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單細胞測序技術(shù)是一種在單細胞水平上對基因組、轉(zhuǎn)錄組、表觀組等進行高通量測序分析的技術(shù)。單細胞測序技術(shù)能夠在組學水平揭示細胞間的異質(zhì)性。單細胞水平細胞譜系追蹤技術(shù)位居2018年Science 雜志評選的科學突破。常規(guī)單細胞轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)丟失了細胞在原組織中至關(guān)重要的空間位置信息,而單細胞空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)在進行單細胞轉(zhuǎn)錄組測序的同時保留并記錄了細胞的空間位置信息。空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)能夠揭示細胞間的相互作用以及細胞所處的微環(huán)境,將成為發(fā)育生物學、神經(jīng)生物學、免疫生物學等領(lǐng)域的研究利器??臻g轉(zhuǎn)錄組測序以分子方式定義病理,完成了病理數(shù)字化結(jié)合病理影像化的革新。武漢BD Rhapsody空間轉(zhuǎn)錄組平臺
相比于常規(guī)的測序手段,空間轉(zhuǎn)錄組測序有幾個明顯的優(yōu)勢:1.將轉(zhuǎn)錄組信息與空間信息對應(yīng),體現(xiàn)組織內(nèi)部的異質(zhì)性:每個區(qū)域獨特的條形碼使測序結(jié)果與空間位置形成一一對應(yīng)關(guān)系。雖然暫時還無法精細到單細胞層面,但是這樣的區(qū)域劃分也已經(jīng)足以展現(xiàn)出組織內(nèi)部不同區(qū)域間的轉(zhuǎn)錄組差異。2.不影響對全組織進行分析:芯片上捕獲的全轉(zhuǎn)錄組在同一個反應(yīng)中完成測序,能有效降低多次重復實驗中的誤差。測序結(jié)果如果不按照條形碼歸類,則直接體現(xiàn)的是切片全組織的轉(zhuǎn)錄組情況,無需再做單獨檢測。3.為進一步的研究提供指導意見:常規(guī)的轉(zhuǎn)錄組測序,對后續(xù)實驗的指導仍然停留在全組織層面。而空間轉(zhuǎn)錄組測序則可以標識出更有價值的研究區(qū)域,引導研究者將組織進一步細分。烈冰生物空間轉(zhuǎn)錄組服務(wù)機構(gòu)十二年測序經(jīng)驗,烈冰生物空間轉(zhuǎn)錄組領(lǐng)域的佼佼者。
機體為響應(yīng)各種應(yīng)激,其細胞會從一種功能“狀態(tài)”轉(zhuǎn)變?yōu)榱硪环N功能“狀態(tài)”;當細胞在不同狀態(tài)之間轉(zhuǎn)變時,往往會經(jīng)歷轉(zhuǎn)錄重組,導致一些基因被“沉默”,一些基因被重新“喚醒”,但純化這些瞬態(tài)細胞進行研究是很困難或不可能的;scRNA-seq擬時序分析可以讓我們在不需要純化的情況下查看這些細胞狀態(tài)。擬時序分析,即根據(jù)不同細胞亞群基因表達量隨時間的變化情況,構(gòu)建細胞譜系發(fā)育,但這里的時間并不是真時間,而是一個虛擬的時間,是指的細胞與細胞之間的轉(zhuǎn)化和演替的順序和軌跡。即使在同一個樣本中,也會存在多種不同的細胞形態(tài)。因此,不論測定了多少樣本,我們都可以采用擬時序分析對樣本中的細胞轉(zhuǎn)化和變化進行描述。
烈冰科技作為國內(nèi)同時擁有10XGenomics和BDRhapsody雙分選平臺的測序服務(wù)商及云計算服務(wù)供應(yīng)商,經(jīng)過多年實戰(zhàn),擁有豐富的單細胞懸液制備和分選經(jīng)驗,實測BDRhapsody對能夠高效捕獲粒細胞。針對不同的分選平臺、建庫方法,實戰(zhàn)總結(jié)搭建出不同的數(shù)據(jù)預處理工作流程;烈冰科技NovelBrain®生物大數(shù)據(jù)平臺能有效支撐生命科學研究、醫(yī)療健康等領(lǐng)域?qū)Υ髷?shù)據(jù)分析的需求。完備的高通量測序?qū)嶒炂脚_,包括NovaSeq6000、10XChromiumX、BDFACSMelody、PANNORAMIC數(shù)字切片掃描儀等,配合一支來自海內(nèi)外名校、多學科交叉型的高素質(zhì)綜合團隊,為您的科學研究保駕護航??臻g轉(zhuǎn)錄組可展示組織切片中不同區(qū)域的基因表達情況,揭示精細病理區(qū)域的信號通路。
烈冰生物真正實現(xiàn)空間轉(zhuǎn)錄組測序的全程把控,做到從實驗設(shè)計、空間信息標記、建庫測序、定制化分析的全流程一站式服務(wù),助力高分文章發(fā)表;專業(yè)實驗團隊保證樣本的高度一致性;專業(yè)的生物學團隊提供個性化的產(chǎn)品應(yīng)用場景解讀、保持對生物學意義的關(guān)注;強大的生信分析團隊一對一地進行詳實科學的實驗方案設(shè)計并提供多次售后分析;可接受樣品類別為冰凍組織:新鮮樣本經(jīng)液氮預冷的異戊烷速凍,-80℃保存OCT包埋組織:新鮮組織異戊烷速凍后進行OCT包埋,或新鮮組織直接OCT包埋后-80℃速凍,注意標明樣本方向,樣本于-80℃保存樣本處理和運輸過程需要在低溫環(huán)境全線搭建10x Genomics空間轉(zhuǎn)錄組測序平臺。廈門scRNA空間轉(zhuǎn)錄組測序服務(wù)
烈冰智造空間轉(zhuǎn)錄組細胞捕獲,媲美國際主流的單細胞平臺。武漢BD Rhapsody空間轉(zhuǎn)錄組平臺
冰凍切片的空間轉(zhuǎn)錄組測序在RNA捕獲、文庫構(gòu)建方面,需要將組織切片貼合在帶有mRNA結(jié)合捕獲探針的載玻片上,通過甲醛固定、H&E染色得到組織切片的形態(tài)結(jié)構(gòu)。再進行透化處理,使細胞中的mRNA釋放,并結(jié)合到芯片相鄰的捕獲探針上。將捕獲的mRNA反轉(zhuǎn)錄合成cDNA并構(gòu)建測序文庫進行上機測序,從而獲取基因表達信息??傮w來說,空間轉(zhuǎn)錄組的實驗流程包括:組織凍存-OCT包埋-冷凍切片-固定染色-組織透化-cDNA合成及建庫-上機測序,而需要客戶進行樣本準備的步驟相對簡單:組織凍存與OCT包埋。武漢BD Rhapsody空間轉(zhuǎn)錄組平臺
上海烈冰生物醫(yī)藥科技有限公司是一家生物科技、醫(yī)藥科技、信息科技、計算機科技領(lǐng)域內(nèi)的技術(shù)開發(fā)、技術(shù)服務(wù)、技術(shù)轉(zhuǎn)讓、技術(shù)咨詢,市場營銷策劃,市場信息咨詢與調(diào)查(不得從事社會調(diào)查、社會調(diào)研、民意調(diào)查、民意測驗),從事貨物及技術(shù)的進出口業(yè)務(wù),計算機、軟件及耗材(除??兀浖_發(fā)【依法須經(jīng)批準的項目,經(jīng)相關(guān)部門批準后方可開展經(jīng)營活動】的公司,致力于發(fā)展為創(chuàng)新務(wù)實、誠實可信的企業(yè)。烈冰生物擁有一支經(jīng)驗豐富、技術(shù)創(chuàng)新的專業(yè)研發(fā)團隊,以高度的專注和執(zhí)著為客戶提供單細胞測序,生物大數(shù)據(jù)云分析平臺,空間轉(zhuǎn)錄組測序,單細胞多組學測序。烈冰生物不斷開拓創(chuàng)新,追求出色,以技術(shù)為先導,以產(chǎn)品為平臺,以應(yīng)用為重點,以服務(wù)為保證,不斷為客戶創(chuàng)造更高價值,提供更優(yōu)服務(wù)。烈冰生物始終關(guān)注醫(yī)藥健康市場,以敏銳的市場洞察力,實現(xiàn)與客戶的成長共贏。