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相對于Smart-Seq技術在細胞數(shù)量上的問題,BD平臺普遍提供的細胞數(shù)量都在1000-10000不等的測序細胞量,特殊研究需求的項目,可提供上限40000個細胞的捕獲量(單個樣本)。這個量級的測序細胞量已經(jīng)可以說能夠完全覆蓋絕大部分組織的Single Cell群體類型。因此,對于基于基因表達進行準確細胞分型上,無論是從細胞數(shù)量上來說還是表達檢測可靠性來說,都會更實用。此外針對特殊項目研究,如需要捕獲和分析脆弱的細胞,如粒細胞、中性粒細胞、CAR-T細胞、干細胞、移植瘤細胞、骨髓瘤細胞等,烈冰生BD平臺也有更好的捕獲效能,滿足您的實際需求。深度的單細胞測序數(shù)據(jù)解讀助力醫(yī)療健康大時代。單細胞轉(zhuǎn)錄組測序
烈冰科技自主研發(fā)的單細胞云平臺致力于幫助每一位客戶定制化分析數(shù)據(jù),深度解讀數(shù)據(jù)分析結(jié)果,深入挖掘其背后的生物學意義;從操作便捷、結(jié)果可視化、分析可追溯、系統(tǒng)穩(wěn)定等方面助力單細胞研究,加速科研進程!此外,烈冰生信團隊根據(jù)豐富的實戰(zhàn)經(jīng)驗為用戶量身打造了一款單細胞測序結(jié)果解讀的神兵利器——單細胞瀏覽器(Single Cell Browser),不但可以將海量復雜的結(jié)果文件可視化,還是可以實現(xiàn)三維立體化展示的軟件。專業(yè)的生信代碼交給專業(yè)的烈冰,專業(yè)的生物學意義交給專業(yè)的您,詳情請咨詢烈冰生物。南京single cell 單細胞測序烈冰一站式單細胞測序服務:立足科學研究,解碼生命本質(zhì)。
關于BD Rhapsody單細胞平臺的樣本類型和樣本制備 :在上機前需要注意細胞消化后的細胞團塊,獲得分離良好的細胞懸液、且細胞活力高(>70%);此外,了解您所研究細胞的大小范圍也很重要。細胞大小通常與細胞表達的轉(zhuǎn)錄本數(shù)量有關。各種尺寸不同的細胞(一般直徑不大于50μm)均可與我們基因表達解決方案中使用的BD Rhapsody平臺兼容。一般來說,細胞制備方案將根據(jù)組織來源和細胞類型而變化。每種組織類型都是獨特的,因此,必須在開始任何單細胞實驗之前優(yōu)化樣本制備,烈冰多年樣本解離消化經(jīng)驗,累積10+物種、50+組織的消化protocol,若您的樣本為組織,且尚未成功將組織樣本消化成單細胞懸液,烈冰將盡可能提供技術及實驗上的幫助。
烈冰生信團隊傾情研發(fā)的NovelBrain?生信大數(shù)據(jù)分析平臺,針對龐大的單細胞測序數(shù)據(jù),能夠?qū)崿F(xiàn)細胞類型鑒定的快、精、準:一鍵導入gene list構建個性化基因列表;輕松一點即可展示Marker基因的Feature plot;任意修改Cluster的顏色和名稱助力高效鑒定細胞類型;一鍵獲得t-SNE圖、Heatmap和Violin圖:輕松獲得并下載基因表達的t-SNE圖、Heatmap、Violin圖,還可以通過調(diào)節(jié)寬、高和系數(shù)比例來調(diào)節(jié)美觀。平臺上線300+task自主分析工具、50+pipeline工作流模板,幫助烈冰生信分析團隊和自主分析用戶實現(xiàn)分析工具和模板的快速調(diào)用和一站式全流程自動化分析,節(jié)省工作時間并提升整體工作效率。此外,烈冰開展了單細胞轉(zhuǎn)錄組、單細胞多組學以及空間轉(zhuǎn)錄組等多種產(chǎn)品在內(nèi)的全套科研解決方案,歡迎垂詢。
單細胞測序?qū)嶒炘贅颖炯毎蠙C分選簽,需要對細胞數(shù)量、細胞活性進準判斷,這對Single Cell分選標記、建庫、下機數(shù)據(jù)的質(zhì)量都具有著決定性的作用。如若細胞計數(shù)偏高,將會影響建庫的成功率;計數(shù)偏低,則會提高雙細胞的比例;而細胞活率過低,就會使測序數(shù)據(jù)的利用率大打折扣,因此把好單細胞懸液質(zhì)量這一關尤為重要。而在鋪板過程中,由于不同操作人員手法具有不可避免的差異,不同的液體流速將直接影響單細胞的入孔效果。因此烈冰生物BD Rhapsody單細胞分選平臺配套了專門定制的電動移液器,其具有Prime Treat、Cell Load、Bead Load、Wash、Lysis、Retrieval多種操作模式,來對應各種不同的操作。通過已經(jīng)設定的程序來控制液體的流速,大幅度降低人為操作習慣帶來的差異,保證實驗操作的一致性。烈冰生物作為BD 中國聯(lián)合成立單細胞測序?qū)嶒炇?,為推動單細胞測序技術發(fā)展貢獻中國力量。重慶single cell 單細胞服務機構
烈冰測序服務已助力300余篇國際期刊研究文章發(fā)表。單細胞轉(zhuǎn)錄組測序
現(xiàn)有的單細胞測序技術陣營在幾個主要領域存在差別。一個是基于微流控通道的細胞與Beads的在通道內(nèi)的動態(tài)結(jié)合,通過油相水相不相容的特點將結(jié)合了的細胞和Beads進行分隔,在這個空間,單個細胞的內(nèi)容物釋放,轉(zhuǎn)錄本或其他生物分析物被標記或添加索引,以便下游識別。BD Rhapsody單細胞測序平臺采用靜態(tài)微孔技術(Cyto-Seq具有類似的技術原理)。通過微孔板的物理分隔,將一個個單個細胞和帶有標簽的磁珠,一對一的“框”在微反應的物理平臺中。這樣,每一個細胞都會結(jié)合一個磁珠,那么在每一個磁珠中上長滿了不同的Cell Barcode和UMI Barcode連接形成的序列,再加上一端PolyT的抓手,這個抓手就會使用oligo dT抓住mRNA構建文庫。單細胞轉(zhuǎn)錄組測序
上海烈冰生物醫(yī)藥科技有限公司是一家生物科技、醫(yī)藥科技、信息科技、計算機科技領域內(nèi)的技術開發(fā)、技術服務、技術轉(zhuǎn)讓、技術咨詢,市場營銷策劃,市場信息咨詢與調(diào)查(不得從事社會調(diào)查、社會調(diào)研、民意調(diào)查、民意測驗),從事貨物及技術的進出口業(yè)務,計算機、軟件及耗材(除專控),軟件開發(fā)【依法須經(jīng)批準的項目,經(jīng)相關部門批準后方可開展經(jīng)營活動】的公司,致力于發(fā)展為創(chuàng)新務實、誠實可信的企業(yè)。公司自創(chuàng)立以來,投身于單細胞測序,生物大數(shù)據(jù)云分析平臺,空間轉(zhuǎn)錄組測序,單細胞多組學測序,是醫(yī)藥健康的主力軍。烈冰生物致力于把技術上的創(chuàng)新展現(xiàn)成對用戶產(chǎn)品上的貼心,為用戶帶來良好體驗。烈冰生物始終關注自身,在風云變化的時代,對自身的建設毫不懈怠,高度的專注與執(zhí)著使烈冰生物在行業(yè)的從容而自信。