溫州BD Rhapsody空間轉(zhuǎn)錄組平臺(tái)

所謂的高通量測序技術(shù)，又名大規(guī)模平行測序，是將DNA（或者cDNA）隨機(jī)片段化、加接頭，制備測序文庫，通過對(duì)文庫中數(shù)以萬計(jì)的克隆(colony)進(jìn)行延伸反應(yīng)，檢測對(duì)應(yīng)的信號(hào)并獲取序列信息。與傳統(tǒng)測序法相比，高通量測序技術(shù)在處理大規(guī)模樣品時(shí)具有強(qiáng)大的優(yōu)勢，又快（兩天）又多（數(shù)百萬克?。?，成為目前組學(xué)研究的主要技術(shù)?？臻g轉(zhuǎn)錄組測序是一個(gè)系統(tǒng)的工程，開展項(xiàng)目前您可能會(huì)先評(píng)估它提供的見解是否與您的研究問題相匹配，如果匹配，實(shí)驗(yàn)過程如何規(guī)劃，實(shí)驗(yàn)平臺(tái)如何選擇，樣本如何制備，數(shù)據(jù)如何分析等等，而在這一切開始之前，我們的服務(wù)就已經(jīng)開始了，從銷售到實(shí)驗(yàn)到專業(yè)技術(shù)支持，我們開通全線對(duì)接渠道，幫助您快速定位項(xiàng)目訴求，提供從實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)到文章發(fā)表的全流程，我們始終是您貼心的科學(xué)合作伙伴。截至2021年10月，烈冰助力發(fā)表空間轉(zhuǎn)錄組測序文章近20篇。溫州BD Rhapsody空間轉(zhuǎn)錄組平臺(tái)

冰凍切片的空間轉(zhuǎn)錄組測序在RNA捕獲、文庫構(gòu)建方面，需要將組織切片貼合在帶有mRNA結(jié)合捕獲探針的載玻片上，通過甲醛固定、H&E染色得到組織切片的形態(tài)結(jié)構(gòu)。再進(jìn)行透化處理，使細(xì)胞中的mRNA釋放，并結(jié)合到芯片相鄰的捕獲探針上。將捕獲的mRNA反轉(zhuǎn)錄合成cDNA并構(gòu)建測序文庫進(jìn)行上機(jī)測序，從而獲取基因表達(dá)信息。總體來說，空間轉(zhuǎn)錄組的實(shí)驗(yàn)流程包括：組織凍存-OCT包埋-冷凍切片-固定染色-組織透化-cDNA合成及建庫-上機(jī)測序，而需要客戶進(jìn)行樣本準(zhǔn)備的步驟相對(duì)簡單：組織凍存與OCT包埋。廈門烈冰科技空間轉(zhuǎn)錄組測序服務(wù)公司烈冰科技已建立了基于空間轉(zhuǎn)錄組的高通量測序?qū)嶒?yàn)多平臺(tái)。

在轉(zhuǎn)錄組學(xué)領(lǐng)域，空間轉(zhuǎn)錄組也開辟了新世界。Nature Methods在今年1月份將空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)評(píng)價(jià)為2020年度方法，空間轉(zhuǎn)錄組方法近幾年越來越受到歡迎，它將帶領(lǐng)組學(xué)在生物學(xué)的研究上進(jìn)入新的階段。從轉(zhuǎn)錄組測序到實(shí)現(xiàn)單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄測序，這一過程為精確認(rèn)識(shí)不同細(xì)胞類型提供了巨大的幫助。現(xiàn)在，新的空間轉(zhuǎn)錄組方法不僅帶來轉(zhuǎn)錄組信息，同時(shí)還提供空間信息，幫研究者更好辨別轉(zhuǎn)錄的位置，進(jìn)一步擴(kuò)展到單細(xì)胞分辨率，這會(huì)更大程度提升科學(xué)家對(duì)單個(gè)細(xì)胞的認(rèn)識(shí)和解讀。

烈冰生物生信分析團(tuán)隊(duì)緊追國際前沿、整合添加多項(xiàng)國際期刊認(rèn)可的空轉(zhuǎn)分析工具，構(gòu)建一套完整的數(shù)據(jù)分析流程；精心研發(fā)空轉(zhuǎn)結(jié)果瀏覽器，可同步展示空間轉(zhuǎn)錄組與單細(xì)胞測序分析結(jié)果，詳細(xì)深入地解析空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)。完成從Rawdata（原始數(shù)據(jù)）到Spot-Gene的具有定位信息的表達(dá)矩陣的過程后，就進(jìn)入了空轉(zhuǎn)的第二步，去進(jìn)行Spot的Cluster的過程，熟悉單細(xì)胞測序的研究者知道，Cluster在單細(xì)胞測序中往往表示為細(xì)胞的類型，也就是說能聚在一起采用算法分為一個(gè)群體細(xì)胞是一個(gè)Celltype（當(dāng)然分情況也會(huì)有不同）。而在空轉(zhuǎn)中，也正是由于前面提到了細(xì)胞的非單一性，導(dǎo)致了這里的分群并不是單純的同一細(xì)胞類型，而應(yīng)該認(rèn)為是具有相同細(xì)胞組成的點(diǎn)陣區(qū)域，或者說是近似的組織結(jié)構(gòu)區(qū)域。烈冰測序服務(wù)已助力300余篇國際主流期刊研究文章發(fā)表。

烈冰生物已空間轉(zhuǎn)錄組測序服務(wù)提供從一個(gè)組織切片樣本中獲取包括空間信息在內(nèi)的全部轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)，從而可以區(qū)分和定位功能基因在特定組織區(qū)域內(nèi)的活躍表達(dá)。其可以檢測組織樣本中的所有基因活動(dòng)，并繪制活動(dòng)發(fā)生的位置，這將有助于科學(xué)家更好地構(gòu)建生物圖譜，并進(jìn)一步理解疾病和生物學(xué)過程。目前，空間轉(zhuǎn)錄組主要應(yīng)用于多種疾病、免疫、發(fā)育、神經(jīng)和病理學(xué)等研究領(lǐng)域。烈冰生物具有專業(yè)的實(shí)驗(yàn)團(tuán)隊(duì)、豐富的切片經(jīng)驗(yàn)，配置了國際主流的儀器設(shè)備，實(shí)驗(yàn)團(tuán)隊(duì)針對(duì)不同組織類型優(yōu)化完善實(shí)驗(yàn)方案，并制定了嚴(yán)謹(jǐn)規(guī)范的實(shí)驗(yàn)室SOP流程，保證空間轉(zhuǎn)錄組切片的質(zhì)量，全優(yōu)保障測序數(shù)據(jù)質(zhì)量。豐富的測序和數(shù)據(jù)分析經(jīng)驗(yàn)，烈冰配套全程個(gè)性化、定制化地?cái)?shù)據(jù)分析服務(wù)。重慶高通量測序空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)支持

強(qiáng)勢發(fā)文！烈冰空間轉(zhuǎn)錄組測序助力揭示愈傷組織能再生的機(jī)制。溫州BD Rhapsody空間轉(zhuǎn)錄組平臺(tái)

空間轉(zhuǎn)錄組測序在病理學(xué)中，通過添加基因表達(dá)維度，得出形態(tài)學(xué)結(jié)論，通過觀察基因表達(dá)區(qū)域，了解可能發(fā)生假陰性/假陽性的位置; 在免疫學(xué)，研究免疫細(xì)胞浸潤、不同區(qū)域的免疫細(xì)胞中的基因表達(dá)特征；免疫群體擴(kuò)散、不同類型免疫細(xì)胞的空間位置解析； 在神經(jīng)科學(xué)，研究大腦皮層層狀組織解析，揭示大腦皮層的結(jié)構(gòu)-功能關(guān)系，正常vs.疾病大腦結(jié)構(gòu)特征分析與疾病相關(guān)的基因表達(dá)于特定的大腦皮層； 在發(fā)育生物學(xué)，通過解析每個(gè)發(fā)育階段不同解剖區(qū)域特有的基因表達(dá)特征，解析組織中與形態(tài)形成相關(guān)基因；豐富基因表達(dá)的空間注釋信息，創(chuàng)建組織發(fā)育的空間細(xì)胞圖譜。溫州BD Rhapsody空間轉(zhuǎn)錄組平臺(tái)

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