后,再進(jìn)行測序。樣品測序衰減可能是由于待測樣品包含特殊的核酸結(jié)構(gòu),如重復(fù)序列、回文結(jié)構(gòu)、發(fā)卡結(jié)構(gòu)、GC富集區(qū)、AT富集區(qū)等。由于是樣品本身結(jié)構(gòu)問題,因此,無法通過優(yōu)化測序反應(yīng)解決,應(yīng)從待測樣品另一端進(jìn)行反向測序,之后兩端的測序結(jié)果拼接得到完整序列。樣品測序中斷此種情況是由于待測樣品包含特殊高級結(jié)構(gòu),導(dǎo)致堿基無法與模板結(jié)合,DNA聚合酶無法繼續(xù)延伸。此情況與樣品測序衰減解決辦法相同,均為從待測樣品另一端進(jìn)行反向測序。 【邁杰轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)】一直以來致力于轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)服務(wù)和伴隨診斷產(chǎn)品開發(fā)及商業(yè)化。浙江專注邁杰轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)NGS平臺經(jīng)驗豐富

    h1)str分型;(h2)y-str分型;(h3)個體識別;(h4)親權(quán)鑒定;(h5)種族推斷。本發(fā)明還保護(hù)上述任一所述引物組合或上述任一所述復(fù)合擴增體系的應(yīng)用,可為(h1)-(h5)中的至少一種:(h1)str分型;(h2)y-str分型;(h3)個體識別;(h4)親權(quán)鑒定;(h5)種族推斷。上述任一所述68個基因座具體可由amelogenin、dys19、dys385a/b、dyf387s1a/b、dys388、dys389-i、dys389-ii、dys390、dys391、dys392、dys393、dyf399s1、dyf404s1a/b、dys437、dys438、dys439、dys443、dys444、dys446、dys447、dys448、dys449、dys456、dys458、dys459a/b、dys460、dys481、dys485、dys504、dys505、dys508、dys510、dys518、dys520、dys522、dys527a/b、dys531、dys533、dys549、dys552、dys557、dys570、dys576、dys587、dys593、dys596、dys612、dys617、dys622、dys626、dys627、dys630、dys635、dys641、dys643、dys644、dys645、dys710、dys720、y-gata-a10和y-gata-h4組成。其中,amelogenin為性別決定基因座。dyf399s1包含三個分型片段。dys385a/b、dyf387s1a/b、dyf404s1a/b、dys459a/b和dys527a/b均包含兩個分型片段。本發(fā)明提供的試劑盒可以檢測68個基因座。天津定制邁杰轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)NGS平臺推薦咨詢邁杰轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)擁有豐富的伴隨診斷開發(fā)經(jīng)驗,高質(zhì)量的管理體系和高素質(zhì)的研發(fā)團隊。

    邁杰轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)NGS平臺現(xiàn)有IlluminaNovaSeq6000、NextSeq500、Miniseq測序儀及QiagenGenereader等一站式臨床診斷測序平臺,目前已建立的常規(guī)檢測能力包括WGS、WES、mRNA-Seq,lncRNA-Seq,miRNA-Seq,靶向富集測序,單細(xì)胞基因組/轉(zhuǎn)錄組測序,免疫組庫測序、慢病毒插入位點檢測等。平臺多次滿分通過國家衛(wèi)生部臨檢中心(NCCL)及美國病理學(xué)家協(xié)會(CAP)組織的室間質(zhì)評與能力認(rèn)證;已完成20+方法學(xué)開發(fā)與驗證,支持40多個臨床實驗,完成了數(shù)千例余例樣本的檢測。6、全外顯子組測序一種生物的外顯子序列的測序,外顯子測序需要將全基因組外顯子區(qū)域DNA捕獲并富集后進(jìn)行測序;人的外顯子序列只占全部基因序列的1%,約30MB,是基因組的編碼序列;相對于基因組測序分析的信息量小,成本較低。7、轉(zhuǎn)錄組測序細(xì)胞內(nèi)轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物RNA的測序,廣義上包括mRNA、核糖體RNA、轉(zhuǎn)運RNA及非編碼RNA;狹義指所有mRNA的**。8、靶向測序作者:心平氣和鏈接:源:知乎著作權(quán)歸作者所有。商業(yè)轉(zhuǎn)載請聯(lián)系作者獲得授權(quán),非商業(yè)轉(zhuǎn)載請注明出處。

    1、Illumina原理:橋式PCR+4色熒光可逆終止+激光掃描成像主要步驟:①DNA文庫制備——超聲打斷加接頭②Flowcell——吸附流動DN**段③橋式PCR擴增與變性——放大信號④測序——測序堿基轉(zhuǎn)化為光學(xué)信號優(yōu)勢劣勢:Illumina的這種測序技術(shù)每次只添加一個dNTP的特點能夠很好的地解決同聚物長度的準(zhǔn)確測量問題,它的主要測序錯誤來源是堿基的替換。而讀長短(200bp-500bp)也讓其應(yīng)用有所局限。2、Roche454油包水PCR+4種dNTP車輪大戰(zhàn)+檢測焦磷酸水解發(fā)光主要步驟:①DNA文庫制備——噴霧打斷加接頭②乳液PCR——注水入油**PCR③焦磷酸測序——磁珠入孔,焦磷酸信號轉(zhuǎn)化為光學(xué)信號優(yōu)勢劣勢:454技術(shù)優(yōu)勢測序讀長較長,平均可達(dá)400bp,缺點是無法準(zhǔn)確測量類似于PolyA的情況時,測序反應(yīng)會一次加入多個T,可能導(dǎo)致結(jié)果不準(zhǔn)確。也正是由于這一原因,454技術(shù)會在測序過程中引入插入和缺失的測序錯誤。3、IonTorrent原理油包水PCR+4種dNTP車輪大戰(zhàn)+微電極PH檢測主要步驟:①DNA文庫制備——噴霧打斷加接頭②乳液PCR——注水入油**PCR③微電極pH檢測——磁珠入池記錄pH優(yōu)勢劣勢:IonTorrent與454相比,主要差異在測序中,IonTorrent不需要昂貴的物理成像設(shè)備,成本相對較低體積較小。邁杰轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)具有多年伴隨診斷服務(wù)經(jīng)驗,獲得CNAS國際實驗室認(rèn)可,美國CAP認(rèn)證。

    ,構(gòu)建單鏈DNA測序文庫。,固體支撐體的每一個單獨小空間中只包含一條DNA鏈,之后通過PCR特異性的將模板DNA進(jìn)行富集,從而達(dá)到測序所需的模板量。,反應(yīng)試劑清洗和成像捕捉,不斷反復(fù)進(jìn)行此三步循環(huán),每一個循環(huán)按順序測定序列中的一個堿基。第二代測序技術(shù)的優(yōu)缺點第二代測序技術(shù)的優(yōu)點:一次能夠同時得到大量的序列數(shù)據(jù),相比于一代測序技術(shù),通量提高了成千上萬倍;單條序列成本非常低廉。第二代測序技術(shù)的缺點:序列讀長較短,Illumina平臺**長為250-300bp,454平臺也只有500bp左右;由于建庫中利用了PCR富集序列,因此有一些含量較少的序列可能無法被大量擴增,造成一些信息的丟失,且PCR過程中有一定概率會引入錯配堿基;想要得到準(zhǔn)確和長度較長的拼接結(jié)果,需要測序的覆蓋率較高,導(dǎo)致結(jié)果錯誤較多和成本增加。第二代測序技術(shù)的應(yīng)用二代測序是現(xiàn)階段科研市場的主力平臺,主要應(yīng)用包括:基因組測序、轉(zhuǎn)錄組測序、群體測序、擴增子測序、宏基因組測序、重測序等。由于成本較低,二代測序在醫(yī)學(xué)領(lǐng)域應(yīng)用也十分***,主要包括:**基因組、遺傳病基因組、**與代謝疾病等。 邁杰擁有StarLIMS實驗室信息化管理系統(tǒng),中心實驗室獲得了中國CNAS ISO 17025實驗室認(rèn)可、美國CAP認(rèn)證。浙江專注邁杰轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)NGS平臺經(jīng)驗豐富

邁杰轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)提供完整的多平臺多組學(xué)服務(wù),打造流程化yao企業(yè)合作。浙江專注邁杰轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)NGS平臺經(jīng)驗豐富

如行家預(yù)判,服務(wù)型發(fā)展即將步入黃金時代,眾多企業(yè)圍繞醫(yī)藥產(chǎn)業(yè)、商業(yè)領(lǐng)域及新興的互聯(lián)網(wǎng)醫(yī)藥等領(lǐng)域正在進(jìn)行廝殺。在我國政策的支持下,在社會資本的推動下以及技術(shù)升級的帶動下,互聯(lián)網(wǎng)巨頭、科技巨頭、地產(chǎn)巨頭等企業(yè)紛紛跨界進(jìn)入服務(wù)型。以石蠟組織DNA提取試劑盒,全血DNA提取試劑盒,免疫組化抗原修復(fù)緩沖液,c-MET抗體試劑為例,主打運動健康A(chǔ)PP停留在工具層面,缺少完整的消費場景閉環(huán),較強的工具屬性停留在實現(xiàn)用戶基礎(chǔ)的功能需求,并未涉及足夠高的用戶使用價值實現(xiàn),同時缺乏數(shù)字化運營的效能也是運動健康A(chǔ)PP發(fā)展的明顯桎梏,經(jīng)營模式有待進(jìn)一步探索。除此之外,我國支付端仍是以醫(yī)保支付為主,石蠟組織DNA提取試劑盒,全血DNA提取試劑盒,免疫組化抗原修復(fù)緩沖液,c-MET抗體試劑鏈的延伸以及消費醫(yī)藥市場價值的獲取也需要進(jìn)一步探索解決的途徑。從石蠟組織DNA提取試劑盒,全血DNA提取試劑盒,免疫組化抗原修復(fù)緩沖液,c-MET抗體試劑的健康發(fā)展來看依舊有待完善。美國銷售產(chǎn)業(yè)與中國有所不同,和美國相比,中國的產(chǎn)業(yè)仍處于初創(chuàng)期。在經(jīng)濟新常態(tài)下,中國大銷售產(chǎn)業(yè)憑借獨特資源和市場優(yōu)勢,一舉成為資本角逐的重點領(lǐng)域之一。有關(guān)機構(gòu)預(yù)測,中國銷售產(chǎn)業(yè)規(guī)模未來5年年均復(fù)合增長率約為27.26%。浙江專注邁杰轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)NGS平臺經(jīng)驗豐富

邁杰轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)研究(蘇州)有限公司于2013年成立,其前身為凱杰(蘇州)轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)研究有限公司?;诨蚪M學(xué)、蛋白組學(xué)、細(xì)胞組學(xué)及病理組學(xué)等綜合性轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)平臺,豐富的伴隨診斷開發(fā)經(jīng)驗,高質(zhì)量的管理體系以及高素質(zhì)的研發(fā)管理團隊,邁杰轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)為全球合作伙伴提供***生物標(biāo)記物發(fā)現(xiàn)、靶點驗證、新藥臨床試驗病人的分型研究和入組篩選、伴隨診斷開發(fā)與商業(yè)化、患者用藥指導(dǎo)檢測等一體化解決方案,并已迅速發(fā)展成為中國伴隨診斷領(lǐng)頭創(chuàng)新企業(yè),致力于解決創(chuàng)新藥物的研發(fā)痛點及患者的用藥痛點,助力精細(xì)醫(yī)療!