北京BD空間轉(zhuǎn)錄組商業(yè)化服務(wù)

來源: 發(fā)布時間:2022-08-09

10x Genomics空間轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)通過將組織切片的高通量mRNA分析和形態(tài)學背景整合,使基因表達譜可以被定位回它們的原始空間位置。傳統(tǒng)的空間轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)局限于冰凍組織切片。10x Genomics推出全新的針對FFPE樣本的Visium空間基因表達解決方案,該技術(shù)打破從FFPE組織樣本中獲取空間全部轉(zhuǎn)錄組基因表達信息的壁壘,能夠從FFPE樣本中獲取高靈敏度、高特異性的相關(guān)基因的表達信息,在形態(tài)學背景下實現(xiàn)真正的探索發(fā)現(xiàn),進一步擴展空間生物學的可能性。經(jīng)驗豐富的實驗團隊,為獲得示組織內(nèi)真實表達水平的高質(zhì)量冷凍切片提供硬件和技術(shù)保障。北京BD空間轉(zhuǎn)錄組商業(yè)化服務(wù)

烈冰提供空間轉(zhuǎn)錄組全流程服務(wù),包括樣本包埋、貼片、選片、HE染色、拍照成像、組織透化、建庫測序以及后續(xù)的FISH驗證等各個步驟,為您提供無憂服務(wù)。烈冰搭建了以萊卡CM1950冷凍切片機、尼康多熒光通路全自動掃描顯微鏡、3Dhistech-midi數(shù)字掃描儀為基礎(chǔ)的先進實驗平臺,并制定嚴格規(guī)范的實驗室SOP,經(jīng)過大量的切片、貼片實操演練,對不同類型組織的切片厚度、溫度進行優(yōu)化,確保獲得更好質(zhì)量的冷凍切片。利用NovelBrain云分析平臺,搭建0代碼需求的空間轉(zhuǎn)錄組分析流程,準確快速解析空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)。取同一樣本組織的相鄰區(qū)域進行單細胞轉(zhuǎn)錄組測序,通過單細胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)和空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)的整合分析,判定空間區(qū)域內(nèi)的細胞類別,精確解析組織空間內(nèi)的異質(zhì)化信息。武漢BD Rhapsody空間轉(zhuǎn)錄組平臺測序可準確地分析基因表達差異、基因結(jié)構(gòu)變異、篩選分子標記(SNPs或SSR)等生命科學重要問題。

冰凍切片的空間轉(zhuǎn)錄組測序在RNA捕獲、文庫構(gòu)建方面,需要將組織切片貼合在帶有mRNA結(jié)合捕獲探針的載玻片上,通過甲醛固定、H&E染色得到組織切片的形態(tài)結(jié)構(gòu)。再進行透化處理,使細胞中的mRNA釋放,并結(jié)合到芯片相鄰的捕獲探針上。將捕獲的mRNA反轉(zhuǎn)錄合成cDNA并構(gòu)建測序文庫進行上機測序,從而獲取基因表達信息。總體來說,空間轉(zhuǎn)錄組的實驗流程包括:組織凍存-OCT包埋-冷凍切片-固定染色-組織透化-cDNA合成及建庫-上機測序,而需要客戶進行樣本準備的步驟相對簡單:組織凍存與OCT包埋。

解決空間轉(zhuǎn)錄組測序數(shù)據(jù)分析中由于超大數(shù)據(jù)量、超高的質(zhì)控要求以及繁多分析需求而引起的分析困難,做到快速可定制化完成空間轉(zhuǎn)錄組分析;擁有行業(yè)先進的3DHISTECH公司的PANNORAMIC系列的數(shù)字切片掃描儀,可以同時實現(xiàn)明場與熒光場下冷凍切片的快速掃描成像;Z-Stack多層聚焦掃描及Extended Focus 景深擴展多層融合掃描模式,進一步提升分辨率和清晰度,保證切片高分辨的數(shù)字圖像信息精細采集;能夠滿足針對分析結(jié)果中感興趣基因的RNA-FISH驗證以及組織切片的免疫組化的高清成像,獲取表達與定位信息。搭建多種測序數(shù)據(jù)的生物信息分析平臺,5000+項目檢驗,真實可信賴。

空間轉(zhuǎn)錄組測序是在組織原位檢測全轉(zhuǎn)錄組基因表達的?種技術(shù),可以展?組織切?中不同區(qū)域的基因表達情況,同時能夠得到?的基因在組織內(nèi)部的空間位置信息。與傳統(tǒng)的全基因轉(zhuǎn)錄組或單細胞轉(zhuǎn)錄組測序相?,空間轉(zhuǎn)錄組測序漿病理影像(H&E染?)與測序數(shù)據(jù)映射在?起,進?可以分析組織切內(nèi)部空間結(jié)構(gòu)的細胞異質(zhì)性。常規(guī)單細胞轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)丟失了細胞在原組織中至關(guān)重要的空間位置信息,而單細胞空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)在進行單細胞轉(zhuǎn)錄組測序的同時保留并記錄了細胞的空間位置信息??臻g轉(zhuǎn)錄組技術(shù)能夠揭示細胞間的相互作用以及細胞所處的微環(huán)境,將成為發(fā)育生物學、神經(jīng)生物學、免疫生物學等領(lǐng)域的研究利器??臻g轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)遍地開花,烈冰服務(wù)讓您的生物醫(yī)學研究如虎添翼。高通量測序空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)支持

附加流式分選細胞表面Marker,對于較低分辨率的標志物也能有效鑒定,助力高要求測序項目。北京BD空間轉(zhuǎn)錄組商業(yè)化服務(wù)

空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)流程:1、組織優(yōu)化由于不同物種、組織來源的樣本所需的比較好透化時間不盡相同,在正式開展空間轉(zhuǎn)錄組測序?qū)嶒炃?,需要利用組織優(yōu)化kit進行條件的摸索。組織優(yōu)化芯片上包含8個捕獲區(qū)域,每個區(qū)域均覆蓋了熒光標記探針,可捕獲mRNA形成帶有熒光標簽的cDNA,隨即可通過熒光成像結(jié)果判定比較好透化時間及組織優(yōu)化條件。2、空間轉(zhuǎn)錄組測序確定組織優(yōu)化條件后,即可進行切片、H&E染色及成像、空間轉(zhuǎn)錄組文庫構(gòu)建及測序分析流程。北京BD空間轉(zhuǎn)錄組商業(yè)化服務(wù)

上海烈冰生物醫(yī)藥科技有限公司位于江月路999號奇亞特中心22幢,擁有一支專業(yè)的技術(shù)團隊。NovelBio,烈冰生物,NovelBrain,PanoCell,烈冰智造是上海烈冰生物醫(yī)藥科技有限公司的主營品牌,是專業(yè)的生物科技、醫(yī)藥科技、信息科技、計算機科技領(lǐng)域內(nèi)的技術(shù)開發(fā)、技術(shù)服務(wù)、技術(shù)轉(zhuǎn)讓、技術(shù)咨詢,市場營銷策劃,市場信息咨詢與調(diào)查(不得從事社會調(diào)查、社會調(diào)研、民意調(diào)查、民意測驗),從事貨物及技術(shù)的進出口業(yè)務(wù),計算機、軟件及耗材(除??兀浖_發(fā)【依法須經(jīng)批準的項目,經(jīng)相關(guān)部門批準后方可開展經(jīng)營活動】公司,擁有自己**的技術(shù)體系。我公司擁有強大的技術(shù)實力,多年來一直專注于生物科技、醫(yī)藥科技、信息科技、計算機科技領(lǐng)域內(nèi)的技術(shù)開發(fā)、技術(shù)服務(wù)、技術(shù)轉(zhuǎn)讓、技術(shù)咨詢,市場營銷策劃,市場信息咨詢與調(diào)查(不得從事社會調(diào)查、社會調(diào)研、民意調(diào)查、民意測驗),從事貨物及技術(shù)的進出口業(yè)務(wù),計算機、軟件及耗材(除??兀?,軟件開發(fā)【依法須經(jīng)批準的項目,經(jīng)相關(guān)部門批準后方可開展經(jīng)營活動】的發(fā)展和創(chuàng)新,打造高指標產(chǎn)品和服務(wù)。自公司成立以來,一直秉承“以質(zhì)量求生存,以信譽求發(fā)展”的經(jīng)營理念,始終堅持以客戶的需求和滿意為重點,為客戶提供良好的單細胞測序,生物大數(shù)據(jù)云分析平臺,空間轉(zhuǎn)錄組測序,單細胞多組學測序,從而使公司不斷發(fā)展壯大。