廣州烈冰空間轉(zhuǎn)錄組測序

單細胞測序是指針對單個細胞進行全轉(zhuǎn)錄組測序分析，可精確地描述每一個細胞的狀態(tài)，在異質(zhì)性發(fā)育過程中具有不可忽視的應用價值。然而，單細胞測序無法給出固態(tài)異質(zhì)化組織中細胞空間排布信息，對于揭示發(fā)育過程、病理微環(huán)境都存在很大的局限性。空間轉(zhuǎn)錄組測序以點陣形式記錄病理切片細胞的空間信息并進行測序，可以精確指示點陣內(nèi)的全部基因表達情況?？臻g轉(zhuǎn)錄組測序的加入，無疑讓單細胞測序如虎添翼，更精確地勾勒了組織水平的異質(zhì)性?？臻g轉(zhuǎn)錄組測序可識別重要的轉(zhuǎn)錄因子，進行譜系和發(fā)育追蹤。廣州烈冰空間轉(zhuǎn)錄組測序

烈冰生物生信分析團隊緊追國際前沿、整合添加多項國際期刊認可的空轉(zhuǎn)分析工具，構(gòu)建一套完整的數(shù)據(jù)分析流程；精心研發(fā)空轉(zhuǎn)結(jié)果瀏覽器，可同步展示空間轉(zhuǎn)錄組與單細胞測序分析結(jié)果，詳細深入地解析空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)。完成從Rawdata（原始數(shù)據(jù)）到Spot-Gene的具有定位信息的表達矩陣的過程后，就進入了空轉(zhuǎn)的第二步，去進行Spot的Cluster的過程，熟悉單細胞測序的研究者知道，Cluster在單細胞測序中往往表示為細胞的類型，也就是說能聚在一起采用算法分為一個群體細胞是一個Celltype（當然分情況也會有不同）。而在空轉(zhuǎn)中，也正是由于前面提到了細胞的非單一性，導致了這里的分群并不是單純的同一細胞類型，而應該認為是具有相同細胞組成的點陣區(qū)域，或者說是近似的組織結(jié)構(gòu)區(qū)域。廣州烈冰生物空間轉(zhuǎn)錄組商業(yè)化服務烈冰全線實驗平臺滿足超深度、大規(guī)模發(fā)現(xiàn)和復雜疾病研究的測序。

空間轉(zhuǎn)錄組測序是在組織原位檢測全轉(zhuǎn)錄組基因表達的?種技術(shù)，可以展?組織切?中不同區(qū)域的基因表達情況，同時能夠得到?的基因在組織內(nèi)部的空間位置信息。與傳統(tǒng)的全基因轉(zhuǎn)錄組或單細胞轉(zhuǎn)錄組測序相?，空間轉(zhuǎn)錄組測序漿病理影像（H&E染?）與測序數(shù)據(jù)映射在?起，進?可以分析組織切內(nèi)部空間結(jié)構(gòu)的細胞異質(zhì)性。常規(guī)單細胞轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)丟失了細胞在原組織中至關(guān)重要的空間位置信息，而單細胞空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)在進行單細胞轉(zhuǎn)錄組測序的同時保留并記錄了細胞的空間位置信息。空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)能夠揭示細胞間的相互作用以及細胞所處的微環(huán)境，將成為發(fā)育生物學、神經(jīng)生物學、免疫生物學等領(lǐng)域的研究利器。

烈冰生信團隊傾情研發(fā)的NovelBrain®生信大數(shù)據(jù)分析平臺，針對龐大的單細胞測序數(shù)據(jù)，能夠?qū)崿F(xiàn)細胞類型鑒定的快、精、準：一鍵導入genelist構(gòu)建個性化基因列表；輕松一點即可展示Marker基因的Featureplot；任意修改Cluster的顏色和名稱助力高效鑒定細胞類型；一鍵獲得t-SNE圖、Heatmap和Violin圖：輕松獲得并下載基因表達的t-SNE圖、Heatmap、Violin圖，還可以通過調(diào)節(jié)寬、高和系數(shù)比例來調(diào)節(jié)美觀。平臺上線300+task自主分析工具、50+pipeline工作流模板，幫助烈冰生信分析團隊和自主分析用戶實現(xiàn)分析工具和模板的快速調(diào)用和一站式全流程自動化分析，節(jié)省您的工作時間并提升整體工作效率。ATCG堿基的排列組合構(gòu)成了測序的龐大世界。

空間轉(zhuǎn)錄組測序與單細胞測序的結(jié)果不同，這里存在一個概念叫做NumberofSpotsundertissue，即，空間轉(zhuǎn)錄組片子上組織覆蓋的有效的spot位點。這個有效Spot的篩選標準是有UMI以及有序列表達。那么這個時候，貼片的質(zhì)量就成為了制約空間轉(zhuǎn)錄組有效區(qū)域的要點了。如果組織沒有很好地覆蓋到空轉(zhuǎn)片上，那么容易出現(xiàn)雖然有HE染色有組織片子，但是沒有基因表達，即無有效Spot位點。同樣的，另一個就是組織切片的大小，也就是說組織切片在整個玻片的覆蓋面積越小，分析的有效區(qū)域就越少。這兩者基本上決定了整個空間轉(zhuǎn)錄組分析結(jié)果的基礎(chǔ)質(zhì)量。自主研發(fā)PanoCell單細胞實驗測序平臺。南京scRNA空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析可視化

烈冰斥巨資引進Novaseq6000，開啟更大通量測序新紀元。廣州烈冰空間轉(zhuǎn)錄組測序

一體化的結(jié)構(gòu)體系難以形成，我國醫(yī)藥健康正處于初級發(fā)展階段，與體系健全的發(fā)達地區(qū)相比，冷鏈物流行業(yè)呈現(xiàn)規(guī)模小且分布雜亂的現(xiàn)象。醫(yī)藥行業(yè)上下游未整體規(guī)劃，成為我國冷鏈物流發(fā)展的障礙，從而使得醫(yī)藥冷鏈物流流通效率低下。以單細胞測序，生物大數(shù)據(jù)云分析平臺，空間轉(zhuǎn)錄組測序，單細胞多組學測序為例，主打運動健康A(chǔ)PP停留在工具層面，缺少完整的消費場景閉環(huán)，較強的工具屬性停留在實現(xiàn)用戶基礎(chǔ)的功能需求，并未涉及足夠高的用戶使用價值實現(xiàn)，同時缺乏數(shù)字化運營的效能也是運動健康A(chǔ)PP發(fā)展的明顯桎梏，經(jīng)營模式有待進一步探索。醫(yī)藥健康方面人才培養(yǎng)體制貧乏，經(jīng)調(diào)查，中國的大學中把物流管理與醫(yī)藥知識結(jié)合的專業(yè)少之又少，單方面精通的人才對于醫(yī)藥冷鏈物流無法完全勝任，通過調(diào)研冷鏈物流企業(yè)，了解到培養(yǎng)物流人員有關(guān)冷鏈物流的相關(guān)知識來勝任冷鏈物流工作的計劃進展緩慢，使得人才成為完善醫(yī)藥健康的重要制約因素。醫(yī)藥健康上下游未整體規(guī)劃，醫(yī)用物流公司十分分散，許多下游需求店鋪及用戶因物流體系不完善而放棄該種醫(yī)藥的引入和使用。由于醫(yī)用藥保存條件要求十分高，存儲倉庫與冷藏運輸車等的建設與運行成本便居高不下，使得醫(yī)藥冷鏈物流從建設到運營中的成本都遠超于傳統(tǒng)物流成本。廣州烈冰空間轉(zhuǎn)錄組測序

上海烈冰生物醫(yī)藥科技有限公司一直專注于生物科技、醫(yī)藥科技、信息科技、計算機科技領(lǐng)域內(nèi)的技術(shù)開發(fā)、技術(shù)服務、技術(shù)轉(zhuǎn)讓、技術(shù)咨詢，市場營銷策劃，市場信息咨詢與調(diào)查（不得從事社會調(diào)查、社會調(diào)研、民意調(diào)查、民意測驗），從事貨物及技術(shù)的進出口業(yè)務，計算機、軟件及耗材（除?？兀?，軟件開發(fā)【依法須經(jīng)批準的項目，經(jīng)相關(guān)部門批準后方可開展經(jīng)營活動】，是一家醫(yī)藥健康的企業(yè)，擁有自己**的技術(shù)體系。公司目前擁有較多的高技術(shù)人才，以不斷增強企業(yè)重點競爭力，加快企業(yè)技術(shù)創(chuàng)新，實現(xiàn)穩(wěn)健生產(chǎn)經(jīng)營。公司業(yè)務范圍主要包括：單細胞測序，生物大數(shù)據(jù)云分析平臺，空間轉(zhuǎn)錄組測序，單細胞多組學測序等。公司奉行顧客至上、質(zhì)量為本的經(jīng)營宗旨，深受客戶好評。公司深耕單細胞測序，生物大數(shù)據(jù)云分析平臺，空間轉(zhuǎn)錄組測序，單細胞多組學測序，正積蓄著更大的能量，向更廣闊的空間、更寬泛的領(lǐng)域拓展。