合肥scRNA單細(xì)胞多組學(xué)多組學(xué)測序

烈冰科技于2010年誕生之初便立足于高通量測序行業(yè)，為科研學(xué)者提供專注的測序數(shù)據(jù)分析服務(wù)，先后經(jīng)歷基因芯片時(shí)代、基因測序、轉(zhuǎn)錄組測序時(shí)代...在科技日新月異的洪流中始終獨(dú)占鰲頭。2018年以來，單細(xì)胞測序進(jìn)入發(fā)展的快車道，烈冰作為國內(nèi)首批引進(jìn)單細(xì)胞實(shí)驗(yàn)雙平臺的公司，依托自主研發(fā)的NovelBrain®生物大數(shù)據(jù)分析平臺，為用戶提供一站式全流程的單細(xì)胞測序服務(wù)和解決方案。4年的單細(xì)胞技術(shù)的積累，烈冰已具備大鼠、小鼠、斑馬魚、猴、裸鼴鼠、水稻、擬南芥等10+物種，皮膚、腦、胰腺、脂肪、心臟、花序等50+組織類型，100+細(xì)胞類型，1000+靶標(biāo)基因，10000+樣本處理經(jīng)驗(yàn)。單細(xì)胞多組學(xué)測序主要包含細(xì)胞分離、文庫構(gòu)建、高通量測序和生物信息學(xué)分析等步驟。合肥scRNA單細(xì)胞多組學(xué)多組學(xué)測序

單細(xì)胞測序?qū)嶒?yàn)再樣本細(xì)胞上機(jī)分選簽，需要對細(xì)胞數(shù)量、細(xì)胞活性進(jìn)行準(zhǔn)確判斷，這對SingleCell分選標(biāo)記、建庫、下機(jī)數(shù)據(jù)的質(zhì)量都具有著決定性的作用。如若細(xì)胞計(jì)數(shù)偏高，將會影響建庫的成功率；計(jì)數(shù)偏低，則會顯著提高雙細(xì)胞的比例；而細(xì)胞活率過低，就會使測序數(shù)據(jù)的利用率大打折扣，因此把好單細(xì)胞懸液質(zhì)量這一關(guān)尤為重要。而在鋪板過程中，由于不同操作人員手法具有不可避免的差異，不同的液體流速將直接影響單細(xì)胞的入孔效果。因此烈冰生物BDRhapsody單細(xì)胞分選平臺配套了專門定制的電動移液器，其具有PrimeTreat、CellLoad、BeadLoad、Wash、Lysis、Retrieval多種操作模式，來對應(yīng)各種不同的操作。通過已經(jīng)設(shè)定的程序來控制液體的流速，大幅度降低人為操作習(xí)慣帶來的差異，保證實(shí)驗(yàn)操作的一致性。寧波烈冰生物單細(xì)胞多組學(xué)服務(wù)機(jī)構(gòu)烈冰專精單細(xì)胞多組學(xué)測序領(lǐng)域。

高通量測序技術(shù)（High-throughputsequencing）又稱“下一代”測序技術(shù)（“Next-generation”sequencing），以能一次并行對幾十萬到幾百萬條DNA分子進(jìn)行序列測定和一般讀長較短等為標(biāo)志。高通量測序技術(shù)是對傳統(tǒng)測序一次顛覆性的改變，一次對幾十萬到幾百萬條DNA分子進(jìn)行序列測定，因此在有些文獻(xiàn)中稱其為下一代測序技術(shù)(nextgenerationsequencing)足見其劃時(shí)代的改變，同時(shí)高通量測序使得對一個(gè)物種的轉(zhuǎn)錄組和基因組進(jìn)行細(xì)致全貌的分析成為可能，所以又被稱為深度測序(deepsequencing)。而烈冰科技具有專業(yè)生物背景和十二年科研服務(wù)經(jīng)驗(yàn)，已助力Nature，immunity等在內(nèi)的300+篇CNS文章發(fā)表。

單細(xì)胞多組學(xué)測序主要包含細(xì)胞分離、文庫構(gòu)建、高通量測序和生物信息學(xué)分析等步驟.因此,單細(xì)胞多組學(xué)測序技術(shù)的發(fā)展也為相關(guān)算法的開發(fā)帶來了機(jī)遇和挑戰(zhàn)。利用多模態(tài)計(jì)算方法不僅可以更好地進(jìn)行細(xì)胞分群和譜系追蹤,還可以推斷基因表達(dá)調(diào)控網(wǎng)絡(luò)和解析細(xì)胞在組織中的空間位置等信息。多組學(xué)的聯(lián)合分析需要解決的計(jì)算問題是如何將大量單細(xì)胞產(chǎn)生的多種不同的組學(xué)數(shù)據(jù)進(jìn)行有效地生成、識別、整合與分析,并且降低數(shù)據(jù)背景噪音和樣本間的批次差異.目前,單細(xì)胞多組學(xué)的生物信息分析方法仍有待發(fā)展,面臨著諸多問題與挑戰(zhàn)。單細(xì)胞多組學(xué)的研究對生物標(biāo)志物的發(fā)現(xiàn)，細(xì)胞分化發(fā)育研究等均有重要意義。

當(dāng)蜂巢孔內(nèi)同時(shí)落入細(xì)胞和磁珠后，接下去可以往BDCartridge板中加入細(xì)胞裂解液對細(xì)胞進(jìn)行裂解，使細(xì)胞內(nèi)的RNA與磁珠上的標(biāo)簽進(jìn)行結(jié)合，完成每個(gè)細(xì)胞內(nèi)RNA的捕獲和標(biāo)記。這時(shí)，再將捕獲了RNA的磁珠進(jìn)行回收，待所有質(zhì)控結(jié)果確認(rèn)通過后就可以進(jìn)行后續(xù)的RNA反轉(zhuǎn)錄、cDNA第二鏈合成等實(shí)驗(yàn)操作。而BDCartridge板則需要再進(jìn)行一次成像，獲得磁珠收集后的掃描圖，判斷磁珠是否已經(jīng)被有效收集。根據(jù)每一步的質(zhì)控結(jié)果，烈冰科技（NovelBio）單細(xì)胞測序?qū)嶒?yàn)團(tuán)隊(duì)會根據(jù)單細(xì)胞分選的實(shí)驗(yàn)結(jié)果生成實(shí)驗(yàn)總結(jié)報(bào)告，判斷每一步驟是否通過質(zhì)控，并得到捕獲的單細(xì)胞數(shù)量以及雙細(xì)胞比例，對整個(gè)實(shí)驗(yàn)進(jìn)行總結(jié)評估。若所有過程通過質(zhì)控，實(shí)驗(yàn)樣本即可進(jìn)行下一步實(shí)驗(yàn)操作。，從多組學(xué)的角度對單細(xì)胞進(jìn)行綜合分析 將是未來單細(xì)胞技術(shù)的必由之路。北京上海烈冰生物單細(xì)胞多組學(xué)測序

單細(xì)胞測序是高通量測序下的又一重大技術(shù)突破。合肥scRNA單細(xì)胞多組學(xué)多組學(xué)測序

BD的技術(shù)不再采用利用微流控孔道射出細(xì)胞和射出的磁珠碰撞的過程，進(jìn)行單細(xì)胞捕獲的技術(shù)，轉(zhuǎn)而采用CytoSeq特有的蜂窩板技術(shù)。該技術(shù)用20萬+的微孔（該數(shù)量級遠(yuǎn)大于Input細(xì)胞數(shù)量），保證單孔中的單細(xì)胞捕獲。同時(shí)避免了10X中存在的概率碰撞影響捕獲效率的問題，采用微孔捕獲相對會有更好的捕獲效率（來自兩家企業(yè)商業(yè)宣傳資料比對），保證Input細(xì)胞的高效使用。對于Input細(xì)胞的量更少的情況，可以基于百萬級別的細(xì)胞總量開始進(jìn)行前期處理以及后期捕獲操作。而在細(xì)胞捕獲完成后，進(jìn)行細(xì)胞裂解后，同樣的也進(jìn)行細(xì)胞中RNApolyA序列的抓取工作。合肥scRNA單細(xì)胞多組學(xué)多組學(xué)測序

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