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烈冰科技于2010年誕生之初便立足于高通量測序行業(yè),為科研學者提供專注的測序數據分析服務,先后經歷基因芯片時代、基因測序、轉錄組測序時代...在科技日新月異的洪流中始終獨占鰲頭。2018年以來,烈冰依托自主研發(fā)的NovelBrain®生物大數據分析平臺,為用戶提供一站式全流程的空間轉錄組測序服務和解決方案。烈冰經過十幾年的經歷,已具備大鼠、小鼠、斑馬魚、猴、裸鼴鼠、水稻、擬南芥等10+物種,皮膚、腦、胰腺、脂肪、心臟、花序等50+組織類型,100+細胞類型,1000+靶標基因,10000+樣本處理經驗??臻g轉錄組測序因其強大的探究疾病--細胞--基因的關系,一度成為高通量測序技術的“天花板”。濟南高通量測序空間轉錄組多組學測序
烈冰與國內高校、研究所、醫(yī)院和藥企單位開展深度合作,服務于600+臨床與研究機構,1000+客戶和5000+重要科研項目,助力并聯(lián)合發(fā)表300+篇CNS等國際學術期刊(不完全統(tǒng)計),在單細胞領域,烈冰助力用戶發(fā)表單細胞文獻30+篇,總IF>300+,IF>10+以上文章占比65%以上,包含Immunity、NatureCellBiology、NaturePlants、AdvancedScience等生物領域國際主流學術期刊,已發(fā)表文章研究領域涵蓋包括COVID-19研究、疾病發(fā)生轉移機制,免疫研究、腦神經、白血病、胚胎發(fā)育、糖尿病、退行性疾病和植物領域研究等。青島烈冰空間轉錄組數據分析可視化空間轉錄組測序技術遍地開花,烈冰服務讓您的生物醫(yī)學研究如虎添翼。
空間轉錄組測序的數據質量和玻片有效區(qū)域的利用率、貼片的質量和透化時間息息相關。貼片質量不良會影響總的有效spot數等;而透化不合理會導致spot的reads數、基因中位數等參數。而在特異性基因表達方面,我們也可以統(tǒng)計空間轉錄組群體的特異性基因表達即Markergene,將他們在組織切片以及空轉上進行著色。我們也可以對于任意一個已知的基因或者數據庫中的一些細胞Marker,然后將其在基因表達在空間轉錄組的切片以及HE染色上展示自己的基因表達進而了解,群體中的可能的細胞組成關系。
其實,空間轉錄組的概念早就已經存在了,目前已經發(fā)表的空間轉錄組技術有Slide-seq,LCM-seq,seqFISH,MERFISH,Liversinglecellzonation,Geo-seqandTomo-seq。但是這些方法存在操作復雜、檢測精度不準確、基因和細胞檢測量的限制等問題。10xGenomics公司升級spatialTranscriptomic后推出的Visium空間基因表達解決方案是一款商業(yè)化的高精度、高通量空間轉錄組測序方案。烈冰科技自2020年起,國內率先搭建空間轉錄組測序服務平臺,聯(lián)合上線單細胞核轉錄組測序、AbSeq、單細胞TCR-Seq、單細胞ATAC-Seq(ARCHR測序)、空間轉錄組測序產品結合scRNA-Seq服務,多組學聯(lián)合助力科研人員探索時空等多維度、多角度的動態(tài)變化的生物學信息。烈冰生物為您提供貼心的單細胞研究完整解決方案!截至2021年10月,烈冰助力發(fā)表空間轉錄組測序文章近20篇。
細胞在組織樣本中的相對空間位置關系對于了解疾病病理學非常重要。但是scRNA-Seq在單細胞懸液制備的過程中破壞了細胞的空間結構,無法給出固態(tài)異質化組織中細胞空間排布信息。而空間轉錄組可以解決這個問題,通過記錄組織切片細胞的空間信息,捕獲組織切片中的組織學信息;通過免疫熒光進行蛋白組檢測,將基因表達譜映射回組織樣本中的原始位置,同時獲得細胞/基因的空間表達特異性。該技術可以為神經科學,發(fā)育生物學,免疫生理學等領域的研究提供組織和基因表達情況的新視角。烈冰實驗室包含從樣本處理到測序下機的全套實驗平臺。北京烈冰空間轉錄組多組學測序
ATCG堿基的排列組合構成了測序的龐大世界。濟南高通量測序空間轉錄組多組學測序
空間轉錄組測序的關鍵就在于,解決了空間位置保留的問題。被放置在芯片區(qū)域內的冰凍組織切片在經過H&E染色和成像記錄后,會被進行透化處理,釋放細胞中的RNA。芯片上的捕獲引物的中段設置了帶有獨特標識的條形碼區(qū)域。芯片被劃分為了數個不同的捕獲區(qū)域,每個捕獲區(qū)域中錨定的引物都帶有不同的條形碼序列。每個區(qū)域對應的組織位置會被記錄下來,然后再進行測序后,通過條形碼將不同區(qū)域的測序結果,映射到對應的組織位置上,拼貼形成組織樣品的空間轉錄組圖像。濟南高通量測序空間轉錄組多組學測序
上海烈冰生物醫(yī)藥科技有限公司位于江月路999號奇亞特中心22幢。公司業(yè)務分為單細胞測序,生物大數據云分析平臺,空間轉錄組測序,單細胞多組學測序等,目前不斷進行創(chuàng)新和服務改進,為客戶提供良好的產品和服務。公司將不斷增強企業(yè)重點競爭力,努力學習行業(yè)知識,遵守行業(yè)規(guī)范,植根于醫(yī)藥健康行業(yè)的發(fā)展。烈冰生物秉承“客戶為尊、服務為榮、創(chuàng)意為先、技術為實”的經營理念,全力打造公司的重點競爭力。