西安10X Chromium X單細(xì)胞測(cè)序數(shù)據(jù)分析

基于10XGeomics動(dòng)態(tài)微流控技術(shù)，利用Tn5轉(zhuǎn)座酶酶切開(kāi)放染色質(zhì)，形成短片段，單細(xì)胞ATAC測(cè)序在表觀基因組學(xué)水平上，揭示單細(xì)胞染色質(zhì)的可及性問(wèn)題，區(qū)分細(xì)胞異質(zhì)性，獲得開(kāi)放染色質(zhì)的位置、轉(zhuǎn)錄因子的結(jié)合位點(diǎn)、核小體的調(diào)控區(qū)域和染色質(zhì)狀態(tài)等信息，是單細(xì)胞表觀遺傳學(xué)的重要突破：分析每個(gè)細(xì)胞數(shù)千個(gè)獨(dú)特的染色質(zhì)開(kāi)放區(qū)域，識(shí)別細(xì)胞類(lèi)型和細(xì)胞狀態(tài)；識(shí)別重要的轉(zhuǎn)錄因子，進(jìn)行譜系和發(fā)育追蹤；探究驅(qū)動(dòng)細(xì)胞類(lèi)型和狀態(tài)之間基因表達(dá)差異的非編碼序列；探究細(xì)胞類(lèi)型特異性和基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)特征等。是當(dāng)前重要的多組學(xué)研究基因表達(dá)和表觀遺傳學(xué)的手段。烈冰實(shí)驗(yàn)室包含從樣本處理到測(cè)序下機(jī)的全套實(shí)驗(yàn)平臺(tái)。西安10X Chromium X單細(xì)胞測(cè)序數(shù)據(jù)分析

細(xì)胞計(jì)數(shù)和活力評(píng)估在評(píng)估樣本質(zhì)量時(shí)，需要在細(xì)胞清洗和過(guò)濾之后測(cè)定細(xì)胞活力，這一點(diǎn)至關(guān)重要。測(cè)定細(xì)胞活力有許多種方法，烈冰多年單細(xì)胞測(cè)序經(jīng)驗(yàn)發(fā)現(xiàn)臺(tái)盼藍(lán)法在鑒定活細(xì)胞與死細(xì)胞的比例時(shí)效果很好。細(xì)胞計(jì)數(shù)的準(zhǔn)確性以及目標(biāo)回收量和實(shí)際回收量之間的一致性，取決于我們了解樣本中有多少個(gè)細(xì)胞。一旦過(guò)濾和清洗完成，可采用細(xì)胞計(jì)數(shù)設(shè)備（如血球計(jì)數(shù)器或自動(dòng)細(xì)胞計(jì)數(shù)儀）進(jìn)行定量。這些設(shè)備不但能提供準(zhǔn)確的細(xì)胞計(jì)數(shù)，還能計(jì)算出向微流體芯片上樣適量細(xì)胞所需的細(xì)胞懸液體積。福州單細(xì)胞測(cè)序數(shù)據(jù)分析ATCG堿基的排列組合構(gòu)成了測(cè)序的龐大世界。

相對(duì)于Smart-Seq技術(shù)在細(xì)胞數(shù)量上的問(wèn)題，10X平臺(tái)普遍提供的細(xì)胞數(shù)量都在1000-20000不等的測(cè)序細(xì)胞量，這個(gè)量級(jí)的測(cè)序細(xì)胞量已經(jīng)可以說(shuō)能夠完全覆蓋絕大部分組織的SingleCell群體類(lèi)型。因此，這兩種技術(shù)對(duì)于基于基因表達(dá)進(jìn)行準(zhǔn)確細(xì)胞分型上，無(wú)論是從細(xì)胞數(shù)量上來(lái)說(shuō)還是表達(dá)檢測(cè)可靠性來(lái)說(shuō)，都會(huì)更實(shí)用。同時(shí)依托RandomCellLabel技術(shù)，使得其對(duì)于NovaSeq、HiSeqXTen、Hiseq4000等設(shè)備存在的Indexhooping現(xiàn)象，相對(duì)于Smart-Seq數(shù)據(jù)來(lái)說(shuō)，影響幾乎可以忽略不計(jì)（10XGenomics官方網(wǎng)站曾給出hooping測(cè)試結(jié)果，顯示無(wú)影響。

單細(xì)胞獲得困難，不同組織要求不盡相同難以搞定？烈冰2000+項(xiàng)目消化經(jīng)驗(yàn)，100+組織類(lèi)型解離protocol，精心設(shè)計(jì)不同組織實(shí)驗(yàn)的解離、細(xì)胞懸浮實(shí)驗(yàn)體系，確保單細(xì)胞的獲得。凍存樣本無(wú)法實(shí)驗(yàn)，珍貴樣本無(wú)法使用？烈冰采用國(guó)際認(rèn)可的凍存組織復(fù)蘇技術(shù)以及死細(xì)胞過(guò)濾技術(shù)，確保凍存組織使用。珍貴樣本，細(xì)胞數(shù)量太少，消化背景雜無(wú)法做單細(xì)胞？采用國(guó)際認(rèn)可的10XGenomics，BDRhapsody雙平臺(tái)模式，根據(jù)樣本實(shí)際情況和用戶(hù)需求提供客觀有效的實(shí)驗(yàn)方案,細(xì)胞量少，背景雜也能做單細(xì)胞。單細(xì)胞RNA分類(lèi)精度不足，部分細(xì)胞無(wú)法細(xì)分？烈冰同時(shí)采用單細(xì)胞蛋白質(zhì)組與單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序技術(shù)，真正做到從上游到下游的全流程檢測(cè)，確保超高的細(xì)胞分類(lèi)精度。烈冰引進(jìn)國(guó)際主流單細(xì)胞和空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序平臺(tái)，保障細(xì)胞精度的前提下提供組織內(nèi)部精細(xì)區(qū)域的空間信息。

烈冰科技作為國(guó)內(nèi)率先同時(shí)擁有10XGenomics和BDRhapsody雙分選平臺(tái)的測(cè)序服務(wù)商及云計(jì)算服務(wù)供應(yīng)商，經(jīng)過(guò)多年實(shí)戰(zhàn)，擁有豐富的單細(xì)胞懸液制備和分選經(jīng)驗(yàn)，實(shí)測(cè)BDRhapsody對(duì)能夠高效捕獲粒細(xì)胞。針對(duì)不同的分選平臺(tái)、建庫(kù)方法，實(shí)戰(zhàn)總結(jié)搭建出不同的數(shù)據(jù)預(yù)處理工作流程；烈冰科技NovelBrain®生物大數(shù)據(jù)平臺(tái)能有效支撐生命科學(xué)研究、醫(yī)療健康等領(lǐng)域?qū)Υ髷?shù)據(jù)分析的需求。高通量測(cè)序?qū)嶒?yàn)平臺(tái)，包括NovaSeq6000、10XChromiumX、BDFACSMelody、PANNORAMIC數(shù)字切片掃描儀等，配合一支來(lái)自海內(nèi)外名校、多學(xué)科交叉型的高素質(zhì)綜合團(tuán)隊(duì)，為您的科學(xué)研究保駕護(hù)航。全線(xiàn)搭建10X Genomics Chromium X單細(xì)胞實(shí)驗(yàn)測(cè)序平臺(tái)。北京10X Chromium X單細(xì)胞測(cè)序商業(yè)化服務(wù)

烈冰一站式單細(xì)胞測(cè)序服務(wù)：立足科學(xué)研究，解碼生命本質(zhì)。西安10X Chromium X單細(xì)胞測(cè)序數(shù)據(jù)分析

10×Genomics單細(xì)胞方案要求使用具有較高活性的單細(xì)胞懸液。在實(shí)際實(shí)驗(yàn)中，我們發(fā)現(xiàn)因?yàn)闃颖绢?lèi)型和制備單細(xì)胞懸液方法的不同，容易出現(xiàn)單細(xì)胞懸液中死亡細(xì)胞的比例較高的情況。去除單細(xì)胞懸液中的死細(xì)胞和其他污染物對(duì)獲得高質(zhì)量數(shù)據(jù)是至關(guān)重要的。這是因?yàn)椋劳龅募?xì)胞易裂解導(dǎo)致其中的RNA釋放出來(lái)。這種cell-freeRNA會(huì)導(dǎo)致檢測(cè)的背景噪聲，并會(huì)影響單細(xì)胞數(shù)據(jù)的質(zhì)量。因此當(dāng)樣本活性較差時(shí)，對(duì)細(xì)胞懸液中細(xì)胞活性檢測(cè)后，需要進(jìn)行一般死細(xì)胞去除的工作（一般懸液活性小于70%時(shí)考慮此操作），以保證較高的上機(jī)捕獲細(xì)胞的質(zhì)量。西安10X Chromium X單細(xì)胞測(cè)序數(shù)據(jù)分析

上海烈冰生物醫(yī)藥科技有限公司屬于醫(yī)藥健康的高新企業(yè)，技術(shù)力量雄厚。烈冰生物是一家有限責(zé)任公司（自然）企業(yè)，一直“以人為本，服務(wù)于社會(huì)”的經(jīng)營(yíng)理念;“誠(chéng)守信譽(yù)，持續(xù)發(fā)展”的質(zhì)量方針。公司始終堅(jiān)持客戶(hù)需求優(yōu)先的原則，致力于提供高質(zhì)量的單細(xì)胞測(cè)序，生物大數(shù)據(jù)云分析平臺(tái)，空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序，單細(xì)胞多組學(xué)測(cè)序。烈冰生物順應(yīng)時(shí)代發(fā)展和市場(chǎng)需求，通過(guò)**技術(shù)，力圖保證高規(guī)格高質(zhì)量的單細(xì)胞測(cè)序，生物大數(shù)據(jù)云分析平臺(tái)，空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序，單細(xì)胞多組學(xué)測(cè)序。