北京烈冰單細胞多組學平臺

相對于Smart-Seq技術(shù)在細胞數(shù)量上的問題，10X平臺普遍提供的細胞數(shù)量都在1000-20000不等的測序細胞量，這個量級的測序細胞量已經(jīng)可以說能夠完全覆蓋絕大部分組織的Single Cell群體類型。因此，這兩種技術(shù)對于基于基因表達進行準確細胞分型上，無論是從細胞數(shù)量上來說還是表達檢測可靠性來說，都會更實用。同時依托Random Cell Label技術(shù)，使得其對于NovaSeq、HiSeq X Ten、Hiseq 4000等設(shè)備存在的Index hooping現(xiàn)象，相對于Smart-Seq數(shù)據(jù)來說，影響幾乎可以忽略不計（10X Genomics官方網(wǎng)站曾給出hooping測試結(jié)果，顯示無影響。目前單細胞多組學技術(shù)仍然處于技術(shù)探索及高通量開發(fā)階段,但應用單細胞多組學分析是研究發(fā)展的必然趨勢。北京烈冰單細胞多組學平臺

未來,單細胞多組學測序技術(shù)的發(fā)展,一方面將集中在對現(xiàn)有技術(shù)的優(yōu)化和新方法的開發(fā).現(xiàn)有技術(shù)的優(yōu)化不僅包括建庫手段、測序技術(shù)和算法工具等方面,還包括優(yōu)化實驗設(shè)計、自動化實驗流程以及提升實驗效率.為了更好地檢測到各種大分子的特征,研究者可以考慮從生物、化學和物理等多學科中尋找解決方案.此外,新的計算方法和分析工具能幫助研究者越過一些實驗限制,發(fā)現(xiàn)更多新奇的生物過程.例如,擬時序分析(pseudotimetrajectory)將有助于人們理解早期胚胎發(fā)育的細胞分化軌跡.新方法則可以更多地關(guān)注目前未能檢測到的一些重要的基因表達調(diào)控層面,如DNA三維結(jié)構(gòu)、非編碼RNA和胞內(nèi)蛋白等.另一方面,目前的單細胞多組學測序技術(shù)發(fā)展勢頭強勁,研究者不斷研發(fā)并豐富著單細胞測序工具箱,各種組學方法百家爭鳴.未來,研究者需要從眾多相似的方法中篩選出一些穩(wěn)定、通用、成本低、可商業(yè)化的方法,并進一步擴大其實際應用范圍。杭州BD單細胞多組學服務機構(gòu)單細胞轉(zhuǎn)錄組技術(shù)在多個研究領(lǐng)域都發(fā)揮了重要的推進作用，揭示了組織中微量的細胞類型和基因表達特征。

單細胞測序技術(shù)（SingleCellSequencing）從一種新興的研究角度，借助已有的高通量測序手段，幫助研究者在疾病樣本的異質(zhì)性、樣本微環(huán)境、發(fā)育學、免疫學以及其他領(lǐng)域中進行單細胞層面的數(shù)據(jù)解析，解決了BulkPopulationSequencing所無法解決的問題。這樣一個新的研究領(lǐng)域必然也需要足夠可靠的實驗手段來支撐。BDRhapsody單細胞分選系統(tǒng)為此提供了完善的硬件設(shè)備，保證了從單細胞懸液質(zhì)量評估到單細胞分選標記過程中每一個實驗步驟的完善質(zhì)控。NovelBio單細胞實驗團隊借助BDRhapsody單細胞分選系統(tǒng)，在實驗實施層面對單細胞測序結(jié)果的可靠性提供了強有力的保證。繼單細胞懸液制備之后，又在另一道關(guān)鍵關(guān)卡提供了可靠的支持，幫助研究者在單細胞測序領(lǐng)域收獲更多的成果。

冰凍切片的空間轉(zhuǎn)錄組測序在RNA捕獲、文庫構(gòu)建方面，需要將組織切片貼合在帶有mRNA結(jié)合捕獲探針的載玻片上，通過甲醛固定、H&E染色得到組織切片的形態(tài)結(jié)構(gòu)。再進行透化處理，使細胞中的mRNA釋放，并結(jié)合到芯片相鄰的捕獲探針上。將捕獲的mRNA反轉(zhuǎn)錄合成cDNA并構(gòu)建測序文庫進行上機測序，從而獲取基因表達信息?？傮w來說，空間轉(zhuǎn)錄組的實驗流程包括：組織凍存-OCT包埋-冷凍切片-固定染色-組織透化-cDNA合成及建庫-上機測序，而需要客戶進行樣本準備的步驟相對簡單：組織凍存與OCT包埋。單細胞多組學可從整體層面快速有效地探尋疾病發(fā)生、發(fā)展的根本原因或藥物作用靶點等信息。

單細胞多組學技術(shù)優(yōu)勢：1. 構(gòu)建蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫，大幅度提高蛋白質(zhì)鑒定數(shù)量；2. 不同層面表達水平分析，構(gòu)建表達“全景圖”；3. 多組學交叉驗證：深層次挖掘其中調(diào)控機制；4. 對基因突變信息在蛋白水平上進行驗證；5.精細醫(yī)療：實現(xiàn)genomics到protegenomics的轉(zhuǎn)變。生物領(lǐng)域各個研究方面，1. 農(nóng)林領(lǐng)域：抗逆脅迫機制，生長發(fā)育機制，育種保護研究等；2. 畜牧業(yè)：肉類及乳品質(zhì)研究，致病機理研究等；3. 基礎(chǔ)醫(yī)學、臨床診斷：生物標志物，疾病機理機制，疾病分型等；4. 生物醫(yī)藥：藥物作用機理，藥效評價，藥物開發(fā)等；5. 微生物領(lǐng)域：致病機理，耐藥機制，病原體-宿主相互作用研究等；6. 海洋水產(chǎn)：漁業(yè)資源，海水養(yǎng)殖，漁業(yè)環(huán)境與水產(chǎn)品安全等；7. 生物能源、環(huán)境科學領(lǐng)域：發(fā)酵過程優(yōu)化，生物燃料生產(chǎn)，環(huán)境危定風險評估研究等；8.食品營養(yǎng)：食品儲藏及加工條件優(yōu)化，食品組分及品質(zhì)鑒定，功能性食品開發(fā)，食品安全監(jiān)檢測等。單細胞測序手段有力地解決了組織內(nèi)高度異質(zhì)性對于低豐度信號影響的問題。深圳單細胞多組學測序服務公司

深度的單細胞測序數(shù)據(jù)解讀助力生物健康醫(yī)療時代。北京烈冰單細胞多組學平臺

單細胞測序技術(shù)的不斷發(fā)展解決了以往群體細胞組學分析面臨的兩個瓶頸:一是大量細胞的混合測序會掩蓋細胞間的異質(zhì)性;二是傳統(tǒng)的測序技術(shù)需要大量的細胞作為起始,細胞數(shù)目稀有的樣品則難以研究.利用單細胞測序方法不僅能夠揭示組織中的細胞類型和稀有亞群、細胞狀態(tài)和命運的變化,還可以研究細胞數(shù)稀有的珍貴樣品,從而幫助人們理解發(fā)育、衰老和疾病發(fā)展的機制。隨著單細胞轉(zhuǎn)錄組、基因組、表觀遺傳組、蛋白組等各組學測序技術(shù)的快速發(fā)展,研究者開始將它們相互組合,使得單個細胞或同類細胞的多個組學數(shù)據(jù)能夠聯(lián)合分析.因此,利用單細胞多組學技術(shù)能夠更有效地研究細胞在特定時空狀態(tài)下各組學間的復雜聯(lián)系,從而揭示細胞狀態(tài)和命運調(diào)控的分子機制。北京烈冰單細胞多組學平臺

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