青島BD Rhapsody單細(xì)胞多組學(xué)技術(shù)支持

來源: 發(fā)布時間:2022-08-23

如在現(xiàn)有研究方法基礎(chǔ)上,進(jìn)行特定亞細(xì)胞區(qū)域的蛋白質(zhì)組學(xué)、相互作用蛋白質(zhì)組學(xué)以及某種特定翻譯后修飾類型的蛋白質(zhì)組學(xué)的研究等。這將有助于諸多生化過程以及致病機理的全新認(rèn)識與發(fā)現(xiàn)。隨著基于單細(xì)胞蛋白質(zhì)組學(xué)質(zhì)譜研究方法的不斷發(fā)展,單細(xì)胞分析方法的靈敏度、蛋白質(zhì)的覆蓋度、細(xì)胞通量、空間分辨率以及多組學(xué)的兼容能力會不斷突破我們的認(rèn)知極限。更重要的是,單細(xì)胞分析在臨床診斷、疾病分型以及細(xì)胞發(fā)展機制這些重大生命科學(xué)領(lǐng)域方面的應(yīng)用將會越來越大。單細(xì)胞多組學(xué) 測序技術(shù)會轉(zhuǎn)向研發(fā)多組學(xué)測序分析和功能驗證同時 進(jìn)行的方法。青島BD Rhapsody單細(xì)胞多組學(xué)技術(shù)支持

單細(xì)胞多組學(xué)測序技術(shù)的發(fā)展依賴于各種單一組學(xué)檢測技術(shù)的完善,但即使在單細(xì)胞測序技術(shù)迅速發(fā)展的情況下,在單細(xì)胞水平協(xié)同檢測多個不同的分子層面仍然非常具有挑戰(zhàn)性.每一種組學(xué)都有不同的特性和測量方法,這些方法在敏感性、特異性、通量和適用性上都有所不同.因此,在單細(xì)胞水平對多種組學(xué)方法進(jìn)行整合和應(yīng)用時,需要在策略上做出改進(jìn),以保證各組學(xué)間的上游建庫以及下游生物信息分析均能良好地兼容,同時也要明確技術(shù)的局限性及其對研究結(jié)果的潛在影響。成都single cell 單細(xì)胞多組學(xué)技術(shù)支持單一的轉(zhuǎn)錄本研究不能體現(xiàn)生命進(jìn)程的變化,因此多組學(xué)聯(lián)合分析成為解析生命進(jìn)程的有力工具。

單細(xì)胞多組學(xué)測序主要包含細(xì)胞分離、文庫構(gòu)建、高通量測序和生物信息學(xué)分析等步驟.因此,單細(xì)胞多組學(xué)測序技術(shù)的發(fā)展也為相關(guān)算法的開發(fā)帶來了機遇和挑戰(zhàn)。利用多模態(tài)計算方法不僅可以更好地進(jìn)行細(xì)胞分群和譜系追蹤,還可以推斷基因表達(dá)調(diào)控網(wǎng)絡(luò)和解析細(xì)胞在組織中的空間位置等信息。多組學(xué)的聯(lián)合分析需要解決的計算問題是如何將大量單細(xì)胞產(chǎn)生的多種不同的組學(xué)數(shù)據(jù)進(jìn)行有效地生成、識別、整合與分析,并且降低數(shù)據(jù)背景噪音和樣本間的批次差異.目前,單細(xì)胞多組學(xué)的生物信息分析方法仍有待發(fā)展,面臨著諸多問題與挑戰(zhàn)。

分子檢測型單細(xì)胞多組學(xué)測序技術(shù)中也有一些集中于探究單細(xì)胞內(nèi)表觀遺傳組各層面的變化及關(guān)聯(lián)。功能研究型單細(xì)胞多組學(xué)測序技術(shù),結(jié)合了強大的CRISPR基因編輯技術(shù),從而可以深度挖掘基因表達(dá)調(diào)控與細(xì)胞功能以及命運決定之間的因果關(guān)系。在未來,為了更系統(tǒng)地研究多層組學(xué)之間的互動關(guān)系對細(xì)胞命運的影響,一方面,單細(xì)胞多組學(xué)測序技術(shù)的策略會繼續(xù)向轉(zhuǎn)錄組結(jié)合其他多個組學(xué)的三組學(xué)甚至四組學(xué)方向發(fā)展.另一方面,單細(xì)胞多組學(xué)測序技術(shù)會轉(zhuǎn)向研發(fā)多組學(xué)測序分析和功能驗證同時進(jìn)行的方法,這種探究因果關(guān)系的策略對于揭示發(fā)育和疾病發(fā)展中的關(guān)鍵因子和分子網(wǎng)絡(luò)模塊十分重要。單細(xì)胞多組學(xué)數(shù)據(jù)整合的一大挑戰(zhàn)在于不同組學(xué)的特征空間存在差異。

單細(xì)胞測序?qū)嶒炘贅颖炯?xì)胞上機分選簽,需要對細(xì)胞數(shù)量、細(xì)胞活性進(jìn)行準(zhǔn)確判斷,這對SingleCell分選標(biāo)記、建庫、下機數(shù)據(jù)的質(zhì)量都具有著決定性的作用。如若細(xì)胞計數(shù)偏高,將會影響建庫的成功率;計數(shù)偏低,則會顯著提高雙細(xì)胞的比例;而細(xì)胞活率過低,就會使測序數(shù)據(jù)的利用率大打折扣,因此把好單細(xì)胞懸液質(zhì)量這一關(guān)尤為重要。而在鋪板過程中,由于不同操作人員手法具有不可避免的差異,不同的液體流速將直接影響單細(xì)胞的入孔效果。因此烈冰生物BDRhapsody單細(xì)胞分選平臺配套了專門定制的電動移液器,其具有PrimeTreat、CellLoad、BeadLoad、Wash、Lysis、Retrieval多種操作模式,來對應(yīng)各種不同的操作。通過已經(jīng)設(shè)定的程序來控制液體的流速,大幅度降低人為操作習(xí)慣帶來的差異,保證實驗操作的一致性。單細(xì)胞多學(xué)可包括基因組學(xué)、轉(zhuǎn)錄組學(xué)、蛋白質(zhì)組學(xué)、代謝組學(xué)、影像組學(xué)。濟南烈冰科技單細(xì)胞多組學(xué)測序

單細(xì)胞多組學(xué)測序主要包含細(xì)胞分離、文庫構(gòu)建、高通量測序和生物信息學(xué)分析等步驟。青島BD Rhapsody單細(xì)胞多組學(xué)技術(shù)支持

機體為響應(yīng)各種應(yīng)激,其細(xì)胞會從一種功能“狀態(tài)”轉(zhuǎn)變?yōu)榱硪环N功能“狀態(tài)”;當(dāng)細(xì)胞在不同狀態(tài)之間轉(zhuǎn)變時,往往會經(jīng)歷轉(zhuǎn)錄重組,導(dǎo)致一些基因被“沉默”,一些基因被重新“喚醒”,但純化這些瞬態(tài)細(xì)胞進(jìn)行研究是很困難或不可能的;scRNA-seq擬時序分析可以讓我們在不需要純化的情況下查看這些細(xì)胞狀態(tài)。擬時序分析,即根據(jù)不同細(xì)胞亞群基因表達(dá)量隨時間的變化情況,構(gòu)建細(xì)胞譜系發(fā)育,但這里的時間并不是真時間,而是一個虛擬的時間,是指的細(xì)胞與細(xì)胞之間的轉(zhuǎn)化和演替的順序和軌跡。即使在同一個樣本中,也會存在多種不同的細(xì)胞形態(tài)。因此,不論測定了多少樣本,我們都可以采用擬時序分析對樣本中的細(xì)胞轉(zhuǎn)化和變化進(jìn)行描述。青島BD Rhapsody單細(xì)胞多組學(xué)技術(shù)支持

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