湖州BD VDJ單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序

來源: 發(fā)布時(shí)間:2022-07-17

您的珍貴樣本,可以放心依賴烈冰生物BD Rhapsody單細(xì)胞捕獲系統(tǒng),基于BD平臺(tái)從原理到效率到通量的多重包容性,使得BD平臺(tái)對(duì)實(shí)驗(yàn)過程存在的批次效應(yīng)產(chǎn)生的可能性更小,可在技術(shù)、生物學(xué)、實(shí)驗(yàn)中心和用戶之間的樣本檢測獲得一致、可靠的結(jié)果,而磁珠的拆分使用和即時(shí)存儲(chǔ),可增加實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)的靈活性,配套的BD Scanner可視化工作流程質(zhì)控,從細(xì)胞鋪板前微孔板空板檢測,到細(xì)胞上樣、磁珠上樣、磁珠洗滌掃描、細(xì)胞裂解、磁珠回收、回收磁珠掃描等全過程,均實(shí)現(xiàn)BD Scanner的可視化質(zhì)控,讓您的每個(gè)樣本在實(shí)驗(yàn)端全程無憂。烈冰生物為您提供多平臺(tái)一站式全流程BD單細(xì)胞測序服務(wù)。湖州BD VDJ單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序

機(jī)體為響應(yīng)各種應(yīng)激,其細(xì)胞會(huì)從一種功能“狀態(tài)”轉(zhuǎn)變?yōu)榱硪环N功能“狀態(tài)”;當(dāng)細(xì)胞在不同狀態(tài)之間轉(zhuǎn)變時(shí),往往會(huì)經(jīng)歷轉(zhuǎn)錄重組,導(dǎo)致一些基因被沉默,一些基因被重新“喚醒”,但純化這些瞬態(tài)細(xì)胞進(jìn)行研究是很困難或不可能的;scRNA-seq擬時(shí)序分析可以讓我們在不需要純化的情況下查看這些細(xì)胞狀態(tài)。擬時(shí)序分析,即根據(jù)不同細(xì)胞亞群基因表達(dá)量隨時(shí)間的變化情況,構(gòu)建細(xì)胞譜系發(fā)育,但這里的時(shí)間并不是真時(shí)間,而是一個(gè)虛擬的時(shí)間,是指的細(xì)胞與細(xì)胞之間的轉(zhuǎn)化和演替的順序和軌跡。即使在同一個(gè)樣本中,也會(huì)存在多種不同的細(xì)胞形態(tài)。因此,不論測定了多少樣本,我們都可以采用擬時(shí)序分析對(duì)樣本中的細(xì)胞轉(zhuǎn)化和變化進(jìn)行描述。云南BD單細(xì)胞多組學(xué)測序烈冰科技已建立了多種國際和國內(nèi)主流的高通量測序?qū)嶒?yàn)平臺(tái)和自主研發(fā)國產(chǎn)化實(shí)驗(yàn)平臺(tái)。

烈冰生物單細(xì)胞測序服務(wù),為您提供可視化質(zhì)控系統(tǒng),保證每次實(shí)驗(yàn)的可靠性:BD Rhapsody 掃描儀具有直接成像功能,可在工作流程的不同階段進(jìn)行質(zhì)量控制,如細(xì)胞捕獲率和細(xì)胞多態(tài)率(雙細(xì)胞率)。成像儀指標(biāo)可以確認(rèn)起始細(xì)胞樣本的質(zhì)量,并確認(rèn)微孔板工作流程中每個(gè)步驟的成功完成狀態(tài) ;在細(xì)胞裂解前的步驟中評(píng)估細(xì)胞活性;并對(duì)通過測序確定的細(xì)胞回收量進(jìn)行可靠估算。利用這些信息,在進(jìn)行高成本的下游測序之前,用戶可根據(jù)需要改變方向并解決實(shí)驗(yàn)中遇到的問題。這些指標(biāo)允許用戶對(duì)不同工作日間的或者不同研究中心間的工作流程性能進(jìn)行跟蹤。

多樣本數(shù)據(jù)合并:Fraction of Reads Kept:合并樣本時(shí),各樣本根據(jù)Mapped Barcoded Reads per Cell數(shù)量計(jì)算出來的數(shù)據(jù)利用率。如果各樣本間該參數(shù)值相差很大,需要進(jìn)行Downsample處理,以數(shù)據(jù)量少的樣本為基準(zhǔn)將不同樣本中細(xì)胞測序深度標(biāo)化到同一水平,從而避免因測序深度差異導(dǎo)致的基因檢測數(shù)量、基因表達(dá)水平的差異。烈冰科技自主研發(fā)的單細(xì)胞云平臺(tái)致力于幫助每一位客戶定制化分析數(shù)據(jù),深度解讀數(shù)據(jù)分析結(jié)果,深入挖掘其背后的生物學(xué)意義;從操作便捷、結(jié)果可視化、分析可追溯、系統(tǒng)穩(wěn)定等方面助力單細(xì)胞研究,加速科研進(jìn)程!烈冰實(shí)驗(yàn)室包含從樣本處理到測序下機(jī)的全套實(shí)驗(yàn)平臺(tái)。

烈冰生物搭建近10臺(tái)BD Rhapsody平臺(tái),目前為全國范圍內(nèi)的高校、醫(yī)院和研究所等單位的科研學(xué)者提供服務(wù),BD Rhapsody平臺(tái)采用U型微孔板,1個(gè)板即對(duì)應(yīng)1個(gè)樣本(不混樣的情況下),每個(gè)通道一般捕獲細(xì)胞數(shù)在1000-10000個(gè)之間,而上限可捕獲40000細(xì)胞時(shí)也能獲得較低的雙細(xì)胞率,此外,單個(gè)細(xì)胞捕獲效率高達(dá)80%,可準(zhǔn)確鑒別稀有細(xì)胞類型,有利于稀有樣本或小細(xì)胞量類型樣本研究;細(xì)胞可適性高,對(duì)細(xì)胞大小(直徑超過40um細(xì)胞需要制備成細(xì)胞核)及類型無限制。細(xì)胞捕獲周期較短,能夠?qū)崿F(xiàn)自動(dòng)分離,且實(shí)驗(yàn)端捕獲細(xì)胞過程全程可視化進(jìn)行,保障每一例珍貴樣本實(shí)驗(yàn)的成功進(jìn)行,1天內(nèi)可完成從細(xì)胞懸液到cDNA文庫構(gòu)建的所有的測序準(zhǔn)備工作。2019年,烈冰已助力發(fā)表了采用BD Rahpsody平臺(tái)的單細(xì)胞風(fēng)濕類文章。吉林BD單細(xì)胞實(shí)驗(yàn)服務(wù)

測序的革新讓科學(xué)研究從個(gè)體基因差異逐漸轉(zhuǎn)為個(gè)體細(xì)胞的基因差異。湖州BD VDJ單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序

單細(xì)胞測序?qū)嶒?yàn)再樣本細(xì)胞上機(jī)分選簽,需要對(duì)細(xì)胞數(shù)量、細(xì)胞活性進(jìn)準(zhǔn)判斷,這對(duì)Single Cell分選標(biāo)記、建庫、下機(jī)數(shù)據(jù)的質(zhì)量都具有著決定性的作用。如若細(xì)胞計(jì)數(shù)偏高,將會(huì)影響建庫的成功率;計(jì)數(shù)偏低,則會(huì)提高雙細(xì)胞的比例;而細(xì)胞活率過低,就會(huì)使測序數(shù)據(jù)的利用率大打折扣,因此把好單細(xì)胞懸液質(zhì)量這一關(guān)尤為重要。而在鋪板過程中,由于不同操作人員手法具有不可避免的差異,不同的液體流速將直接影響單細(xì)胞的入孔效果。因此烈冰生物BD Rhapsody單細(xì)胞分選平臺(tái)配套了專門定制的電動(dòng)移液器,其具有Prime Treat、Cell Load、Bead Load、Wash、Lysis、Retrieval多種操作模式,來對(duì)應(yīng)各種不同的操作。通過已經(jīng)設(shè)定的程序來控制液體的流速,大幅度降低人為操作習(xí)慣帶來的差異,保證實(shí)驗(yàn)操作的一致性。湖州BD VDJ單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序

上海烈冰生物醫(yī)藥科技有限公司主營品牌有NovelBio,烈冰生物,NovelBrain,PanoCell,烈冰智造,發(fā)展規(guī)模團(tuán)隊(duì)不斷壯大,該公司服務(wù)型的公司。是一家有限責(zé)任公司(自然)企業(yè),隨著市場的發(fā)展和生產(chǎn)的需求,與多家企業(yè)合作研究,在原有產(chǎn)品的基礎(chǔ)上經(jīng)過不斷改進(jìn),追求新型,在強(qiáng)化內(nèi)部管理,完善結(jié)構(gòu)調(diào)整的同時(shí),良好的質(zhì)量、合理的價(jià)格、完善的服務(wù),在業(yè)界受到寬泛好評(píng)。公司始終堅(jiān)持客戶需求優(yōu)先的原則,致力于提供高質(zhì)量的單細(xì)胞測序,生物大數(shù)據(jù)云分析平臺(tái),空間轉(zhuǎn)錄組測序,單細(xì)胞多組學(xué)測序。烈冰生物以創(chuàng)造***產(chǎn)品及服務(wù)的理念,打造高指標(biāo)的服務(wù),引導(dǎo)行業(yè)的發(fā)展。