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高通量測序技術(High-throughputsequencing)又稱“下一代”測序技術(“Next-generation”sequencing),以能一次并行對幾十萬到幾百萬條DNA分子進行序列測定和一般讀長較短等為標志。高通量測序技術是對傳統(tǒng)測序一次顛覆性的改變,一次對幾十萬到幾百萬條DNA分子進行序列測定,因此在有些文獻中稱其為下一代測序技術(nextgenerationsequencing)足見其劃時代的改變,同時高通量測序使得對一個物種的轉錄組和基因組進行細致全貌的分析成為可能,所以又被稱為深度測序(deepsequencing)。而烈冰科技具有專業(yè)生物背景和十二年科研服務經(jīng)驗,已助力Nature,immunity等在內的300+篇CNS文章發(fā)表。搭建多種測序數(shù)據(jù)的生物信息分析平臺,5000+項目檢驗,真實可信賴。蘇州10X Chromium X單細胞測序平臺
RNA測序(RNA-seq)或芯片分析等大量樣本的轉錄組學方法作為一類強大的工具,可提供混合樣本的基因表達平均數(shù)據(jù),幫助科學家開始揭示這種異質性。隨后,技術創(chuàng)新的飛躍在單細胞技術上達到新高度——使得科學家能夠定義細胞類型特異的基因表達,從過去的平均數(shù)據(jù)中分辨出真正驅動其表達模式的細胞異質性。這讓研究人員能夠更詳細地表征組織異質性,鑒定稀有細胞類型,并逐個細胞地仔細分析其分子機制。當獲得了對其研究的生物系統(tǒng)更為真實的圖譜后,研究人員就有了更為堅實可靠的知識基礎,并能在這個基礎上規(guī)劃下一步實驗,以獲取更深入的可行動見解。北京高通量測序單細胞測序平臺單細胞測序是高通量測序下的又一重大技術突破。
單細胞獲得困難,不同組織要求不盡相同難以搞定?烈冰2000+項目消化經(jīng)驗,100+組織類型解離protocol,精心設計不同組織實驗的解離、細胞懸浮實驗體系,確保單細胞的獲得。凍存樣本無法實驗,珍貴樣本無法使用?烈冰采用國際認可的凍存組織復蘇技術以及死細胞過濾技術,確保凍存組織使用。珍貴樣本,細胞數(shù)量太少,消化背景雜無法做單細胞?采用國際認可的10XGenomics,BDRhapsody雙平臺模式,根據(jù)樣本實際情況和用戶需求提供客觀有效的實驗方案,細胞量少,背景雜也能做單細胞。單細胞RNA分類精度不足,部分細胞無法細分?烈冰同時采用單細胞蛋白質組與單細胞轉錄組測序技術,真正做到從上游到下游的全流程檢測,確保超高的細胞分類精度。
基于10XGeomics動態(tài)微流控技術,利用Tn5轉座酶酶切開放染色質,形成短片段,單細胞ATAC測序在表觀基因組學水平上,揭示單細胞染色質的可及性問題,區(qū)分細胞異質性,獲得開放染色質的位置、轉錄因子的結合位點、核小體的調控區(qū)域和染色質狀態(tài)等信息,是單細胞表觀遺傳學的重要突破:分析每個細胞數(shù)千個獨特的染色質開放區(qū)域,識別細胞類型和細胞狀態(tài);識別重要的轉錄因子,進行譜系和發(fā)育追蹤;探究驅動細胞類型和狀態(tài)之間基因表達差異的非編碼序列;探究細胞類型特異性和基因調控網(wǎng)絡特征等。是當前重要的多組學研究基因表達和表觀遺傳學的手段。單個細胞的基因結構和基因表達狀態(tài),并鑒定細胞的類型。
科研的魅力之處,在于無窮盡的探尋生命的本底,通過單細胞測序,我們對組織的分子基礎的研究也從初級到深層,并在單細胞層面逐漸達成一致,那么不禁要問一句,組織的空間位置到底重不重要?空間異質性是功能的關鍵特征,細胞的位置信息更能反應細胞命運調控機制和細胞譜系發(fā)生過程。因此時間和空間即像組織的AB面,而不可否認的是,此時空間坐標的記錄,像一個還未長大的娃娃,雖未觸及分子基礎研究的深層,但仍在努力攀登探尋生命本底的下一個高峰。烈冰單細胞多組學測序助您探究細胞類型特異性和基因調控網(wǎng)絡特征。福州10X Chromium X單細胞測序
烈冰生物成立于2010年,專注于單細胞測序領域科研服務。蘇州10X Chromium X單細胞測序平臺
針對單細胞測序的細胞上樣數(shù),為什么不建議捕獲到的細胞數(shù)量越高越好?一味地追求高數(shù)量的細胞捕獲可能會存在一些問題。例如在上機細胞懸液濃度固定時,如果目標細胞捕獲數(shù)增加到8000甚至10000,上樣細胞懸液體積勢必增加,在細胞懸液質量不是很理想(細胞活性5%、結團率均>5%)的情況下,引入的背景信號會增加,分析結果不理想的直接體現(xiàn)包括:cell、non-cell無法有效區(qū)分和Fractionreadsincells偏低。當cell和non-cell無法有效區(qū)分時,會使得數(shù)據(jù)出現(xiàn)假陽性和假陰性結果!當目標細胞捕獲數(shù)很大時,多細胞率會增加,數(shù)據(jù)分析時,此部分“cell”表現(xiàn)為基因檢測數(shù)和UMI檢測數(shù)是正常cell的N倍(N是一個GEM包裹的細胞數(shù)),導致所有細胞的統(tǒng)計數(shù)據(jù)(單個細胞基因檢測中位數(shù)、單個細胞UMI檢測中位數(shù))虛高。此部分“cell”雖然可以通過設置數(shù)據(jù)分析閾值進行過濾,但是容易會有此類數(shù)據(jù)的殘留和正常高基因檢測細胞的人為去除!蘇州10X Chromium X單細胞測序平臺
上海烈冰生物醫(yī)藥科技有限公司是一家生物科技、醫(yī)藥科技、信息科技、計算機科技領域內的技術開發(fā)、技術服務、技術轉讓、技術咨詢,市場營銷策劃,市場信息咨詢與調查(不得從事社會調查、社會調研、民意調查、民意測驗),從事貨物及技術的進出口業(yè)務,計算機、軟件及耗材(除??兀浖_發(fā)【依法須經(jīng)批準的項目,經(jīng)相關部門批準后方可開展經(jīng)營活動】的公司,致力于發(fā)展為創(chuàng)新務實、誠實可信的企業(yè)。烈冰生物擁有一支經(jīng)驗豐富、技術創(chuàng)新的專業(yè)研發(fā)團隊,以高度的專注和執(zhí)著為客戶提供單細胞測序,生物大數(shù)據(jù)云分析平臺,空間轉錄組測序,單細胞多組學測序。烈冰生物始終以本分踏實的精神和必勝的信念,影響并帶動團隊取得成功。烈冰生物始終關注醫(yī)藥健康市場,以敏銳的市場洞察力,實現(xiàn)與客戶的成長共贏。