西安10X Chromium X單細胞測序平臺

來源: 發(fā)布時間:2022-08-07

針對單細胞測序數(shù)據(jù)分析時的reads數(shù)、基因表達量及細胞數(shù)量判定過程中:以捕獲5000個細胞、100G的測序量為標準,每個細胞的reads數(shù)大約在50k左右;每個細胞的基因中位數(shù)取決于樣本的細胞類型,例如成熟的B,T,粒細胞數(shù)量較多的組織中,由于該類型細胞表達的基因數(shù)普遍較少,導致基因中位數(shù)下降。而某些疾病組織、或者體外培養(yǎng)的如干細胞等,他們的基因表達數(shù)較高,甚至可以超過1W,這就導致該類樣本基因中位數(shù)非常高。因此,我們對細胞數(shù)量以及基因中位數(shù)確認時,需要考察實際組織的細胞組成。十二年測序經(jīng)驗,烈冰生物單細胞多組學領(lǐng)域的佼佼者。西安10X Chromium X單細胞測序平臺

高通量測序技術(shù)(High-throughputsequencing)又稱“下一代”測序技術(shù)(“Next-generation”sequencing),以能一次并行對幾十萬到幾百萬條DNA分子進行序列測定和一般讀長較短等為標志。高通量測序技術(shù)是對傳統(tǒng)測序一次顛覆性的改變,一次對幾十萬到幾百萬條DNA分子進行序列測定,因此在有些文獻中稱其為下一代測序技術(shù)(nextgenerationsequencing)足見其劃時代的改變,同時高通量測序使得對一個物種的轉(zhuǎn)錄組和基因組進行細致全貌的分析成為可能,所以又被稱為深度測序(deepsequencing)。而烈冰科技具有專業(yè)生物背景和十二年科研服務經(jīng)驗,已助力Nature,immunity等在內(nèi)的300+篇CNS文章發(fā)表。單細胞測序商業(yè)化服務烈冰測序數(shù)據(jù)分析平臺,不依賴已有物種信息,可研究非模式物種,針對不同平臺的數(shù)據(jù),制定多套流程;

10X Genomics單細胞轉(zhuǎn)錄組測序是利用單細胞水平上的高通量測序分析基因表達譜的技術(shù),也是目前國內(nèi)和國際上公認的單細胞測序大規(guī)模實驗平臺技術(shù),該平臺基于動態(tài)微流控原理,突破傳統(tǒng)高通量測序的局限性,組織解離后,單個樣本一次上機能捕獲500-20000個細胞, 基于每個細胞分別建庫測序,獲得單個細胞的基因結(jié)構(gòu)和基因表達狀態(tài),并鑒定細胞的類型,可以在不同樣本間從細胞類型的組成和豐度角度進行比較,反映細胞間的異質(zhì)性,提供足夠靈活的定制測定法以滿足多種實驗需要,并有效縮短實驗是時間和降低測序成本。

單細胞多組學提升見解基于測序的數(shù)據(jù)能夠?qū)⒄蔑@其強大之處,因為它能夠了解同一單細胞的多種生物分析指標。如果說單細胞基因表達提供了一種顏色的詳細信息,那么單細胞多組學提供了同一細節(jié)的全彩色圖譜,為您帶來樣本的真實視圖。烈冰2021年強勢引進的10xGenomicsChromium單細胞平臺能夠從同一單細胞中讀取細胞復雜性的多組學特征。與傳統(tǒng)方法不同,單細胞多組學簡化了您需要開展的實驗,也節(jié)省了您需要分析的樣本,而能獲得相同的結(jié)果。這不但節(jié)省了寶貴的樣本,還保證了更高的生物學準確性,因為您不需要匹配拆分樣本的數(shù)據(jù)集并通過計算來推斷各個組學之間的關(guān)系。烈冰科技已建立了多種國際和國內(nèi)主流的高通量測序?qū)嶒炂脚_。

基于10XGeomics動態(tài)微流控技術(shù),利用Tn5轉(zhuǎn)座酶酶切開放染色質(zhì),形成短片段,單細胞ATAC測序在表觀基因組學水平上,揭示單細胞染色質(zhì)的可及性問題,區(qū)分細胞異質(zhì)性,獲得開放染色質(zhì)的位置、轉(zhuǎn)錄因子的結(jié)合位點、核小體的調(diào)控區(qū)域和染色質(zhì)狀態(tài)等信息,是單細胞表觀遺傳學的重要突破:分析每個細胞數(shù)千個獨特的染色質(zhì)開放區(qū)域,識別細胞類型和細胞狀態(tài);識別重要的轉(zhuǎn)錄因子,進行譜系和發(fā)育追蹤;探究驅(qū)動細胞類型和狀態(tài)之間基因表達差異的非編碼序列;探究細胞類型特異性和基因調(diào)控網(wǎng)絡特征等。是當前重要的多組學研究基因表達和表觀遺傳學的手段。搭建多種測序數(shù)據(jù)的生物信息分析平臺,5000+項目檢驗,真實可信賴。廣州高通量測序單細胞測序服務

單細胞測序平臺,烈冰提供高性價比服務方案。西安10X Chromium X單細胞測序平臺

樣本制備后的保存為了盡可能地減少轉(zhuǎn)錄組的變化,在對細胞進行清洗和計數(shù)后,單細胞懸液應當保存于冰上,直至用于后續(xù)的上機和文庫制備步驟。在理想狀況下,一旦制備好樣本,應當在3min鐘內(nèi)將其用于下游步驟。然而,您還有必要了解各類細胞的不同性質(zhì),因為這可能會影響細胞應在冰上保存的時間,以及它們在制備后多久便應當被盡快使用。例如,有些細胞(如PBMC)如果在冰上放置一段時間,它們就開始形成團塊。這些團塊很難解離,增加了堵塞的風險,而且每個團塊被當成單細胞計數(shù),又降低了細胞計數(shù)的準確性。此外,有些細胞更加粘稠,形成團塊的速度更快。對于這些細胞,必須盡量減少制備和使用之間的時間差西安10X Chromium X單細胞測序平臺

上海烈冰生物醫(yī)藥科技有限公司致力于醫(yī)藥健康,是一家服務型的公司。烈冰生物致力于為客戶提供良好的單細胞測序,生物大數(shù)據(jù)云分析平臺,空間轉(zhuǎn)錄組測序,單細胞多組學測序,一切以用戶需求為中心,深受廣大客戶的歡迎。公司將不斷增強企業(yè)重點競爭力,努力學習行業(yè)知識,遵守行業(yè)規(guī)范,植根于醫(yī)藥健康行業(yè)的發(fā)展。在社會各界的鼎力支持下,持續(xù)創(chuàng)新,不斷鑄造高質(zhì)量服務體驗,為客戶成功提供堅實有力的支持。