廣州烈冰科技空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)支持

來源: 發(fā)布時(shí)間:2022-08-14

所謂的高通量測(cè)序技術(shù),又名大規(guī)模平行測(cè)序,是將DNA(或者cDNA)隨機(jī)片段化、加接頭,制備測(cè)序文庫(kù),通過對(duì)文庫(kù)中數(shù)以萬計(jì)的克隆(colony)進(jìn)行延伸反應(yīng),檢測(cè)對(duì)應(yīng)的信號(hào)并獲取序列信息。與傳統(tǒng)測(cè)序法相比,高通量測(cè)序技術(shù)在處理大規(guī)模樣品時(shí)具有強(qiáng)大的優(yōu)勢(shì),又快(兩天)又多(數(shù)百萬克?。?,成為目前組學(xué)研究的主要技術(shù)??臻g轉(zhuǎn)錄組測(cè)序是一個(gè)系統(tǒng)的工程,開展項(xiàng)目前您可能會(huì)先評(píng)估它提供的見解是否與您的研究問題相匹配,如果匹配,實(shí)驗(yàn)過程如何規(guī)劃,實(shí)驗(yàn)平臺(tái)如何選擇,樣本如何制備,數(shù)據(jù)如何分析等等,而在這一切開始之前,我們的服務(wù)就已經(jīng)開始了,從銷售到實(shí)驗(yàn)到專業(yè)技術(shù)支持,我們開通全線對(duì)接渠道,幫助您快速定位項(xiàng)目訴求,提供從實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)到文章發(fā)表的全流程,我們始終是您貼心的科學(xué)合作伙伴??臻g轉(zhuǎn)錄組測(cè)序以分子方式定義病理,完成了病理數(shù)字化結(jié)合病理影像化的革新。廣州烈冰科技空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)支持

其實(shí),空間轉(zhuǎn)錄組的概念早就已經(jīng)存在了,目前已經(jīng)發(fā)表的空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)有Slide-seq,LCM-seq,seqFISH,MERFISH,Liversinglecellzonation,Geo-seqandTomo-seq。但是這些方法存在操作復(fù)雜、檢測(cè)精度不準(zhǔn)確、基因和細(xì)胞檢測(cè)量的限制等問題。10xGenomics公司升級(jí)spatialTranscriptomic后推出的Visium空間基因表達(dá)解決方案是一款商業(yè)化的高精度、高通量空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序方案。烈冰科技自2020年起,國(guó)內(nèi)率先搭建空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序服務(wù)平臺(tái),聯(lián)合上線單細(xì)胞核轉(zhuǎn)錄組測(cè)序、AbSeq、單細(xì)胞TCR-Seq、單細(xì)胞ATAC-Seq(ARCHR測(cè)序)、空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序產(chǎn)品結(jié)合scRNA-Seq服務(wù),多組學(xué)聯(lián)合助力科研人員探索時(shí)空等多維度、多角度的動(dòng)態(tài)變化的生物學(xué)信息。烈冰生物為您提供貼心的單細(xì)胞研究完整解決方案!溫州上海烈冰生物空間轉(zhuǎn)錄組多組學(xué)測(cè)序十二年測(cè)序經(jīng)驗(yàn),累計(jì)服務(wù)與5000余項(xiàng)重要科研項(xiàng)目。

10x Genomics空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序技術(shù)通過將組織切片的高通量mRNA分析和形態(tài)學(xué)背景整合,使基因表達(dá)譜可以被定位回它們的原始空間位置。傳統(tǒng)的空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序技術(shù)局限于冰凍組織切片。10x Genomics推出全新的針對(duì)FFPE樣本的Visium空間基因表達(dá)解決方案,該技術(shù)打破從FFPE組織樣本中獲取空間全部轉(zhuǎn)錄組基因表達(dá)信息的壁壘,能夠從FFPE樣本中獲取高靈敏度、高特異性的相關(guān)基因的表達(dá)信息,在形態(tài)學(xué)背景下實(shí)現(xiàn)真正的探索發(fā)現(xiàn),進(jìn)一步擴(kuò)展空間生物學(xué)的可能性。

在轉(zhuǎn)錄組學(xué)領(lǐng)域,空間轉(zhuǎn)錄組也開辟了新世界。Nature Methods在今年1月份將空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)評(píng)價(jià)為2020年度方法,空間轉(zhuǎn)錄組方法近幾年越來越受到歡迎,它將帶領(lǐng)組學(xué)在生物學(xué)的研究上進(jìn)入新的階段。從轉(zhuǎn)錄組測(cè)序到實(shí)現(xiàn)單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄測(cè)序,這一過程為精確認(rèn)識(shí)不同細(xì)胞類型提供了巨大的幫助?,F(xiàn)在,新的空間轉(zhuǎn)錄組方法不僅帶來轉(zhuǎn)錄組信息,同時(shí)還提供空間信息,幫研究者更好辨別轉(zhuǎn)錄的位置,進(jìn)一步擴(kuò)展到單細(xì)胞分辨率,這會(huì)更大程度提升科學(xué)家對(duì)單個(gè)細(xì)胞的認(rèn)識(shí)和解讀。國(guó)產(chǎn)化PanoCell空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序平臺(tái),提供高性價(jià)比服務(wù)方案。

當(dāng)組織冷凍切片附在帶有spatialbarcode的空間轉(zhuǎn)錄組芯片上時(shí),通過透化處理,細(xì)胞內(nèi)的mRNA釋放出來,從而被芯片上帶有oligo-dT的探針捕獲。被捕獲的mRNA開始逆轉(zhuǎn)錄,得到的cDNA中包含了spatialbarcode序列。通過上機(jī)測(cè)序,可以將每個(gè)mRNA轉(zhuǎn)錄的序列映射回組織切片中的映射回組織切片中的原始位置。Visium空間轉(zhuǎn)錄組的重點(diǎn)在于芯片部分:正式文庫(kù)構(gòu)建的芯片上有4個(gè)捕獲區(qū)域(6.5mmX6.5mm,可以檢測(cè)4個(gè)樣本)每個(gè)捕獲區(qū)域含有約5000個(gè)被條形碼標(biāo)記的點(diǎn)(barcodedspots)每個(gè)spot直徑55μm,每個(gè)spot能捕獲1-10個(gè)細(xì)胞spot與spot中心點(diǎn)之間的距離為100μm每個(gè)spot含有上百萬個(gè)可以與mRNA結(jié)合的捕獲探針,每個(gè)探針上都帶有獨(dú)特的spatialbarcodes,用以標(biāo)記捕獲的mRNA的空間位置。ATCG堿基的排列組合構(gòu)成了測(cè)序的龐大世界。廈門空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析可視化

測(cè)序的革新讓科學(xué)研究從個(gè)體基因差異逐漸轉(zhuǎn)為個(gè)體細(xì)胞的基因差異。廣州烈冰科技空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)支持

高通量測(cè)序技術(shù)(High-throughputsequencing)又稱“下一代”測(cè)序技術(shù)(“Next-generation”sequencing),以能一次并行對(duì)幾十萬到幾百萬條DNA分子進(jìn)行序列測(cè)定和一般讀長(zhǎng)較短等為標(biāo)志。高通量測(cè)序技術(shù)是對(duì)傳統(tǒng)測(cè)序一次顛覆性的改變,一次對(duì)幾十萬到幾百萬條DNA分子進(jìn)行序列測(cè)定,因此在有些文獻(xiàn)中稱其為下一代測(cè)序技術(shù)(nextgenerationsequencing)足見其劃時(shí)代的改變,同時(shí)高通量測(cè)序使得對(duì)一個(gè)物種的轉(zhuǎn)錄組和基因組進(jìn)行細(xì)致全貌的分析成為可能,所以又被稱為深度測(cè)序(deepsequencing)。而烈冰科技具有專業(yè)生物背景和十二年科研服務(wù)經(jīng)驗(yàn),已助力Nature,immunity等在內(nèi)的300+篇CNS文章發(fā)表。廣州烈冰科技空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)支持

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