廈門single cell RNA單細(xì)胞多組學(xué)商業(yè)化服務(wù)

單細(xì)胞技術(shù)讓我們在基因組學(xué)、表觀基因組學(xué)、轉(zhuǎn)錄組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)等層面上解析了許多錯綜復(fù)雜的生命密碼。隨著科技的進(jìn)步，我們發(fā)現(xiàn)整合多個組學(xué)的信息可以更仔細(xì)地觀察細(xì)胞之間的可變性，更清楚地識別特定細(xì)胞及其功能。單細(xì)胞多組學(xué)在臨床診斷、疾病分型以及細(xì)胞發(fā)展機制這些重大生命科學(xué)領(lǐng)域方面的應(yīng)用也將越來越廣。單細(xì)胞技術(shù)從 2009 年發(fā)展到現(xiàn)在，研究范圍不再局限于轉(zhuǎn)錄組，而是擴展到了基因組、免疫組、表觀組、蛋白組等多組學(xué)水平。單細(xì)胞多組學(xué)技術(shù)(single-cell multimodal omics) 是指在同一細(xì)胞中同時測量多種組學(xué)數(shù)據(jù)的前沿技術(shù)。廈門single cell RNA單細(xì)胞多組學(xué)商業(yè)化服務(wù)

RNA測序（RNA-seq）是轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究的重要工具，也是生命科學(xué)領(lǐng)域常用的技術(shù)之一。相比于傳統(tǒng)通路研究低維度、低通量的局限性，轉(zhuǎn)錄組學(xué)有以下優(yōu)勢：1）能夠動態(tài)考察細(xì)胞基因組的表達(dá)，多維度地反映差異變化；2）可用于研究占RNA絕大部分的非編碼RNA，研究其結(jié)構(gòu)以及在細(xì)胞生命活動中的重要調(diào)控作用；3）與蛋白組學(xué)研究相互補充，多角度呈現(xiàn)細(xì)胞水平的變化信息。作為轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究的技術(shù)基礎(chǔ)，RNA測序技術(shù)也在不斷地更新迭代，現(xiàn)如今更大通量、更深精度的測序為眾多科研和醫(yī)學(xué)工作者提供了豐富的工具和探索真理的手段。南京single cell 單細(xì)胞多組學(xué)多組學(xué)測序單細(xì)胞測序技術(shù)提供了單個細(xì)胞水平下的科學(xué)研究視角。

烈冰科技于2010年誕生之初便立足于高通量測序行業(yè)，為科研學(xué)者提供專注的測序數(shù)據(jù)分析服務(wù)，先后經(jīng)歷基因芯片時代、基因測序、轉(zhuǎn)錄組測序時代...在科技日新月異的洪流中始終獨占鰲頭。2018年以來，單細(xì)胞測序進(jìn)入發(fā)展的快車道，烈冰作為國內(nèi)首批引進(jìn)單細(xì)胞實驗雙平臺的公司，依托自主研發(fā)的NovelBrain®生物大數(shù)據(jù)分析平臺，為用戶提供一站式全流程的單細(xì)胞測序服務(wù)和解決方案。4年的單細(xì)胞技術(shù)的積累，烈冰已具備大鼠、小鼠、斑馬魚、猴、裸鼴鼠、水稻、擬南芥等10+物種，皮膚、腦、胰腺、脂肪、心臟、花序等50+組織類型，100+細(xì)胞類型，1000+靶標(biāo)基因，10000+樣本處理經(jīng)驗。

烈冰生物生信分析團隊緊追國際前沿、整合添加多項國際期刊認(rèn)可的空轉(zhuǎn)分析工具，構(gòu)建一套完整的數(shù)據(jù)分析流程；精心研發(fā)空轉(zhuǎn)結(jié)果瀏覽器，可同步展示空間轉(zhuǎn)錄組與單細(xì)胞測序分析結(jié)果，詳細(xì)深入地解析空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)。完成從Rawdata（原始數(shù)據(jù)）到Spot-Gene的具有定位信息的表達(dá)矩陣的過程后，就進(jìn)入了空轉(zhuǎn)的第二步，去進(jìn)行Spot的Cluster的過程，熟悉單細(xì)胞測序的研究者知道，Cluster在單細(xì)胞測序中往往表示為細(xì)胞的類型，也就是說能聚在一起采用算法分為一個群體細(xì)胞是一個Celltype（當(dāng)然分情況也會有不同）。而在空轉(zhuǎn)中，也正是由于前面提到了細(xì)胞的非單一性，導(dǎo)致了這里的分群并不是單純的同一細(xì)胞類型，而應(yīng)該認(rèn)為是具有相同細(xì)胞組成的點陣區(qū)域，或者說是近似的組織結(jié)構(gòu)區(qū)域。烈冰智造PanoCell單細(xì)胞捕獲，媲美國際主流的單細(xì)胞平臺。

空間轉(zhuǎn)錄組測序的數(shù)據(jù)分析基本分為三個階段：1.數(shù)據(jù)的預(yù)處理部分；2.Spot點陣的分群與定義；3.Spot分群的功能與生物學(xué)價值。每一個部分都不可或缺，其結(jié)果都對后續(xù)的分析結(jié)果有重要影響。由于空間轉(zhuǎn)錄組的序列結(jié)構(gòu)與單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序的左端序列結(jié)構(gòu)是非常接近的，都是Cellbarcode/SpotBarcode+UMI+捕獲區(qū)域這樣的設(shè)計。右端普遍為捕獲的RNA序列。因此采用單細(xì)胞的原始數(shù)據(jù)過濾策略即可，左端可以考慮切下捕獲區(qū)域前的序列區(qū)域作為后續(xù)分析用的序列以減少分析負(fù)荷。隨后，采用10X官方的Spatialranger的策略進(jìn)行后續(xù)分析，解析出位于空間位置中的有效的Spot表達(dá)矩陣。單細(xì)胞多組學(xué)測序技術(shù)提供了全新的視角來分析細(xì)胞的分化路徑、細(xì)胞間的交互調(diào)控和細(xì)胞亞群的分離現(xiàn)象。南京上海烈冰生物單細(xì)胞多組學(xué)平臺

單細(xì)胞多組學(xué)的研究對生物標(biāo)志物的發(fā)現(xiàn)，細(xì)胞分化發(fā)育研究等均有重要意義。廈門single cell RNA單細(xì)胞多組學(xué)商業(yè)化服務(wù)

冰凍切片的空間轉(zhuǎn)錄組測序在RNA捕獲、文庫構(gòu)建方面，需要將組織切片貼合在帶有mRNA結(jié)合捕獲探針的載玻片上，通過甲醛固定、H&E染色得到組織切片的形態(tài)結(jié)構(gòu)。再進(jìn)行透化處理，使細(xì)胞中的mRNA釋放，并結(jié)合到芯片相鄰的捕獲探針上。將捕獲的mRNA反轉(zhuǎn)錄合成cDNA并構(gòu)建測序文庫進(jìn)行上機測序，從而獲取基因表達(dá)信息?？傮w來說，空間轉(zhuǎn)錄組的實驗流程包括：組織凍存-OCT包埋-冷凍切片-固定染色-組織透化-cDNA合成及建庫-上機測序，而需要客戶進(jìn)行樣本準(zhǔn)備的步驟相對簡單：組織凍存與OCT包埋。廈門single cell RNA單細(xì)胞多組學(xué)商業(yè)化服務(wù)

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