青島BD單細胞多組學平臺

來源: 發(fā)布時間:2022-09-17

烈冰生信團隊傾情研發(fā)的NovelBrain®生信大數(shù)據(jù)分析平臺,針對龐大的單細胞測序數(shù)據(jù),能夠實現(xiàn)細胞類型鑒定的快、精、準:一鍵導入genelist構建個性化基因列表;輕松一點即可展示Marker基因的Featureplot;任意修改Cluster的顏色和名稱助力高效鑒定細胞類型;一鍵獲得t-SNE圖、Heatmap和Violin圖:輕松獲得并下載基因表達的t-SNE圖、Heatmap、Violin圖,還可以通過調節(jié)寬、高和系數(shù)比例來調節(jié)美觀。平臺上線300+task自主分析工具、50+pipeline工作流模板,幫助烈冰生信分析團隊和自主分析用戶實現(xiàn)分析工具和模板的快速調用和一站式全流程自動化分析,節(jié)省您的工作時間并提升整體工作效率。單細胞多組學測序技術整合了單細胞各個組學特征, 提供了揭示細胞內復雜分子調控網(wǎng)絡及其互動關系的機會。青島BD單細胞多組學平臺

轉錄組學和蛋白質組學都是獲得基因表達情況的重要工具,從生物學角度上看,轉錄組表示了基因表達的中間狀態(tài),可以反映諸如轉錄調控、轉錄后調控的機理;而蛋白質是生物體直接的功能執(zhí)行者,因而對其表達水平的研究有著不可替代的優(yōu)勢。要探究生物體疾病機理、脅迫機制,精確研究重要基因的表達模式和調控機理,只有聯(lián)合轉錄組學和蛋白組學表達量數(shù)據(jù)對生物樣本進行系統(tǒng)研究,才能真正觀察到mRNA-蛋白質關聯(lián)性,進而從整體上解釋生物學問題。廈門上海烈冰生物單細胞多組學技術支持單細胞組學技術方法的不斷 發(fā)展和改進, 為單細胞層級的多組學整合分析奠定了 基礎。

從單細胞測序描述性分析轉向復雜樣本中不同細胞類型的功能解析,越來越需要一種多組學的細胞生物學視角。通過單細胞多組學——即對不同組學的數(shù)據(jù)集進行分析和整合——科學家能夠從同一個單細胞來源中檢測多種細胞特征。這些特征包括全轉錄組基因表達、細胞表面蛋白表達、免疫組庫序列(包括T細胞和B細胞受體)以及用于了解表觀基因組調控的開放染色質區(qū)域。隨著單個實驗可提供更多信息豐富的數(shù)據(jù),研究人員的獲益更多,包括保留珍貴樣本、提高生產(chǎn)力、減少因批次效應引起的錯誤,并節(jié)省更多的高科技資源(從資助基金到人員時間)。單細胞測序因其強大的探究疾病--細胞--基因的關系,一度成為高通量測序技術的“天花板”。

高通量測序技術(High-throughputsequencing)又稱“下一代”測序技術(“Next-generation”sequencing),以能一次并行對幾十萬到幾百萬條DNA分子進行序列測定和一般讀長較短等為標志。高通量測序技術是對傳統(tǒng)測序一次顛覆性的改變,一次對幾十萬到幾百萬條DNA分子進行序列測定,因此在有些文獻中稱其為下一代測序技術(nextgenerationsequencing)足見其劃時代的改變,同時高通量測序使得對一個物種的轉錄組和基因組進行細致全貌的分析成為可能,所以又被稱為深度測序(deepsequencing)。而烈冰科技具有專業(yè)生物背景和十二年科研服務經(jīng)驗,已助力Nature,immunity等在內的300+篇CNS文章發(fā)表。單細胞多組學 測序技術會轉向研發(fā)多組學測序分析和功能驗證同時 進行的方法。

當蜂巢孔內同時落入細胞和磁珠后,接下去可以往BDCartridge板中加入細胞裂解液對細胞進行裂解,使細胞內的RNA與磁珠上的標簽進行結合,完成每個細胞內RNA的捕獲和標記。這時,再將捕獲了RNA的磁珠進行回收,待所有質控結果確認通過后就可以進行后續(xù)的RNA反轉錄、cDNA第二鏈合成等實驗操作。而BDCartridge板則需要再進行一次成像,獲得磁珠收集后的掃描圖,判斷磁珠是否已經(jīng)被有效收集。根據(jù)每一步的質控結果,烈冰科技(NovelBio)單細胞測序實驗團隊會根據(jù)單細胞分選的實驗結果生成實驗總結報告,判斷每一步驟是否通過質控,并得到捕獲的單細胞數(shù)量以及雙細胞比例,對整個實驗進行總結評估。若所有過程通過質控,實驗樣本即可進行下一步實驗操作。在單細胞水平上的多組學分析能夠為研究組提供前所未有的臨床和科研大數(shù)據(jù)。青島烈冰生物單細胞多組學多組學測序

單細胞測序技術遍地開花,烈冰服務讓您的生物醫(yī)學研究如虎添翼。青島BD單細胞多組學平臺

烈冰科技自主研發(fā)的單細胞云平臺致力于幫助每一位客戶定制化分析數(shù)據(jù),深入解讀數(shù)據(jù)分析結果,深入挖掘其背后的生物學意義;從操作便捷、結果可視化、分析可追溯、系統(tǒng)穩(wěn)定等方面助力單細胞研究,加速科研進程!此外,烈冰生信團隊根據(jù)豐富的實戰(zhàn)經(jīng)驗為用戶量身打造了一款單細胞測序結果解讀的神兵利器——單細胞瀏覽器(SingleCellBrowser),不僅可以將海量復雜的結果文件可視化,還可以實現(xiàn)分析結果的三維立體化的展示呈現(xiàn)。專業(yè)的生信代碼交給專業(yè)的烈冰,專業(yè)的生物學意義交給專業(yè)的您!青島BD單細胞多組學平臺

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