西安高通量測序單細胞多組學技術支持

來源: 發(fā)布時間:2022-09-04

RNA測序(RNA-seq)是轉錄組學研究的重要工具,也是生命科學領域常用的技術之一。相比于傳統(tǒng)通路研究低維度、低通量的局限性,轉錄組學有以下優(yōu)勢:1)能夠動態(tài)考察細胞基因組的表達,多維度地反映差異變化;2)可用于研究占RNA絕大部分的非編碼RNA,研究其結構以及在細胞生命活動中的重要調控作用;3)與蛋白組學研究相互補充,多角度呈現(xiàn)細胞水平的變化信息。作為轉錄組學研究的技術基礎,RNA測序技術也在不斷地更新迭代,現(xiàn)如今更大通量、更深精度的測序為眾多科研和醫(yī)學工作者提供了豐富的工具和探索真理的手段。單細胞多組學技術可在同一細胞中捕獲分析兩種以上的組學信息,包括轉錄組、基因組、表觀基因組、蛋白組等。西安高通量測序單細胞多組學技術支持

二代測序技術在測序方法上取得了重大突破,基于“邊合成邊測序”(sequencingbysynthesis)和大規(guī)模平行測序技術(massiveparallelanalysis,MPS),使測序通量和讀取速度得到極大提升,烈冰生物斥巨資購置的Novaseq6000測序儀的測序原理可以簡化為四步:樣品文庫構建、簇生成、測序和數(shù)據(jù)分析。由于讀長限制,樣品DNA或由RNA逆轉錄得到的cDNA需要被打斷成300-500bp的片段,并在3和5端接上3種序列:1)Index,用于區(qū)分樣品來源;2)Adapter,用于結合測序通道上的位點;3)Primerbindingsite,用于結合PCR引物啟動擴增反應。西安高通量測序單細胞多組學技術支持目前單細胞多組學技術仍然處于技術探索及高通量開發(fā)階段,但應用單細胞多組學分析是研究發(fā)展的必然趨勢。

烈冰與國內高校、研究所、醫(yī)院和藥企單位開展深度合作,服務于600+臨床與研究機構,1000+客戶和5000+重要科研項目,助力并聯(lián)合發(fā)表300+篇CNS等國際學術期刊(不完全統(tǒng)計),在單細胞領域,烈冰助力用戶發(fā)表單細胞文獻30+篇,總IF>300+,IF>10+以上文章占比65%以上,包含Immunity、NatureCellBiology、NaturePlants、AdvancedScience等生物領域國際主流學術期刊,已發(fā)表文章研究領域涵蓋包括COVID-19研究、疾病發(fā)生轉移機制,免疫研究、腦神經(jīng)、白血病、胚胎發(fā)育、糖尿病、退行性疾病和植物領域研究等。

如在現(xiàn)有研究方法基礎上,進行特定亞細胞區(qū)域的蛋白質組學、相互作用蛋白質組學以及某種特定翻譯后修飾類型的蛋白質組學的研究等。這將有助于諸多生化過程以及致病機理的全新認識與發(fā)現(xiàn)。隨著基于單細胞蛋白質組學質譜研究方法的不斷發(fā)展,單細胞分析方法的靈敏度、蛋白質的覆蓋度、細胞通量、空間分辨率以及多組學的兼容能力會不斷突破我們的認知極限。更重要的是,單細胞分析在臨床診斷、疾病分型以及細胞發(fā)展機制這些重大生命科學領域方面的應用將會越來越大。未來,單細胞多組學測序技術的策略會繼續(xù)向轉錄組結合其他多個組學的三組學甚至四組學方向發(fā)展。

單細胞測序是指針對單個細胞進行全轉錄組測序分析,可精確地描述每一個細胞的狀態(tài),在異質性發(fā)育過程中具有不可忽視的應用價值。然而,單細胞測序無法給出固態(tài)異質化組織中細胞空間排布信息,對于揭示發(fā)育過程、病理微環(huán)境都存在很大的局限性??臻g轉錄組測序以點陣形式記錄病理切片細胞的空間信息并進行測序,可以精確指示點陣內的全部基因表達情況??臻g轉錄組測序的加入,無疑讓單細胞測序如虎添翼,更精確地勾勒了組織水平的異質性。烈冰生物為您提供一站式全流程高通量測序服務。廣州single cell 單細胞多組學平臺

烈冰測序服務已助力300余篇國際主流期刊研究文章發(fā)表。西安高通量測序單細胞多組學技術支持

reads數(shù)、基因表達量及細胞數(shù)量判定過程中:以捕獲5000個細胞、100G的測序量為標準,每個細胞的reads數(shù)大約在50k左右;每個細胞的基因中位數(shù)取決于樣本的細胞類型,例如成熟的B,T,粒細胞數(shù)量較多的組織中,由于該類型細胞表達的基因數(shù)普遍較少,導致基因中位數(shù)下降。而某一疾病組織、或者體外培養(yǎng)的如干細胞等,他們的基因表達數(shù)較高,甚至可以超過1萬,這就導致該類樣本基因中位數(shù)非常高。因此,我們對細胞數(shù)量以及基因中位數(shù)確認時,需要考察實際組織的細胞組成。西安高通量測序單細胞多組學技術支持

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